Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5H2H6

Protein Details
Accession U5H2H6    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-61KPIVGARQPQKKEKNQADKRVINPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
77-96SFGARGRGGRGGRGRGAGNP
239-252KKEAKAPKEKKTKT
259-302RHQPPRRDGEDGARGGRGGRGRGEGRGRGRGEGRGGGRGRGGRG
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 14, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
Amino Acid Sequences MAQVRSANPFALLGDDGEDSAPVAAPKAAPAAAPAAQKPIVGARQPQKKEKNQADKRVINPDAPAAPGDLKEERAASFGARGRGGRGGRGRGAGNPRSNAGTYLGGDRPRRENGGGRVFDRQSQTGHRDSDKAEAQGWGAEEGQQELEAEKLGEADAQADGAATPAAVDGASTPVVSAAPVEEEDNSQTYEEYLAAQAERKLNIALPEARKIEDADEIKGVKAVKKGEQEEEEFLAQQKKEAKAPKEKKTKTFLEVEFRHQPPRRDGEDGARGGRGGRGRGEGRGRGRGEGRGGGRGRGGRGGNANGAAQNGSSNAGVNLDDNTAFPNL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.11
3 0.11
4 0.1
5 0.1
6 0.08
7 0.08
8 0.08
9 0.06
10 0.07
11 0.08
12 0.08
13 0.09
14 0.11
15 0.1
16 0.1
17 0.11
18 0.13
19 0.16
20 0.19
21 0.18
22 0.21
23 0.21
24 0.21
25 0.21
26 0.23
27 0.24
28 0.24
29 0.32
30 0.36
31 0.45
32 0.51
33 0.6
34 0.65
35 0.69
36 0.77
37 0.79
38 0.82
39 0.82
40 0.87
41 0.87
42 0.84
43 0.8
44 0.79
45 0.7
46 0.6
47 0.51
48 0.44
49 0.36
50 0.29
51 0.25
52 0.17
53 0.16
54 0.15
55 0.17
56 0.15
57 0.15
58 0.15
59 0.16
60 0.15
61 0.15
62 0.15
63 0.12
64 0.16
65 0.18
66 0.19
67 0.2
68 0.2
69 0.2
70 0.26
71 0.26
72 0.28
73 0.29
74 0.3
75 0.31
76 0.33
77 0.32
78 0.32
79 0.39
80 0.39
81 0.39
82 0.36
83 0.35
84 0.35
85 0.34
86 0.3
87 0.24
88 0.19
89 0.15
90 0.18
91 0.19
92 0.22
93 0.24
94 0.26
95 0.27
96 0.28
97 0.3
98 0.28
99 0.32
100 0.34
101 0.41
102 0.41
103 0.38
104 0.41
105 0.39
106 0.41
107 0.37
108 0.31
109 0.24
110 0.26
111 0.29
112 0.28
113 0.3
114 0.28
115 0.27
116 0.27
117 0.3
118 0.28
119 0.24
120 0.21
121 0.19
122 0.17
123 0.16
124 0.16
125 0.11
126 0.08
127 0.09
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.07
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.02
151 0.02
152 0.02
153 0.02
154 0.02
155 0.02
156 0.02
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.03
166 0.03
167 0.04
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.06
172 0.07
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.07
184 0.1
185 0.11
186 0.11
187 0.11
188 0.11
189 0.12
190 0.14
191 0.16
192 0.19
193 0.19
194 0.23
195 0.24
196 0.24
197 0.23
198 0.22
199 0.2
200 0.21
201 0.2
202 0.17
203 0.18
204 0.18
205 0.17
206 0.19
207 0.18
208 0.15
209 0.18
210 0.19
211 0.22
212 0.28
213 0.31
214 0.34
215 0.36
216 0.36
217 0.35
218 0.35
219 0.3
220 0.24
221 0.23
222 0.23
223 0.19
224 0.2
225 0.23
226 0.23
227 0.28
228 0.36
229 0.41
230 0.47
231 0.57
232 0.64
233 0.69
234 0.73
235 0.74
236 0.75
237 0.73
238 0.67
239 0.66
240 0.61
241 0.6
242 0.57
243 0.56
244 0.57
245 0.53
246 0.58
247 0.54
248 0.55
249 0.52
250 0.57
251 0.54
252 0.5
253 0.51
254 0.5
255 0.53
256 0.51
257 0.45
258 0.38
259 0.33
260 0.29
261 0.31
262 0.25
263 0.19
264 0.19
265 0.24
266 0.25
267 0.31
268 0.37
269 0.4
270 0.43
271 0.49
272 0.48
273 0.46
274 0.47
275 0.45
276 0.42
277 0.42
278 0.38
279 0.38
280 0.38
281 0.35
282 0.37
283 0.36
284 0.34
285 0.34
286 0.33
287 0.28
288 0.32
289 0.33
290 0.31
291 0.3
292 0.29
293 0.24
294 0.23
295 0.2
296 0.15
297 0.12
298 0.11
299 0.11
300 0.1
301 0.1
302 0.09
303 0.1
304 0.1
305 0.1
306 0.11
307 0.11
308 0.11
309 0.11