Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5HA97

Protein Details
Accession U5HA97    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
616-637RSTLNPLKQRNKKKVHWPLNDVHydrophilic
940-959ASKMKGKKAGKGAKGKVTKCBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
942-955KMKGKKAGKGAKGK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto 9, mito_nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MSSADVSAYIDLDTFPSSDAGSTIAAEGQHPRASTSYLPIDDDNEGLASPAVFHKGNIDSLNMDSDLPAELPSPFRESAPDAASMTLMLGGENVNNSDEISGMMAVDGDASIFRLQTEADRLSPEPFNSGFEAEVDDDEEDVDQNEDKDDEDDEDDGEELVQSIDPSTLTASSSLPAEMETDVIAIHPALIGEAPVASTSTAAPVTPSAPATIVKKKAEATTTSTKKVAASTHSTMNPAIVITPKSAVAQGKLPALTSTSVLTTAKPAGTASLKSKLTSATSATSAANSSAAPTPENQAWIKMYASQLRDVLANLRTTKTPLVLANRLAKGLSHFSFGNANPQLSPWGDQSVIPPSDRLTILTQMLQNGTKEFWNAFAAVPGDEGIKTIKVWFWGASLSCTSVAKKGEEGKMEVESSKGQGRELEGTLVPILKALNKLPLTINHLKTYELGKRVRRVDRGSKNKEAVKLARELVNKWQELASSITDSKDEATSKKAASAAIKRKTPDSSSEAPVKKLKTVSAGKTVVAEAKKHVADAATTSTRKAPTSTATLVPVKKAPVVVANPLQKMLAQMKFDKKRTSEPPSTSAAAPTPSTAFRTLAATTSLAADKIPSELRSTLNPLKQRNKKKVHWPLNDVDLNHIRIIENCLDGQRPRKGMGEAGAEDEDIGFESLVRDMNEREGAVMTQGAAMEEEITWYEPLFIEVPDTADFSSYHAVVESEEADFQAQREMGRPEYLYDESNPEAQMESPAEPQLDATAGEDEPETKEMTFSSEMTSDPFVMQAIANAQSLNTPTQGYLQEDQLQSLLGNLVSMQEHHHQQPHQLQQHVHQPHTGPSSNALEQTGVFDEQALAKLRAFDPALIQSIVNQHPQELGMLANELSQRETFPVQLKPTPPLPHSMLSWQQQQQQSLMSQAPQLTLSDQYNGYVPPGGSSIDMQASKMKGKKAGKGAKGKVTKCRFFNTPRGCDMGTKCRFKHDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.09
3 0.09
4 0.09
5 0.09
6 0.1
7 0.1
8 0.09
9 0.09
10 0.09
11 0.1
12 0.1
13 0.11
14 0.15
15 0.18
16 0.2
17 0.2
18 0.21
19 0.21
20 0.24
21 0.24
22 0.26
23 0.29
24 0.27
25 0.3
26 0.29
27 0.3
28 0.28
29 0.26
30 0.21
31 0.15
32 0.13
33 0.11
34 0.1
35 0.07
36 0.08
37 0.09
38 0.12
39 0.12
40 0.12
41 0.16
42 0.19
43 0.23
44 0.22
45 0.23
46 0.21
47 0.22
48 0.24
49 0.2
50 0.18
51 0.14
52 0.13
53 0.13
54 0.11
55 0.1
56 0.09
57 0.09
58 0.12
59 0.14
60 0.18
61 0.18
62 0.18
63 0.21
64 0.24
65 0.28
66 0.27
67 0.27
68 0.23
69 0.23
70 0.22
71 0.19
72 0.15
73 0.11
74 0.09
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.07
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.09
84 0.08
85 0.08
86 0.07
87 0.08
88 0.07
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.04
96 0.04
97 0.05
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.07
103 0.1
104 0.16
105 0.17
106 0.18
107 0.21
108 0.22
109 0.25
110 0.28
111 0.25
112 0.24
113 0.22
114 0.23
115 0.22
116 0.22
117 0.18
118 0.16
119 0.18
120 0.14
121 0.14
122 0.13
123 0.11
124 0.1
125 0.1
126 0.1
127 0.07
128 0.07
129 0.08
130 0.07
131 0.07
132 0.08
133 0.09
134 0.09
135 0.1
136 0.1
137 0.11
138 0.12
139 0.12
140 0.11
141 0.12
142 0.11
143 0.1
144 0.09
145 0.07
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.05
150 0.05
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.07
156 0.08
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.1
161 0.09
162 0.08
163 0.08
164 0.09
165 0.08
166 0.08
167 0.07
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.05
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.05
184 0.04
185 0.05
186 0.05
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.08
192 0.09
193 0.1
194 0.1
195 0.09
196 0.1
197 0.13
198 0.17
199 0.24
200 0.29
201 0.29
202 0.31
203 0.33
204 0.36
205 0.37
206 0.35
207 0.35
208 0.39
209 0.43
210 0.43
211 0.42
212 0.39
213 0.36
214 0.36
215 0.31
216 0.26
217 0.28
218 0.28
219 0.33
220 0.33
221 0.34
222 0.31
223 0.29
224 0.23
225 0.16
226 0.14
227 0.11
228 0.11
229 0.1
230 0.11
231 0.11
232 0.12
233 0.15
234 0.15
235 0.14
236 0.17
237 0.18
238 0.2
239 0.19
240 0.19
241 0.17
242 0.17
243 0.16
244 0.13
245 0.11
246 0.09
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.11
251 0.12
252 0.12
253 0.11
254 0.11
255 0.12
256 0.14
257 0.16
258 0.18
259 0.23
260 0.24
261 0.24
262 0.25
263 0.24
264 0.24
265 0.23
266 0.21
267 0.16
268 0.16
269 0.18
270 0.17
271 0.16
272 0.14
273 0.13
274 0.11
275 0.09
276 0.1
277 0.1
278 0.11
279 0.11
280 0.11
281 0.14
282 0.15
283 0.18
284 0.16
285 0.16
286 0.16
287 0.17
288 0.17
289 0.16
290 0.18
291 0.2
292 0.21
293 0.21
294 0.21
295 0.2
296 0.2
297 0.18
298 0.18
299 0.16
300 0.17
301 0.17
302 0.18
303 0.18
304 0.19
305 0.2
306 0.17
307 0.17
308 0.18
309 0.22
310 0.24
311 0.28
312 0.32
313 0.32
314 0.31
315 0.28
316 0.25
317 0.21
318 0.24
319 0.2
320 0.16
321 0.15
322 0.16
323 0.2
324 0.2
325 0.26
326 0.21
327 0.21
328 0.19
329 0.19
330 0.2
331 0.17
332 0.19
333 0.12
334 0.13
335 0.13
336 0.13
337 0.14
338 0.19
339 0.19
340 0.17
341 0.16
342 0.15
343 0.18
344 0.17
345 0.18
346 0.13
347 0.15
348 0.15
349 0.18
350 0.17
351 0.15
352 0.17
353 0.16
354 0.14
355 0.13
356 0.13
357 0.11
358 0.11
359 0.1
360 0.1
361 0.1
362 0.1
363 0.1
364 0.1
365 0.1
366 0.1
367 0.1
368 0.08
369 0.08
370 0.07
371 0.07
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.07
376 0.07
377 0.08
378 0.09
379 0.09
380 0.09
381 0.1
382 0.1
383 0.11
384 0.11
385 0.1
386 0.11
387 0.11
388 0.11
389 0.13
390 0.14
391 0.13
392 0.15
393 0.2
394 0.22
395 0.23
396 0.24
397 0.22
398 0.22
399 0.22
400 0.19
401 0.15
402 0.12
403 0.12
404 0.14
405 0.13
406 0.11
407 0.12
408 0.13
409 0.15
410 0.15
411 0.15
412 0.11
413 0.12
414 0.12
415 0.11
416 0.09
417 0.07
418 0.07
419 0.06
420 0.08
421 0.08
422 0.14
423 0.14
424 0.15
425 0.16
426 0.18
427 0.25
428 0.3
429 0.32
430 0.28
431 0.28
432 0.28
433 0.28
434 0.3
435 0.26
436 0.25
437 0.28
438 0.3
439 0.36
440 0.42
441 0.46
442 0.47
443 0.49
444 0.53
445 0.59
446 0.65
447 0.66
448 0.65
449 0.65
450 0.62
451 0.59
452 0.53
453 0.46
454 0.38
455 0.34
456 0.29
457 0.3
458 0.28
459 0.25
460 0.29
461 0.31
462 0.29
463 0.26
464 0.25
465 0.2
466 0.2
467 0.21
468 0.14
469 0.11
470 0.11
471 0.11
472 0.11
473 0.11
474 0.1
475 0.1
476 0.1
477 0.09
478 0.11
479 0.13
480 0.13
481 0.15
482 0.15
483 0.14
484 0.18
485 0.26
486 0.32
487 0.35
488 0.37
489 0.36
490 0.38
491 0.39
492 0.36
493 0.32
494 0.3
495 0.29
496 0.29
497 0.37
498 0.36
499 0.36
500 0.38
501 0.34
502 0.3
503 0.27
504 0.25
505 0.24
506 0.28
507 0.29
508 0.32
509 0.32
510 0.3
511 0.3
512 0.29
513 0.25
514 0.21
515 0.19
516 0.12
517 0.16
518 0.15
519 0.15
520 0.15
521 0.11
522 0.1
523 0.11
524 0.14
525 0.14
526 0.14
527 0.15
528 0.17
529 0.18
530 0.18
531 0.18
532 0.15
533 0.14
534 0.19
535 0.21
536 0.19
537 0.22
538 0.25
539 0.25
540 0.24
541 0.23
542 0.19
543 0.17
544 0.16
545 0.13
546 0.14
547 0.15
548 0.17
549 0.21
550 0.24
551 0.24
552 0.24
553 0.23
554 0.19
555 0.2
556 0.21
557 0.18
558 0.17
559 0.21
560 0.3
561 0.37
562 0.4
563 0.43
564 0.4
565 0.45
566 0.5
567 0.54
568 0.53
569 0.49
570 0.5
571 0.49
572 0.49
573 0.41
574 0.35
575 0.27
576 0.21
577 0.17
578 0.14
579 0.12
580 0.11
581 0.13
582 0.13
583 0.12
584 0.12
585 0.14
586 0.13
587 0.13
588 0.13
589 0.11
590 0.1
591 0.11
592 0.1
593 0.08
594 0.08
595 0.07
596 0.06
597 0.08
598 0.09
599 0.08
600 0.11
601 0.12
602 0.14
603 0.15
604 0.22
605 0.25
606 0.29
607 0.34
608 0.39
609 0.48
610 0.56
611 0.64
612 0.68
613 0.71
614 0.73
615 0.79
616 0.83
617 0.84
618 0.82
619 0.78
620 0.71
621 0.69
622 0.65
623 0.54
624 0.48
625 0.41
626 0.35
627 0.28
628 0.26
629 0.18
630 0.16
631 0.19
632 0.16
633 0.13
634 0.12
635 0.13
636 0.15
637 0.17
638 0.22
639 0.24
640 0.24
641 0.25
642 0.27
643 0.27
644 0.27
645 0.28
646 0.27
647 0.22
648 0.23
649 0.21
650 0.18
651 0.17
652 0.15
653 0.11
654 0.07
655 0.06
656 0.04
657 0.04
658 0.04
659 0.05
660 0.07
661 0.07
662 0.08
663 0.09
664 0.11
665 0.12
666 0.12
667 0.12
668 0.11
669 0.1
670 0.1
671 0.09
672 0.07
673 0.06
674 0.06
675 0.06
676 0.05
677 0.05
678 0.05
679 0.05
680 0.05
681 0.05
682 0.06
683 0.06
684 0.06
685 0.07
686 0.06
687 0.08
688 0.08
689 0.07
690 0.08
691 0.08
692 0.1
693 0.1
694 0.1
695 0.09
696 0.09
697 0.1
698 0.1
699 0.12
700 0.1
701 0.09
702 0.09
703 0.09
704 0.08
705 0.09
706 0.08
707 0.07
708 0.07
709 0.07
710 0.08
711 0.08
712 0.08
713 0.09
714 0.09
715 0.09
716 0.13
717 0.15
718 0.16
719 0.18
720 0.18
721 0.17
722 0.21
723 0.22
724 0.2
725 0.19
726 0.21
727 0.2
728 0.21
729 0.2
730 0.16
731 0.15
732 0.14
733 0.15
734 0.13
735 0.14
736 0.13
737 0.14
738 0.14
739 0.13
740 0.13
741 0.11
742 0.1
743 0.08
744 0.08
745 0.09
746 0.08
747 0.09
748 0.09
749 0.09
750 0.1
751 0.11
752 0.11
753 0.09
754 0.09
755 0.09
756 0.13
757 0.14
758 0.13
759 0.14
760 0.14
761 0.14
762 0.16
763 0.17
764 0.14
765 0.12
766 0.12
767 0.1
768 0.1
769 0.09
770 0.08
771 0.09
772 0.1
773 0.1
774 0.1
775 0.1
776 0.1
777 0.12
778 0.12
779 0.11
780 0.1
781 0.1
782 0.14
783 0.16
784 0.19
785 0.19
786 0.21
787 0.27
788 0.26
789 0.26
790 0.23
791 0.21
792 0.16
793 0.15
794 0.13
795 0.06
796 0.06
797 0.06
798 0.07
799 0.07
800 0.07
801 0.1
802 0.14
803 0.18
804 0.21
805 0.27
806 0.26
807 0.33
808 0.41
809 0.48
810 0.5
811 0.51
812 0.5
813 0.49
814 0.58
815 0.56
816 0.48
817 0.42
818 0.37
819 0.38
820 0.43
821 0.39
822 0.3
823 0.3
824 0.34
825 0.32
826 0.32
827 0.27
828 0.21
829 0.2
830 0.21
831 0.19
832 0.14
833 0.12
834 0.11
835 0.11
836 0.12
837 0.15
838 0.16
839 0.15
840 0.15
841 0.19
842 0.19
843 0.22
844 0.22
845 0.2
846 0.19
847 0.22
848 0.24
849 0.21
850 0.21
851 0.18
852 0.24
853 0.26
854 0.28
855 0.24
856 0.22
857 0.22
858 0.23
859 0.21
860 0.15
861 0.13
862 0.09
863 0.1
864 0.09
865 0.11
866 0.12
867 0.12
868 0.13
869 0.13
870 0.13
871 0.15
872 0.17
873 0.18
874 0.21
875 0.27
876 0.3
877 0.35
878 0.37
879 0.38
880 0.44
881 0.46
882 0.43
883 0.43
884 0.43
885 0.4
886 0.4
887 0.42
888 0.42
889 0.41
890 0.48
891 0.46
892 0.5
893 0.51
894 0.51
895 0.45
896 0.42
897 0.38
898 0.33
899 0.31
900 0.25
901 0.23
902 0.22
903 0.22
904 0.19
905 0.19
906 0.17
907 0.19
908 0.19
909 0.19
910 0.18
911 0.18
912 0.19
913 0.18
914 0.18
915 0.17
916 0.16
917 0.14
918 0.15
919 0.15
920 0.14
921 0.14
922 0.16
923 0.18
924 0.18
925 0.18
926 0.22
927 0.23
928 0.3
929 0.33
930 0.35
931 0.39
932 0.44
933 0.51
934 0.57
935 0.65
936 0.67
937 0.73
938 0.76
939 0.77
940 0.8
941 0.78
942 0.77
943 0.78
944 0.76
945 0.71
946 0.7
947 0.68
948 0.66
949 0.72
950 0.72
951 0.68
952 0.64
953 0.64
954 0.59
955 0.58
956 0.57
957 0.57
958 0.56
959 0.58
960 0.55