FuNGI

U5H6X2

Protein Details

Accession

U5H6X2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
301-324	ALNRLGKRRRKVAKKVVRPKVRDG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
97-106	GRKGRKGAGA
305-320	LGKRRRKVAKKVVRPK

Subcellular Location(s)

mito 12, nucl 9.5, cyto_nucl 7, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039905 CD2BP2/Lin1 IPR035445 GYF-like_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005682 C:U5 snRNP

Amino Acid Sequences

MAPKRPAESLARPNASSSSLAATQPSSSTGGKRVKFDAATLNATNSGGANASATEAELEEDDLLNPSTARKKVVTDGYDSDSSADGSEDGFGGIGGGRKGRKGAGAEKEKEGEGEDEDDDMFDGGHDEGEGVAKRNTAEKSKKKEFLEMGDIEGQEFGKGEDEEEGQEQDGAEQDEEEEYALEDDLANDDDAPRSRRSKKGMGYQLSSFNMADELNEGRFSADGTYVRNNDDPLATHDKWLDGVSKASIRAARESKKRMDEQARKKEEEEARGAEAMAQQRDDCLIGLLSLVRPGESITMALNRLGKRRRKVAKKVVRPKVRDGDEAMDLDEQTTTSSEVSKGKQREEEEAEDVDPAVKMIDRITYLASTLLAQGELEIYDISYEAIIQTLKEEGAVRRDWVPPVDPDIAKEEEEERLASLAQPRRGLIARPNVVTARPSSSTPQAVATAVNPNGRKFFYKWKVPQADQVPNQEYGPFGTEEIETWIQGGFLGPQGANIVVRVEGQGGQAWTNWQEAKV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.45
3	0.37
4	0.28
5	0.23
6	0.21
7	0.21
8	0.21
9	0.2
10	0.19
11	0.18
12	0.19
13	0.18
14	0.18
15	0.2
16	0.27
17	0.35
18	0.37
19	0.4
20	0.41
21	0.44
22	0.43
23	0.43
24	0.43
25	0.39
26	0.41
27	0.38
28	0.36
29	0.31
30	0.3
31	0.27
32	0.19
33	0.15
34	0.1
35	0.09
36	0.08
37	0.07
38	0.08
39	0.07
40	0.07
41	0.07
42	0.06
43	0.07
44	0.07
45	0.08
46	0.07
47	0.08
48	0.08
49	0.09
50	0.09
51	0.09
52	0.09
53	0.12
54	0.18
55	0.2
56	0.23
57	0.23
58	0.26
59	0.33
60	0.41
61	0.4
62	0.38
63	0.41
64	0.42
65	0.41
66	0.38
67	0.32
68	0.24
69	0.22
70	0.17
71	0.13
72	0.08
73	0.07
74	0.08
75	0.06
76	0.06
77	0.05
78	0.05
79	0.05
80	0.05
81	0.07
82	0.07
83	0.11
84	0.12
85	0.13
86	0.15
87	0.16
88	0.19
89	0.22
90	0.29
91	0.36
92	0.45
93	0.47
94	0.49
95	0.49
96	0.45
97	0.41
98	0.34
99	0.25
100	0.17
101	0.17
102	0.14
103	0.12
104	0.12
105	0.12
106	0.1
107	0.09
108	0.07
109	0.05
110	0.05
111	0.05
112	0.05
113	0.05
114	0.05
115	0.05
116	0.07
117	0.08
118	0.09
119	0.1
120	0.11
121	0.11
122	0.16
123	0.19
124	0.26
125	0.35
126	0.43
127	0.52
128	0.6
129	0.67
130	0.64
131	0.68
132	0.63
133	0.58
134	0.56
135	0.47
136	0.41
137	0.36
138	0.34
139	0.27
140	0.24
141	0.19
142	0.11
143	0.11
144	0.08
145	0.07
146	0.07
147	0.07
148	0.08
149	0.09
150	0.1
151	0.11
152	0.11
153	0.09
154	0.09
155	0.09
156	0.07
157	0.08
158	0.08
159	0.07
160	0.06
161	0.06
162	0.06
163	0.06
164	0.06
165	0.05
166	0.04
167	0.05
168	0.04
169	0.04
170	0.04
171	0.04
172	0.05
173	0.06
174	0.05
175	0.05
176	0.05
177	0.07
178	0.1
179	0.13
180	0.15
181	0.21
182	0.26
183	0.32
184	0.38
185	0.45
186	0.49
187	0.56
188	0.62
189	0.6
190	0.58
191	0.54
192	0.53
193	0.46
194	0.41
195	0.31
196	0.21
197	0.17
198	0.14
199	0.11
200	0.08
201	0.08
202	0.07
203	0.07
204	0.07
205	0.07
206	0.07
207	0.07
208	0.06
209	0.07
210	0.07
211	0.1
212	0.13
213	0.14
214	0.16
215	0.16
216	0.16
217	0.14
218	0.14
219	0.13
220	0.15
221	0.23
222	0.21
223	0.22
224	0.22
225	0.21
226	0.21
227	0.21
228	0.17
229	0.09
230	0.1
231	0.1
232	0.11
233	0.11
234	0.12
235	0.13
236	0.12
237	0.17
238	0.21
239	0.27
240	0.32
241	0.37
242	0.41
243	0.44
244	0.45
245	0.48
246	0.53
247	0.56
248	0.6
249	0.66
250	0.66
251	0.62
252	0.61
253	0.62
254	0.55
255	0.49
256	0.41
257	0.33
258	0.28
259	0.27
260	0.26
261	0.18
262	0.17
263	0.16
264	0.13
265	0.12
266	0.1
267	0.1
268	0.11
269	0.1
270	0.07
271	0.05
272	0.05
273	0.04
274	0.05
275	0.05
276	0.04
277	0.06
278	0.05
279	0.05
280	0.05
281	0.05
282	0.06
283	0.06
284	0.06
285	0.06
286	0.07
287	0.08
288	0.09
289	0.13
290	0.14
291	0.2
292	0.28
293	0.34
294	0.37
295	0.47
296	0.55
297	0.61
298	0.7
299	0.75
300	0.78
301	0.82
302	0.88
303	0.88
304	0.88
305	0.82
306	0.79
307	0.77
308	0.7
309	0.61
310	0.53
311	0.46
312	0.39
313	0.35
314	0.28
315	0.19
316	0.16
317	0.14
318	0.11
319	0.08
320	0.06
321	0.06
322	0.06
323	0.05
324	0.06
325	0.08
326	0.12
327	0.14
328	0.21
329	0.24
330	0.26
331	0.32
332	0.33
333	0.37
334	0.39
335	0.41
336	0.36
337	0.34
338	0.31
339	0.26
340	0.24
341	0.18
342	0.12
343	0.08
344	0.06
345	0.05
346	0.05
347	0.05
348	0.07
349	0.07
350	0.08
351	0.1
352	0.09
353	0.1
354	0.1
355	0.09
356	0.08
357	0.08
358	0.08
359	0.06
360	0.06
361	0.06
362	0.06
363	0.05
364	0.05
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.04
369	0.04
370	0.04
371	0.04
372	0.03
373	0.04
374	0.05
375	0.05
376	0.05
377	0.06
378	0.06
379	0.07
380	0.1
381	0.11
382	0.15
383	0.16
384	0.18
385	0.2
386	0.22
387	0.23
388	0.23
389	0.24
390	0.21
391	0.26
392	0.3
393	0.26
394	0.26
395	0.28
396	0.28
397	0.25
398	0.25
399	0.21
400	0.17
401	0.18
402	0.17
403	0.13
404	0.12
405	0.12
406	0.12
407	0.19
408	0.23
409	0.26
410	0.27
411	0.27
412	0.3
413	0.32
414	0.33
415	0.33
416	0.37
417	0.38
418	0.37
419	0.4
420	0.37
421	0.37
422	0.36
423	0.3
424	0.25
425	0.23
426	0.24
427	0.25
428	0.29
429	0.3
430	0.29
431	0.29
432	0.25
433	0.24
434	0.22
435	0.2
436	0.21
437	0.22
438	0.26
439	0.26
440	0.26
441	0.29
442	0.31
443	0.33
444	0.3
445	0.39
446	0.42
447	0.51
448	0.57
449	0.65
450	0.71
451	0.69
452	0.74
453	0.72
454	0.73
455	0.68
456	0.68
457	0.61
458	0.54
459	0.52
460	0.43
461	0.35
462	0.27
463	0.25
464	0.17
465	0.14
466	0.14
467	0.13
468	0.14
469	0.19
470	0.18
471	0.15
472	0.15
473	0.14
474	0.13
475	0.12
476	0.12
477	0.07
478	0.08
479	0.11
480	0.1
481	0.1
482	0.12
483	0.13
484	0.12
485	0.12
486	0.11
487	0.09
488	0.1
489	0.1
490	0.1
491	0.11
492	0.12
493	0.15
494	0.15
495	0.15
496	0.15
497	0.18
498	0.18
499	0.21

U5H6X2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer