Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5HF21

Protein Details
Accession U5HF21    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
62-87SSPFERAPPRHKSKSNDNSKSPKSNAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
657-694LKKRVGGGREGRQPWEGRGKQTIRRDEGRGRGEGKHRI
Subcellular Location(s) mito 22, nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF13041  PPR_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MFSRTAATRLIHPVNPTRCTAFPGGLLYSTTVKVSAPPRRSSSGPASSESNAPGRTHRSAPSSPFERAPPRHKSKSNDNSKSPKSNATLGSPFRQNGQPYDDSYMLCDQVRLLCSRDQLEKAVDLVRRTPAPTCTVVVWNVLINEVLQSFGDTGKAYELWMEMKRRGFAPTTRSFATALRGFASSANKAKGKTGTINKTKTTIASSATLSRARTIHSQWVTHLNNALDSEKMTLQHDSDELSVLPTNHFLTFLGNTEKWELLLETFNSLPTSGPLAPNSATYSLVLGFLKALPPSAENFQLAIEIYNRMINTLPPSQLDNRTLSVVLSICRDQVRPDDQALGISIVTQIFGLLPLSETHRLDDPTTPKPLLRMDSTSFSSVLTLLLKMQRYNLAVEWFDQVRDHGDRFGNQLIGPQQCELVLQAWAAKRGDAGAEALLEWMLAQGIEPSMQCYALVIKACWKNVNLSRAYHILSRMTGQNLPTPSSQPISTPSNSSSKTLETRIIPFSTKRLRPSSQALTYFLHTALSTRDRSQLSEALSTFLTPRKEGGLDGKKYLFDDPDPDSDTNPDSTKARQVPTTLEEKYFRFTLHRVLERCLNKILDVPKLVVGRYLGTTKVAEWEGVWDRVKEWVGRNRHPNLGEGEEREESMERRYEALKKRVGGGREGRQPWEGRGKQTIRRDEGRGRGEGKHRIGFEKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.51
3 0.49
4 0.46
5 0.42
6 0.44
7 0.42
8 0.34
9 0.29
10 0.3
11 0.28
12 0.24
13 0.24
14 0.21
15 0.2
16 0.19
17 0.17
18 0.14
19 0.13
20 0.18
21 0.26
22 0.33
23 0.38
24 0.43
25 0.49
26 0.53
27 0.55
28 0.56
29 0.57
30 0.57
31 0.53
32 0.49
33 0.48
34 0.45
35 0.45
36 0.41
37 0.37
38 0.3
39 0.28
40 0.3
41 0.32
42 0.35
43 0.36
44 0.38
45 0.41
46 0.43
47 0.48
48 0.52
49 0.5
50 0.49
51 0.48
52 0.49
53 0.52
54 0.55
55 0.58
56 0.59
57 0.64
58 0.71
59 0.75
60 0.76
61 0.78
62 0.8
63 0.83
64 0.82
65 0.81
66 0.82
67 0.82
68 0.83
69 0.75
70 0.72
71 0.64
72 0.62
73 0.56
74 0.53
75 0.53
76 0.48
77 0.5
78 0.47
79 0.44
80 0.41
81 0.43
82 0.39
83 0.35
84 0.38
85 0.35
86 0.34
87 0.39
88 0.36
89 0.31
90 0.32
91 0.3
92 0.25
93 0.22
94 0.19
95 0.15
96 0.17
97 0.19
98 0.18
99 0.19
100 0.2
101 0.23
102 0.26
103 0.3
104 0.28
105 0.29
106 0.29
107 0.27
108 0.26
109 0.28
110 0.27
111 0.24
112 0.25
113 0.26
114 0.25
115 0.26
116 0.27
117 0.25
118 0.26
119 0.27
120 0.26
121 0.25
122 0.26
123 0.25
124 0.23
125 0.21
126 0.18
127 0.15
128 0.14
129 0.12
130 0.09
131 0.09
132 0.07
133 0.07
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.07
138 0.08
139 0.07
140 0.07
141 0.09
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.09
146 0.12
147 0.16
148 0.19
149 0.22
150 0.25
151 0.26
152 0.27
153 0.29
154 0.29
155 0.29
156 0.34
157 0.36
158 0.38
159 0.38
160 0.38
161 0.36
162 0.33
163 0.35
164 0.3
165 0.24
166 0.21
167 0.2
168 0.19
169 0.21
170 0.24
171 0.21
172 0.23
173 0.26
174 0.27
175 0.27
176 0.3
177 0.3
178 0.3
179 0.35
180 0.4
181 0.45
182 0.51
183 0.56
184 0.53
185 0.53
186 0.5
187 0.43
188 0.37
189 0.29
190 0.23
191 0.21
192 0.21
193 0.21
194 0.24
195 0.25
196 0.21
197 0.22
198 0.2
199 0.21
200 0.23
201 0.23
202 0.29
203 0.3
204 0.3
205 0.29
206 0.38
207 0.37
208 0.34
209 0.34
210 0.26
211 0.24
212 0.24
213 0.23
214 0.14
215 0.13
216 0.14
217 0.11
218 0.12
219 0.12
220 0.12
221 0.12
222 0.12
223 0.12
224 0.11
225 0.11
226 0.1
227 0.09
228 0.09
229 0.1
230 0.1
231 0.1
232 0.1
233 0.11
234 0.1
235 0.1
236 0.09
237 0.1
238 0.1
239 0.12
240 0.15
241 0.14
242 0.15
243 0.16
244 0.16
245 0.14
246 0.14
247 0.12
248 0.09
249 0.11
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.09
257 0.07
258 0.11
259 0.1
260 0.11
261 0.11
262 0.13
263 0.13
264 0.14
265 0.15
266 0.12
267 0.11
268 0.1
269 0.1
270 0.09
271 0.1
272 0.09
273 0.07
274 0.07
275 0.06
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.06
280 0.07
281 0.09
282 0.1
283 0.11
284 0.1
285 0.11
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.09
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.12
299 0.13
300 0.14
301 0.13
302 0.16
303 0.18
304 0.21
305 0.23
306 0.2
307 0.19
308 0.19
309 0.18
310 0.16
311 0.14
312 0.11
313 0.1
314 0.1
315 0.09
316 0.1
317 0.1
318 0.11
319 0.11
320 0.14
321 0.17
322 0.17
323 0.18
324 0.18
325 0.17
326 0.17
327 0.16
328 0.12
329 0.09
330 0.07
331 0.06
332 0.05
333 0.05
334 0.04
335 0.04
336 0.03
337 0.03
338 0.03
339 0.03
340 0.04
341 0.04
342 0.07
343 0.1
344 0.1
345 0.11
346 0.13
347 0.13
348 0.14
349 0.18
350 0.2
351 0.21
352 0.23
353 0.23
354 0.21
355 0.22
356 0.24
357 0.22
358 0.2
359 0.2
360 0.19
361 0.22
362 0.24
363 0.23
364 0.2
365 0.18
366 0.16
367 0.12
368 0.11
369 0.08
370 0.06
371 0.07
372 0.1
373 0.1
374 0.1
375 0.11
376 0.13
377 0.14
378 0.15
379 0.15
380 0.14
381 0.14
382 0.15
383 0.16
384 0.14
385 0.13
386 0.11
387 0.1
388 0.12
389 0.13
390 0.12
391 0.13
392 0.14
393 0.15
394 0.18
395 0.19
396 0.16
397 0.14
398 0.16
399 0.17
400 0.17
401 0.17
402 0.15
403 0.13
404 0.12
405 0.12
406 0.11
407 0.07
408 0.07
409 0.06
410 0.09
411 0.09
412 0.12
413 0.12
414 0.11
415 0.1
416 0.1
417 0.11
418 0.08
419 0.08
420 0.06
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.05
425 0.05
426 0.04
427 0.03
428 0.03
429 0.02
430 0.02
431 0.03
432 0.03
433 0.04
434 0.04
435 0.05
436 0.06
437 0.06
438 0.06
439 0.06
440 0.07
441 0.09
442 0.1
443 0.09
444 0.16
445 0.19
446 0.21
447 0.22
448 0.22
449 0.27
450 0.31
451 0.37
452 0.33
453 0.31
454 0.33
455 0.33
456 0.34
457 0.29
458 0.25
459 0.2
460 0.18
461 0.18
462 0.18
463 0.18
464 0.19
465 0.18
466 0.21
467 0.21
468 0.23
469 0.22
470 0.22
471 0.21
472 0.21
473 0.2
474 0.17
475 0.2
476 0.22
477 0.22
478 0.23
479 0.23
480 0.28
481 0.29
482 0.3
483 0.27
484 0.26
485 0.28
486 0.28
487 0.29
488 0.25
489 0.28
490 0.29
491 0.29
492 0.28
493 0.26
494 0.31
495 0.36
496 0.38
497 0.41
498 0.44
499 0.45
500 0.48
501 0.55
502 0.55
503 0.53
504 0.51
505 0.48
506 0.43
507 0.42
508 0.38
509 0.3
510 0.22
511 0.15
512 0.14
513 0.15
514 0.17
515 0.19
516 0.19
517 0.25
518 0.25
519 0.27
520 0.3
521 0.3
522 0.28
523 0.29
524 0.28
525 0.24
526 0.23
527 0.21
528 0.19
529 0.19
530 0.19
531 0.15
532 0.15
533 0.16
534 0.17
535 0.18
536 0.27
537 0.32
538 0.33
539 0.36
540 0.36
541 0.35
542 0.35
543 0.36
544 0.28
545 0.2
546 0.21
547 0.22
548 0.24
549 0.28
550 0.27
551 0.26
552 0.26
553 0.27
554 0.25
555 0.22
556 0.2
557 0.18
558 0.2
559 0.28
560 0.31
561 0.32
562 0.31
563 0.32
564 0.35
565 0.37
566 0.42
567 0.35
568 0.34
569 0.34
570 0.33
571 0.35
572 0.31
573 0.28
574 0.25
575 0.25
576 0.3
577 0.35
578 0.41
579 0.4
580 0.42
581 0.5
582 0.49
583 0.51
584 0.46
585 0.39
586 0.32
587 0.35
588 0.35
589 0.32
590 0.31
591 0.29
592 0.29
593 0.3
594 0.29
595 0.25
596 0.23
597 0.19
598 0.2
599 0.2
600 0.16
601 0.17
602 0.17
603 0.16
604 0.19
605 0.18
606 0.16
607 0.14
608 0.2
609 0.22
610 0.26
611 0.27
612 0.23
613 0.23
614 0.28
615 0.3
616 0.28
617 0.32
618 0.36
619 0.43
620 0.51
621 0.6
622 0.6
623 0.65
624 0.61
625 0.57
626 0.54
627 0.51
628 0.47
629 0.41
630 0.41
631 0.34
632 0.34
633 0.31
634 0.28
635 0.23
636 0.23
637 0.25
638 0.21
639 0.23
640 0.27
641 0.34
642 0.42
643 0.49
644 0.51
645 0.48
646 0.55
647 0.58
648 0.56
649 0.56
650 0.56
651 0.56
652 0.59
653 0.61
654 0.56
655 0.56
656 0.56
657 0.54
658 0.56
659 0.51
660 0.47
661 0.54
662 0.57
663 0.6
664 0.68
665 0.71
666 0.67
667 0.69
668 0.71
669 0.7
670 0.72
671 0.69
672 0.65
673 0.6
674 0.6
675 0.62
676 0.64
677 0.62
678 0.59
679 0.56