Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5H221

Protein Details
Accession U5H221    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
620-643GRALHRRKVIGRWTKQRWRWMGTWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
623-631LHRRKVIGR
Subcellular Location(s) mito 11.5, nucl 11, cyto_mito 8, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036279  5-3_exonuclease_C_sf  
IPR008918  HhH2  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR006086  XPG-I_dom  
IPR006084  XPG/Rad2  
IPR006085  XPG_DNA_repair_N  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF00867  XPG_I  
PF00752  XPG_N  
Amino Acid Sequences MGIKDLATTLTKHAPQAITPLRSLSHLQGQTVAIDASVLTGKLHFSRPTQAHPSQSSPSTSDANTISRTRIVQGWYTFLRALSKAGIKPIVVFDGPTRLAAKANENRRRLEARELQKGRSGVEWNRGERLRETLEGWRRVGERDWQEIRKRFRETVLKGVEDGRVVVTEQAAWVSDSASDPLSTGTLEPPRPTAEPLSTLPITPPPPLWETVQAEAEKTVVDAQEDVVELPQEDDVEFEEEEESSSVSDSAASDPLSTGTLESAAHPISDHPSTLLRTPSPPLPDAVLTTVLSLAELHARFQADATNTLYSKNQTLVTEAERRWYDSILAEERSSEDVNVVDSEILPHRLTGIDMDVLESILRQSNELERSHRTRAEAVPWQASEDVLDLIRSLGIPYLKPSPTSPYEAEALCASLYHARIASLVISEDTDVIVYQAPLLRRVNSAGQNPANTDGNGEVASSKGMSVWDAEKAREGLGLSREEMIDFALLCGSDFTERIPQLGPARALELIRKYGSIEAILNSQTRYLPSDPPIYLLSVAAARQIFNDIPPLTSEDHLTLIGRDATLDAMLDDGENEVLQKWGIKGGVLRFDGMGWPTVEEVNDRQAEGGESGCCGRRMGRALHRRKVIGRWTKQRWRWMGTWGKRCR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.3
3 0.38
4 0.42
5 0.38
6 0.36
7 0.37
8 0.32
9 0.34
10 0.36
11 0.31
12 0.32
13 0.3
14 0.3
15 0.31
16 0.31
17 0.28
18 0.27
19 0.22
20 0.12
21 0.1
22 0.09
23 0.08
24 0.08
25 0.08
26 0.07
27 0.07
28 0.1
29 0.13
30 0.18
31 0.19
32 0.21
33 0.31
34 0.34
35 0.42
36 0.48
37 0.5
38 0.53
39 0.55
40 0.57
41 0.53
42 0.52
43 0.47
44 0.41
45 0.4
46 0.35
47 0.31
48 0.29
49 0.27
50 0.27
51 0.28
52 0.27
53 0.26
54 0.26
55 0.27
56 0.25
57 0.27
58 0.27
59 0.29
60 0.29
61 0.32
62 0.31
63 0.33
64 0.31
65 0.28
66 0.28
67 0.22
68 0.22
69 0.21
70 0.25
71 0.24
72 0.28
73 0.29
74 0.26
75 0.27
76 0.27
77 0.26
78 0.2
79 0.19
80 0.16
81 0.2
82 0.2
83 0.2
84 0.2
85 0.17
86 0.2
87 0.21
88 0.29
89 0.31
90 0.41
91 0.49
92 0.51
93 0.53
94 0.57
95 0.6
96 0.53
97 0.55
98 0.54
99 0.53
100 0.61
101 0.61
102 0.57
103 0.57
104 0.55
105 0.46
106 0.41
107 0.39
108 0.32
109 0.39
110 0.43
111 0.39
112 0.46
113 0.46
114 0.44
115 0.4
116 0.41
117 0.35
118 0.3
119 0.31
120 0.33
121 0.4
122 0.41
123 0.41
124 0.39
125 0.36
126 0.37
127 0.37
128 0.36
129 0.33
130 0.38
131 0.44
132 0.47
133 0.54
134 0.6
135 0.65
136 0.64
137 0.64
138 0.58
139 0.59
140 0.62
141 0.58
142 0.6
143 0.57
144 0.51
145 0.46
146 0.46
147 0.39
148 0.3
149 0.25
150 0.16
151 0.11
152 0.1
153 0.1
154 0.08
155 0.07
156 0.07
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.07
164 0.08
165 0.08
166 0.07
167 0.07
168 0.08
169 0.08
170 0.07
171 0.07
172 0.1
173 0.15
174 0.16
175 0.17
176 0.18
177 0.21
178 0.21
179 0.23
180 0.22
181 0.19
182 0.21
183 0.22
184 0.25
185 0.23
186 0.22
187 0.21
188 0.22
189 0.22
190 0.2
191 0.19
192 0.17
193 0.18
194 0.2
195 0.21
196 0.23
197 0.24
198 0.25
199 0.28
200 0.25
201 0.23
202 0.21
203 0.2
204 0.13
205 0.11
206 0.1
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.06
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.08
229 0.07
230 0.06
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.04
235 0.05
236 0.05
237 0.06
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.08
244 0.07
245 0.06
246 0.05
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.1
256 0.1
257 0.09
258 0.09
259 0.11
260 0.12
261 0.14
262 0.15
263 0.13
264 0.14
265 0.17
266 0.19
267 0.2
268 0.19
269 0.18
270 0.17
271 0.17
272 0.16
273 0.15
274 0.13
275 0.1
276 0.1
277 0.09
278 0.07
279 0.07
280 0.06
281 0.05
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.09
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.12
290 0.09
291 0.11
292 0.12
293 0.13
294 0.13
295 0.14
296 0.15
297 0.13
298 0.13
299 0.12
300 0.12
301 0.11
302 0.12
303 0.13
304 0.16
305 0.21
306 0.2
307 0.23
308 0.21
309 0.23
310 0.21
311 0.2
312 0.17
313 0.12
314 0.15
315 0.13
316 0.14
317 0.13
318 0.12
319 0.13
320 0.14
321 0.13
322 0.1
323 0.08
324 0.07
325 0.08
326 0.08
327 0.07
328 0.05
329 0.04
330 0.06
331 0.06
332 0.08
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.08
337 0.08
338 0.07
339 0.07
340 0.06
341 0.06
342 0.07
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.05
347 0.05
348 0.07
349 0.07
350 0.06
351 0.07
352 0.12
353 0.16
354 0.17
355 0.2
356 0.22
357 0.27
358 0.3
359 0.31
360 0.28
361 0.28
362 0.29
363 0.32
364 0.33
365 0.31
366 0.3
367 0.28
368 0.28
369 0.24
370 0.22
371 0.17
372 0.11
373 0.09
374 0.06
375 0.06
376 0.05
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.04
381 0.05
382 0.06
383 0.06
384 0.09
385 0.14
386 0.15
387 0.16
388 0.17
389 0.2
390 0.23
391 0.27
392 0.26
393 0.23
394 0.25
395 0.24
396 0.24
397 0.18
398 0.16
399 0.11
400 0.09
401 0.08
402 0.08
403 0.09
404 0.09
405 0.09
406 0.08
407 0.09
408 0.09
409 0.09
410 0.06
411 0.06
412 0.06
413 0.06
414 0.06
415 0.06
416 0.05
417 0.05
418 0.04
419 0.05
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.08
424 0.08
425 0.12
426 0.14
427 0.15
428 0.15
429 0.18
430 0.23
431 0.26
432 0.28
433 0.31
434 0.32
435 0.31
436 0.31
437 0.32
438 0.28
439 0.22
440 0.2
441 0.14
442 0.13
443 0.12
444 0.11
445 0.08
446 0.06
447 0.07
448 0.06
449 0.05
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.07
454 0.08
455 0.14
456 0.15
457 0.15
458 0.17
459 0.18
460 0.18
461 0.17
462 0.16
463 0.14
464 0.16
465 0.17
466 0.16
467 0.16
468 0.16
469 0.15
470 0.14
471 0.11
472 0.08
473 0.07
474 0.06
475 0.06
476 0.05
477 0.05
478 0.06
479 0.06
480 0.06
481 0.06
482 0.08
483 0.14
484 0.14
485 0.15
486 0.16
487 0.19
488 0.22
489 0.26
490 0.26
491 0.2
492 0.21
493 0.22
494 0.22
495 0.22
496 0.21
497 0.21
498 0.2
499 0.2
500 0.19
501 0.19
502 0.2
503 0.17
504 0.16
505 0.13
506 0.15
507 0.16
508 0.16
509 0.15
510 0.15
511 0.14
512 0.14
513 0.18
514 0.18
515 0.21
516 0.24
517 0.3
518 0.28
519 0.3
520 0.3
521 0.26
522 0.24
523 0.2
524 0.17
525 0.12
526 0.12
527 0.13
528 0.12
529 0.11
530 0.11
531 0.14
532 0.14
533 0.13
534 0.19
535 0.16
536 0.16
537 0.17
538 0.2
539 0.19
540 0.19
541 0.2
542 0.15
543 0.16
544 0.16
545 0.15
546 0.13
547 0.13
548 0.13
549 0.11
550 0.1
551 0.1
552 0.1
553 0.09
554 0.09
555 0.06
556 0.05
557 0.06
558 0.05
559 0.05
560 0.05
561 0.05
562 0.05
563 0.06
564 0.06
565 0.06
566 0.07
567 0.08
568 0.08
569 0.11
570 0.12
571 0.12
572 0.16
573 0.21
574 0.28
575 0.27
576 0.27
577 0.24
578 0.25
579 0.26
580 0.23
581 0.21
582 0.13
583 0.13
584 0.14
585 0.14
586 0.14
587 0.15
588 0.16
589 0.21
590 0.21
591 0.2
592 0.2
593 0.2
594 0.21
595 0.19
596 0.18
597 0.11
598 0.12
599 0.14
600 0.16
601 0.17
602 0.16
603 0.17
604 0.22
605 0.27
606 0.35
607 0.43
608 0.51
609 0.6
610 0.68
611 0.73
612 0.72
613 0.72
614 0.72
615 0.72
616 0.72
617 0.72
618 0.74
619 0.78
620 0.83
621 0.86
622 0.87
623 0.84
624 0.81
625 0.73
626 0.73
627 0.73
628 0.72