FuNGI

U5H326

Protein Details

Accession

U5H326

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
178-198	EDNERWDKKVARKNRRAEFSF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
8-20	ARKASGAAAKKGK

Subcellular Location(s)

nucl 14, mito 10, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004882 Luc7-rel IPR013260 mRNA_splic_SYF2
Gene Ontology	GO:0005685 C:U1 snRNP GO:0003729 F:mRNA binding GO:0006376 P:mRNA splice site selection
Pfam	View protein in Pfam PF03194 LUC7 PF08231 SYF2

Amino Acid Sequences

MAPRKTSARKASGAAAKKGKAAAVAESFALDHDIEQPAPIPVDEHESTPTTTSQAEEPQASSSSASASTEAAVTEEAESTTAATGSEGGQSAAAAPTPSLTPAERLAKVKVLRQRMTESAKANKQDLITESNQRRDSARNLAKLERKRQQAEAMGEKQQALETGEDLERKRAWDYTIEDNERWDKKVARKNRRAEFSFTDYDDIARRKYKKDMDVFKPDHKAYNAQRAAAHDAAALVASSSSNPDAGALLAAQDLYRDANSFVYADHKPSEDAIDRVIGKINLDLNARENRSRERKNEVEGDITYINEKNKHFNKKLERYYDAVTKDIRDSFERAARSIFVRPTSAMSKRPSRASTSHVKSYKEDELELSGRMVGGRGRGGGERMGINEKQGGPLQVTGGPAWGVPVGDAEDDDDDDEDEGDEEDISSVYLQAIRAYESMALKKDQRRAEKALKDARAILTATSNEVDGNVRAAMAKADQMVKQASEAAAKATRESQENPSAQWAIAFSSQHAVAEQVTQGFDTLREDLKSRDGQLFQEMIEAFTERSSRNKKVFKKFKQAVAAQEHEAIEMAREVQRKLLEQLMGAESMGIVTVTPSLWDPKVCRAFVTGVCTHDLFTNTKMDLGTCPRVHSPKLKNEYDALRAKAEAEEDQVKIKELNRLRLDFEQQTLAFVEECDRRIRMAQRRLEKTPEENARFVNLMREIGEVEGAYQAAMAEVELLGSEGKVEESLAQLTKAEALKSEKEEKERELQNLSETAGASGHQKLRVCDICGAYLSLLDSDRRLADHFGGRMHLGYHQLRIMMDEWRTRGPLATGPAPSHNGGAPNGSAHPPPSGPPPSSASSGPASYRPPSSAPLSRPPPSGPMVPSGPPAPGFVPAAGPASATSSGRDRSDRDRSDRDRDSYRSDRDRERGSRDDRDRERDGGERRSDRDRSDRDRDGHRSSREDRDRDHRGSRDERDSYRSSRRSEDDRDRGDRRSSKRYDDGDESRPLSSRRMDDAEDRLDGDKRRKIEA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.6
3	0.55
4	0.54
5	0.52
6	0.44
7	0.39
8	0.33
9	0.31
10	0.26
11	0.26
12	0.23
13	0.22
14	0.21
15	0.17
16	0.17
17	0.12
18	0.09
19	0.11
20	0.13
21	0.13
22	0.13
23	0.14
24	0.14
25	0.15
26	0.14
27	0.12
28	0.1
29	0.18
30	0.18
31	0.19
32	0.21
33	0.22
34	0.23
35	0.24
36	0.24
37	0.18
38	0.18
39	0.18
40	0.18
41	0.21
42	0.24
43	0.24
44	0.24
45	0.25
46	0.26
47	0.25
48	0.22
49	0.17
50	0.15
51	0.14
52	0.14
53	0.12
54	0.11
55	0.11
56	0.1
57	0.1
58	0.09
59	0.09
60	0.09
61	0.09
62	0.09
63	0.08
64	0.08
65	0.08
66	0.08
67	0.08
68	0.07
69	0.07
70	0.06
71	0.07
72	0.07
73	0.09
74	0.09
75	0.09
76	0.09
77	0.08
78	0.09
79	0.09
80	0.09
81	0.07
82	0.07
83	0.08
84	0.08
85	0.09
86	0.11
87	0.11
88	0.13
89	0.19
90	0.25
91	0.28
92	0.3
93	0.32
94	0.37
95	0.39
96	0.43
97	0.44
98	0.48
99	0.48
100	0.5
101	0.53
102	0.54
103	0.58
104	0.58
105	0.56
106	0.56
107	0.58
108	0.57
109	0.53
110	0.49
111	0.43
112	0.4
113	0.37
114	0.34
115	0.32
116	0.38
117	0.42
118	0.47
119	0.48
120	0.45
121	0.45
122	0.43
123	0.45
124	0.46
125	0.48
126	0.47
127	0.49
128	0.56
129	0.62
130	0.66
131	0.7
132	0.67
133	0.68
134	0.65
135	0.65
136	0.65
137	0.64
138	0.62
139	0.61
140	0.57
141	0.54
142	0.51
143	0.47
144	0.4
145	0.32
146	0.27
147	0.19
148	0.15
149	0.11
150	0.13
151	0.15
152	0.18
153	0.18
154	0.21
155	0.21
156	0.22
157	0.23
158	0.22
159	0.22
160	0.24
161	0.28
162	0.33
163	0.41
164	0.44
165	0.42
166	0.44
167	0.5
168	0.46
169	0.44
170	0.38
171	0.36
172	0.41
173	0.5
174	0.58
175	0.61
176	0.69
177	0.76
178	0.81
179	0.84
180	0.79
181	0.76
182	0.72
183	0.68
184	0.63
185	0.54
186	0.47
187	0.38
188	0.35
189	0.33
190	0.29
191	0.25
192	0.29
193	0.31
194	0.33
195	0.41
196	0.48
197	0.51
198	0.59
199	0.65
200	0.65
201	0.73
202	0.74
203	0.72
204	0.72
205	0.64
206	0.59
207	0.51
208	0.52
209	0.46
210	0.52
211	0.47
212	0.42
213	0.43
214	0.41
215	0.45
216	0.37
217	0.31
218	0.2
219	0.18
220	0.16
221	0.14
222	0.11
223	0.05
224	0.04
225	0.04
226	0.04
227	0.06
228	0.06
229	0.06
230	0.06
231	0.06
232	0.07
233	0.07
234	0.07
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.04
240	0.04
241	0.05
242	0.05
243	0.06
244	0.06
245	0.07
246	0.08
247	0.08
248	0.09
249	0.08
250	0.12
251	0.13
252	0.14
253	0.15
254	0.15
255	0.15
256	0.16
257	0.2
258	0.17
259	0.17
260	0.16
261	0.18
262	0.18
263	0.18
264	0.2
265	0.16
266	0.14
267	0.16
268	0.16
269	0.15
270	0.16
271	0.16
272	0.18
273	0.24
274	0.26
275	0.26
276	0.27
277	0.33
278	0.42
279	0.48
280	0.48
281	0.51
282	0.52
283	0.55
284	0.59
285	0.52
286	0.46
287	0.4
288	0.39
289	0.31
290	0.27
291	0.23
292	0.19
293	0.19
294	0.2
295	0.2
296	0.26
297	0.33
298	0.43
299	0.46
300	0.53
301	0.61
302	0.67
303	0.74
304	0.72
305	0.67
306	0.61
307	0.6
308	0.57
309	0.48
310	0.4
311	0.33
312	0.27
313	0.27
314	0.26
315	0.24
316	0.2
317	0.22
318	0.23
319	0.27
320	0.26
321	0.24
322	0.23
323	0.22
324	0.22
325	0.23
326	0.22
327	0.18
328	0.19
329	0.19
330	0.21
331	0.25
332	0.26
333	0.28
334	0.3
335	0.37
336	0.39
337	0.44
338	0.43
339	0.43
340	0.42
341	0.42
342	0.47
343	0.44
344	0.5
345	0.48
346	0.48
347	0.45
348	0.47
349	0.48
350	0.39
351	0.34
352	0.26
353	0.25
354	0.24
355	0.23
356	0.18
357	0.12
358	0.11
359	0.1
360	0.1
361	0.07
362	0.07
363	0.07
364	0.07
365	0.08
366	0.09
367	0.1
368	0.1
369	0.1
370	0.1
371	0.11
372	0.14
373	0.13
374	0.13
375	0.16
376	0.15
377	0.16
378	0.16
379	0.15
380	0.12
381	0.12
382	0.13
383	0.11
384	0.12
385	0.1
386	0.09
387	0.09
388	0.08
389	0.08
390	0.07
391	0.05
392	0.04
393	0.04
394	0.05
395	0.05
396	0.05
397	0.05
398	0.05
399	0.05
400	0.05
401	0.05
402	0.05
403	0.05
404	0.05
405	0.04
406	0.04
407	0.04
408	0.04
409	0.04
410	0.04
411	0.04
412	0.04
413	0.04
414	0.04
415	0.03
416	0.03
417	0.05
418	0.05
419	0.05
420	0.06
421	0.07
422	0.07
423	0.07
424	0.09
425	0.1
426	0.12
427	0.12
428	0.14
429	0.18
430	0.23
431	0.29
432	0.34
433	0.39
434	0.42
435	0.48
436	0.55
437	0.55
438	0.58
439	0.58
440	0.54
441	0.49
442	0.45
443	0.38
444	0.31
445	0.26
446	0.19
447	0.13
448	0.11
449	0.11
450	0.1
451	0.09
452	0.07
453	0.07
454	0.08
455	0.06
456	0.06
457	0.05
458	0.05
459	0.05
460	0.05
461	0.05
462	0.05
463	0.06
464	0.06
465	0.08
466	0.08
467	0.1
468	0.1
469	0.1
470	0.1
471	0.1
472	0.09
473	0.08
474	0.08
475	0.08
476	0.1
477	0.1
478	0.1
479	0.12
480	0.13
481	0.14
482	0.16
483	0.19
484	0.23
485	0.24
486	0.24
487	0.23
488	0.23
489	0.2
490	0.18
491	0.14
492	0.08
493	0.1
494	0.09
495	0.07
496	0.08
497	0.08
498	0.08
499	0.08
500	0.07
501	0.05
502	0.06
503	0.06
504	0.05
505	0.05
506	0.05
507	0.05
508	0.05
509	0.05
510	0.06
511	0.07
512	0.07
513	0.08
514	0.09
515	0.1
516	0.14
517	0.15
518	0.16
519	0.17
520	0.17
521	0.17
522	0.19
523	0.19
524	0.15
525	0.16
526	0.14
527	0.11
528	0.1
529	0.1
530	0.08
531	0.08
532	0.09
533	0.07
534	0.14
535	0.2
536	0.25
537	0.32
538	0.4
539	0.49
540	0.58
541	0.69
542	0.7
543	0.76
544	0.76
545	0.75
546	0.74
547	0.68
548	0.64
549	0.59
550	0.53
551	0.42
552	0.4
553	0.33
554	0.25
555	0.22
556	0.15
557	0.09
558	0.07
559	0.07
560	0.08
561	0.09
562	0.09
563	0.12
564	0.13
565	0.14
566	0.15
567	0.17
568	0.15
569	0.14
570	0.15
571	0.14
572	0.13
573	0.11
574	0.09
575	0.06
576	0.06
577	0.05
578	0.03
579	0.02
580	0.02
581	0.03
582	0.03
583	0.03
584	0.04
585	0.06
586	0.07
587	0.09
588	0.1
589	0.18
590	0.24
591	0.23
592	0.23
593	0.23
594	0.26
595	0.26
596	0.31
597	0.24
598	0.2
599	0.22
600	0.21
601	0.2
602	0.18
603	0.18
604	0.14
605	0.14
606	0.15
607	0.14
608	0.15
609	0.14
610	0.13
611	0.14
612	0.18
613	0.23
614	0.2
615	0.22
616	0.25
617	0.28
618	0.3
619	0.36
620	0.38
621	0.42
622	0.49
623	0.48
624	0.47
625	0.48
626	0.49
627	0.47
628	0.45
629	0.37
630	0.3
631	0.28
632	0.27
633	0.24
634	0.22
635	0.15
636	0.13
637	0.14
638	0.14
639	0.16
640	0.16
641	0.16
642	0.16
643	0.17
644	0.22
645	0.22
646	0.31
647	0.33
648	0.34
649	0.37
650	0.38
651	0.41
652	0.35
653	0.33
654	0.28
655	0.23
656	0.23
657	0.2
658	0.18
659	0.12
660	0.11
661	0.14
662	0.12
663	0.13
664	0.14
665	0.14
666	0.15
667	0.19
668	0.28
669	0.33
670	0.4
671	0.46
672	0.54
673	0.59
674	0.62
675	0.63
676	0.58
677	0.53
678	0.53
679	0.55
680	0.49
681	0.45
682	0.42
683	0.38
684	0.36
685	0.31
686	0.27
687	0.18
688	0.15
689	0.15
690	0.14
691	0.13
692	0.12
693	0.12
694	0.08
695	0.07
696	0.07
697	0.06
698	0.05
699	0.04
700	0.04
701	0.04
702	0.04
703	0.03
704	0.03
705	0.03
706	0.03
707	0.03
708	0.03
709	0.03
710	0.03
711	0.03
712	0.03
713	0.04
714	0.04
715	0.04
716	0.04
717	0.06
718	0.08
719	0.08
720	0.08
721	0.08
722	0.09
723	0.12
724	0.13
725	0.12
726	0.13
727	0.16
728	0.2
729	0.24
730	0.33
731	0.32
732	0.36
733	0.39
734	0.4
735	0.44
736	0.45
737	0.43
738	0.38
739	0.36
740	0.33
741	0.31
742	0.28
743	0.21
744	0.17
745	0.14
746	0.11
747	0.11
748	0.11
749	0.14
750	0.16
751	0.18
752	0.2
753	0.2
754	0.28
755	0.31
756	0.31
757	0.31
758	0.3
759	0.28
760	0.26
761	0.26
762	0.19
763	0.16
764	0.13
765	0.1
766	0.09
767	0.09
768	0.09
769	0.09
770	0.1
771	0.1
772	0.11
773	0.12
774	0.15
775	0.19
776	0.2
777	0.2
778	0.21
779	0.2
780	0.19
781	0.18
782	0.16
783	0.18
784	0.18
785	0.19
786	0.19
787	0.2
788	0.19
789	0.2
790	0.2
791	0.17
792	0.19
793	0.21
794	0.22
795	0.23
796	0.24
797	0.22
798	0.22
799	0.2
800	0.21
801	0.22
802	0.24
803	0.24
804	0.24
805	0.27
806	0.29
807	0.28
808	0.25
809	0.21
810	0.19
811	0.18
812	0.18
813	0.15
814	0.14
815	0.15
816	0.16
817	0.16
818	0.14
819	0.16
820	0.15
821	0.16
822	0.22
823	0.25
824	0.25
825	0.27
826	0.31
827	0.32
828	0.34
829	0.33
830	0.29
831	0.26
832	0.27
833	0.25
834	0.24
835	0.24
836	0.24
837	0.26
838	0.25
839	0.24
840	0.26
841	0.31
842	0.34
843	0.36
844	0.43
845	0.47
846	0.48
847	0.49
848	0.47
849	0.46
850	0.42
851	0.42
852	0.34
853	0.32
854	0.32
855	0.31
856	0.31
857	0.28
858	0.25
859	0.22
860	0.22
861	0.17
862	0.16
863	0.16
864	0.14
865	0.14
866	0.14
867	0.16
868	0.14
869	0.13
870	0.11
871	0.13
872	0.14
873	0.13
874	0.14
875	0.16
876	0.2
877	0.22
878	0.25
879	0.26
880	0.33
881	0.43
882	0.49
883	0.52
884	0.59
885	0.63
886	0.7
887	0.73
888	0.7
889	0.67
890	0.64
891	0.65
892	0.64
893	0.66
894	0.65
895	0.64
896	0.67
897	0.66
898	0.72
899	0.7
900	0.69
901	0.69
902	0.67
903	0.72
904	0.72
905	0.75
906	0.73
907	0.74
908	0.71
909	0.64
910	0.61
911	0.58
912	0.57
913	0.55
914	0.57
915	0.55
916	0.54
917	0.6
918	0.6
919	0.58
920	0.61
921	0.62
922	0.61
923	0.65
924	0.69
925	0.66
926	0.71
927	0.73
928	0.72
929	0.72
930	0.68
931	0.67
932	0.65
933	0.7
934	0.71
935	0.68
936	0.65
937	0.66
938	0.69
939	0.68
940	0.71
941	0.66
942	0.65
943	0.69
944	0.7
945	0.7
946	0.68
947	0.65
948	0.63
949	0.63
950	0.62
951	0.64
952	0.63
953	0.57
954	0.58
955	0.61
956	0.62
957	0.66
958	0.7
959	0.69
960	0.71
961	0.75
962	0.72
963	0.7
964	0.72
965	0.71
966	0.67
967	0.68
968	0.66
969	0.66
970	0.71
971	0.71
972	0.69
973	0.69
974	0.68
975	0.64
976	0.64
977	0.58
978	0.5
979	0.49
980	0.43
981	0.39
982	0.39
983	0.37
984	0.37
985	0.39
986	0.41
987	0.43
988	0.48
989	0.47
990	0.42
991	0.39
992	0.35
993	0.36
994	0.39
995	0.42
996	0.41

U5H326

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer