Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5H5B2

Protein Details
Accession U5H5B2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
235-260TEVQGGPVNKKKKKKRLRESEVGGDGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
243-252NKKKKKKRLR
291-299RKKKKLKQG
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.333, cyto 6, cyto_mito 3.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013942  Mediator_Med19_fun  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Amino Acid Sequences MEAGPSRPLGPIASTSTSTSTLSSTLNGGAELSTTAFATTTGRNLASVLIAPSNMKPSPLSGSRDLISLFHLEPLYDTHLRPFLPQDSTSTGSNNSTTSDPNTPNPVHSNGKGKQSLVVDPAPSRIGISFGGIKLGALGPGALNGSGNDGKQGNPTQQQQRQPKPEKEKTYLYLVADIPGRNAIRKDSYLKHLILNPDSPAVDLRALDEDVLRDAFTLKPGTIPGFDALVWENDTEVQGGPVNKKKKKKRLRESEVGGDGGGGGGGNVVTLTATGTPNLSGTTNTSEDDHRKKKKLKQG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.25
3 0.26
4 0.27
5 0.26
6 0.23
7 0.18
8 0.17
9 0.16
10 0.15
11 0.14
12 0.14
13 0.13
14 0.12
15 0.11
16 0.1
17 0.09
18 0.09
19 0.08
20 0.07
21 0.07
22 0.07
23 0.06
24 0.07
25 0.09
26 0.1
27 0.11
28 0.13
29 0.13
30 0.13
31 0.13
32 0.14
33 0.12
34 0.12
35 0.11
36 0.09
37 0.1
38 0.11
39 0.11
40 0.16
41 0.15
42 0.15
43 0.14
44 0.15
45 0.21
46 0.25
47 0.3
48 0.28
49 0.31
50 0.31
51 0.31
52 0.3
53 0.24
54 0.2
55 0.18
56 0.15
57 0.14
58 0.13
59 0.12
60 0.12
61 0.14
62 0.18
63 0.17
64 0.17
65 0.17
66 0.2
67 0.2
68 0.21
69 0.22
70 0.2
71 0.22
72 0.22
73 0.23
74 0.25
75 0.28
76 0.27
77 0.25
78 0.22
79 0.2
80 0.2
81 0.17
82 0.14
83 0.13
84 0.13
85 0.16
86 0.2
87 0.21
88 0.22
89 0.27
90 0.26
91 0.27
92 0.29
93 0.31
94 0.29
95 0.3
96 0.36
97 0.33
98 0.4
99 0.39
100 0.36
101 0.35
102 0.33
103 0.32
104 0.27
105 0.25
106 0.2
107 0.18
108 0.2
109 0.16
110 0.14
111 0.12
112 0.09
113 0.09
114 0.08
115 0.09
116 0.09
117 0.08
118 0.09
119 0.08
120 0.08
121 0.07
122 0.07
123 0.05
124 0.04
125 0.04
126 0.03
127 0.04
128 0.04
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.06
133 0.07
134 0.07
135 0.08
136 0.08
137 0.09
138 0.11
139 0.13
140 0.13
141 0.16
142 0.22
143 0.28
144 0.34
145 0.42
146 0.49
147 0.55
148 0.63
149 0.67
150 0.71
151 0.73
152 0.76
153 0.74
154 0.7
155 0.67
156 0.59
157 0.56
158 0.5
159 0.41
160 0.35
161 0.29
162 0.25
163 0.23
164 0.2
165 0.14
166 0.15
167 0.15
168 0.13
169 0.14
170 0.14
171 0.15
172 0.18
173 0.22
174 0.22
175 0.28
176 0.31
177 0.31
178 0.31
179 0.32
180 0.33
181 0.3
182 0.28
183 0.24
184 0.21
185 0.2
186 0.18
187 0.15
188 0.13
189 0.11
190 0.09
191 0.09
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.08
200 0.06
201 0.08
202 0.08
203 0.1
204 0.11
205 0.09
206 0.1
207 0.12
208 0.13
209 0.12
210 0.14
211 0.12
212 0.12
213 0.11
214 0.12
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.1
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.08
224 0.08
225 0.1
226 0.12
227 0.18
228 0.25
229 0.34
230 0.41
231 0.51
232 0.61
233 0.69
234 0.78
235 0.83
236 0.87
237 0.89
238 0.92
239 0.92
240 0.89
241 0.87
242 0.79
243 0.68
244 0.56
245 0.44
246 0.34
247 0.24
248 0.16
249 0.07
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.03
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.04
259 0.06
260 0.07
261 0.08
262 0.09
263 0.09
264 0.1
265 0.11
266 0.11
267 0.1
268 0.13
269 0.18
270 0.19
271 0.19
272 0.21
273 0.25
274 0.33
275 0.43
276 0.5
277 0.54
278 0.62
279 0.7