Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5H8J1

Protein Details
Accession U5H8J1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
130-156QAEAKTAKNRLKRQKKKHAQRTTSASGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
136-148AKNRLKRQKKKHA
Subcellular Location(s) nucl 17, mito_nucl 12.833, cyto_nucl 10.333, mito 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009548  Prkrip1  
Gene Ontology GO:0003725  F:double-stranded RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06658  DUF1168  
Amino Acid Sequences MASPSRSTSTPSTTTITTTTTTTSIPSSKELRHATPAQLQAAALQRLLKDTSKPVHIPSPPKEGVKQLRAPREMMRNVQGSSAGAGSGEFHVYKESRRREYERLKLMDEEEAYNKAKKAALDRQATYESQAEAKTAKNRLKRQKKKHAQRTTSASGAGEKADQVEEEKDDGAILGDKKRKLGSSTAASGGTFTFKSAKERQDEDQDEDEEAGPKDDDTQRIETINNGAFVQDAITVPQVAPAIEAGVKIVDDDDF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.31
3 0.28
4 0.23
5 0.21
6 0.2
7 0.17
8 0.17
9 0.16
10 0.18
11 0.18
12 0.19
13 0.22
14 0.25
15 0.26
16 0.35
17 0.38
18 0.38
19 0.42
20 0.44
21 0.44
22 0.46
23 0.48
24 0.4
25 0.36
26 0.33
27 0.29
28 0.31
29 0.27
30 0.21
31 0.19
32 0.17
33 0.19
34 0.21
35 0.19
36 0.17
37 0.22
38 0.25
39 0.29
40 0.31
41 0.31
42 0.36
43 0.4
44 0.46
45 0.44
46 0.49
47 0.47
48 0.48
49 0.46
50 0.48
51 0.5
52 0.5
53 0.53
54 0.51
55 0.56
56 0.56
57 0.56
58 0.53
59 0.54
60 0.5
61 0.46
62 0.44
63 0.38
64 0.37
65 0.34
66 0.3
67 0.21
68 0.18
69 0.15
70 0.09
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.07
76 0.06
77 0.06
78 0.08
79 0.09
80 0.14
81 0.21
82 0.27
83 0.32
84 0.38
85 0.44
86 0.51
87 0.59
88 0.64
89 0.64
90 0.6
91 0.56
92 0.51
93 0.46
94 0.4
95 0.32
96 0.24
97 0.17
98 0.17
99 0.17
100 0.17
101 0.16
102 0.14
103 0.15
104 0.15
105 0.19
106 0.24
107 0.31
108 0.34
109 0.35
110 0.37
111 0.37
112 0.36
113 0.32
114 0.25
115 0.17
116 0.14
117 0.13
118 0.11
119 0.1
120 0.12
121 0.15
122 0.2
123 0.25
124 0.31
125 0.4
126 0.51
127 0.61
128 0.7
129 0.76
130 0.82
131 0.87
132 0.91
133 0.93
134 0.93
135 0.87
136 0.83
137 0.81
138 0.73
139 0.64
140 0.53
141 0.42
142 0.32
143 0.27
144 0.21
145 0.13
146 0.08
147 0.08
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.08
152 0.08
153 0.09
154 0.09
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.07
159 0.08
160 0.09
161 0.14
162 0.19
163 0.19
164 0.21
165 0.23
166 0.25
167 0.25
168 0.28
169 0.29
170 0.29
171 0.32
172 0.32
173 0.31
174 0.29
175 0.26
176 0.22
177 0.18
178 0.12
179 0.1
180 0.12
181 0.12
182 0.19
183 0.25
184 0.31
185 0.34
186 0.38
187 0.42
188 0.48
189 0.51
190 0.5
191 0.48
192 0.43
193 0.38
194 0.35
195 0.32
196 0.24
197 0.2
198 0.16
199 0.12
200 0.11
201 0.16
202 0.18
203 0.21
204 0.23
205 0.26
206 0.27
207 0.28
208 0.28
209 0.24
210 0.26
211 0.25
212 0.22
213 0.18
214 0.17
215 0.15
216 0.15
217 0.14
218 0.1
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.1
223 0.1
224 0.12
225 0.12
226 0.1
227 0.11
228 0.09
229 0.1
230 0.1
231 0.1
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.08