Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

U5HHM8

Protein Details
Accession U5HHM8    Localization Confidence High Confidence Score 20.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
79-98AFKSSGKKRVARPKALSAKLHydrophilic
101-129ASSASKRKPSISARRAPRKKKIPAEGEDGHydrophilic
320-342EAETRKARKDKTRLKELKKTVEABasic
992-1059EDDERNEKTKRRRMARMMKIAMRWTATRIRLRARRVRRRARVARPQKPRRRRLSPNPRRPPPSSEPNDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-37GGGRRASGRVRKAPERLKPGTATAA
83-122SGKKRVARPKALSAKLAVASSASKRKPSISARRAPRKKKI
324-335RKARKDKTRLKE
624-631KGGRKGKG
999-1053KTKRRRMARMMKIAMRWTATRIRLRARRVRRRARVARPQKPRRRRLSPNPRRPPP
Subcellular Location(s) plas 13, nucl 10.5, cyto_nucl 7, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR039662  Cohesin_Scc3/SA  
IPR020839  SCD  
IPR013721  STAG  
Pfam View protein in Pfam  
PF08514  STAG  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51425  SCD  
Amino Acid Sequences MSSTSGDEGGPGGGGRRASGRVRKAPERLKPGTATAAKNKRTSISERDLNSQAEDEDEENEEEDDSMPSETESEEEAEAFKSSGKKRVARPKALSAKLAVASSASKRKPSISARRAPRKKKIPAEGEDGQAEGFALGALAKGDFKIKDDNSIFNAVRDRNSALETTVEDWFEQYSEEPGPAMAELVNFLLRSCGCNSSVDEHQAVDEDGVVETLSDIQDEFKNETSLAYPVVSRSAAYKKFRGSLSAFISKLFHSAASSDVLYESDFSNVILPWIVTLSSSKIRSFRHTATLFGMYSVAGLSATHAGVKKEHATANRAVEAETRKARKDKTRLKELKKTVEAIQNKQQQIEVTIKSLWDTIFVNRYRDTDAGIRSECIAAFSVLIKINPDYWIDGMHMRYIGWVLSDESKEPRREAVRALFSLYAKKAYIGAVQHFTERFKGPIVQMAIGDVDTTIRVQTIQVLRQLEDYGLLDEDQSDEIAKLIFETEPRVRRAAADFFIRVWTEEVAEREKEISTGREPSAAGKKKGSGVPEETKKQIRLKTLAEMLIKYGNAIDGIDDGEDDDEASGDGDTAKEADMADVKTHHGRVAFAVEALWDNLDTVQEWQSIMEFLLLDHSGASGKGGRKGKGRATQPAEGDKVEESCKLVEEEESLLVEVFVASITRVIAAAQATSKKGKEQDDEVQADVTRAVIEALPRLFAKHQMVLARIIDILAIPRLLLLDVYLDLRMVTAYEGLWDAVTTQFFKHSDSDVLDQATQTIMYLRKASSLANTNTEKMAGLEEKLVSTLREVVAGKDLESDGFEEDELHAVTACFARFDRLYKVVDLSEALQNDDKGKQNSVMEIVESVVERGRLGYKDEAAMVQHALSIQGTFVMWETLNLTKKAAENDQTDYGAIASLVERRGNMVDKLEEFSVGQTSNAAEGVKQKALVILLDAHILSCAITSAKSDPDGKLTDLRLTCSDELQSRCAGVVEAEIERRCEELQAFWAEDDERNEKTKRRRMARMMKIAMRWTATRIRLRARRVRRRARVARPQKPRRRRLSPNPRRPPPSSEPNDSRSRPV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.11
3 0.14
4 0.18
5 0.26
6 0.35
7 0.43
8 0.49
9 0.57
10 0.65
11 0.71
12 0.76
13 0.78
14 0.78
15 0.74
16 0.71
17 0.66
18 0.62
19 0.61
20 0.58
21 0.55
22 0.56
23 0.6
24 0.6
25 0.61
26 0.6
27 0.55
28 0.54
29 0.55
30 0.54
31 0.53
32 0.55
33 0.54
34 0.57
35 0.57
36 0.53
37 0.48
38 0.4
39 0.31
40 0.25
41 0.24
42 0.18
43 0.16
44 0.17
45 0.16
46 0.15
47 0.15
48 0.14
49 0.12
50 0.12
51 0.11
52 0.1
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.09
57 0.08
58 0.09
59 0.09
60 0.1
61 0.1
62 0.1
63 0.11
64 0.12
65 0.12
66 0.11
67 0.13
68 0.19
69 0.22
70 0.3
71 0.37
72 0.43
73 0.52
74 0.63
75 0.7
76 0.73
77 0.76
78 0.79
79 0.81
80 0.78
81 0.71
82 0.62
83 0.57
84 0.49
85 0.42
86 0.31
87 0.22
88 0.22
89 0.25
90 0.32
91 0.29
92 0.31
93 0.33
94 0.36
95 0.43
96 0.5
97 0.56
98 0.57
99 0.64
100 0.71
101 0.8
102 0.88
103 0.88
104 0.89
105 0.88
106 0.88
107 0.89
108 0.88
109 0.86
110 0.81
111 0.8
112 0.73
113 0.66
114 0.56
115 0.47
116 0.36
117 0.26
118 0.21
119 0.12
120 0.08
121 0.04
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.04
126 0.04
127 0.05
128 0.05
129 0.09
130 0.1
131 0.12
132 0.21
133 0.21
134 0.3
135 0.32
136 0.35
137 0.35
138 0.42
139 0.4
140 0.34
141 0.39
142 0.32
143 0.32
144 0.31
145 0.29
146 0.24
147 0.25
148 0.23
149 0.18
150 0.18
151 0.18
152 0.18
153 0.17
154 0.16
155 0.14
156 0.14
157 0.13
158 0.12
159 0.11
160 0.09
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.09
166 0.1
167 0.09
168 0.09
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.07
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.1
177 0.09
178 0.12
179 0.14
180 0.16
181 0.16
182 0.18
183 0.21
184 0.23
185 0.26
186 0.27
187 0.25
188 0.22
189 0.21
190 0.2
191 0.18
192 0.13
193 0.1
194 0.07
195 0.07
196 0.06
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.07
205 0.09
206 0.12
207 0.14
208 0.15
209 0.16
210 0.16
211 0.16
212 0.16
213 0.15
214 0.13
215 0.11
216 0.1
217 0.1
218 0.12
219 0.11
220 0.1
221 0.13
222 0.2
223 0.27
224 0.32
225 0.36
226 0.37
227 0.42
228 0.43
229 0.44
230 0.39
231 0.39
232 0.41
233 0.43
234 0.39
235 0.35
236 0.36
237 0.3
238 0.29
239 0.22
240 0.16
241 0.1
242 0.1
243 0.11
244 0.11
245 0.11
246 0.1
247 0.1
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.08
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.07
259 0.07
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.05
264 0.06
265 0.1
266 0.15
267 0.17
268 0.19
269 0.23
270 0.26
271 0.32
272 0.38
273 0.37
274 0.41
275 0.4
276 0.4
277 0.39
278 0.4
279 0.33
280 0.27
281 0.24
282 0.14
283 0.13
284 0.11
285 0.08
286 0.04
287 0.04
288 0.05
289 0.06
290 0.06
291 0.08
292 0.09
293 0.1
294 0.11
295 0.14
296 0.15
297 0.18
298 0.21
299 0.22
300 0.25
301 0.29
302 0.32
303 0.32
304 0.29
305 0.26
306 0.27
307 0.28
308 0.3
309 0.32
310 0.31
311 0.33
312 0.38
313 0.43
314 0.49
315 0.56
316 0.6
317 0.62
318 0.71
319 0.77
320 0.8
321 0.84
322 0.82
323 0.8
324 0.73
325 0.68
326 0.62
327 0.6
328 0.57
329 0.52
330 0.54
331 0.52
332 0.49
333 0.47
334 0.42
335 0.34
336 0.32
337 0.32
338 0.24
339 0.18
340 0.18
341 0.17
342 0.16
343 0.17
344 0.14
345 0.11
346 0.11
347 0.11
348 0.18
349 0.19
350 0.22
351 0.22
352 0.23
353 0.24
354 0.23
355 0.24
356 0.21
357 0.21
358 0.22
359 0.22
360 0.21
361 0.19
362 0.19
363 0.16
364 0.13
365 0.11
366 0.08
367 0.08
368 0.08
369 0.1
370 0.1
371 0.1
372 0.1
373 0.1
374 0.1
375 0.11
376 0.11
377 0.1
378 0.09
379 0.1
380 0.1
381 0.12
382 0.12
383 0.11
384 0.11
385 0.1
386 0.1
387 0.09
388 0.08
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.09
393 0.1
394 0.11
395 0.15
396 0.2
397 0.21
398 0.21
399 0.25
400 0.25
401 0.26
402 0.29
403 0.31
404 0.31
405 0.3
406 0.31
407 0.28
408 0.26
409 0.28
410 0.25
411 0.19
412 0.15
413 0.15
414 0.13
415 0.12
416 0.15
417 0.13
418 0.15
419 0.16
420 0.17
421 0.18
422 0.18
423 0.18
424 0.18
425 0.17
426 0.15
427 0.13
428 0.15
429 0.13
430 0.18
431 0.18
432 0.16
433 0.15
434 0.15
435 0.14
436 0.11
437 0.11
438 0.06
439 0.04
440 0.04
441 0.04
442 0.04
443 0.03
444 0.04
445 0.04
446 0.09
447 0.12
448 0.13
449 0.17
450 0.18
451 0.18
452 0.19
453 0.2
454 0.14
455 0.13
456 0.11
457 0.08
458 0.07
459 0.07
460 0.06
461 0.05
462 0.06
463 0.05
464 0.05
465 0.04
466 0.04
467 0.04
468 0.05
469 0.04
470 0.04
471 0.04
472 0.05
473 0.05
474 0.09
475 0.14
476 0.18
477 0.2
478 0.2
479 0.2
480 0.21
481 0.24
482 0.23
483 0.2
484 0.19
485 0.18
486 0.17
487 0.18
488 0.17
489 0.14
490 0.12
491 0.1
492 0.08
493 0.09
494 0.1
495 0.11
496 0.11
497 0.11
498 0.11
499 0.11
500 0.11
501 0.1
502 0.11
503 0.1
504 0.14
505 0.14
506 0.14
507 0.14
508 0.17
509 0.26
510 0.28
511 0.28
512 0.26
513 0.27
514 0.29
515 0.31
516 0.29
517 0.23
518 0.24
519 0.29
520 0.33
521 0.34
522 0.34
523 0.35
524 0.37
525 0.39
526 0.36
527 0.34
528 0.33
529 0.32
530 0.33
531 0.32
532 0.32
533 0.28
534 0.24
535 0.21
536 0.18
537 0.16
538 0.13
539 0.1
540 0.07
541 0.06
542 0.05
543 0.05
544 0.03
545 0.04
546 0.04
547 0.04
548 0.03
549 0.03
550 0.03
551 0.03
552 0.03
553 0.03
554 0.03
555 0.03
556 0.03
557 0.03
558 0.03
559 0.03
560 0.03
561 0.03
562 0.04
563 0.04
564 0.04
565 0.04
566 0.06
567 0.07
568 0.07
569 0.08
570 0.09
571 0.11
572 0.11
573 0.12
574 0.1
575 0.1
576 0.11
577 0.12
578 0.11
579 0.09
580 0.09
581 0.08
582 0.08
583 0.07
584 0.07
585 0.04
586 0.04
587 0.04
588 0.04
589 0.04
590 0.05
591 0.07
592 0.07
593 0.07
594 0.07
595 0.07
596 0.07
597 0.07
598 0.06
599 0.05
600 0.04
601 0.06
602 0.06
603 0.05
604 0.05
605 0.05
606 0.05
607 0.05
608 0.06
609 0.08
610 0.09
611 0.16
612 0.2
613 0.22
614 0.27
615 0.32
616 0.39
617 0.42
618 0.45
619 0.47
620 0.49
621 0.51
622 0.48
623 0.48
624 0.42
625 0.35
626 0.32
627 0.24
628 0.19
629 0.16
630 0.14
631 0.11
632 0.1
633 0.1
634 0.1
635 0.1
636 0.08
637 0.09
638 0.09
639 0.09
640 0.08
641 0.08
642 0.07
643 0.06
644 0.06
645 0.04
646 0.03
647 0.03
648 0.03
649 0.03
650 0.03
651 0.03
652 0.03
653 0.04
654 0.04
655 0.05
656 0.05
657 0.06
658 0.07
659 0.09
660 0.11
661 0.13
662 0.14
663 0.15
664 0.2
665 0.24
666 0.25
667 0.29
668 0.34
669 0.39
670 0.4
671 0.37
672 0.33
673 0.29
674 0.27
675 0.21
676 0.14
677 0.07
678 0.05
679 0.05
680 0.05
681 0.05
682 0.08
683 0.08
684 0.09
685 0.09
686 0.11
687 0.11
688 0.15
689 0.17
690 0.17
691 0.19
692 0.2
693 0.22
694 0.22
695 0.22
696 0.18
697 0.15
698 0.13
699 0.1
700 0.08
701 0.07
702 0.06
703 0.05
704 0.04
705 0.04
706 0.05
707 0.05
708 0.04
709 0.04
710 0.04
711 0.05
712 0.06
713 0.05
714 0.05
715 0.05
716 0.05
717 0.05
718 0.05
719 0.04
720 0.04
721 0.04
722 0.05
723 0.05
724 0.05
725 0.05
726 0.05
727 0.05
728 0.06
729 0.07
730 0.08
731 0.08
732 0.11
733 0.11
734 0.14
735 0.15
736 0.15
737 0.17
738 0.19
739 0.21
740 0.2
741 0.21
742 0.19
743 0.17
744 0.16
745 0.13
746 0.1
747 0.07
748 0.09
749 0.09
750 0.1
751 0.12
752 0.12
753 0.14
754 0.15
755 0.16
756 0.17
757 0.23
758 0.24
759 0.28
760 0.3
761 0.29
762 0.29
763 0.28
764 0.24
765 0.17
766 0.17
767 0.12
768 0.11
769 0.12
770 0.12
771 0.12
772 0.12
773 0.12
774 0.09
775 0.09
776 0.11
777 0.09
778 0.13
779 0.13
780 0.13
781 0.18
782 0.18
783 0.17
784 0.16
785 0.16
786 0.12
787 0.13
788 0.13
789 0.09
790 0.09
791 0.08
792 0.07
793 0.08
794 0.09
795 0.09
796 0.08
797 0.07
798 0.07
799 0.08
800 0.09
801 0.08
802 0.08
803 0.08
804 0.11
805 0.13
806 0.16
807 0.2
808 0.22
809 0.24
810 0.24
811 0.26
812 0.23
813 0.22
814 0.2
815 0.18
816 0.17
817 0.16
818 0.16
819 0.16
820 0.16
821 0.18
822 0.21
823 0.24
824 0.23
825 0.24
826 0.26
827 0.26
828 0.27
829 0.27
830 0.23
831 0.18
832 0.16
833 0.15
834 0.12
835 0.11
836 0.1
837 0.08
838 0.08
839 0.08
840 0.09
841 0.12
842 0.12
843 0.16
844 0.18
845 0.18
846 0.19
847 0.2
848 0.2
849 0.17
850 0.17
851 0.14
852 0.11
853 0.1
854 0.09
855 0.08
856 0.08
857 0.07
858 0.06
859 0.06
860 0.05
861 0.05
862 0.06
863 0.07
864 0.06
865 0.07
866 0.09
867 0.14
868 0.19
869 0.19
870 0.19
871 0.2
872 0.23
873 0.27
874 0.3
875 0.3
876 0.3
877 0.34
878 0.36
879 0.34
880 0.32
881 0.28
882 0.22
883 0.16
884 0.13
885 0.08
886 0.06
887 0.09
888 0.11
889 0.11
890 0.11
891 0.13
892 0.16
893 0.19
894 0.19
895 0.2
896 0.21
897 0.22
898 0.25
899 0.23
900 0.21
901 0.18
902 0.18
903 0.17
904 0.14
905 0.12
906 0.1
907 0.1
908 0.1
909 0.11
910 0.1
911 0.08
912 0.13
913 0.18
914 0.18
915 0.18
916 0.17
917 0.18
918 0.19
919 0.18
920 0.15
921 0.12
922 0.11
923 0.12
924 0.12
925 0.1
926 0.1
927 0.09
928 0.08
929 0.06
930 0.06
931 0.05
932 0.05
933 0.08
934 0.1
935 0.12
936 0.16
937 0.19
938 0.19
939 0.24
940 0.26
941 0.27
942 0.3
943 0.29
944 0.34
945 0.32
946 0.34
947 0.31
948 0.34
949 0.33
950 0.29
951 0.31
952 0.3
953 0.32
954 0.31
955 0.29
956 0.24
957 0.24
958 0.22
959 0.19
960 0.13
961 0.12
962 0.12
963 0.13
964 0.17
965 0.18
966 0.19
967 0.2
968 0.21
969 0.2
970 0.2
971 0.19
972 0.17
973 0.21
974 0.23
975 0.24
976 0.22
977 0.23
978 0.22
979 0.24
980 0.26
981 0.25
982 0.24
983 0.27
984 0.32
985 0.38
986 0.47
987 0.53
988 0.58
989 0.64
990 0.71
991 0.78
992 0.85
993 0.87
994 0.88
995 0.87
996 0.83
997 0.78
998 0.72
999 0.64
1000 0.57
1001 0.47
1002 0.42
1003 0.41
1004 0.43
1005 0.46
1006 0.48
1007 0.55
1008 0.59
1009 0.68
1010 0.73
1011 0.76
1012 0.8
1013 0.83
1014 0.88
1015 0.89
1016 0.92
1017 0.93
1018 0.94
1019 0.94
1020 0.94
1021 0.93
1022 0.93
1023 0.94
1024 0.94
1025 0.94
1026 0.94
1027 0.93
1028 0.92
1029 0.92
1030 0.93
1031 0.93
1032 0.93
1033 0.94
1034 0.94
1035 0.94
1036 0.91
1037 0.85
1038 0.83
1039 0.8
1040 0.8
1041 0.76
1042 0.75
1043 0.72
1044 0.71
1045 0.76