Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

U5HCB7

Protein Details
Accession U5HCB7    Localization Confidence High Confidence Score 23.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
80-106KAPMLKMRTLDNRRKRKQGAGRNAAKTHydrophilic
999-1018TSDAWRRKFKKGHKDLVLEEHydrophilic
1152-1183TPNKIPNQSGAPRKKRKTRAAGGAQRKKRAREHydrophilic
1200-1225AGTGPVVSKRRSRRKATKTPAAEIVDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
92-99RRKRKQGA
199-207KKDPASARK
1162-1182APRKKRKTRAAGGAQRKKRAR
1208-1215KRRSRRKA
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 6.5, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036279  5-3_exonuclease_C_sf  
IPR008918  HhH2  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR006086  XPG-I_dom  
IPR006084  XPG/Rad2  
IPR001044  XPG/Rad2_eukaryotes  
IPR019974  XPG_CS  
IPR006085  XPG_DNA_repair_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004519  F:endonuclease activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF00867  XPG_I  
PF00752  XPG_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00841  XPG_1  
PS00842  XPG_2  
CDD cd09904  H3TH_XPG  
cd09868  PIN_XPG_RAD2  
Amino Acid Sequences MGVNGLWSLLTPVARPVNLDALERKRLAIDASIWLYQFQMTMRDKKSGDVLKGAHVMGTFRRIMKLIYHGIRPVFVFDGKAPMLKMRTLDNRRKRKQGAGRNAAKTAQLLLSAQLRAAAAGAALQRRGPDEDTLKDTSAASTSGNARTAQKLSYDRDTGERIDEHTTYLEDLEAGIGPSSSRPPHTLPKTPSRSAGPTKKDPASARKKHVLRDEYALPEIAGSLDSRIKPTDVRLATEAEQREFLNEMRPEFFDSAEFASLSTQLKYDIIGEQRLKSRQVNHRRVQEMKTLSSALDFSQSQIANLVVRNQYTQKLFQVTDELGQAAIQIPTRMAGERNRMYQLIKQDPSKGTGYVLAVQNPEFTKDTPIVIDTTTDESSDGTDSDEFEEIGIAKYHPKRSDVNEVTRQAEVLELLCARHEIKRPPVEIDPYLDVVPVEGIKSLFGHDRNPPSPVHSSHLIDEDEGIQAAIYESTLAPRHLESADFPGSPKDDHSAPAPTVGKCPSVSKRPTVSKWLPRIDDDGDSDSAHDAEDGHTVQETAPRQVISARSESTDSDYLEEVEIMRSDFIFKSEKKLNASSASAGSRRSTSPLLAPSPVASVPRTSPPTRPTGETSSLVLDPTAPEFVWTTNPAATRTPSPSVPTISTRISQGDIEEEVHLNETETDRARNGAPSSERDSTLSGRAFAIVAGNLNATTAPVLEASTPGRNDMGLPQGSSVSEHPANVSQAVTPPQQYDSETSAEAFLEWERSPTPSRLAAEAVEASESSRASETPHLEHKVNEDEGVNGDSSGDRSDDNHNEEGEVIASLRREQAQYADILSQLKNRRIEDMHDEAQADIASLSAQRNVDQRNADGISRQMENDIKELLSLFGLPFVDAPQEAEAECADLLSRKLVDGIVTDDSDVFLFGGASIYRNMFNDDKFIECYLLADLDRELGLDRKKLVRLAHLLGSDYTEGLPGVGPVLGRELLEEFPGDDGLSDFKEWWTKVQSGRDGPEDTSDAWRRKFKKGHKDLVLEESWPTSAIAKAYLAPVVSGDDEPFEWGSIDLDGIRAFLARNLSWGPEKVNGIMLPLLSRQKARSDGTLKRQGFISEFFDVSVGTGPLQRQHRRGYASSRLQSVLDQHRAKTLKKDTSKVKAEPATSTSEIPSSATPNKIPNQSGAPRKKRKTRAAGGAQRKKRAREAALFLDDDAEDAADEKAGTGPVVSKRRSRRKATKTPAAEIVDSDDDNVQEAG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.22
3 0.23
4 0.28
5 0.29
6 0.32
7 0.34
8 0.36
9 0.42
10 0.41
11 0.39
12 0.33
13 0.32
14 0.31
15 0.27
16 0.23
17 0.23
18 0.26
19 0.27
20 0.26
21 0.25
22 0.24
23 0.21
24 0.19
25 0.13
26 0.19
27 0.23
28 0.31
29 0.34
30 0.4
31 0.4
32 0.41
33 0.5
34 0.48
35 0.46
36 0.44
37 0.43
38 0.41
39 0.44
40 0.42
41 0.34
42 0.28
43 0.26
44 0.22
45 0.26
46 0.23
47 0.21
48 0.23
49 0.23
50 0.24
51 0.26
52 0.3
53 0.34
54 0.36
55 0.38
56 0.4
57 0.4
58 0.4
59 0.36
60 0.32
61 0.26
62 0.22
63 0.21
64 0.18
65 0.23
66 0.22
67 0.24
68 0.21
69 0.23
70 0.25
71 0.25
72 0.25
73 0.27
74 0.37
75 0.45
76 0.55
77 0.61
78 0.7
79 0.76
80 0.85
81 0.82
82 0.82
83 0.83
84 0.83
85 0.84
86 0.84
87 0.85
88 0.8
89 0.77
90 0.68
91 0.58
92 0.48
93 0.4
94 0.3
95 0.21
96 0.17
97 0.17
98 0.19
99 0.18
100 0.17
101 0.16
102 0.14
103 0.13
104 0.13
105 0.1
106 0.06
107 0.08
108 0.11
109 0.12
110 0.12
111 0.13
112 0.14
113 0.17
114 0.2
115 0.2
116 0.23
117 0.26
118 0.3
119 0.34
120 0.36
121 0.35
122 0.33
123 0.31
124 0.25
125 0.22
126 0.18
127 0.13
128 0.14
129 0.17
130 0.19
131 0.2
132 0.21
133 0.23
134 0.26
135 0.28
136 0.25
137 0.28
138 0.31
139 0.34
140 0.38
141 0.38
142 0.36
143 0.38
144 0.4
145 0.35
146 0.33
147 0.29
148 0.25
149 0.27
150 0.26
151 0.23
152 0.21
153 0.2
154 0.17
155 0.16
156 0.13
157 0.09
158 0.09
159 0.08
160 0.07
161 0.07
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.07
166 0.11
167 0.13
168 0.15
169 0.18
170 0.23
171 0.33
172 0.41
173 0.48
174 0.51
175 0.6
176 0.66
177 0.65
178 0.64
179 0.6
180 0.6
181 0.61
182 0.63
183 0.6
184 0.61
185 0.65
186 0.64
187 0.65
188 0.64
189 0.64
190 0.66
191 0.67
192 0.67
193 0.69
194 0.7
195 0.71
196 0.75
197 0.7
198 0.62
199 0.59
200 0.57
201 0.51
202 0.48
203 0.41
204 0.31
205 0.25
206 0.21
207 0.15
208 0.1
209 0.07
210 0.07
211 0.12
212 0.12
213 0.14
214 0.16
215 0.17
216 0.18
217 0.21
218 0.28
219 0.25
220 0.28
221 0.27
222 0.3
223 0.31
224 0.36
225 0.35
226 0.26
227 0.27
228 0.23
229 0.23
230 0.21
231 0.19
232 0.21
233 0.21
234 0.22
235 0.22
236 0.23
237 0.26
238 0.25
239 0.24
240 0.17
241 0.17
242 0.17
243 0.15
244 0.14
245 0.11
246 0.1
247 0.12
248 0.13
249 0.11
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.1
254 0.11
255 0.13
256 0.15
257 0.21
258 0.23
259 0.26
260 0.31
261 0.34
262 0.36
263 0.36
264 0.42
265 0.47
266 0.56
267 0.62
268 0.64
269 0.71
270 0.73
271 0.73
272 0.68
273 0.66
274 0.59
275 0.51
276 0.45
277 0.37
278 0.31
279 0.27
280 0.24
281 0.16
282 0.15
283 0.13
284 0.12
285 0.17
286 0.16
287 0.16
288 0.16
289 0.16
290 0.14
291 0.14
292 0.18
293 0.14
294 0.15
295 0.17
296 0.18
297 0.22
298 0.24
299 0.26
300 0.24
301 0.27
302 0.27
303 0.25
304 0.27
305 0.23
306 0.22
307 0.2
308 0.17
309 0.12
310 0.11
311 0.11
312 0.08
313 0.08
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.08
318 0.09
319 0.09
320 0.11
321 0.15
322 0.23
323 0.26
324 0.3
325 0.31
326 0.32
327 0.32
328 0.33
329 0.37
330 0.37
331 0.37
332 0.36
333 0.4
334 0.4
335 0.42
336 0.4
337 0.32
338 0.24
339 0.23
340 0.23
341 0.21
342 0.21
343 0.2
344 0.19
345 0.18
346 0.21
347 0.18
348 0.2
349 0.16
350 0.15
351 0.17
352 0.17
353 0.17
354 0.15
355 0.16
356 0.14
357 0.12
358 0.12
359 0.11
360 0.13
361 0.13
362 0.12
363 0.12
364 0.11
365 0.11
366 0.11
367 0.1
368 0.07
369 0.07
370 0.08
371 0.09
372 0.09
373 0.08
374 0.08
375 0.08
376 0.07
377 0.08
378 0.08
379 0.07
380 0.13
381 0.18
382 0.24
383 0.25
384 0.28
385 0.31
386 0.36
387 0.47
388 0.47
389 0.5
390 0.52
391 0.53
392 0.52
393 0.47
394 0.42
395 0.31
396 0.25
397 0.17
398 0.1
399 0.08
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.08
404 0.08
405 0.12
406 0.17
407 0.21
408 0.29
409 0.35
410 0.36
411 0.39
412 0.41
413 0.41
414 0.37
415 0.36
416 0.29
417 0.25
418 0.23
419 0.19
420 0.16
421 0.12
422 0.11
423 0.08
424 0.06
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.06
429 0.07
430 0.1
431 0.11
432 0.13
433 0.18
434 0.25
435 0.26
436 0.27
437 0.26
438 0.27
439 0.31
440 0.3
441 0.29
442 0.26
443 0.26
444 0.26
445 0.29
446 0.25
447 0.2
448 0.18
449 0.15
450 0.11
451 0.1
452 0.08
453 0.05
454 0.04
455 0.05
456 0.04
457 0.03
458 0.03
459 0.03
460 0.05
461 0.07
462 0.07
463 0.08
464 0.08
465 0.1
466 0.1
467 0.1
468 0.1
469 0.14
470 0.16
471 0.15
472 0.15
473 0.15
474 0.16
475 0.15
476 0.15
477 0.12
478 0.11
479 0.12
480 0.14
481 0.15
482 0.14
483 0.19
484 0.21
485 0.19
486 0.21
487 0.21
488 0.21
489 0.18
490 0.23
491 0.23
492 0.28
493 0.31
494 0.33
495 0.39
496 0.44
497 0.46
498 0.5
499 0.54
500 0.54
501 0.59
502 0.59
503 0.54
504 0.49
505 0.49
506 0.42
507 0.36
508 0.29
509 0.24
510 0.19
511 0.18
512 0.17
513 0.13
514 0.11
515 0.09
516 0.07
517 0.05
518 0.05
519 0.06
520 0.06
521 0.06
522 0.06
523 0.07
524 0.07
525 0.1
526 0.11
527 0.11
528 0.12
529 0.12
530 0.12
531 0.14
532 0.17
533 0.15
534 0.16
535 0.16
536 0.15
537 0.16
538 0.17
539 0.18
540 0.18
541 0.15
542 0.14
543 0.14
544 0.13
545 0.12
546 0.12
547 0.08
548 0.06
549 0.06
550 0.05
551 0.05
552 0.04
553 0.06
554 0.06
555 0.07
556 0.11
557 0.11
558 0.17
559 0.22
560 0.25
561 0.27
562 0.29
563 0.3
564 0.28
565 0.29
566 0.24
567 0.21
568 0.2
569 0.18
570 0.17
571 0.15
572 0.14
573 0.14
574 0.15
575 0.14
576 0.13
577 0.15
578 0.17
579 0.18
580 0.17
581 0.16
582 0.14
583 0.14
584 0.14
585 0.12
586 0.09
587 0.09
588 0.1
589 0.14
590 0.18
591 0.18
592 0.22
593 0.24
594 0.29
595 0.29
596 0.3
597 0.3
598 0.31
599 0.32
600 0.29
601 0.27
602 0.24
603 0.22
604 0.2
605 0.15
606 0.1
607 0.07
608 0.07
609 0.07
610 0.05
611 0.05
612 0.06
613 0.06
614 0.08
615 0.09
616 0.09
617 0.1
618 0.11
619 0.12
620 0.13
621 0.14
622 0.15
623 0.17
624 0.18
625 0.17
626 0.18
627 0.18
628 0.19
629 0.2
630 0.2
631 0.19
632 0.19
633 0.19
634 0.18
635 0.17
636 0.16
637 0.14
638 0.12
639 0.11
640 0.1
641 0.1
642 0.09
643 0.09
644 0.08
645 0.08
646 0.08
647 0.07
648 0.07
649 0.06
650 0.08
651 0.08
652 0.09
653 0.08
654 0.1
655 0.1
656 0.12
657 0.12
658 0.14
659 0.15
660 0.18
661 0.23
662 0.24
663 0.24
664 0.22
665 0.24
666 0.21
667 0.24
668 0.21
669 0.16
670 0.14
671 0.14
672 0.13
673 0.11
674 0.1
675 0.06
676 0.05
677 0.05
678 0.05
679 0.04
680 0.04
681 0.04
682 0.04
683 0.03
684 0.03
685 0.03
686 0.03
687 0.04
688 0.04
689 0.05
690 0.07
691 0.1
692 0.1
693 0.1
694 0.1
695 0.09
696 0.1
697 0.1
698 0.14
699 0.12
700 0.12
701 0.12
702 0.12
703 0.12
704 0.13
705 0.12
706 0.11
707 0.11
708 0.11
709 0.11
710 0.13
711 0.13
712 0.12
713 0.12
714 0.08
715 0.09
716 0.12
717 0.12
718 0.12
719 0.12
720 0.13
721 0.14
722 0.14
723 0.16
724 0.15
725 0.16
726 0.15
727 0.15
728 0.14
729 0.13
730 0.11
731 0.09
732 0.07
733 0.08
734 0.08
735 0.08
736 0.08
737 0.11
738 0.13
739 0.14
740 0.17
741 0.17
742 0.19
743 0.19
744 0.19
745 0.17
746 0.16
747 0.15
748 0.13
749 0.09
750 0.08
751 0.07
752 0.07
753 0.07
754 0.06
755 0.06
756 0.06
757 0.08
758 0.13
759 0.15
760 0.17
761 0.23
762 0.26
763 0.26
764 0.26
765 0.28
766 0.28
767 0.26
768 0.23
769 0.18
770 0.15
771 0.16
772 0.16
773 0.13
774 0.08
775 0.08
776 0.07
777 0.07
778 0.07
779 0.06
780 0.06
781 0.08
782 0.14
783 0.17
784 0.21
785 0.22
786 0.22
787 0.21
788 0.21
789 0.19
790 0.14
791 0.1
792 0.07
793 0.06
794 0.06
795 0.06
796 0.08
797 0.09
798 0.09
799 0.09
800 0.11
801 0.12
802 0.12
803 0.13
804 0.12
805 0.12
806 0.13
807 0.13
808 0.17
809 0.21
810 0.26
811 0.29
812 0.29
813 0.32
814 0.32
815 0.35
816 0.36
817 0.38
818 0.35
819 0.31
820 0.31
821 0.27
822 0.26
823 0.22
824 0.15
825 0.08
826 0.06
827 0.05
828 0.05
829 0.06
830 0.08
831 0.09
832 0.1
833 0.15
834 0.17
835 0.21
836 0.21
837 0.22
838 0.24
839 0.25
840 0.23
841 0.2
842 0.2
843 0.18
844 0.17
845 0.17
846 0.15
847 0.16
848 0.17
849 0.17
850 0.16
851 0.14
852 0.13
853 0.13
854 0.11
855 0.08
856 0.08
857 0.06
858 0.07
859 0.07
860 0.07
861 0.06
862 0.07
863 0.07
864 0.07
865 0.08
866 0.07
867 0.07
868 0.07
869 0.08
870 0.07
871 0.07
872 0.07
873 0.06
874 0.05
875 0.06
876 0.06
877 0.08
878 0.08
879 0.07
880 0.08
881 0.08
882 0.09
883 0.08
884 0.11
885 0.11
886 0.11
887 0.11
888 0.1
889 0.11
890 0.1
891 0.09
892 0.06
893 0.04
894 0.04
895 0.04
896 0.05
897 0.05
898 0.06
899 0.07
900 0.08
901 0.09
902 0.1
903 0.14
904 0.14
905 0.15
906 0.17
907 0.18
908 0.19
909 0.19
910 0.2
911 0.16
912 0.14
913 0.15
914 0.12
915 0.12
916 0.1
917 0.09
918 0.08
919 0.08
920 0.08
921 0.07
922 0.08
923 0.11
924 0.13
925 0.15
926 0.18
927 0.21
928 0.23
929 0.27
930 0.28
931 0.3
932 0.33
933 0.35
934 0.36
935 0.33
936 0.32
937 0.28
938 0.28
939 0.22
940 0.17
941 0.13
942 0.09
943 0.08
944 0.07
945 0.07
946 0.05
947 0.05
948 0.05
949 0.05
950 0.05
951 0.07
952 0.08
953 0.07
954 0.08
955 0.09
956 0.09
957 0.1
958 0.1
959 0.08
960 0.08
961 0.09
962 0.08
963 0.06
964 0.06
965 0.07
966 0.08
967 0.08
968 0.08
969 0.09
970 0.14
971 0.15
972 0.18
973 0.21
974 0.24
975 0.3
976 0.36
977 0.42
978 0.42
979 0.45
980 0.46
981 0.43
982 0.4
983 0.37
984 0.32
985 0.27
986 0.3
987 0.34
988 0.34
989 0.37
990 0.44
991 0.45
992 0.53
993 0.61
994 0.63
995 0.67
996 0.73
997 0.78
998 0.78
999 0.8
1000 0.74
1001 0.72
1002 0.63
1003 0.52
1004 0.43
1005 0.33
1006 0.25
1007 0.19
1008 0.16
1009 0.1
1010 0.11
1011 0.1
1012 0.11
1013 0.1
1014 0.11
1015 0.12
1016 0.13
1017 0.11
1018 0.1
1019 0.1
1020 0.1
1021 0.11
1022 0.1
1023 0.1
1024 0.09
1025 0.1
1026 0.12
1027 0.12
1028 0.1
1029 0.09
1030 0.09
1031 0.09
1032 0.08
1033 0.09
1034 0.07
1035 0.07
1036 0.07
1037 0.07
1038 0.06
1039 0.06
1040 0.06
1041 0.08
1042 0.12
1043 0.11
1044 0.14
1045 0.15
1046 0.18
1047 0.2
1048 0.22
1049 0.22
1050 0.23
1051 0.25
1052 0.23
1053 0.25
1054 0.23
1055 0.21
1056 0.21
1057 0.18
1058 0.15
1059 0.17
1060 0.21
1061 0.19
1062 0.21
1063 0.22
1064 0.26
1065 0.32
1066 0.33
1067 0.38
1068 0.42
1069 0.49
1070 0.56
1071 0.64
1072 0.6
1073 0.55
1074 0.54
1075 0.47
1076 0.42
1077 0.37
1078 0.32
1079 0.25
1080 0.24
1081 0.23
1082 0.21
1083 0.19
1084 0.17
1085 0.15
1086 0.11
1087 0.08
1088 0.11
1089 0.12
1090 0.18
1091 0.27
1092 0.33
1093 0.37
1094 0.43
1095 0.49
1096 0.53
1097 0.57
1098 0.59
1099 0.6
1100 0.64
1101 0.63
1102 0.59
1103 0.54
1104 0.49
1105 0.45
1106 0.45
1107 0.44
1108 0.43
1109 0.42
1110 0.39
1111 0.46
1112 0.49
1113 0.5
1114 0.51
1115 0.52
1116 0.53
1117 0.57
1118 0.65
1119 0.66
1120 0.72
1121 0.78
1122 0.72
1123 0.72
1124 0.67
1125 0.62
1126 0.58
1127 0.52
1128 0.49
1129 0.42
1130 0.4
1131 0.32
1132 0.27
1133 0.25
1134 0.23
1135 0.21
1136 0.2
1137 0.23
1138 0.25
1139 0.27
1140 0.33
1141 0.39
1142 0.43
1143 0.43
1144 0.41
1145 0.45
1146 0.49
1147 0.57
1148 0.62
1149 0.66
1150 0.71
1151 0.79
1152 0.85
1153 0.87
1154 0.9
1155 0.9
1156 0.89
1157 0.89
1158 0.9
1159 0.9
1160 0.91
1161 0.91
1162 0.89
1163 0.88
1164 0.84
1165 0.79
1166 0.77
1167 0.75
1168 0.72
1169 0.71
1170 0.7
1171 0.69
1172 0.68
1173 0.63
1174 0.54
1175 0.46
1176 0.38
1177 0.29
1178 0.21
1179 0.12
1180 0.07
1181 0.08
1182 0.08
1183 0.06
1184 0.06
1185 0.07
1186 0.08
1187 0.08
1188 0.08
1189 0.08
1190 0.13
1191 0.21
1192 0.29
1193 0.33
1194 0.4
1195 0.51
1196 0.62
1197 0.71
1198 0.77
1199 0.79
1200 0.82
1201 0.9
1202 0.92
1203 0.92
1204 0.87
1205 0.84
1206 0.81
1207 0.74
1208 0.64
1209 0.54
1210 0.49
1211 0.41
1212 0.34
1213 0.3
1214 0.23
1215 0.18