Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5HI85

Protein Details
Accession U5HI85    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
245-265QEWNRTRKDNHKEVERRRRETBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
36-38KRG
43-62GARSSERTAAAPSSKKGGKK
185-199GKRKGKKNQARAAKK
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 15.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011598  bHLH_dom  
IPR047206  bHLHzip_scCBP1-like  
IPR036638  HLH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00010  HLH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50888  BHLH  
CDD cd11398  bHLHzip_scCBP1  
Amino Acid Sequences MAPYNSNGNGSAPTADDHTLANLLTTMAQQQPLPKKRGSNAAGARSSERTAAAPSSKKGGKKNADETPAAADKNVDSSATAKGKADGNKTNGTGPSTRNLSASIASQPHQQAPQPPTCNGRTGSAAQASTTIDPSATGGTTNASANPAERNDSRASSKNGSDADYSEDNDESYMANATAPATTNGKRKGKKNQARAAKKEASTTGASTGNANASTSAAGAAANGNGAAATNGDDEEGGEKLHTEQEWNRTRKDNHKEVERRRRETINEGINELKNIVPGCEKNKGSILSRAVQYIQQLKDREATLKDKEATLIEKWTLEKLLSDQTTSDLKREVEKLREELSIARMQNGKRGEVEGGGQYGGSEPKRSRLEGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.16
4 0.14
5 0.14
6 0.14
7 0.13
8 0.12
9 0.09
10 0.09
11 0.09
12 0.09
13 0.11
14 0.12
15 0.14
16 0.14
17 0.22
18 0.33
19 0.4
20 0.44
21 0.45
22 0.49
23 0.53
24 0.62
25 0.57
26 0.57
27 0.57
28 0.61
29 0.6
30 0.56
31 0.54
32 0.47
33 0.45
34 0.36
35 0.29
36 0.21
37 0.2
38 0.22
39 0.26
40 0.27
41 0.27
42 0.34
43 0.37
44 0.41
45 0.46
46 0.52
47 0.54
48 0.59
49 0.65
50 0.66
51 0.66
52 0.61
53 0.56
54 0.52
55 0.46
56 0.38
57 0.3
58 0.23
59 0.18
60 0.2
61 0.19
62 0.12
63 0.09
64 0.11
65 0.18
66 0.19
67 0.2
68 0.17
69 0.2
70 0.25
71 0.29
72 0.34
73 0.34
74 0.37
75 0.4
76 0.4
77 0.41
78 0.37
79 0.36
80 0.32
81 0.28
82 0.28
83 0.28
84 0.27
85 0.25
86 0.24
87 0.22
88 0.2
89 0.2
90 0.19
91 0.17
92 0.17
93 0.21
94 0.22
95 0.23
96 0.24
97 0.24
98 0.27
99 0.31
100 0.38
101 0.37
102 0.37
103 0.4
104 0.39
105 0.41
106 0.35
107 0.32
108 0.27
109 0.25
110 0.27
111 0.24
112 0.23
113 0.19
114 0.19
115 0.18
116 0.15
117 0.14
118 0.11
119 0.07
120 0.07
121 0.08
122 0.07
123 0.06
124 0.06
125 0.05
126 0.06
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.08
133 0.1
134 0.1
135 0.13
136 0.13
137 0.17
138 0.18
139 0.2
140 0.23
141 0.25
142 0.29
143 0.28
144 0.29
145 0.29
146 0.28
147 0.27
148 0.24
149 0.2
150 0.2
151 0.18
152 0.18
153 0.15
154 0.14
155 0.12
156 0.11
157 0.11
158 0.07
159 0.06
160 0.06
161 0.05
162 0.04
163 0.04
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.06
168 0.09
169 0.11
170 0.17
171 0.24
172 0.31
173 0.35
174 0.4
175 0.5
176 0.58
177 0.64
178 0.69
179 0.7
180 0.73
181 0.78
182 0.78
183 0.75
184 0.7
185 0.62
186 0.54
187 0.47
188 0.4
189 0.32
190 0.27
191 0.21
192 0.17
193 0.16
194 0.14
195 0.14
196 0.11
197 0.1
198 0.1
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.05
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.05
222 0.06
223 0.06
224 0.05
225 0.04
226 0.05
227 0.06
228 0.08
229 0.08
230 0.1
231 0.13
232 0.23
233 0.32
234 0.35
235 0.37
236 0.42
237 0.47
238 0.54
239 0.61
240 0.6
241 0.56
242 0.65
243 0.71
244 0.75
245 0.82
246 0.81
247 0.77
248 0.73
249 0.73
250 0.66
251 0.63
252 0.6
253 0.57
254 0.48
255 0.45
256 0.44
257 0.39
258 0.35
259 0.3
260 0.21
261 0.16
262 0.15
263 0.14
264 0.14
265 0.16
266 0.2
267 0.27
268 0.28
269 0.28
270 0.32
271 0.34
272 0.33
273 0.37
274 0.36
275 0.33
276 0.34
277 0.33
278 0.3
279 0.28
280 0.29
281 0.3
282 0.29
283 0.31
284 0.31
285 0.31
286 0.34
287 0.34
288 0.34
289 0.31
290 0.34
291 0.32
292 0.38
293 0.37
294 0.34
295 0.34
296 0.32
297 0.31
298 0.27
299 0.26
300 0.2
301 0.21
302 0.22
303 0.22
304 0.21
305 0.18
306 0.17
307 0.16
308 0.23
309 0.22
310 0.22
311 0.2
312 0.22
313 0.29
314 0.29
315 0.28
316 0.24
317 0.24
318 0.28
319 0.34
320 0.38
321 0.38
322 0.42
323 0.44
324 0.43
325 0.43
326 0.39
327 0.36
328 0.35
329 0.34
330 0.3
331 0.3
332 0.32
333 0.32
334 0.37
335 0.37
336 0.34
337 0.29
338 0.31
339 0.28
340 0.24
341 0.26
342 0.22
343 0.21
344 0.18
345 0.16
346 0.14
347 0.14
348 0.18
349 0.17
350 0.21
351 0.21
352 0.3
353 0.35