Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5H8W0

Protein Details
Accession U5H8W0    Localization Confidence High Confidence Score 18
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-63RYIREIYKRGEREKREKKEEADBasic
331-350ASGFKKRKMHGANAVRKKQGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
49-59KRGEREKREKK
263-278KKMFKEEIEKTRKRAK
334-349FKKRKMHGANAVRKKQ
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 14, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000690  Matrin/U1-C_Znf_C2H2  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR013085  U1-CZ_Znf_C2H2  
IPR040023  WBP4  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06220  zf-U1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50171  ZF_MATRIN  
Amino Acid Sequences MTEYWISKDRYWCKYCSIYIADDKPSRIHHETGLKHKGHYERYIREIYKRGEREKREKKEEADEMARIEKAARLAMGSSSLDLGDRTSSTPHAPTSKPTPAGPPDPFASYTTAADLGFKDEPVIVDPAIEAREKDKETRQTEGVIGQWEVVKKKKPLSTTSGVTTMNARVVPPPPQWMQNSPGYTNGVKVKNEGKQEGEDEQGAEHEEPEQEQPKAAPKYLNEKAYATDEDDYDPSKVGPVKLKRKILTLKEQQEIDEREREKKMFKEEIEKTRKRAKLERGNGWSQVEAGDEGLLEFEEPPEAEGEVKQEEGNGAKPSVAEEEEDKLKVASGFKKRKMHGANAVRKKQGPFPG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.56
3 0.53
4 0.49
5 0.45
6 0.49
7 0.51
8 0.52
9 0.48
10 0.48
11 0.44
12 0.44
13 0.46
14 0.43
15 0.4
16 0.39
17 0.45
18 0.5
19 0.56
20 0.61
21 0.55
22 0.52
23 0.56
24 0.56
25 0.54
26 0.56
27 0.55
28 0.52
29 0.57
30 0.64
31 0.6
32 0.59
33 0.6
34 0.57
35 0.58
36 0.59
37 0.62
38 0.63
39 0.7
40 0.75
41 0.79
42 0.83
43 0.82
44 0.81
45 0.77
46 0.76
47 0.73
48 0.69
49 0.62
50 0.53
51 0.47
52 0.42
53 0.37
54 0.28
55 0.23
56 0.18
57 0.14
58 0.14
59 0.12
60 0.1
61 0.11
62 0.11
63 0.12
64 0.11
65 0.1
66 0.09
67 0.09
68 0.09
69 0.08
70 0.08
71 0.07
72 0.08
73 0.08
74 0.1
75 0.11
76 0.13
77 0.15
78 0.17
79 0.21
80 0.21
81 0.25
82 0.31
83 0.35
84 0.36
85 0.35
86 0.38
87 0.38
88 0.44
89 0.41
90 0.37
91 0.32
92 0.32
93 0.32
94 0.27
95 0.26
96 0.2
97 0.19
98 0.17
99 0.16
100 0.13
101 0.13
102 0.12
103 0.12
104 0.11
105 0.1
106 0.1
107 0.09
108 0.1
109 0.11
110 0.12
111 0.08
112 0.07
113 0.08
114 0.08
115 0.09
116 0.09
117 0.07
118 0.08
119 0.13
120 0.14
121 0.17
122 0.23
123 0.31
124 0.33
125 0.37
126 0.36
127 0.33
128 0.33
129 0.31
130 0.26
131 0.18
132 0.16
133 0.12
134 0.13
135 0.13
136 0.14
137 0.16
138 0.2
139 0.21
140 0.27
141 0.3
142 0.33
143 0.36
144 0.41
145 0.43
146 0.4
147 0.39
148 0.37
149 0.33
150 0.29
151 0.26
152 0.19
153 0.16
154 0.13
155 0.11
156 0.09
157 0.11
158 0.14
159 0.14
160 0.18
161 0.17
162 0.21
163 0.23
164 0.23
165 0.26
166 0.27
167 0.28
168 0.24
169 0.25
170 0.23
171 0.22
172 0.22
173 0.24
174 0.22
175 0.21
176 0.23
177 0.25
178 0.28
179 0.3
180 0.29
181 0.25
182 0.23
183 0.25
184 0.24
185 0.21
186 0.16
187 0.14
188 0.12
189 0.11
190 0.1
191 0.08
192 0.07
193 0.06
194 0.06
195 0.07
196 0.1
197 0.12
198 0.11
199 0.11
200 0.12
201 0.19
202 0.21
203 0.22
204 0.22
205 0.21
206 0.3
207 0.35
208 0.37
209 0.31
210 0.3
211 0.3
212 0.31
213 0.3
214 0.23
215 0.18
216 0.16
217 0.16
218 0.16
219 0.15
220 0.12
221 0.12
222 0.1
223 0.11
224 0.13
225 0.14
226 0.21
227 0.29
228 0.39
229 0.47
230 0.54
231 0.53
232 0.58
233 0.64
234 0.63
235 0.64
236 0.64
237 0.63
238 0.6
239 0.59
240 0.52
241 0.51
242 0.48
243 0.41
244 0.39
245 0.34
246 0.35
247 0.38
248 0.39
249 0.37
250 0.38
251 0.42
252 0.42
253 0.43
254 0.47
255 0.52
256 0.61
257 0.66
258 0.65
259 0.63
260 0.65
261 0.67
262 0.64
263 0.64
264 0.65
265 0.65
266 0.7
267 0.74
268 0.72
269 0.72
270 0.69
271 0.62
272 0.51
273 0.4
274 0.32
275 0.23
276 0.16
277 0.12
278 0.08
279 0.07
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.07
290 0.07
291 0.08
292 0.08
293 0.11
294 0.11
295 0.12
296 0.11
297 0.11
298 0.13
299 0.14
300 0.17
301 0.17
302 0.16
303 0.15
304 0.16
305 0.17
306 0.18
307 0.17
308 0.15
309 0.15
310 0.19
311 0.22
312 0.23
313 0.22
314 0.18
315 0.19
316 0.2
317 0.24
318 0.28
319 0.35
320 0.45
321 0.53
322 0.62
323 0.63
324 0.7
325 0.72
326 0.72
327 0.72
328 0.73
329 0.75
330 0.77
331 0.83
332 0.78
333 0.76
334 0.71