Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5HFK6

Protein Details
Accession U5HFK6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-56PTPHTPQPQAQPQSRRPRNVAPPSHTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR033133  PUM-HD  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00806  PUF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50302  PUM  
PS50303  PUM_HD  
Amino Acid Sequences MSSSSTKGEDGDGRKTSNAGVRLSALDSEEPTPHTPQPQAQPQSRRPRNVAPPSHTTSASTSTTSTTTTTTTTTASSQSRQTHYRSLSLPERYCSPTSSNPIASDSPLAALIAKSPSPLQLDVASYDRPSITTTPHLRSSNPGRPPSQFQQSHDDTYESAQSPVDALTGRMTPFHFFRETDGDGDRPSTSRASMPASLSRAWTSQADLSSQAIATRPSNGTTFGEASSSASASILGHNIWTDPPARAASRQDSMGSLHLHSDAQHEYLRQWQDPPQRSSRDDVADLARQSIGLEWTPTLTTSTLELANRVGMLSDMSMLLRDRVLALERDRMSKSQELDQLRGFVQNALMNQHQQQRPQNPFHAVYDAPHQRPILTPLRPLSASGGNGGGRTYGSGGQVESSLKTYASLHTPHHGRYHTPSSSIGSFLDSIGSHTTEDAATCSTAGSLSHYGSASSSVAHSPVVSQGLSISKLAEYRFVSSPGNIGGFNGATGGEGGRGPFRFGAGALPAPGETLRGEPTSQDLSTSSSNSVVPPLWTEKPSGHRRSHGSEPGPIHHTGGQGHQGRDRDRDRGRSMSAISPLEAQPLWITRQTSFEHINYRALLENETDIDDEAFVRRVMNQNDQQCSLFLQQRVRSTSSDLRRRSLFNAVSKHLLPLAVSKFGNFLVSRCLEYGGSELASTFTQRLTGRFLELALDHAGCHVVQRLLDYGGQVTKTLVVKEIMDQPLTLTSKNACHCWNRLLSTVNSPEFYEGLARTGRGLWAEITKEEGGSLVCQHTLEDWPAAHTSVIARELYDSMEQVAKSSCGSFVLSTLLDRNALPFRAKLMDIAPRLALDSFGAKALEKAIRTGKIQAHAVATFVEVICRSQDSRPPVLVDVASHANGAQLISVLLTGGNSVSYDGRIIIARTVSQHASVLKHAPHGQRVWNICQAMTVR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.36
3 0.36
4 0.35
5 0.36
6 0.29
7 0.28
8 0.28
9 0.29
10 0.29
11 0.26
12 0.22
13 0.18
14 0.19
15 0.19
16 0.19
17 0.21
18 0.23
19 0.26
20 0.27
21 0.3
22 0.31
23 0.36
24 0.43
25 0.5
26 0.55
27 0.59
28 0.66
29 0.72
30 0.79
31 0.82
32 0.8
33 0.76
34 0.78
35 0.8
36 0.81
37 0.81
38 0.76
39 0.75
40 0.74
41 0.71
42 0.62
43 0.53
44 0.46
45 0.42
46 0.37
47 0.31
48 0.25
49 0.23
50 0.23
51 0.22
52 0.2
53 0.16
54 0.16
55 0.16
56 0.17
57 0.16
58 0.16
59 0.16
60 0.17
61 0.21
62 0.23
63 0.25
64 0.3
65 0.36
66 0.41
67 0.44
68 0.47
69 0.5
70 0.5
71 0.53
72 0.48
73 0.48
74 0.51
75 0.55
76 0.53
77 0.47
78 0.49
79 0.48
80 0.47
81 0.43
82 0.4
83 0.39
84 0.43
85 0.47
86 0.45
87 0.41
88 0.43
89 0.41
90 0.37
91 0.31
92 0.24
93 0.19
94 0.16
95 0.15
96 0.11
97 0.1
98 0.11
99 0.12
100 0.11
101 0.12
102 0.12
103 0.16
104 0.18
105 0.19
106 0.19
107 0.18
108 0.19
109 0.21
110 0.23
111 0.21
112 0.18
113 0.19
114 0.17
115 0.15
116 0.17
117 0.16
118 0.17
119 0.25
120 0.3
121 0.34
122 0.41
123 0.42
124 0.4
125 0.47
126 0.53
127 0.52
128 0.55
129 0.55
130 0.51
131 0.54
132 0.61
133 0.6
134 0.61
135 0.56
136 0.52
137 0.55
138 0.56
139 0.56
140 0.49
141 0.44
142 0.34
143 0.31
144 0.33
145 0.25
146 0.21
147 0.17
148 0.15
149 0.15
150 0.14
151 0.13
152 0.08
153 0.08
154 0.09
155 0.11
156 0.12
157 0.13
158 0.14
159 0.16
160 0.17
161 0.21
162 0.21
163 0.19
164 0.23
165 0.27
166 0.28
167 0.27
168 0.28
169 0.25
170 0.23
171 0.24
172 0.21
173 0.16
174 0.16
175 0.15
176 0.14
177 0.15
178 0.17
179 0.2
180 0.22
181 0.24
182 0.27
183 0.29
184 0.28
185 0.29
186 0.28
187 0.24
188 0.22
189 0.2
190 0.18
191 0.18
192 0.18
193 0.17
194 0.17
195 0.17
196 0.16
197 0.15
198 0.13
199 0.11
200 0.12
201 0.12
202 0.15
203 0.15
204 0.16
205 0.16
206 0.18
207 0.19
208 0.19
209 0.2
210 0.16
211 0.16
212 0.14
213 0.15
214 0.13
215 0.12
216 0.09
217 0.07
218 0.08
219 0.07
220 0.08
221 0.08
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.07
227 0.08
228 0.09
229 0.09
230 0.11
231 0.13
232 0.15
233 0.17
234 0.21
235 0.24
236 0.25
237 0.26
238 0.24
239 0.23
240 0.23
241 0.24
242 0.2
243 0.16
244 0.15
245 0.15
246 0.14
247 0.14
248 0.15
249 0.13
250 0.13
251 0.14
252 0.14
253 0.14
254 0.21
255 0.23
256 0.21
257 0.22
258 0.27
259 0.36
260 0.43
261 0.48
262 0.49
263 0.51
264 0.52
265 0.54
266 0.52
267 0.46
268 0.39
269 0.36
270 0.32
271 0.31
272 0.29
273 0.25
274 0.2
275 0.16
276 0.15
277 0.14
278 0.12
279 0.08
280 0.09
281 0.08
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.1
290 0.11
291 0.11
292 0.12
293 0.11
294 0.11
295 0.1
296 0.09
297 0.07
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.04
304 0.05
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.08
312 0.1
313 0.12
314 0.19
315 0.2
316 0.23
317 0.24
318 0.24
319 0.27
320 0.28
321 0.28
322 0.27
323 0.32
324 0.31
325 0.33
326 0.32
327 0.3
328 0.27
329 0.26
330 0.21
331 0.15
332 0.14
333 0.13
334 0.13
335 0.14
336 0.14
337 0.14
338 0.17
339 0.25
340 0.25
341 0.29
342 0.36
343 0.41
344 0.46
345 0.49
346 0.5
347 0.46
348 0.46
349 0.42
350 0.37
351 0.29
352 0.24
353 0.28
354 0.3
355 0.27
356 0.27
357 0.26
358 0.24
359 0.24
360 0.29
361 0.28
362 0.23
363 0.25
364 0.24
365 0.27
366 0.27
367 0.26
368 0.23
369 0.19
370 0.17
371 0.15
372 0.15
373 0.13
374 0.13
375 0.13
376 0.1
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.08
385 0.09
386 0.09
387 0.08
388 0.08
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.09
393 0.09
394 0.12
395 0.14
396 0.14
397 0.18
398 0.21
399 0.22
400 0.26
401 0.25
402 0.24
403 0.27
404 0.33
405 0.29
406 0.28
407 0.27
408 0.25
409 0.25
410 0.24
411 0.18
412 0.12
413 0.12
414 0.1
415 0.1
416 0.07
417 0.08
418 0.08
419 0.08
420 0.07
421 0.07
422 0.07
423 0.06
424 0.07
425 0.06
426 0.06
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.06
434 0.07
435 0.07
436 0.09
437 0.09
438 0.09
439 0.09
440 0.1
441 0.07
442 0.06
443 0.07
444 0.06
445 0.06
446 0.06
447 0.06
448 0.05
449 0.06
450 0.07
451 0.06
452 0.06
453 0.06
454 0.07
455 0.08
456 0.08
457 0.07
458 0.06
459 0.08
460 0.08
461 0.11
462 0.11
463 0.14
464 0.15
465 0.16
466 0.16
467 0.15
468 0.15
469 0.12
470 0.12
471 0.09
472 0.08
473 0.07
474 0.06
475 0.06
476 0.05
477 0.04
478 0.03
479 0.04
480 0.04
481 0.04
482 0.04
483 0.04
484 0.06
485 0.06
486 0.07
487 0.07
488 0.07
489 0.07
490 0.07
491 0.08
492 0.07
493 0.07
494 0.07
495 0.07
496 0.06
497 0.07
498 0.06
499 0.06
500 0.05
501 0.06
502 0.07
503 0.08
504 0.08
505 0.08
506 0.11
507 0.13
508 0.12
509 0.12
510 0.1
511 0.13
512 0.14
513 0.14
514 0.12
515 0.11
516 0.11
517 0.11
518 0.12
519 0.09
520 0.09
521 0.09
522 0.13
523 0.14
524 0.15
525 0.16
526 0.18
527 0.26
528 0.35
529 0.4
530 0.39
531 0.42
532 0.45
533 0.5
534 0.53
535 0.52
536 0.44
537 0.43
538 0.42
539 0.4
540 0.39
541 0.33
542 0.28
543 0.23
544 0.22
545 0.18
546 0.17
547 0.22
548 0.23
549 0.23
550 0.25
551 0.27
552 0.28
553 0.34
554 0.35
555 0.35
556 0.36
557 0.42
558 0.43
559 0.43
560 0.43
561 0.38
562 0.38
563 0.33
564 0.32
565 0.26
566 0.22
567 0.21
568 0.19
569 0.18
570 0.16
571 0.13
572 0.1
573 0.11
574 0.12
575 0.12
576 0.13
577 0.12
578 0.17
579 0.18
580 0.21
581 0.23
582 0.23
583 0.26
584 0.27
585 0.28
586 0.24
587 0.24
588 0.22
589 0.2
590 0.18
591 0.13
592 0.12
593 0.11
594 0.11
595 0.1
596 0.08
597 0.08
598 0.07
599 0.07
600 0.07
601 0.07
602 0.06
603 0.06
604 0.08
605 0.14
606 0.18
607 0.25
608 0.3
609 0.35
610 0.37
611 0.39
612 0.37
613 0.32
614 0.31
615 0.28
616 0.26
617 0.24
618 0.27
619 0.3
620 0.34
621 0.38
622 0.37
623 0.34
624 0.36
625 0.41
626 0.44
627 0.49
628 0.47
629 0.47
630 0.47
631 0.49
632 0.46
633 0.46
634 0.42
635 0.4
636 0.42
637 0.41
638 0.41
639 0.39
640 0.37
641 0.29
642 0.23
643 0.17
644 0.18
645 0.17
646 0.18
647 0.18
648 0.17
649 0.18
650 0.18
651 0.2
652 0.15
653 0.13
654 0.14
655 0.16
656 0.17
657 0.16
658 0.17
659 0.14
660 0.15
661 0.16
662 0.11
663 0.1
664 0.09
665 0.08
666 0.08
667 0.09
668 0.09
669 0.08
670 0.07
671 0.11
672 0.12
673 0.13
674 0.17
675 0.18
676 0.19
677 0.19
678 0.19
679 0.16
680 0.15
681 0.16
682 0.13
683 0.12
684 0.1
685 0.1
686 0.1
687 0.08
688 0.09
689 0.09
690 0.08
691 0.09
692 0.1
693 0.11
694 0.12
695 0.13
696 0.13
697 0.12
698 0.13
699 0.13
700 0.12
701 0.11
702 0.13
703 0.14
704 0.14
705 0.14
706 0.14
707 0.14
708 0.17
709 0.24
710 0.22
711 0.21
712 0.2
713 0.19
714 0.24
715 0.25
716 0.22
717 0.16
718 0.16
719 0.22
720 0.25
721 0.27
722 0.25
723 0.29
724 0.32
725 0.37
726 0.4
727 0.37
728 0.38
729 0.39
730 0.37
731 0.39
732 0.43
733 0.38
734 0.33
735 0.31
736 0.29
737 0.25
738 0.23
739 0.18
740 0.12
741 0.13
742 0.13
743 0.13
744 0.13
745 0.13
746 0.14
747 0.12
748 0.12
749 0.11
750 0.14
751 0.16
752 0.15
753 0.18
754 0.18
755 0.17
756 0.15
757 0.14
758 0.11
759 0.11
760 0.13
761 0.1
762 0.1
763 0.1
764 0.1
765 0.11
766 0.13
767 0.14
768 0.14
769 0.13
770 0.15
771 0.16
772 0.16
773 0.14
774 0.12
775 0.12
776 0.13
777 0.15
778 0.13
779 0.12
780 0.13
781 0.14
782 0.15
783 0.15
784 0.12
785 0.12
786 0.15
787 0.14
788 0.14
789 0.15
790 0.13
791 0.13
792 0.14
793 0.13
794 0.11
795 0.12
796 0.11
797 0.11
798 0.13
799 0.12
800 0.13
801 0.15
802 0.14
803 0.14
804 0.13
805 0.16
806 0.17
807 0.19
808 0.2
809 0.18
810 0.21
811 0.23
812 0.24
813 0.22
814 0.22
815 0.28
816 0.28
817 0.29
818 0.26
819 0.23
820 0.24
821 0.22
822 0.19
823 0.12
824 0.12
825 0.11
826 0.11
827 0.12
828 0.11
829 0.11
830 0.15
831 0.18
832 0.17
833 0.21
834 0.25
835 0.28
836 0.3
837 0.36
838 0.37
839 0.38
840 0.4
841 0.39
842 0.36
843 0.33
844 0.32
845 0.25
846 0.21
847 0.16
848 0.14
849 0.13
850 0.1
851 0.11
852 0.12
853 0.14
854 0.16
855 0.18
856 0.25
857 0.3
858 0.35
859 0.37
860 0.39
861 0.38
862 0.38
863 0.35
864 0.29
865 0.26
866 0.24
867 0.22
868 0.19
869 0.17
870 0.15
871 0.15
872 0.14
873 0.09
874 0.06
875 0.06
876 0.06
877 0.06
878 0.05
879 0.05
880 0.05
881 0.05
882 0.05
883 0.05
884 0.05
885 0.07
886 0.07
887 0.08
888 0.09
889 0.09
890 0.1
891 0.12
892 0.13
893 0.14
894 0.15
895 0.16
896 0.18
897 0.22
898 0.22
899 0.22
900 0.24
901 0.24
902 0.25
903 0.27
904 0.31
905 0.28
906 0.33
907 0.39
908 0.42
909 0.46
910 0.47
911 0.51
912 0.53
913 0.57
914 0.56
915 0.56
916 0.52
917 0.44