Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5HIW1

Protein Details
Accession U5HIW1    Localization Confidence Low Confidence Score 8.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
22-44KVPARPTHTRRATKDESKRQSIVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 10, cyto 7, mito 6, plas 1, extr 1, pero 1, E.R. 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR016059  DNA_ligase_ATP-dep_CS  
IPR012308  DNA_ligase_ATP-dep_N  
IPR036599  DNA_ligase_N_sf  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF04675  DNA_ligase_A_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00697  DNA_LIGASE_A1  
PS00333  DNA_LIGASE_A2  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
Amino Acid Sequences MKLSSNPIPFRGLCGLIDELAKVPARPTHTRRATKDESKRQSIVRRWIQDHKDGTAPWLSERMPPGTIVLWFRMMYPEEGVRRRYSIGDTTMAAWLADYLDLRKELRDELPGEWSRPDRERRAGVTGCLGLKISQSWPMNPRSSTPLTLGRIDELLDELAAKAGTSADRVRSLYSSTSRTRNRDEILRELFDPLTEREASIMVQIILQDMSPIFYPLPTTSSTAALLKYNARAHERLTAQDAMALWHERMPDLYRIKADIDEAATEVERALRCGEEPQNFQPRLGIPILVPRTNKPQACEDACRCLSGRTAVETKYDGERVQAHIDLSLPIERQVQIFSKSCRDSTKDRYRLIPIIRASLGLTIPSVNQVRSWLGMPRTADSTHGMTYADDTIVEPRLLRRSAQTRAQEWKKLVLEGEMVPFDENTNAPAPFYTLVYAKSGRDNGAAAAEEDAESAMTGSTQEETPSDGLPLHLHIVWFELLVLDDISLLDTPFSLRRVLLKKLINEIQGFSSFPETIDIDFADRSTALEELRSRFAQIITERKEGLMLKPLTGVYNELHDNRRWIKLKKDFIPGCGDTIDVHVLGASWKKERGRDQLVPTTVYTTFFIGFLASESPFDLWTNIPAKPHYVILSASSYGHQGALDRKRLCELNSNIMSAEQLEFSSARHVAGEAFYGDFKRVKVSEQGLDVWMADACPYTFSLSKELESSATMPWIIFTEPRVFEIVGAGFQKERGCKYHALRWPRIAKVDRTDGDPVDLEQLQAIAHHATDSPWAVSELFTPHVQLCDNYPDQHSSLDSVLARAKAHECKKWVAKLEEADKIERPTFAWNHRMVEEDDGERQDKHIAGPYALVCQAFGISWADLVGPASGCRKRPYDTLGADNSVKPRARDGSPPFRLDRTAWGRQAPDRQLTFTKLLIPPSTAQPLTPLFPLNVLRASNLISEAESESSGSPTRDYAWSVLPAPEIDCTMGLPGPCHLKNSNYYRHPLHVLWAAGWSIPGYRPLSRLRQGVIYVESEHDIDFVRQISRHALPSKDKKLLWFIDRRWYGHRTSLQSLSQSNGVLQVW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.28
3 0.24
4 0.24
5 0.2
6 0.16
7 0.18
8 0.18
9 0.15
10 0.16
11 0.19
12 0.25
13 0.34
14 0.4
15 0.47
16 0.57
17 0.66
18 0.7
19 0.75
20 0.77
21 0.78
22 0.83
23 0.83
24 0.82
25 0.8
26 0.79
27 0.77
28 0.77
29 0.76
30 0.76
31 0.74
32 0.74
33 0.72
34 0.78
35 0.76
36 0.75
37 0.7
38 0.62
39 0.57
40 0.49
41 0.46
42 0.42
43 0.36
44 0.29
45 0.3
46 0.28
47 0.27
48 0.31
49 0.3
50 0.25
51 0.25
52 0.25
53 0.22
54 0.25
55 0.23
56 0.21
57 0.21
58 0.2
59 0.21
60 0.23
61 0.23
62 0.21
63 0.21
64 0.26
65 0.3
66 0.35
67 0.37
68 0.36
69 0.37
70 0.37
71 0.36
72 0.35
73 0.33
74 0.32
75 0.31
76 0.3
77 0.29
78 0.29
79 0.26
80 0.21
81 0.15
82 0.12
83 0.1
84 0.09
85 0.08
86 0.08
87 0.11
88 0.13
89 0.14
90 0.15
91 0.16
92 0.19
93 0.21
94 0.25
95 0.25
96 0.25
97 0.33
98 0.34
99 0.34
100 0.35
101 0.35
102 0.35
103 0.4
104 0.47
105 0.45
106 0.5
107 0.55
108 0.55
109 0.6
110 0.56
111 0.51
112 0.47
113 0.44
114 0.37
115 0.31
116 0.27
117 0.2
118 0.18
119 0.19
120 0.16
121 0.2
122 0.21
123 0.26
124 0.31
125 0.37
126 0.41
127 0.39
128 0.41
129 0.41
130 0.43
131 0.4
132 0.39
133 0.4
134 0.38
135 0.4
136 0.37
137 0.31
138 0.28
139 0.26
140 0.22
141 0.15
142 0.12
143 0.09
144 0.09
145 0.07
146 0.08
147 0.07
148 0.06
149 0.05
150 0.06
151 0.07
152 0.1
153 0.12
154 0.14
155 0.18
156 0.19
157 0.2
158 0.21
159 0.23
160 0.25
161 0.27
162 0.3
163 0.32
164 0.41
165 0.46
166 0.51
167 0.55
168 0.56
169 0.56
170 0.58
171 0.57
172 0.57
173 0.55
174 0.52
175 0.46
176 0.42
177 0.37
178 0.3
179 0.28
180 0.21
181 0.19
182 0.17
183 0.16
184 0.14
185 0.15
186 0.14
187 0.12
188 0.12
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.07
195 0.07
196 0.06
197 0.07
198 0.07
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.09
203 0.09
204 0.12
205 0.12
206 0.15
207 0.15
208 0.16
209 0.18
210 0.17
211 0.18
212 0.17
213 0.17
214 0.17
215 0.21
216 0.23
217 0.26
218 0.29
219 0.29
220 0.29
221 0.35
222 0.34
223 0.31
224 0.32
225 0.3
226 0.25
227 0.26
228 0.24
229 0.17
230 0.18
231 0.17
232 0.13
233 0.13
234 0.13
235 0.12
236 0.13
237 0.15
238 0.2
239 0.22
240 0.24
241 0.24
242 0.25
243 0.26
244 0.25
245 0.23
246 0.17
247 0.15
248 0.13
249 0.12
250 0.12
251 0.1
252 0.1
253 0.09
254 0.11
255 0.09
256 0.1
257 0.1
258 0.1
259 0.11
260 0.16
261 0.22
262 0.24
263 0.29
264 0.35
265 0.44
266 0.44
267 0.43
268 0.4
269 0.35
270 0.34
271 0.3
272 0.23
273 0.14
274 0.22
275 0.26
276 0.26
277 0.27
278 0.25
279 0.33
280 0.39
281 0.41
282 0.35
283 0.38
284 0.41
285 0.45
286 0.5
287 0.44
288 0.46
289 0.45
290 0.43
291 0.38
292 0.32
293 0.29
294 0.25
295 0.24
296 0.2
297 0.22
298 0.22
299 0.23
300 0.23
301 0.23
302 0.22
303 0.22
304 0.18
305 0.17
306 0.19
307 0.2
308 0.21
309 0.2
310 0.17
311 0.16
312 0.16
313 0.14
314 0.13
315 0.13
316 0.1
317 0.1
318 0.12
319 0.12
320 0.12
321 0.14
322 0.15
323 0.17
324 0.21
325 0.22
326 0.27
327 0.28
328 0.3
329 0.32
330 0.34
331 0.37
332 0.44
333 0.53
334 0.53
335 0.54
336 0.56
337 0.57
338 0.59
339 0.54
340 0.5
341 0.4
342 0.36
343 0.34
344 0.3
345 0.26
346 0.21
347 0.18
348 0.11
349 0.11
350 0.07
351 0.07
352 0.11
353 0.12
354 0.1
355 0.1
356 0.12
357 0.12
358 0.13
359 0.14
360 0.14
361 0.14
362 0.17
363 0.18
364 0.18
365 0.2
366 0.19
367 0.19
368 0.17
369 0.18
370 0.16
371 0.15
372 0.14
373 0.11
374 0.12
375 0.12
376 0.09
377 0.07
378 0.07
379 0.08
380 0.09
381 0.09
382 0.08
383 0.09
384 0.14
385 0.15
386 0.15
387 0.19
388 0.24
389 0.29
390 0.36
391 0.39
392 0.39
393 0.48
394 0.52
395 0.51
396 0.46
397 0.48
398 0.42
399 0.38
400 0.33
401 0.25
402 0.22
403 0.18
404 0.18
405 0.12
406 0.11
407 0.1
408 0.1
409 0.09
410 0.08
411 0.07
412 0.07
413 0.09
414 0.08
415 0.08
416 0.08
417 0.09
418 0.09
419 0.09
420 0.09
421 0.08
422 0.09
423 0.11
424 0.13
425 0.12
426 0.14
427 0.15
428 0.15
429 0.15
430 0.14
431 0.12
432 0.12
433 0.12
434 0.09
435 0.08
436 0.07
437 0.06
438 0.06
439 0.05
440 0.04
441 0.04
442 0.03
443 0.03
444 0.03
445 0.03
446 0.03
447 0.04
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.07
452 0.08
453 0.08
454 0.08
455 0.07
456 0.07
457 0.07
458 0.08
459 0.08
460 0.07
461 0.07
462 0.07
463 0.08
464 0.07
465 0.07
466 0.06
467 0.05
468 0.04
469 0.05
470 0.05
471 0.03
472 0.03
473 0.03
474 0.04
475 0.04
476 0.03
477 0.03
478 0.03
479 0.04
480 0.05
481 0.07
482 0.07
483 0.07
484 0.13
485 0.17
486 0.2
487 0.26
488 0.28
489 0.29
490 0.33
491 0.36
492 0.33
493 0.3
494 0.28
495 0.23
496 0.2
497 0.18
498 0.13
499 0.12
500 0.09
501 0.09
502 0.09
503 0.08
504 0.08
505 0.08
506 0.08
507 0.07
508 0.07
509 0.07
510 0.05
511 0.05
512 0.05
513 0.05
514 0.06
515 0.05
516 0.07
517 0.08
518 0.1
519 0.13
520 0.13
521 0.13
522 0.13
523 0.13
524 0.15
525 0.16
526 0.22
527 0.24
528 0.26
529 0.26
530 0.25
531 0.27
532 0.24
533 0.22
534 0.22
535 0.18
536 0.16
537 0.17
538 0.17
539 0.16
540 0.15
541 0.16
542 0.08
543 0.1
544 0.11
545 0.13
546 0.15
547 0.15
548 0.19
549 0.19
550 0.26
551 0.29
552 0.3
553 0.37
554 0.43
555 0.5
556 0.52
557 0.59
558 0.53
559 0.51
560 0.55
561 0.46
562 0.38
563 0.31
564 0.25
565 0.16
566 0.16
567 0.14
568 0.07
569 0.06
570 0.05
571 0.05
572 0.06
573 0.08
574 0.08
575 0.08
576 0.12
577 0.14
578 0.18
579 0.24
580 0.31
581 0.36
582 0.41
583 0.45
584 0.49
585 0.48
586 0.45
587 0.4
588 0.35
589 0.27
590 0.23
591 0.18
592 0.12
593 0.11
594 0.1
595 0.1
596 0.07
597 0.07
598 0.06
599 0.07
600 0.06
601 0.06
602 0.06
603 0.06
604 0.07
605 0.07
606 0.07
607 0.06
608 0.1
609 0.12
610 0.13
611 0.14
612 0.14
613 0.15
614 0.16
615 0.17
616 0.14
617 0.13
618 0.12
619 0.13
620 0.14
621 0.13
622 0.12
623 0.11
624 0.11
625 0.1
626 0.1
627 0.08
628 0.08
629 0.14
630 0.19
631 0.26
632 0.27
633 0.27
634 0.29
635 0.31
636 0.31
637 0.33
638 0.3
639 0.32
640 0.33
641 0.33
642 0.3
643 0.29
644 0.27
645 0.19
646 0.16
647 0.07
648 0.06
649 0.06
650 0.06
651 0.06
652 0.09
653 0.08
654 0.08
655 0.08
656 0.08
657 0.08
658 0.08
659 0.09
660 0.06
661 0.07
662 0.07
663 0.07
664 0.09
665 0.09
666 0.09
667 0.12
668 0.12
669 0.13
670 0.19
671 0.22
672 0.23
673 0.23
674 0.24
675 0.21
676 0.21
677 0.19
678 0.14
679 0.1
680 0.08
681 0.06
682 0.05
683 0.04
684 0.05
685 0.06
686 0.07
687 0.1
688 0.11
689 0.15
690 0.16
691 0.16
692 0.17
693 0.17
694 0.15
695 0.14
696 0.14
697 0.1
698 0.1
699 0.09
700 0.08
701 0.08
702 0.08
703 0.08
704 0.07
705 0.09
706 0.14
707 0.14
708 0.15
709 0.17
710 0.16
711 0.15
712 0.16
713 0.15
714 0.11
715 0.11
716 0.11
717 0.09
718 0.11
719 0.13
720 0.14
721 0.16
722 0.17
723 0.2
724 0.27
725 0.31
726 0.38
727 0.42
728 0.49
729 0.51
730 0.57
731 0.59
732 0.55
733 0.59
734 0.54
735 0.53
736 0.5
737 0.53
738 0.45
739 0.43
740 0.43
741 0.36
742 0.33
743 0.28
744 0.23
745 0.18
746 0.17
747 0.13
748 0.1
749 0.1
750 0.08
751 0.08
752 0.08
753 0.05
754 0.05
755 0.06
756 0.06
757 0.06
758 0.08
759 0.09
760 0.08
761 0.08
762 0.09
763 0.09
764 0.09
765 0.1
766 0.11
767 0.12
768 0.12
769 0.13
770 0.12
771 0.13
772 0.13
773 0.12
774 0.13
775 0.17
776 0.19
777 0.2
778 0.21
779 0.22
780 0.23
781 0.23
782 0.21
783 0.17
784 0.15
785 0.17
786 0.15
787 0.14
788 0.16
789 0.16
790 0.16
791 0.16
792 0.2
793 0.25
794 0.3
795 0.33
796 0.34
797 0.4
798 0.47
799 0.52
800 0.55
801 0.5
802 0.5
803 0.51
804 0.53
805 0.52
806 0.47
807 0.44
808 0.39
809 0.39
810 0.35
811 0.29
812 0.25
813 0.25
814 0.28
815 0.3
816 0.35
817 0.34
818 0.36
819 0.36
820 0.38
821 0.33
822 0.31
823 0.29
824 0.24
825 0.23
826 0.23
827 0.24
828 0.21
829 0.21
830 0.19
831 0.17
832 0.17
833 0.21
834 0.2
835 0.19
836 0.22
837 0.21
838 0.21
839 0.22
840 0.2
841 0.13
842 0.12
843 0.12
844 0.08
845 0.09
846 0.08
847 0.07
848 0.07
849 0.07
850 0.07
851 0.07
852 0.08
853 0.07
854 0.06
855 0.07
856 0.14
857 0.17
858 0.2
859 0.24
860 0.27
861 0.29
862 0.34
863 0.39
864 0.42
865 0.42
866 0.46
867 0.45
868 0.45
869 0.44
870 0.42
871 0.38
872 0.36
873 0.34
874 0.28
875 0.3
876 0.31
877 0.32
878 0.39
879 0.45
880 0.5
881 0.54
882 0.58
883 0.56
884 0.53
885 0.52
886 0.44
887 0.46
888 0.42
889 0.44
890 0.43
891 0.44
892 0.46
893 0.48
894 0.56
895 0.51
896 0.51
897 0.45
898 0.46
899 0.45
900 0.46
901 0.44
902 0.36
903 0.37
904 0.32
905 0.34
906 0.31
907 0.3
908 0.28
909 0.3
910 0.35
911 0.28
912 0.25
913 0.26
914 0.27
915 0.26
916 0.25
917 0.22
918 0.16
919 0.2
920 0.22
921 0.21
922 0.22
923 0.2
924 0.2
925 0.19
926 0.2
927 0.18
928 0.17
929 0.15
930 0.11
931 0.12
932 0.13
933 0.13
934 0.12
935 0.12
936 0.11
937 0.13
938 0.15
939 0.14
940 0.13
941 0.13
942 0.16
943 0.17
944 0.18
945 0.19
946 0.2
947 0.23
948 0.24
949 0.24
950 0.22
951 0.21
952 0.2
953 0.18
954 0.16
955 0.13
956 0.11
957 0.1
958 0.11
959 0.12
960 0.11
961 0.11
962 0.13
963 0.2
964 0.21
965 0.25
966 0.25
967 0.28
968 0.37
969 0.45
970 0.52
971 0.5
972 0.55
973 0.55
974 0.58
975 0.58
976 0.5
977 0.47
978 0.42
979 0.38
980 0.32
981 0.3
982 0.26
983 0.2
984 0.2
985 0.15
986 0.11
987 0.11
988 0.16
989 0.18
990 0.19
991 0.24
992 0.3
993 0.39
994 0.43
995 0.46
996 0.43
997 0.45
998 0.44
999 0.44
1000 0.4
1001 0.34
1002 0.29
1003 0.27
1004 0.25
1005 0.21
1006 0.19
1007 0.16
1008 0.15
1009 0.13
1010 0.13
1011 0.14
1012 0.15
1013 0.15
1014 0.17
1015 0.23
1016 0.25
1017 0.32
1018 0.35
1019 0.4
1020 0.47
1021 0.57
1022 0.63
1023 0.65
1024 0.63
1025 0.6
1026 0.64
1027 0.64
1028 0.63
1029 0.62
1030 0.58
1031 0.61
1032 0.65
1033 0.63
1034 0.6
1035 0.57
1036 0.52
1037 0.52
1038 0.56
1039 0.52
1040 0.53
1041 0.56
1042 0.53
1043 0.54
1044 0.51
1045 0.45
1046 0.4
1047 0.34
1048 0.28