FuNGI

U5H5N0

Protein Details

Accession

U5H5N0

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
54-84	PPESTETASKKRKKSKSNHQQQQQQQQQPPE	Hydrophilic
230-256	FGDGQKPVKKNKKRSKAEQKGGKERSE	Basic
536-557	KAPSQDDKKRLRLKPVGRKDIS	Basic
559-585	TNGSGNKDARDRKGKKRQRIMGGEEGV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
63-68	KKRKKS
235-254	KPVKKNKKRSKAEQKGGKER
543-592	KKRLRLKPVGRKDISRTNGSGNKDARDRKGKKRQRIMGGEEGVFKKRKEK

Subcellular Location(s)

nucl 10, cyto_nucl 9.333, mito_nucl 8.833, cyto 7.5, mito 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0005524 F:ATP binding GO:0016787 F:hydrolase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0000480 P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000447 P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000472 P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0048254 P:snoRNA localization
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF00271 Helicase_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER
CDD	cd18787 SF2_C_DEAD

Amino Acid Sequences

MDAFKILAAGTRFDRRRFNQDIQAFEPKSQTPRVASTSTVLPSELDFFGNVTAPPESTETASKKRKKSKSNHQQQQQQQQQPPEALDYATLLRTKRIKCTGDDVPNPIPSWNHLPQNAQTTLLHNNWTTKMHLHEPTGIQMSAWGIMLENRDLLACAPTGSGKTLSFLVPLLLSVTLSTSDDPSTKKGPIAPRAIILEPTRELAMQVQREALALSQGSRWKIRVLGEDGFGDGQKPVKKNKKRSKAEQKGGKERSETTEKGAEEAELLLEEKQEEEGGVVEILISTPLRLIYSIKSSQVSVVGTSHLILDESDKLFELNFLTQTDEIISHLPSTTQKAMFSATLPSSIEELAKTVMKPSLIRAIVGHKDAANDQIDQTLLFVGAEDHKLLSLRTLIAQGQFTPPVLIFVQSILRAKELATELVLDGINVDTIHAERTAAERDAAVQAFAQGKVWCLIATDVLGRGVDFRGVKLVINYDFPQSAGSYVHRIGRTGRAGNPGKAITFFTQADAPYLKIIVNVMRSSGCAVPSYMLDLKAPSQDDKKRLRLKPVGRKDISRTNGSGNKDARDRKGKKRQRIMGGEEGVFKKRKEKIQIEE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.47
2	0.48
3	0.56
4	0.61
5	0.64
6	0.64
7	0.65
8	0.67
9	0.64
10	0.68
11	0.6
12	0.54
13	0.51
14	0.44
15	0.44
16	0.42
17	0.4
18	0.33
19	0.38
20	0.41
21	0.39
22	0.37
23	0.35
24	0.36
25	0.33
26	0.3
27	0.25
28	0.2
29	0.19
30	0.21
31	0.19
32	0.14
33	0.12
34	0.12
35	0.13
36	0.13
37	0.12
38	0.11
39	0.11
40	0.1
41	0.12
42	0.14
43	0.15
44	0.16
45	0.23
46	0.26
47	0.35
48	0.45
49	0.52
50	0.59
51	0.69
52	0.76
53	0.79
54	0.85
55	0.86
56	0.88
57	0.91
58	0.91
59	0.91
60	0.91
61	0.9
62	0.9
63	0.89
64	0.86
65	0.81
66	0.76
67	0.7
68	0.62
69	0.54
70	0.46
71	0.37
72	0.28
73	0.22
74	0.18
75	0.15
76	0.16
77	0.17
78	0.15
79	0.19
80	0.27
81	0.29
82	0.36
83	0.43
84	0.44
85	0.44
86	0.51
87	0.55
88	0.57
89	0.58
90	0.56
91	0.51
92	0.51
93	0.48
94	0.42
95	0.33
96	0.28
97	0.32
98	0.31
99	0.32
100	0.32
101	0.35
102	0.37
103	0.44
104	0.41
105	0.35
106	0.31
107	0.28
108	0.32
109	0.3
110	0.29
111	0.22
112	0.25
113	0.25
114	0.26
115	0.25
116	0.22
117	0.25
118	0.28
119	0.31
120	0.3
121	0.33
122	0.32
123	0.34
124	0.34
125	0.3
126	0.23
127	0.2
128	0.18
129	0.14
130	0.13
131	0.09
132	0.06
133	0.08
134	0.09
135	0.09
136	0.09
137	0.08
138	0.08
139	0.08
140	0.09
141	0.08
142	0.07
143	0.06
144	0.07
145	0.07
146	0.08
147	0.1
148	0.11
149	0.1
150	0.11
151	0.12
152	0.12
153	0.12
154	0.11
155	0.1
156	0.08
157	0.08
158	0.08
159	0.06
160	0.06
161	0.05
162	0.06
163	0.06
164	0.07
165	0.07
166	0.07
167	0.08
168	0.1
169	0.12
170	0.15
171	0.18
172	0.18
173	0.19
174	0.23
175	0.29
176	0.35
177	0.39
178	0.36
179	0.36
180	0.38
181	0.37
182	0.35
183	0.29
184	0.24
185	0.19
186	0.19
187	0.17
188	0.13
189	0.13
190	0.14
191	0.18
192	0.17
193	0.17
194	0.16
195	0.16
196	0.16
197	0.16
198	0.12
199	0.08
200	0.07
201	0.07
202	0.09
203	0.12
204	0.14
205	0.15
206	0.16
207	0.16
208	0.18
209	0.2
210	0.22
211	0.24
212	0.24
213	0.24
214	0.23
215	0.22
216	0.2
217	0.17
218	0.13
219	0.09
220	0.11
221	0.13
222	0.16
223	0.24
224	0.34
225	0.43
226	0.54
227	0.64
228	0.72
229	0.76
230	0.85
231	0.88
232	0.88
233	0.89
234	0.87
235	0.85
236	0.84
237	0.8
238	0.71
239	0.62
240	0.52
241	0.48
242	0.45
243	0.38
244	0.31
245	0.31
246	0.29
247	0.27
248	0.26
249	0.2
250	0.14
251	0.13
252	0.1
253	0.05
254	0.05
255	0.05
256	0.04
257	0.04
258	0.04
259	0.04
260	0.04
261	0.04
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.04
267	0.03
268	0.03
269	0.03
270	0.04
271	0.03
272	0.03
273	0.03
274	0.03
275	0.04
276	0.04
277	0.05
278	0.06
279	0.11
280	0.13
281	0.14
282	0.14
283	0.14
284	0.14
285	0.15
286	0.14
287	0.09
288	0.09
289	0.08
290	0.07
291	0.07
292	0.07
293	0.05
294	0.05
295	0.04
296	0.05
297	0.07
298	0.07
299	0.07
300	0.07
301	0.07
302	0.07
303	0.08
304	0.08
305	0.06
306	0.07
307	0.07
308	0.08
309	0.08
310	0.08
311	0.08
312	0.07
313	0.07
314	0.07
315	0.07
316	0.06
317	0.06
318	0.07
319	0.07
320	0.11
321	0.13
322	0.13
323	0.13
324	0.14
325	0.15
326	0.15
327	0.14
328	0.13
329	0.11
330	0.11
331	0.11
332	0.11
333	0.11
334	0.1
335	0.1
336	0.07
337	0.07
338	0.08
339	0.08
340	0.08
341	0.08
342	0.09
343	0.1
344	0.1
345	0.12
346	0.18
347	0.17
348	0.17
349	0.17
350	0.21
351	0.23
352	0.23
353	0.22
354	0.15
355	0.16
356	0.16
357	0.19
358	0.15
359	0.13
360	0.12
361	0.12
362	0.11
363	0.1
364	0.1
365	0.07
366	0.05
367	0.05
368	0.04
369	0.04
370	0.06
371	0.07
372	0.07
373	0.06
374	0.07
375	0.07
376	0.07
377	0.07
378	0.07
379	0.07
380	0.08
381	0.1
382	0.11
383	0.12
384	0.13
385	0.13
386	0.13
387	0.13
388	0.13
389	0.12
390	0.1
391	0.11
392	0.1
393	0.1
394	0.08
395	0.09
396	0.1
397	0.12
398	0.14
399	0.12
400	0.12
401	0.12
402	0.12
403	0.15
404	0.14
405	0.13
406	0.11
407	0.11
408	0.11
409	0.12
410	0.12
411	0.08
412	0.07
413	0.06
414	0.06
415	0.05
416	0.05
417	0.04
418	0.05
419	0.06
420	0.06
421	0.06
422	0.06
423	0.09
424	0.12
425	0.12
426	0.12
427	0.11
428	0.13
429	0.16
430	0.15
431	0.13
432	0.1
433	0.12
434	0.13
435	0.13
436	0.14
437	0.11
438	0.12
439	0.13
440	0.13
441	0.1
442	0.09
443	0.1
444	0.08
445	0.09
446	0.09
447	0.08
448	0.09
449	0.09
450	0.08
451	0.08
452	0.08
453	0.11
454	0.1
455	0.1
456	0.13
457	0.14
458	0.14
459	0.14
460	0.18
461	0.15
462	0.19
463	0.2
464	0.19
465	0.19
466	0.19
467	0.18
468	0.15
469	0.15
470	0.13
471	0.13
472	0.15
473	0.17
474	0.22
475	0.22
476	0.23
477	0.24
478	0.3
479	0.34
480	0.34
481	0.36
482	0.4
483	0.44
484	0.45
485	0.47
486	0.4
487	0.35
488	0.32
489	0.32
490	0.24
491	0.25
492	0.23
493	0.2
494	0.22
495	0.21
496	0.23
497	0.21
498	0.19
499	0.15
500	0.15
501	0.14
502	0.12
503	0.13
504	0.13
505	0.16
506	0.16
507	0.17
508	0.16
509	0.17
510	0.19
511	0.2
512	0.17
513	0.14
514	0.14
515	0.14
516	0.14
517	0.19
518	0.18
519	0.17
520	0.17
521	0.17
522	0.19
523	0.22
524	0.24
525	0.23
526	0.3
527	0.36
528	0.45
529	0.52
530	0.6
531	0.66
532	0.69
533	0.75
534	0.76
535	0.8
536	0.82
537	0.84
538	0.85
539	0.79
540	0.8
541	0.77
542	0.77
543	0.71
544	0.66
545	0.57
546	0.55
547	0.57
548	0.56
549	0.57
550	0.5
551	0.51
552	0.53
553	0.58
554	0.58
555	0.63
556	0.66
557	0.69
558	0.77
559	0.81
560	0.84
561	0.88
562	0.88
563	0.88
564	0.89
565	0.86
566	0.84
567	0.79
568	0.71
569	0.67
570	0.6
571	0.55
572	0.5
573	0.43
574	0.42
575	0.44
576	0.51
577	0.54

U5H5N0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer