Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5HHM8

Protein Details
Accession U5HHM8    Localization Confidence High Confidence Score 20.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
79-98AFKSSGKKRVARPKALSAKLHydrophilic
101-129ASSASKRKPSISARRAPRKKKIPAEGEDGHydrophilic
320-342EAETRKARKDKTRLKELKKTVEABasic
992-1059EDDERNEKTKRRRMARMMKIAMRWTATRIRLRARRVRRRARVARPQKPRRRRLSPNPRRPPPSSEPNDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-37GGGRRASGRVRKAPERLKPGTATAA
83-122SGKKRVARPKALSAKLAVASSASKRKPSISARRAPRKKKI
324-335RKARKDKTRLKE
624-631KGGRKGKG
999-1053KTKRRRMARMMKIAMRWTATRIRLRARRVRRRARVARPQKPRRRRLSPNPRRPPP
Subcellular Location(s) plas 13, nucl 10.5, cyto_nucl 7, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR039662  Cohesin_Scc3/SA  
IPR020839  SCD  
IPR013721  STAG  
Pfam View protein in Pfam  
PF08514  STAG  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51425  SCD  
Amino Acid Sequences MSSTSGDEGGPGGGGRRASGRVRKAPERLKPGTATAAKNKRTSISERDLNSQAEDEDEENEEEDDSMPSETESEEEAEAFKSSGKKRVARPKALSAKLAVASSASKRKPSISARRAPRKKKIPAEGEDGQAEGFALGALAKGDFKIKDDNSIFNAVRDRNSALETTVEDWFEQYSEEPGPAMAELVNFLLRSCGCNSSVDEHQAVDEDGVVETLSDIQDEFKNETSLAYPVVSRSAAYKKFRGSLSAFISKLFHSAASSDVLYESDFSNVILPWIVTLSSSKIRSFRHTATLFGMYSVAGLSATHAGVKKEHATANRAVEAETRKARKDKTRLKELKKTVEAIQNKQQQIEVTIKSLWDTIFVNRYRDTDAGIRSECIAAFSVLIKINPDYWIDGMHMRYIGWVLSDESKEPRREAVRALFSLYAKKAYIGAVQHFTERFKGPIVQMAIGDVDTTIRVQTIQVLRQLEDYGLLDEDQSDEIAKLIFETEPRVRRAAADFFIRVWTEEVAEREKEISTGREPSAAGKKKGSGVPEETKKQIRLKTLAEMLIKYGNAIDGIDDGEDDDEASGDGDTAKEADMADVKTHHGRVAFAVEALWDNLDTVQEWQSIMEFLLLDHSGASGKGGRKGKGRATQPAEGDKVEESCKLVEEEESLLVEVFVASITRVIAAAQATSKKGKEQDDEVQADVTRAVIEALPRLFAKHQMVLARIIDILAIPRLLLLDVYLDLRMVTAYEGLWDAVTTQFFKHSDSDVLDQATQTIMYLRKASSLANTNTEKMAGLEEKLVSTLREVVAGKDLESDGFEEDELHAVTACFARFDRLYKVVDLSEALQNDDKGKQNSVMEIVESVVERGRLGYKDEAAMVQHALSIQGTFVMWETLNLTKKAAENDQTDYGAIASLVERRGNMVDKLEEFSVGQTSNAAEGVKQKALVILLDAHILSCAITSAKSDPDGKLTDLRLTCSDELQSRCAGVVEAEIERRCEELQAFWAEDDERNEKTKRRRMARMMKIAMRWTATRIRLRARRVRRRARVARPQKPRRRRLSPNPRRPPPSSEPNDSRSRPV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.11
3 0.14
4 0.18
5 0.26
6 0.35
7 0.43
8 0.49
9 0.57
10 0.65
11 0.71
12 0.76
13 0.78
14 0.78
15 0.74
16 0.71
17 0.66
18 0.62
19 0.61
20 0.58
21 0.55
22 0.56
23 0.6
24 0.6
25 0.61
26 0.6
27 0.55
28 0.54
29 0.55
30 0.54
31 0.53
32 0.55
33 0.54
34 0.57
35 0.57
36 0.53
37 0.48
38 0.4
39 0.31
40 0.25
41 0.24
42 0.18
43 0.16
44 0.17
45 0.16
46 0.15
47 0.15
48 0.14
49 0.12
50 0.12
51 0.11
52 0.1
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.09
57 0.08
58 0.09
59 0.09
60 0.1
61 0.1
62 0.1
63 0.11
64 0.12
65 0.12
66 0.11
67 0.13
68 0.19
69 0.22
70 0.3
71 0.37
72 0.43
73 0.52
74 0.63
75 0.7
76 0.73
77 0.76
78 0.79
79 0.81
80 0.78
81 0.71
82 0.62
83 0.57
84 0.49
85 0.42
86 0.31
87 0.22
88 0.22
89 0.25
90 0.32
91 0.29
92 0.31
93 0.33
94 0.36
95 0.43
96 0.5
97 0.56
98 0.57
99 0.64
100 0.71
101 0.8
102 0.88
103 0.88
104 0.89
105 0.88
106 0.88
107 0.89
108 0.88
109 0.86
110 0.81
111 0.8
112 0.73
113 0.66
114 0.56
115 0.47
116 0.36
117 0.26
118 0.21
119 0.12
120 0.08
121 0.04
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.04
126 0.04
127 0.05
128 0.05
129 0.09
130 0.1
131 0.12
132 0.21
133 0.21
134 0.3
135 0.32
136 0.35
137 0.35
138 0.42
139 0.4
140 0.34
141 0.39
142 0.32
143 0.32
144 0.31
145 0.29
146 0.24
147 0.25
148 0.23
149 0.18
150 0.18
151 0.18
152 0.18
153 0.17
154 0.16
155 0.14
156 0.14
157 0.13
158 0.12
159 0.11
160 0.09
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.09
166 0.1
167 0.09
168 0.09
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.07
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.1
177 0.09
178 0.12
179 0.14
180 0.16
181 0.16
182 0.18
183 0.21
184 0.23
185 0.26
186 0.27
187 0.25
188 0.22
189 0.21
190 0.2
191 0.18
192 0.13
193 0.1
194 0.07
195 0.07
196 0.06
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.07
205 0.09
206 0.12
207 0.14
208 0.15
209 0.16
210 0.16
211 0.16
212 0.16
213 0.15
214 0.13
215 0.11
216 0.1
217 0.1
218 0.12
219 0.11
220 0.1
221 0.13
222 0.2
223 0.27
224 0.32
225 0.36
226 0.37
227 0.42
228 0.43
229 0.44
230 0.39
231 0.39
232 0.41
233 0.43
234 0.39
235 0.35
236 0.36
237 0.3
238 0.29
239 0.22
240 0.16
241 0.1
242 0.1
243 0.11
244 0.11
245 0.11
246 0.1
247 0.1
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.08
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.07
259 0.07
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.05
264 0.06
265 0.1
266 0.15
267 0.17
268 0.19
269 0.23
270 0.26
271 0.32
272 0.38
273 0.37
274 0.41
275 0.4
276 0.4
277 0.39
278 0.4
279 0.33
280 0.27
281 0.24
282 0.14
283 0.13
284 0.11
285 0.08
286 0.04
287 0.04
288 0.05
289 0.06
290 0.06
291 0.08
292 0.09
293 0.1
294 0.11
295 0.14
296 0.15
297 0.18
298 0.21
299 0.22
300 0.25
301 0.29
302 0.32
303 0.32
304 0.29
305 0.26
306 0.27
307 0.28
308 0.3
309 0.32
310 0.31
311 0.33
312 0.38
313 0.43
314 0.49
315 0.56
316 0.6
317 0.62
318 0.71
319 0.77
320 0.8
321 0.84
322 0.82
323 0.8
324 0.73
325 0.68
326 0.62
327 0.6
328 0.57
329 0.52
330 0.54
331 0.52
332 0.49
333 0.47
334 0.42
335 0.34
336 0.32
337 0.32
338 0.24
339 0.18
340 0.18
341 0.17
342 0.16
343 0.17
344 0.14
345 0.11
346 0.11
347 0.11
348 0.18
349 0.19
350 0.22
351 0.22
352 0.23
353 0.24
354 0.23
355 0.24
356 0.21
357 0.21
358 0.22
359 0.22
360 0.21
361 0.19
362 0.19
363 0.16
364 0.13
365 0.11
366 0.08
367 0.08
368 0.08
369 0.1
370 0.1
371 0.1
372 0.1
373 0.1
374 0.1
375 0.11
376 0.11
377 0.1
378 0.09
379 0.1
380 0.1
381 0.12
382 0.12
383 0.11
384 0.11
385 0.1
386 0.1
387 0.09
388 0.08
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.09
393 0.1
394 0.11
395 0.15
396 0.2
397 0.21
398 0.21
399 0.25
400 0.25
401 0.26
402 0.29
403 0.31
404 0.31
405 0.3
406 0.31
407 0.28
408 0.26
409 0.28
410 0.25
411 0.19
412 0.15
413 0.15
414 0.13
415 0.12
416 0.15
417 0.13
418 0.15
419 0.16
420 0.17
421 0.18
422 0.18
423 0.18
424 0.18
425 0.17
426 0.15
427 0.13
428 0.15
429 0.13
430 0.18
431 0.18
432 0.16
433 0.15
434 0.15
435 0.14
436 0.11
437 0.11
438 0.06
439 0.04
440 0.04
441 0.04
442 0.04
443 0.03
444 0.04
445 0.04
446 0.09
447 0.12
448 0.13
449 0.17
450 0.18
451 0.18
452 0.19
453 0.2
454 0.14
455 0.13
456 0.11
457 0.08
458 0.07
459 0.07
460 0.06
461 0.05
462 0.06
463 0.05
464 0.05
465 0.04
466 0.04
467 0.04
468 0.05
469 0.04
470 0.04
471 0.04
472 0.05
473 0.05
474 0.09
475 0.14
476 0.18
477 0.2
478 0.2
479 0.2
480 0.21
481 0.24
482 0.23
483 0.2
484 0.19
485 0.18
486 0.17
487 0.18
488 0.17
489 0.14
490 0.12
491 0.1
492 0.08
493 0.09
494 0.1
495 0.11
496 0.11
497 0.11
498 0.11
499 0.11
500 0.11
501 0.1
502 0.11
503 0.1
504 0.14
505 0.14
506 0.14
507 0.14
508 0.17
509 0.26
510 0.28
511 0.28
512 0.26
513 0.27
514 0.29
515 0.31
516 0.29
517 0.23
518 0.24
519 0.29
520 0.33
521 0.34
522 0.34
523 0.35
524 0.37
525 0.39
526 0.36
527 0.34
528 0.33
529 0.32
530 0.33
531 0.32
532 0.32
533 0.28
534 0.24
535 0.21
536 0.18
537 0.16
538 0.13
539 0.1
540 0.07
541 0.06
542 0.05
543 0.05
544 0.03
545 0.04
546 0.04
547 0.04
548 0.03
549 0.03
550 0.03
551 0.03
552 0.03
553 0.03
554 0.03
555 0.03
556 0.03
557 0.03
558 0.03
559 0.03
560 0.03
561 0.03
562 0.04
563 0.04
564 0.04
565 0.04
566 0.06
567 0.07
568 0.07
569 0.08
570 0.09
571 0.11
572 0.11
573 0.12
574 0.1
575 0.1
576 0.11
577 0.12
578 0.11
579 0.09
580 0.09
581 0.08
582 0.08
583 0.07
584 0.07
585 0.04
586 0.04
587 0.04
588 0.04
589 0.04
590 0.05
591 0.07
592 0.07
593 0.07
594 0.07
595 0.07
596 0.07
597 0.07
598 0.06
599 0.05
600 0.04
601 0.06
602 0.06
603 0.05
604 0.05
605 0.05
606 0.05
607 0.05
608 0.06
609 0.08
610 0.09
611 0.16
612 0.2
613 0.22
614 0.27
615 0.32
616 0.39
617 0.42
618 0.45
619 0.47
620 0.49
621 0.51
622 0.48
623 0.48
624 0.42
625 0.35
626 0.32
627 0.24
628 0.19
629 0.16
630 0.14
631 0.11
632 0.1
633 0.1
634 0.1
635 0.1
636 0.08
637 0.09
638 0.09
639 0.09
640 0.08
641 0.08
642 0.07
643 0.06
644 0.06
645 0.04
646 0.03
647 0.03
648 0.03
649 0.03
650 0.03
651 0.03
652 0.03
653 0.04
654 0.04
655 0.05
656 0.05
657 0.06
658 0.07
659 0.09
660 0.11
661 0.13
662 0.14
663 0.15
664 0.2
665 0.24
666 0.25
667 0.29
668 0.34
669 0.39
670 0.4
671 0.37
672 0.33
673 0.29
674 0.27
675 0.21
676 0.14
677 0.07
678 0.05
679 0.05
680 0.05
681 0.05
682 0.08
683 0.08
684 0.09
685 0.09
686 0.11
687 0.11
688 0.15
689 0.17
690 0.17
691 0.19
692 0.2
693 0.22
694 0.22
695 0.22
696 0.18
697 0.15
698 0.13
699 0.1
700 0.08
701 0.07
702 0.06
703 0.05
704 0.04
705 0.04
706 0.05
707 0.05
708 0.04
709 0.04
710 0.04
711 0.05
712 0.06
713 0.05
714 0.05
715 0.05
716 0.05
717 0.05
718 0.05
719 0.04
720 0.04
721 0.04
722 0.05
723 0.05
724 0.05
725 0.05
726 0.05
727 0.05
728 0.06
729 0.07
730 0.08
731 0.08
732 0.11
733 0.11
734 0.14
735 0.15
736 0.15
737 0.17
738 0.19
739 0.21
740 0.2
741 0.21
742 0.19
743 0.17
744 0.16
745 0.13
746 0.1
747 0.07
748 0.09
749 0.09
750 0.1
751 0.12
752 0.12
753 0.14
754 0.15
755 0.16
756 0.17
757 0.23
758 0.24
759 0.28
760 0.3
761 0.29
762 0.29
763 0.28
764 0.24
765 0.17
766 0.17
767 0.12
768 0.11
769 0.12
770 0.12
771 0.12
772 0.12
773 0.12
774 0.09
775 0.09
776 0.11
777 0.09
778 0.13
779 0.13
780 0.13
781 0.18
782 0.18
783 0.17
784 0.16
785 0.16
786 0.12
787 0.13
788 0.13
789 0.09
790 0.09
791 0.08
792 0.07
793 0.08
794 0.09
795 0.09
796 0.08
797 0.07
798 0.07
799 0.08
800 0.09
801 0.08
802 0.08
803 0.08
804 0.11
805 0.13
806 0.16
807 0.2
808 0.22
809 0.24
810 0.24
811 0.26
812 0.23
813 0.22
814 0.2
815 0.18
816 0.17
817 0.16
818 0.16
819 0.16
820 0.16
821 0.18
822 0.21
823 0.24
824 0.23
825 0.24
826 0.26
827 0.26
828 0.27
829 0.27
830 0.23
831 0.18
832 0.16
833 0.15
834 0.12
835 0.11
836 0.1
837 0.08
838 0.08
839 0.08
840 0.09
841 0.12
842 0.12
843 0.16
844 0.18
845 0.18
846 0.19
847 0.2
848 0.2
849 0.17
850 0.17
851 0.14
852 0.11
853 0.1
854 0.09
855 0.08
856 0.08
857 0.07
858 0.06
859 0.06
860 0.05
861 0.05
862 0.06
863 0.07
864 0.06
865 0.07
866 0.09
867 0.14
868 0.19
869 0.19
870 0.19
871 0.2
872 0.23
873 0.27
874 0.3
875 0.3
876 0.3
877 0.34
878 0.36
879 0.34
880 0.32
881 0.28
882 0.22
883 0.16
884 0.13
885 0.08
886 0.06
887 0.09
888 0.11
889 0.11
890 0.11
891 0.13
892 0.16
893 0.19
894 0.19
895 0.2
896 0.21
897 0.22
898 0.25
899 0.23
900 0.21
901 0.18
902 0.18
903 0.17
904 0.14
905 0.12
906 0.1
907 0.1
908 0.1
909 0.11
910 0.1
911 0.08
912 0.13
913 0.18
914 0.18
915 0.18
916 0.17
917 0.18
918 0.19
919 0.18
920 0.15
921 0.12
922 0.11
923 0.12
924 0.12
925 0.1
926 0.1
927 0.09
928 0.08
929 0.06
930 0.06
931 0.05
932 0.05
933 0.08
934 0.1
935 0.12
936 0.16
937 0.19
938 0.19
939 0.24
940 0.26
941 0.27
942 0.3
943 0.29
944 0.34
945 0.32
946 0.34
947 0.31
948 0.34
949 0.33
950 0.29
951 0.31
952 0.3
953 0.32
954 0.31
955 0.29
956 0.24
957 0.24
958 0.22
959 0.19
960 0.13
961 0.12
962 0.12
963 0.13
964 0.17
965 0.18
966 0.19
967 0.2
968 0.21
969 0.2
970 0.2
971 0.19
972 0.17
973 0.21
974 0.23
975 0.24
976 0.22
977 0.23
978 0.22
979 0.24
980 0.26
981 0.25
982 0.24
983 0.27
984 0.32
985 0.38
986 0.47
987 0.53
988 0.58
989 0.64
990 0.71
991 0.78
992 0.85
993 0.87
994 0.88
995 0.87
996 0.83
997 0.78
998 0.72
999 0.64
1000 0.57
1001 0.47
1002 0.42
1003 0.41
1004 0.43
1005 0.46
1006 0.48
1007 0.55
1008 0.59
1009 0.68
1010 0.73
1011 0.76
1012 0.8
1013 0.83
1014 0.88
1015 0.89
1016 0.92
1017 0.93
1018 0.94
1019 0.94
1020 0.94
1021 0.93
1022 0.93
1023 0.94
1024 0.94
1025 0.94
1026 0.94
1027 0.93
1028 0.92
1029 0.92
1030 0.93
1031 0.93
1032 0.93
1033 0.94
1034 0.94
1035 0.94
1036 0.91
1037 0.85
1038 0.83
1039 0.8
1040 0.8
1041 0.76
1042 0.75
1043 0.72
1044 0.71
1045 0.76