FuNGI

U5HFT6

Protein Details

Accession

U5HFT6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
462-488	NGASGDGRKRGKKRDRGGKGDERDRDD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
466-510	GDGRKRGKKRDRGGKGDERDRDDDEREAGMPRMGGGGGKKLKGRR

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 14, nucl 13.5, cyto 11.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR044765 DDX47/Rrp3_DEADc IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR000629 RNA-helicase_DEAD-box_CS IPR014014 RNA_helicase_DEAD_Q_motif
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0005524 F:ATP binding GO:0016787 F:hydrolase activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0000462 P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF00271 Helicase_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS00039 DEAD_ATP_HELICASE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER PS51195 Q_MOTIF
CDD	cd17954 DEADc_DDX47 cd18787 SF2_C_DEAD

Amino Acid Sequences

MSDSDSESVSGSGPGSASGASSSSSRASSPQVTRATSSSSTKPIAQDAVTTSPEPATAKSATPTPSFADLGIIEPLCAACASLNFTCPTEIQRECIPYGLQGKDIIGLAQTGSGKTAAFALPILQALWDQPQGLFACVLAPTRELAYQIAEQFLALGSGIGVRVATIVGGIDTMSQQVALAKKPHIIVATPGRLQDHLENTKGFSLRTLKYLVMDEADRLLDLDFGPVIDKILKLIPREERHTYLFSATMTTKVAKLQRASLRDPVKLEVSSKYQTVSTLLQYYLLVPMKHKDLHLVHLAHILSGNTIIIFVRTVLDAQRLSIILRLLSFPAVPLHGQLSQSARLGALNKFKSGSRSILVATDVASRGLDIPAVDCVINFDLPTHSKDYIHRVGRTARAGRSGKSISLVTQYDVELFQRIEGVIGKKMDEYPLGGGGKEQVMLLAERVGEASREAARELKENGASGDGRKRGKKRDRGGKGDERDRDDDEREAGMPRMGGGGGKKLKGRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.09
2	0.09
3	0.08
4	0.08
5	0.08
6	0.08
7	0.08
8	0.09
9	0.11
10	0.12
11	0.13
12	0.13
13	0.15
14	0.2
15	0.27
16	0.31
17	0.37
18	0.4
19	0.42
20	0.43
21	0.43
22	0.43
23	0.39
24	0.4
25	0.37
26	0.37
27	0.37
28	0.38
29	0.38
30	0.35
31	0.34
32	0.3
33	0.28
34	0.26
35	0.29
36	0.28
37	0.26
38	0.24
39	0.21
40	0.22
41	0.21
42	0.18
43	0.17
44	0.16
45	0.17
46	0.18
47	0.23
48	0.25
49	0.25
50	0.26
51	0.25
52	0.27
53	0.26
54	0.24
55	0.22
56	0.18
57	0.18
58	0.19
59	0.16
60	0.12
61	0.12
62	0.11
63	0.1
64	0.09
65	0.07
66	0.05
67	0.06
68	0.11
69	0.11
70	0.14
71	0.15
72	0.16
73	0.17
74	0.17
75	0.19
76	0.21
77	0.21
78	0.22
79	0.25
80	0.28
81	0.27
82	0.29
83	0.26
84	0.24
85	0.29
86	0.27
87	0.23
88	0.21
89	0.2
90	0.2
91	0.19
92	0.15
93	0.09
94	0.08
95	0.07
96	0.09
97	0.09
98	0.08
99	0.09
100	0.09
101	0.08
102	0.08
103	0.1
104	0.08
105	0.08
106	0.08
107	0.08
108	0.08
109	0.09
110	0.09
111	0.07
112	0.07
113	0.07
114	0.1
115	0.09
116	0.09
117	0.08
118	0.12
119	0.13
120	0.13
121	0.12
122	0.1
123	0.1
124	0.1
125	0.11
126	0.08
127	0.08
128	0.08
129	0.09
130	0.1
131	0.1
132	0.1
133	0.11
134	0.13
135	0.13
136	0.13
137	0.12
138	0.11
139	0.1
140	0.1
141	0.07
142	0.04
143	0.04
144	0.03
145	0.03
146	0.03
147	0.03
148	0.03
149	0.03
150	0.03
151	0.03
152	0.03
153	0.03
154	0.03
155	0.03
156	0.03
157	0.03
158	0.03
159	0.03
160	0.04
161	0.04
162	0.04
163	0.04
164	0.06
165	0.08
166	0.1
167	0.13
168	0.14
169	0.16
170	0.17
171	0.19
172	0.17
173	0.16
174	0.18
175	0.23
176	0.26
177	0.25
178	0.25
179	0.24
180	0.23
181	0.25
182	0.23
183	0.23
184	0.22
185	0.23
186	0.22
187	0.23
188	0.25
189	0.24
190	0.2
191	0.16
192	0.19
193	0.18
194	0.2
195	0.21
196	0.18
197	0.19
198	0.2
199	0.18
200	0.13
201	0.13
202	0.11
203	0.09
204	0.09
205	0.08
206	0.07
207	0.06
208	0.05
209	0.05
210	0.05
211	0.04
212	0.04
213	0.05
214	0.05
215	0.05
216	0.05
217	0.05
218	0.06
219	0.09
220	0.11
221	0.11
222	0.15
223	0.22
224	0.25
225	0.3
226	0.33
227	0.33
228	0.33
229	0.34
230	0.31
231	0.25
232	0.22
233	0.17
234	0.16
235	0.13
236	0.11
237	0.1
238	0.1
239	0.1
240	0.12
241	0.15
242	0.16
243	0.17
244	0.23
245	0.27
246	0.31
247	0.33
248	0.37
249	0.37
250	0.36
251	0.36
252	0.31
253	0.28
254	0.24
255	0.23
256	0.18
257	0.19
258	0.18
259	0.17
260	0.17
261	0.15
262	0.14
263	0.15
264	0.14
265	0.12
266	0.12
267	0.12
268	0.12
269	0.12
270	0.12
271	0.13
272	0.14
273	0.13
274	0.12
275	0.13
276	0.16
277	0.17
278	0.17
279	0.19
280	0.18
281	0.22
282	0.27
283	0.26
284	0.24
285	0.27
286	0.26
287	0.2
288	0.19
289	0.16
290	0.1
291	0.09
292	0.08
293	0.04
294	0.04
295	0.04
296	0.04
297	0.04
298	0.04
299	0.04
300	0.04
301	0.05
302	0.06
303	0.09
304	0.09
305	0.09
306	0.1
307	0.1
308	0.1
309	0.11
310	0.11
311	0.08
312	0.09
313	0.09
314	0.08
315	0.09
316	0.08
317	0.07
318	0.07
319	0.08
320	0.08
321	0.08
322	0.09
323	0.11
324	0.11
325	0.12
326	0.14
327	0.15
328	0.16
329	0.15
330	0.13
331	0.13
332	0.15
333	0.17
334	0.23
335	0.22
336	0.22
337	0.23
338	0.24
339	0.27
340	0.27
341	0.27
342	0.2
343	0.2
344	0.2
345	0.2
346	0.19
347	0.16
348	0.14
349	0.13
350	0.12
351	0.11
352	0.1
353	0.09
354	0.09
355	0.09
356	0.08
357	0.06
358	0.06
359	0.07
360	0.08
361	0.08
362	0.06
363	0.09
364	0.09
365	0.09
366	0.09
367	0.09
368	0.11
369	0.13
370	0.16
371	0.18
372	0.18
373	0.2
374	0.23
375	0.3
376	0.36
377	0.4
378	0.39
379	0.39
380	0.43
381	0.47
382	0.51
383	0.48
384	0.42
385	0.45
386	0.45
387	0.43
388	0.45
389	0.42
390	0.35
391	0.32
392	0.31
393	0.23
394	0.27
395	0.26
396	0.2
397	0.19
398	0.19
399	0.17
400	0.17
401	0.16
402	0.13
403	0.12
404	0.11
405	0.1
406	0.1
407	0.1
408	0.13
409	0.15
410	0.17
411	0.18
412	0.18
413	0.19
414	0.2
415	0.21
416	0.18
417	0.17
418	0.14
419	0.2
420	0.19
421	0.18
422	0.17
423	0.17
424	0.17
425	0.16
426	0.13
427	0.08
428	0.09
429	0.1
430	0.1
431	0.09
432	0.08
433	0.08
434	0.09
435	0.09
436	0.08
437	0.08
438	0.11
439	0.12
440	0.13
441	0.14
442	0.17
443	0.18
444	0.22
445	0.25
446	0.27
447	0.26
448	0.26
449	0.26
450	0.26
451	0.25
452	0.25
453	0.3
454	0.32
455	0.37
456	0.44
457	0.51
458	0.59
459	0.68
460	0.75
461	0.77
462	0.82
463	0.86
464	0.86
465	0.89
466	0.88
467	0.87
468	0.86
469	0.83
470	0.78
471	0.72
472	0.68
473	0.63
474	0.56
475	0.49
476	0.41
477	0.36
478	0.31
479	0.29
480	0.25
481	0.22
482	0.18
483	0.16
484	0.15
485	0.13
486	0.14
487	0.13
488	0.21
489	0.25
490	0.29

U5HFT6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer