Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5H1M1

Protein Details
Accession U5H1M1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
269-290EGKQKPKRTELEKKKLSKRAEKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
269-289EGKQKPKRTELEKKKLSKRAE
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10, cyto 5.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034393  TatSF1-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12285  RRM3_RBM39_like  
Amino Acid Sequences MNPPHLPSQPQPQPQTQAQTPPPNTAAATNTFASDPRVHFSLADQKWVFEADDGSEMEWDAVRGAWVPRLGEEEVAQQQAAYAVHGVDESVPAAPVLARQNGKKRKADQVTPQQTSTEMNYNDDDNNSSSSSSIASTSNLSGPAAQNKPNKKARPPKANTAIFVSHLPATATIPLLQTVFSKAGLILEDVDGNPRIKLYDDETTGLFKGEALIVYLQAASVDLAIRLLDETELELGKGQQVMKVSEAQAWRKKSGTAGEGVADDKGNAEGKQKPKRTELEKKKLSKRAEKLNQRLTEWSSDEDDNSAAIVARARSNKVVVLQGMFTLKELEEDPTLLLELKEDVRDECETMGTVTNVTLYDQEEEGIITIRFKDEVSAQACIAKMNGRFFGGRSIVASVLDPKQKYRRTGQGVSLEGTGLDLEADEEASKAEKERLARYAEWLEKGGDEEGGAEKAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.66
3 0.59
4 0.59
5 0.59
6 0.64
7 0.6
8 0.59
9 0.55
10 0.48
11 0.45
12 0.38
13 0.34
14 0.27
15 0.29
16 0.24
17 0.23
18 0.22
19 0.22
20 0.24
21 0.25
22 0.23
23 0.23
24 0.24
25 0.24
26 0.23
27 0.27
28 0.33
29 0.29
30 0.36
31 0.32
32 0.31
33 0.31
34 0.32
35 0.29
36 0.19
37 0.19
38 0.12
39 0.15
40 0.15
41 0.14
42 0.13
43 0.12
44 0.12
45 0.11
46 0.09
47 0.06
48 0.06
49 0.06
50 0.08
51 0.09
52 0.12
53 0.14
54 0.14
55 0.14
56 0.18
57 0.19
58 0.18
59 0.17
60 0.19
61 0.2
62 0.21
63 0.2
64 0.15
65 0.15
66 0.16
67 0.15
68 0.1
69 0.08
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.08
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.05
80 0.06
81 0.06
82 0.09
83 0.12
84 0.17
85 0.2
86 0.25
87 0.36
88 0.45
89 0.53
90 0.56
91 0.58
92 0.63
93 0.68
94 0.7
95 0.7
96 0.72
97 0.75
98 0.7
99 0.66
100 0.56
101 0.49
102 0.43
103 0.36
104 0.32
105 0.23
106 0.22
107 0.22
108 0.23
109 0.24
110 0.22
111 0.21
112 0.15
113 0.16
114 0.14
115 0.13
116 0.12
117 0.11
118 0.11
119 0.1
120 0.1
121 0.09
122 0.09
123 0.1
124 0.11
125 0.12
126 0.12
127 0.11
128 0.11
129 0.12
130 0.19
131 0.2
132 0.26
133 0.32
134 0.37
135 0.46
136 0.53
137 0.57
138 0.6
139 0.68
140 0.71
141 0.75
142 0.75
143 0.77
144 0.78
145 0.76
146 0.67
147 0.61
148 0.52
149 0.42
150 0.37
151 0.29
152 0.19
153 0.16
154 0.15
155 0.1
156 0.1
157 0.09
158 0.09
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.09
166 0.09
167 0.08
168 0.08
169 0.07
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.08
178 0.09
179 0.09
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.09
185 0.11
186 0.14
187 0.15
188 0.16
189 0.17
190 0.18
191 0.17
192 0.16
193 0.12
194 0.08
195 0.07
196 0.06
197 0.06
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.05
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.09
228 0.1
229 0.11
230 0.13
231 0.12
232 0.15
233 0.18
234 0.22
235 0.27
236 0.29
237 0.29
238 0.28
239 0.28
240 0.27
241 0.27
242 0.23
243 0.19
244 0.17
245 0.16
246 0.16
247 0.16
248 0.14
249 0.1
250 0.08
251 0.06
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.1
256 0.15
257 0.24
258 0.33
259 0.39
260 0.42
261 0.46
262 0.53
263 0.59
264 0.65
265 0.68
266 0.69
267 0.73
268 0.78
269 0.81
270 0.82
271 0.8
272 0.79
273 0.74
274 0.74
275 0.76
276 0.77
277 0.77
278 0.78
279 0.74
280 0.66
281 0.62
282 0.53
283 0.47
284 0.39
285 0.31
286 0.25
287 0.23
288 0.21
289 0.19
290 0.16
291 0.12
292 0.1
293 0.09
294 0.05
295 0.05
296 0.07
297 0.07
298 0.11
299 0.13
300 0.15
301 0.16
302 0.17
303 0.18
304 0.19
305 0.21
306 0.17
307 0.17
308 0.15
309 0.15
310 0.15
311 0.14
312 0.12
313 0.1
314 0.09
315 0.09
316 0.1
317 0.11
318 0.1
319 0.11
320 0.1
321 0.09
322 0.1
323 0.09
324 0.08
325 0.06
326 0.08
327 0.08
328 0.09
329 0.1
330 0.1
331 0.13
332 0.14
333 0.14
334 0.13
335 0.12
336 0.11
337 0.12
338 0.13
339 0.1
340 0.09
341 0.09
342 0.09
343 0.09
344 0.09
345 0.09
346 0.09
347 0.1
348 0.1
349 0.1
350 0.09
351 0.09
352 0.09
353 0.1
354 0.08
355 0.07
356 0.08
357 0.09
358 0.09
359 0.09
360 0.1
361 0.11
362 0.17
363 0.19
364 0.21
365 0.2
366 0.22
367 0.22
368 0.21
369 0.2
370 0.18
371 0.19
372 0.21
373 0.22
374 0.22
375 0.23
376 0.23
377 0.29
378 0.26
379 0.23
380 0.2
381 0.21
382 0.19
383 0.19
384 0.19
385 0.16
386 0.2
387 0.26
388 0.25
389 0.3
390 0.39
391 0.44
392 0.49
393 0.53
394 0.58
395 0.61
396 0.66
397 0.68
398 0.66
399 0.63
400 0.59
401 0.52
402 0.41
403 0.32
404 0.26
405 0.18
406 0.1
407 0.07
408 0.04
409 0.04
410 0.05
411 0.05
412 0.05
413 0.05
414 0.06
415 0.08
416 0.08
417 0.1
418 0.14
419 0.17
420 0.21
421 0.26
422 0.31
423 0.35
424 0.36
425 0.4
426 0.45
427 0.47
428 0.45
429 0.42
430 0.37
431 0.32
432 0.33
433 0.28
434 0.19
435 0.14
436 0.13
437 0.13