Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5H1L6

Protein Details
Accession U5H1L6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
628-654MNPTMNPAKRRYRRHPKPDPNAPVKPSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
558-571ARGGSKSRGVKRKS
636-644KRRYRRHPK
Subcellular Location(s) cyto 10, extr 8, nucl 4, mito 4, mito_nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
IPR001660  SAM  
IPR013761  SAM/pointed_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00536  SAM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MDSNMSSSSTPASSSSLSALAAGGPAIGSGSSGTGSSGDRQDYFGTLAIVDSAGASAKAPAPATLTGDNSSNHYNHQPLHHPTAYPYHASWVAGSVAPAPGSATAAASPSAGAPAASALSAAVGDLSNVLEPTRSRPSLHDRGAPLGSPSTLSNVGAAWINRYHQAMPRHTMSNGTMTTTAPASATSRGGTLHPANDPAHAIVPNQGHHAHGHAQAYPHHPAYSNYPDSSSSHHTQQFKSGGAALSHLLHYTDQTETSSAAPHCNPHGGSAPYPTPVTPSLLSSSNMSSNQTSITHVESSALEVAPNSVSSSAAAAAVAAAGATAPGSLHIPMAKSTTTTTTMGHPIATFSHMHSHLWPSYPSSTVASSSTNLGPAASRQLAPPAAATAPAPINLVHELLYSLHLTQYYDTFVAEGFDRLEALDDITEADFEAVGVRRGHRRLIQRHLASIKGLPTSAPLVLPIALGHGENGTISTVPALAAVKNHGLGKAEWVDPTVADQAQVVDANAADEFAPKSKMEDEVEESDDNQIGDVSVATTLVEDQEMSNLSSSTGASRARGGSKSRGVKRKSIAPAKTLPTSVTQTNRNVFYIHPTNSASVTRSTTASRTAVPIQTTAVSTSATPGTPMNPTMNPAKRRYRRHPKPDPNAPVKPSSAYVEFSTSIRAQLGTSKSFTEIARIVGEKWQALPCLEKADLERRTIEAKEAYARDLELYQQGKEWREYEAYLKQFRAKYPDSAIGPSTTAAGVAELETGSSPAPSGSGSGSTAGKESKVVGCGKGRGGRRSSTRTVQLAAPVGEVAPTRSVRMGRRTSARRSLAKHGAREELSSDSDLDGDGDGEGEGEDVDGEGETDEDPLVGSSTTTMTNGNGVGVEGKGEEFDKEQWDAVRVLANVHRRECELSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.18
3 0.16
4 0.15
5 0.15
6 0.14
7 0.11
8 0.09
9 0.08
10 0.06
11 0.05
12 0.05
13 0.05
14 0.04
15 0.04
16 0.04
17 0.05
18 0.05
19 0.06
20 0.06
21 0.07
22 0.09
23 0.13
24 0.17
25 0.19
26 0.19
27 0.21
28 0.22
29 0.22
30 0.23
31 0.2
32 0.17
33 0.14
34 0.13
35 0.11
36 0.1
37 0.08
38 0.07
39 0.06
40 0.05
41 0.05
42 0.06
43 0.07
44 0.09
45 0.12
46 0.12
47 0.13
48 0.15
49 0.17
50 0.21
51 0.22
52 0.22
53 0.21
54 0.23
55 0.23
56 0.24
57 0.27
58 0.23
59 0.24
60 0.26
61 0.28
62 0.28
63 0.34
64 0.38
65 0.41
66 0.49
67 0.48
68 0.44
69 0.43
70 0.48
71 0.46
72 0.41
73 0.34
74 0.31
75 0.3
76 0.3
77 0.27
78 0.21
79 0.19
80 0.17
81 0.16
82 0.13
83 0.12
84 0.12
85 0.11
86 0.1
87 0.08
88 0.09
89 0.09
90 0.08
91 0.08
92 0.09
93 0.09
94 0.08
95 0.08
96 0.07
97 0.08
98 0.07
99 0.06
100 0.05
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.05
105 0.04
106 0.05
107 0.05
108 0.04
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.05
114 0.05
115 0.06
116 0.06
117 0.07
118 0.08
119 0.14
120 0.22
121 0.23
122 0.24
123 0.3
124 0.4
125 0.48
126 0.52
127 0.53
128 0.47
129 0.5
130 0.5
131 0.44
132 0.37
133 0.28
134 0.24
135 0.19
136 0.17
137 0.16
138 0.15
139 0.15
140 0.13
141 0.12
142 0.12
143 0.14
144 0.14
145 0.13
146 0.13
147 0.15
148 0.17
149 0.19
150 0.2
151 0.23
152 0.31
153 0.33
154 0.37
155 0.4
156 0.4
157 0.38
158 0.39
159 0.35
160 0.33
161 0.28
162 0.25
163 0.22
164 0.19
165 0.21
166 0.18
167 0.16
168 0.1
169 0.11
170 0.1
171 0.11
172 0.12
173 0.11
174 0.12
175 0.12
176 0.13
177 0.17
178 0.17
179 0.18
180 0.18
181 0.22
182 0.22
183 0.22
184 0.23
185 0.18
186 0.19
187 0.16
188 0.16
189 0.17
190 0.19
191 0.19
192 0.2
193 0.2
194 0.18
195 0.18
196 0.21
197 0.2
198 0.21
199 0.22
200 0.2
201 0.21
202 0.24
203 0.28
204 0.29
205 0.27
206 0.24
207 0.23
208 0.23
209 0.28
210 0.33
211 0.32
212 0.29
213 0.29
214 0.3
215 0.3
216 0.34
217 0.33
218 0.28
219 0.31
220 0.36
221 0.39
222 0.38
223 0.44
224 0.42
225 0.36
226 0.34
227 0.3
228 0.26
229 0.22
230 0.22
231 0.16
232 0.14
233 0.13
234 0.12
235 0.11
236 0.09
237 0.09
238 0.1
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.14
246 0.13
247 0.16
248 0.16
249 0.17
250 0.18
251 0.2
252 0.2
253 0.18
254 0.22
255 0.21
256 0.22
257 0.24
258 0.23
259 0.22
260 0.22
261 0.2
262 0.17
263 0.16
264 0.18
265 0.15
266 0.15
267 0.16
268 0.18
269 0.19
270 0.17
271 0.18
272 0.18
273 0.18
274 0.18
275 0.16
276 0.15
277 0.15
278 0.15
279 0.15
280 0.13
281 0.15
282 0.13
283 0.13
284 0.14
285 0.12
286 0.13
287 0.13
288 0.11
289 0.09
290 0.08
291 0.09
292 0.08
293 0.08
294 0.07
295 0.05
296 0.05
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.05
301 0.05
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.03
306 0.02
307 0.02
308 0.02
309 0.02
310 0.02
311 0.02
312 0.02
313 0.03
314 0.03
315 0.04
316 0.05
317 0.06
318 0.06
319 0.07
320 0.09
321 0.09
322 0.09
323 0.1
324 0.12
325 0.14
326 0.15
327 0.15
328 0.16
329 0.19
330 0.18
331 0.17
332 0.15
333 0.12
334 0.12
335 0.13
336 0.11
337 0.09
338 0.15
339 0.15
340 0.16
341 0.16
342 0.19
343 0.19
344 0.2
345 0.19
346 0.17
347 0.17
348 0.18
349 0.18
350 0.16
351 0.15
352 0.14
353 0.15
354 0.13
355 0.12
356 0.13
357 0.13
358 0.12
359 0.11
360 0.1
361 0.09
362 0.08
363 0.11
364 0.1
365 0.1
366 0.1
367 0.12
368 0.13
369 0.13
370 0.12
371 0.1
372 0.09
373 0.08
374 0.08
375 0.08
376 0.08
377 0.08
378 0.08
379 0.07
380 0.08
381 0.09
382 0.09
383 0.07
384 0.07
385 0.07
386 0.07
387 0.08
388 0.07
389 0.06
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.07
394 0.07
395 0.07
396 0.07
397 0.07
398 0.06
399 0.06
400 0.07
401 0.06
402 0.06
403 0.05
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.06
408 0.05
409 0.05
410 0.04
411 0.04
412 0.05
413 0.05
414 0.05
415 0.04
416 0.04
417 0.03
418 0.03
419 0.04
420 0.04
421 0.07
422 0.07
423 0.09
424 0.13
425 0.14
426 0.17
427 0.21
428 0.29
429 0.34
430 0.41
431 0.49
432 0.45
433 0.49
434 0.47
435 0.43
436 0.35
437 0.3
438 0.23
439 0.15
440 0.14
441 0.1
442 0.09
443 0.1
444 0.09
445 0.08
446 0.06
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.05
451 0.04
452 0.04
453 0.04
454 0.04
455 0.04
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.04
460 0.03
461 0.03
462 0.03
463 0.03
464 0.03
465 0.04
466 0.04
467 0.04
468 0.05
469 0.06
470 0.07
471 0.08
472 0.08
473 0.08
474 0.09
475 0.09
476 0.12
477 0.14
478 0.14
479 0.12
480 0.13
481 0.12
482 0.11
483 0.12
484 0.11
485 0.08
486 0.07
487 0.07
488 0.07
489 0.07
490 0.07
491 0.06
492 0.04
493 0.04
494 0.04
495 0.04
496 0.04
497 0.04
498 0.04
499 0.05
500 0.06
501 0.07
502 0.07
503 0.09
504 0.09
505 0.12
506 0.12
507 0.14
508 0.17
509 0.18
510 0.21
511 0.2
512 0.19
513 0.17
514 0.16
515 0.14
516 0.1
517 0.07
518 0.05
519 0.05
520 0.04
521 0.04
522 0.03
523 0.03
524 0.03
525 0.03
526 0.03
527 0.03
528 0.03
529 0.03
530 0.03
531 0.05
532 0.06
533 0.06
534 0.06
535 0.06
536 0.06
537 0.07
538 0.07
539 0.07
540 0.09
541 0.09
542 0.09
543 0.11
544 0.13
545 0.15
546 0.18
547 0.2
548 0.24
549 0.31
550 0.39
551 0.45
552 0.52
553 0.52
554 0.56
555 0.56
556 0.59
557 0.61
558 0.61
559 0.56
560 0.52
561 0.55
562 0.52
563 0.5
564 0.42
565 0.34
566 0.28
567 0.29
568 0.28
569 0.26
570 0.27
571 0.29
572 0.33
573 0.33
574 0.3
575 0.28
576 0.25
577 0.28
578 0.29
579 0.26
580 0.25
581 0.25
582 0.25
583 0.26
584 0.26
585 0.21
586 0.17
587 0.17
588 0.16
589 0.16
590 0.16
591 0.16
592 0.18
593 0.18
594 0.17
595 0.18
596 0.2
597 0.21
598 0.21
599 0.2
600 0.18
601 0.17
602 0.17
603 0.14
604 0.12
605 0.09
606 0.08
607 0.1
608 0.1
609 0.09
610 0.09
611 0.09
612 0.1
613 0.11
614 0.13
615 0.14
616 0.13
617 0.16
618 0.23
619 0.3
620 0.34
621 0.39
622 0.49
623 0.54
624 0.64
625 0.72
626 0.76
627 0.79
628 0.85
629 0.9
630 0.9
631 0.92
632 0.93
633 0.91
634 0.88
635 0.84
636 0.76
637 0.68
638 0.58
639 0.5
640 0.41
641 0.35
642 0.28
643 0.23
644 0.21
645 0.2
646 0.2
647 0.19
648 0.21
649 0.17
650 0.16
651 0.15
652 0.14
653 0.11
654 0.16
655 0.2
656 0.19
657 0.19
658 0.19
659 0.2
660 0.23
661 0.22
662 0.21
663 0.18
664 0.17
665 0.19
666 0.18
667 0.18
668 0.19
669 0.21
670 0.17
671 0.18
672 0.19
673 0.17
674 0.17
675 0.19
676 0.16
677 0.2
678 0.19
679 0.18
680 0.2
681 0.28
682 0.3
683 0.29
684 0.29
685 0.26
686 0.3
687 0.29
688 0.29
689 0.22
690 0.21
691 0.25
692 0.25
693 0.24
694 0.21
695 0.21
696 0.19
697 0.17
698 0.17
699 0.17
700 0.18
701 0.17
702 0.2
703 0.24
704 0.25
705 0.27
706 0.26
707 0.23
708 0.24
709 0.25
710 0.26
711 0.3
712 0.34
713 0.35
714 0.37
715 0.4
716 0.41
717 0.42
718 0.45
719 0.4
720 0.39
721 0.4
722 0.45
723 0.4
724 0.4
725 0.38
726 0.31
727 0.29
728 0.24
729 0.2
730 0.13
731 0.11
732 0.08
733 0.07
734 0.06
735 0.06
736 0.06
737 0.05
738 0.05
739 0.05
740 0.06
741 0.06
742 0.05
743 0.05
744 0.05
745 0.05
746 0.05
747 0.06
748 0.07
749 0.08
750 0.09
751 0.11
752 0.12
753 0.12
754 0.14
755 0.14
756 0.13
757 0.12
758 0.14
759 0.15
760 0.19
761 0.21
762 0.23
763 0.26
764 0.29
765 0.34
766 0.38
767 0.41
768 0.44
769 0.46
770 0.49
771 0.53
772 0.58
773 0.59
774 0.6
775 0.61
776 0.56
777 0.55
778 0.49
779 0.46
780 0.42
781 0.35
782 0.29
783 0.21
784 0.19
785 0.17
786 0.15
787 0.13
788 0.14
789 0.14
790 0.15
791 0.18
792 0.23
793 0.28
794 0.37
795 0.42
796 0.44
797 0.53
798 0.59
799 0.64
800 0.69
801 0.72
802 0.69
803 0.68
804 0.71
805 0.71
806 0.71
807 0.68
808 0.63
809 0.62
810 0.56
811 0.52
812 0.44
813 0.38
814 0.33
815 0.28
816 0.25
817 0.18
818 0.17
819 0.15
820 0.13
821 0.1
822 0.08
823 0.06
824 0.06
825 0.05
826 0.06
827 0.05
828 0.05
829 0.04
830 0.04
831 0.04
832 0.04
833 0.04
834 0.04
835 0.04
836 0.04
837 0.05
838 0.05
839 0.06
840 0.06
841 0.05
842 0.06
843 0.06
844 0.07
845 0.06
846 0.06
847 0.06
848 0.08
849 0.09
850 0.1
851 0.1
852 0.1
853 0.12
854 0.12
855 0.12
856 0.1
857 0.1
858 0.1
859 0.09
860 0.09
861 0.08
862 0.08
863 0.09
864 0.09
865 0.1
866 0.11
867 0.14
868 0.18
869 0.19
870 0.21
871 0.21
872 0.23
873 0.23
874 0.21
875 0.24
876 0.2
877 0.22
878 0.26
879 0.33
880 0.37
881 0.39
882 0.4
883 0.38