Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5H5T6

Protein Details
Accession U5H5T6    Localization Confidence High Confidence Score 19.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
837-860VVSSLADKPKKKKRALPSPSNEIDHydrophilic
872-899VTSSSAKPNKPSSSKKPKRSMLEVEPHDHydrophilic
914-937VASLTQGKKGKKKAKETIGRAAKGHydrophilic
940-966VDTSEFRKEPRVNKAPKKGNVSRSFAKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
844-850KPKKKKR
886-888KKP
921-936KKGKKKAKETIGRAAK
946-959RKEPRVNKAPKKGN
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12.833, nucl 12.5, cyto 12, cyto_mito 7.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002562  3'-5'_exonuclease_dom  
IPR012588  Exosome-assoc_fac_Rrp6_N  
IPR010997  HRDC-like_sf  
IPR002121  HRDC_dom  
IPR044876  HRDC_dom_sf  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR045092  Rrp6-like  
Gene Ontology GO:0000176  C:nuclear exosome (RNase complex)  
GO:0000175  F:3'-5'-RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000166  F:nucleotide binding  
GO:0000467  P:exonucleolytic trimming to generate mature 3'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF01612  DNA_pol_A_exo1  
PF00570  HRDC  
PF08066  PMC2NT  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50967  HRDC  
Amino Acid Sequences MAYYLDPTRSPPLHGSVMASTPAAFELSSTYLAALSEALGQTTAQADSLPASSDLSFERTLSRALARKLDAHSERVLALVENLLSWSTQDIEPKASASQPRLDADLLHDGLYTNVVDRLEPLLEAADDELEIHLGVSKNHTSKHAPLRSNAPGIKSKSVAGPSKDRLAPHLLHDPNTVKPQLAFPERLCLPRPRLAEQVLPLEEPIWKPVLRRKLHSLSNSNQNAEDRTSWLRVVHTRHTDRFSSITGTEPPSYPIYLHPYQAEIEQLSPPAHYAIRPPLPPTPKEHSFDITPFAWVDDEQAFEAMLSHIREMGAQGKKELAIDLEHHDQRTWGGITCLIQLSTRTQDYVIDVLDPIVRDLLERLNEFTTDPEWIKVFHGAASDIIWLQRDFGIYIVGLFDTYHATRVLQYPHHSLASLLEKYTDFVPDKRYQLADWRIRPLPEAMLHYARSDTHYLLDVYDHLRIALHELETESDRTSEREGKMLLDADELQVNPLVRVFNLSKTVSSSTFSIAPYDSQTGHFENGWLGLLAKNGQLHHYASALRVPTLPVRSGWGPGQVHFELMKVLHRWREAVAREEDESTSWVLSNWALFNLAAQAPREVGEVMRIVGGSMGRNGGGVGEVMRRRKGEVVECILSVLREVESRGEKKEGEVVVVSEAMKERGEAASEPVVRPVVESLWSDAVEEVAEVKVVAKSSFFGGSNKASTSTLSTQNLVASKSGFFGSSSSKKIPVPTVQNSADLTPQRAAAIARIHSSLLLGGGLASSLQGAKVPEPQAPPPVDTSVDTNDPQTHASALTGDHSFIPFGERTTKDVPTPSTSKPEPAPKRSDKDVIVVSSLADKPKKKKRALPSPSNEIDLIPSTAPSASTVTSSSAKPNKPSSSKKPKRSMLEVEPHDYSTSQSILDADPASVASLTQGKKGKKKAKETIGRAAKGFVVDTSEFRKEPRVNKAPKKGNVSRSFAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.36
3 0.3
4 0.31
5 0.29
6 0.25
7 0.19
8 0.16
9 0.15
10 0.12
11 0.09
12 0.07
13 0.1
14 0.12
15 0.13
16 0.12
17 0.12
18 0.12
19 0.12
20 0.12
21 0.09
22 0.07
23 0.09
24 0.09
25 0.09
26 0.09
27 0.09
28 0.09
29 0.11
30 0.1
31 0.07
32 0.07
33 0.07
34 0.09
35 0.1
36 0.11
37 0.1
38 0.11
39 0.11
40 0.13
41 0.14
42 0.16
43 0.16
44 0.15
45 0.17
46 0.17
47 0.18
48 0.19
49 0.24
50 0.27
51 0.3
52 0.36
53 0.35
54 0.39
55 0.41
56 0.49
57 0.45
58 0.43
59 0.41
60 0.37
61 0.34
62 0.3
63 0.27
64 0.17
65 0.15
66 0.12
67 0.1
68 0.09
69 0.09
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.09
75 0.11
76 0.15
77 0.17
78 0.2
79 0.21
80 0.22
81 0.22
82 0.25
83 0.28
84 0.27
85 0.32
86 0.32
87 0.33
88 0.34
89 0.33
90 0.28
91 0.27
92 0.31
93 0.26
94 0.22
95 0.2
96 0.18
97 0.18
98 0.18
99 0.14
100 0.08
101 0.1
102 0.1
103 0.09
104 0.11
105 0.13
106 0.12
107 0.12
108 0.11
109 0.1
110 0.1
111 0.1
112 0.09
113 0.07
114 0.06
115 0.07
116 0.06
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.08
121 0.08
122 0.09
123 0.13
124 0.19
125 0.21
126 0.23
127 0.28
128 0.29
129 0.37
130 0.47
131 0.52
132 0.49
133 0.5
134 0.56
135 0.58
136 0.61
137 0.54
138 0.48
139 0.47
140 0.49
141 0.49
142 0.42
143 0.38
144 0.35
145 0.4
146 0.41
147 0.39
148 0.42
149 0.42
150 0.48
151 0.49
152 0.45
153 0.42
154 0.41
155 0.38
156 0.35
157 0.41
158 0.35
159 0.34
160 0.39
161 0.37
162 0.35
163 0.39
164 0.35
165 0.26
166 0.25
167 0.27
168 0.3
169 0.32
170 0.32
171 0.28
172 0.35
173 0.36
174 0.39
175 0.38
176 0.38
177 0.39
178 0.41
179 0.45
180 0.41
181 0.44
182 0.44
183 0.45
184 0.41
185 0.42
186 0.36
187 0.33
188 0.28
189 0.23
190 0.23
191 0.19
192 0.18
193 0.15
194 0.14
195 0.16
196 0.24
197 0.33
198 0.35
199 0.4
200 0.47
201 0.52
202 0.58
203 0.64
204 0.64
205 0.6
206 0.66
207 0.64
208 0.56
209 0.5
210 0.45
211 0.39
212 0.34
213 0.29
214 0.23
215 0.23
216 0.23
217 0.22
218 0.22
219 0.23
220 0.26
221 0.3
222 0.35
223 0.41
224 0.45
225 0.49
226 0.52
227 0.5
228 0.47
229 0.44
230 0.37
231 0.31
232 0.26
233 0.24
234 0.23
235 0.25
236 0.24
237 0.22
238 0.23
239 0.21
240 0.21
241 0.18
242 0.18
243 0.22
244 0.22
245 0.24
246 0.21
247 0.21
248 0.21
249 0.21
250 0.2
251 0.13
252 0.13
253 0.12
254 0.13
255 0.12
256 0.11
257 0.11
258 0.11
259 0.11
260 0.1
261 0.12
262 0.19
263 0.23
264 0.24
265 0.27
266 0.32
267 0.37
268 0.38
269 0.42
270 0.42
271 0.43
272 0.46
273 0.45
274 0.41
275 0.38
276 0.38
277 0.35
278 0.27
279 0.22
280 0.19
281 0.17
282 0.14
283 0.11
284 0.13
285 0.09
286 0.1
287 0.09
288 0.09
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.06
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.09
300 0.16
301 0.18
302 0.18
303 0.18
304 0.19
305 0.19
306 0.19
307 0.19
308 0.12
309 0.09
310 0.1
311 0.14
312 0.2
313 0.21
314 0.21
315 0.21
316 0.2
317 0.19
318 0.2
319 0.17
320 0.11
321 0.1
322 0.11
323 0.12
324 0.13
325 0.13
326 0.1
327 0.1
328 0.1
329 0.12
330 0.15
331 0.14
332 0.13
333 0.13
334 0.13
335 0.14
336 0.14
337 0.12
338 0.09
339 0.08
340 0.08
341 0.09
342 0.08
343 0.07
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.07
348 0.09
349 0.1
350 0.11
351 0.13
352 0.13
353 0.13
354 0.13
355 0.14
356 0.12
357 0.12
358 0.12
359 0.11
360 0.11
361 0.11
362 0.12
363 0.12
364 0.12
365 0.1
366 0.1
367 0.1
368 0.1
369 0.09
370 0.09
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.07
381 0.06
382 0.06
383 0.05
384 0.05
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.06
389 0.06
390 0.08
391 0.08
392 0.08
393 0.09
394 0.12
395 0.15
396 0.15
397 0.18
398 0.21
399 0.23
400 0.23
401 0.21
402 0.18
403 0.19
404 0.21
405 0.18
406 0.15
407 0.14
408 0.14
409 0.15
410 0.15
411 0.15
412 0.11
413 0.12
414 0.18
415 0.21
416 0.23
417 0.24
418 0.24
419 0.21
420 0.28
421 0.36
422 0.37
423 0.35
424 0.38
425 0.38
426 0.38
427 0.38
428 0.31
429 0.25
430 0.2
431 0.2
432 0.18
433 0.18
434 0.19
435 0.18
436 0.17
437 0.15
438 0.15
439 0.14
440 0.12
441 0.1
442 0.11
443 0.11
444 0.1
445 0.1
446 0.09
447 0.09
448 0.09
449 0.08
450 0.07
451 0.07
452 0.07
453 0.09
454 0.09
455 0.07
456 0.07
457 0.07
458 0.08
459 0.09
460 0.1
461 0.08
462 0.08
463 0.08
464 0.08
465 0.11
466 0.15
467 0.15
468 0.16
469 0.16
470 0.16
471 0.17
472 0.17
473 0.14
474 0.1
475 0.1
476 0.08
477 0.09
478 0.08
479 0.07
480 0.07
481 0.07
482 0.06
483 0.07
484 0.06
485 0.05
486 0.09
487 0.1
488 0.1
489 0.14
490 0.15
491 0.14
492 0.16
493 0.18
494 0.15
495 0.16
496 0.14
497 0.12
498 0.13
499 0.13
500 0.12
501 0.11
502 0.11
503 0.11
504 0.12
505 0.11
506 0.11
507 0.13
508 0.13
509 0.14
510 0.13
511 0.11
512 0.1
513 0.1
514 0.09
515 0.06
516 0.06
517 0.05
518 0.06
519 0.06
520 0.07
521 0.08
522 0.08
523 0.1
524 0.11
525 0.11
526 0.11
527 0.12
528 0.11
529 0.1
530 0.13
531 0.12
532 0.11
533 0.1
534 0.11
535 0.13
536 0.14
537 0.14
538 0.12
539 0.14
540 0.15
541 0.16
542 0.16
543 0.19
544 0.17
545 0.18
546 0.23
547 0.2
548 0.2
549 0.19
550 0.18
551 0.13
552 0.13
553 0.14
554 0.11
555 0.13
556 0.16
557 0.16
558 0.17
559 0.17
560 0.23
561 0.22
562 0.26
563 0.26
564 0.25
565 0.25
566 0.26
567 0.24
568 0.18
569 0.18
570 0.13
571 0.1
572 0.08
573 0.07
574 0.07
575 0.07
576 0.07
577 0.06
578 0.06
579 0.07
580 0.06
581 0.06
582 0.08
583 0.09
584 0.09
585 0.09
586 0.09
587 0.09
588 0.1
589 0.1
590 0.08
591 0.07
592 0.08
593 0.08
594 0.08
595 0.08
596 0.07
597 0.06
598 0.07
599 0.07
600 0.06
601 0.06
602 0.06
603 0.06
604 0.06
605 0.06
606 0.05
607 0.05
608 0.04
609 0.05
610 0.09
611 0.12
612 0.15
613 0.17
614 0.18
615 0.19
616 0.22
617 0.25
618 0.25
619 0.29
620 0.32
621 0.31
622 0.31
623 0.3
624 0.27
625 0.23
626 0.18
627 0.12
628 0.07
629 0.06
630 0.07
631 0.1
632 0.16
633 0.18
634 0.2
635 0.22
636 0.21
637 0.22
638 0.27
639 0.24
640 0.19
641 0.18
642 0.16
643 0.14
644 0.15
645 0.14
646 0.09
647 0.09
648 0.09
649 0.08
650 0.08
651 0.08
652 0.08
653 0.09
654 0.09
655 0.11
656 0.16
657 0.17
658 0.17
659 0.17
660 0.18
661 0.16
662 0.16
663 0.14
664 0.09
665 0.1
666 0.11
667 0.12
668 0.13
669 0.13
670 0.13
671 0.12
672 0.11
673 0.09
674 0.08
675 0.06
676 0.05
677 0.05
678 0.04
679 0.05
680 0.06
681 0.07
682 0.07
683 0.06
684 0.07
685 0.09
686 0.11
687 0.12
688 0.12
689 0.15
690 0.17
691 0.19
692 0.18
693 0.18
694 0.16
695 0.16
696 0.2
697 0.21
698 0.24
699 0.24
700 0.25
701 0.24
702 0.26
703 0.27
704 0.22
705 0.19
706 0.14
707 0.13
708 0.13
709 0.13
710 0.11
711 0.09
712 0.1
713 0.17
714 0.2
715 0.24
716 0.25
717 0.28
718 0.29
719 0.32
720 0.35
721 0.35
722 0.39
723 0.4
724 0.45
725 0.43
726 0.44
727 0.42
728 0.38
729 0.36
730 0.29
731 0.27
732 0.2
733 0.19
734 0.17
735 0.17
736 0.16
737 0.15
738 0.18
739 0.17
740 0.18
741 0.18
742 0.18
743 0.17
744 0.17
745 0.13
746 0.09
747 0.07
748 0.05
749 0.04
750 0.04
751 0.04
752 0.03
753 0.03
754 0.03
755 0.03
756 0.03
757 0.05
758 0.06
759 0.08
760 0.14
761 0.16
762 0.2
763 0.23
764 0.26
765 0.31
766 0.32
767 0.32
768 0.29
769 0.29
770 0.26
771 0.24
772 0.25
773 0.22
774 0.24
775 0.23
776 0.22
777 0.22
778 0.22
779 0.22
780 0.19
781 0.16
782 0.13
783 0.12
784 0.11
785 0.1
786 0.11
787 0.11
788 0.11
789 0.11
790 0.11
791 0.11
792 0.1
793 0.13
794 0.11
795 0.12
796 0.19
797 0.2
798 0.25
799 0.29
800 0.31
801 0.3
802 0.34
803 0.36
804 0.35
805 0.38
806 0.36
807 0.4
808 0.39
809 0.42
810 0.43
811 0.5
812 0.53
813 0.56
814 0.62
815 0.63
816 0.68
817 0.7
818 0.7
819 0.61
820 0.58
821 0.55
822 0.47
823 0.39
824 0.33
825 0.27
826 0.26
827 0.26
828 0.26
829 0.27
830 0.31
831 0.39
832 0.5
833 0.59
834 0.62
835 0.7
836 0.75
837 0.81
838 0.85
839 0.87
840 0.84
841 0.84
842 0.79
843 0.72
844 0.62
845 0.5
846 0.43
847 0.34
848 0.27
849 0.18
850 0.15
851 0.13
852 0.13
853 0.13
854 0.12
855 0.12
856 0.1
857 0.11
858 0.12
859 0.15
860 0.17
861 0.18
862 0.26
863 0.32
864 0.36
865 0.41
866 0.48
867 0.54
868 0.6
869 0.69
870 0.71
871 0.74
872 0.81
873 0.85
874 0.87
875 0.87
876 0.86
877 0.85
878 0.83
879 0.81
880 0.81
881 0.76
882 0.71
883 0.64
884 0.57
885 0.49
886 0.4
887 0.32
888 0.24
889 0.2
890 0.15
891 0.14
892 0.14
893 0.13
894 0.16
895 0.15
896 0.12
897 0.11
898 0.11
899 0.12
900 0.1
901 0.09
902 0.08
903 0.14
904 0.15
905 0.22
906 0.28
907 0.35
908 0.44
909 0.54
910 0.62
911 0.65
912 0.75
913 0.78
914 0.82
915 0.86
916 0.85
917 0.85
918 0.86
919 0.79
920 0.69
921 0.61
922 0.51
923 0.42
924 0.35
925 0.25
926 0.21
927 0.19
928 0.21
929 0.26
930 0.29
931 0.28
932 0.28
933 0.37
934 0.39
935 0.45
936 0.53
937 0.57
938 0.63
939 0.73
940 0.83
941 0.84
942 0.85
943 0.87
944 0.85
945 0.86
946 0.84