Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5H5U1

Protein Details
Accession U5H5U1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
554-581VEDALERRARRRKELKARRKRMETGVGVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
560-574RRARRRKELKARRKR
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 8, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000195  Rab-GAP-TBC_dom  
IPR035969  Rab-GAP_TBC_sf  
IPR045913  TBC20/Gyp8-like  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005096  F:GTPase activator activity  
GO:0043547  P:positive regulation of GTPase activity  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00566  RabGAP-TBC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50086  TBC_RABGAP  
Amino Acid Sequences MHSSYGPTPTTTPRPASPSKQLPRLPSSSSLASSSSSSSSSSASTRPTSRQQLGPSSSNTNGHCTIDKQLELDAPAAQDELTKAMQARDRTRLKQLAVAPGGFRSDQVRSQVWPILLGVPRSNEPEAASASVARPSKSKGDLPPHKDEHQVHLDILRSFVSYSIDVSAEEKQRLRDQLENVIVTVLRRHPSLHYFQGYHDIISILLLTFKDEELTIQAAEKMSLHRLRDSMGTGLEPVIGYLKILHRILYKHDADLARMVDSAASLPYFSLSWVLTLMSHDLTSIDLISRLFDFLLAHNPVMISYLGVAIVLLKQEQLAQLEDDDPAMVHHTLSKVPNLVLDRPSTSKEVPEANQGSKGTRDEDDDEDLMSSSQQSDSFLSSSMISTSEASTDWESSSTLSQLATCSTHSLQTLDDSIFEDPDIFGLAFPSSAYQVPTQTNPSSLKSVLLERLDDEPPKTPAKTPARKNRAPAEISIEDLIQTTLKLYETHPYLPSEDRDNSIQADQIMGPKSCIFTWPLSIEGTLTDTEADLIAENGVDIVLVGVEEGGGEVVEDALERRARRRKELKARRKRMETGVGVVLVIAGVAGVVLATYGGTLMLGNGEGASSSGAGNEGARRFGLPSKLVLQEWRAWGGEVVQNFRLI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.54
3 0.58
4 0.61
5 0.64
6 0.66
7 0.71
8 0.72
9 0.71
10 0.71
11 0.69
12 0.63
13 0.57
14 0.54
15 0.48
16 0.45
17 0.39
18 0.33
19 0.3
20 0.26
21 0.23
22 0.2
23 0.17
24 0.16
25 0.16
26 0.16
27 0.16
28 0.17
29 0.18
30 0.21
31 0.26
32 0.29
33 0.34
34 0.42
35 0.49
36 0.52
37 0.55
38 0.56
39 0.6
40 0.61
41 0.59
42 0.55
43 0.52
44 0.5
45 0.49
46 0.44
47 0.41
48 0.37
49 0.35
50 0.33
51 0.3
52 0.32
53 0.32
54 0.31
55 0.26
56 0.26
57 0.25
58 0.25
59 0.24
60 0.19
61 0.14
62 0.14
63 0.13
64 0.11
65 0.1
66 0.09
67 0.11
68 0.1
69 0.11
70 0.12
71 0.15
72 0.2
73 0.26
74 0.31
75 0.38
76 0.45
77 0.48
78 0.56
79 0.58
80 0.54
81 0.55
82 0.54
83 0.53
84 0.49
85 0.46
86 0.38
87 0.33
88 0.33
89 0.27
90 0.23
91 0.17
92 0.17
93 0.19
94 0.23
95 0.24
96 0.24
97 0.27
98 0.31
99 0.28
100 0.25
101 0.22
102 0.23
103 0.24
104 0.24
105 0.22
106 0.21
107 0.22
108 0.26
109 0.25
110 0.21
111 0.2
112 0.2
113 0.2
114 0.18
115 0.17
116 0.14
117 0.14
118 0.19
119 0.19
120 0.17
121 0.18
122 0.2
123 0.25
124 0.28
125 0.33
126 0.35
127 0.45
128 0.54
129 0.59
130 0.65
131 0.65
132 0.63
133 0.65
134 0.59
135 0.56
136 0.52
137 0.47
138 0.38
139 0.35
140 0.35
141 0.28
142 0.27
143 0.2
144 0.14
145 0.13
146 0.13
147 0.13
148 0.1
149 0.1
150 0.11
151 0.1
152 0.1
153 0.12
154 0.17
155 0.18
156 0.21
157 0.21
158 0.23
159 0.28
160 0.31
161 0.33
162 0.33
163 0.32
164 0.38
165 0.4
166 0.37
167 0.32
168 0.29
169 0.26
170 0.21
171 0.21
172 0.17
173 0.14
174 0.14
175 0.15
176 0.18
177 0.23
178 0.28
179 0.32
180 0.32
181 0.31
182 0.32
183 0.39
184 0.36
185 0.31
186 0.26
187 0.19
188 0.15
189 0.14
190 0.13
191 0.05
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.07
198 0.06
199 0.07
200 0.08
201 0.09
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.14
210 0.17
211 0.18
212 0.19
213 0.19
214 0.2
215 0.21
216 0.22
217 0.17
218 0.14
219 0.13
220 0.11
221 0.11
222 0.1
223 0.08
224 0.06
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.07
229 0.08
230 0.12
231 0.12
232 0.14
233 0.15
234 0.16
235 0.21
236 0.27
237 0.27
238 0.23
239 0.28
240 0.27
241 0.25
242 0.27
243 0.22
244 0.15
245 0.14
246 0.14
247 0.09
248 0.08
249 0.08
250 0.05
251 0.05
252 0.04
253 0.04
254 0.04
255 0.05
256 0.05
257 0.06
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.07
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.05
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.04
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.06
281 0.06
282 0.11
283 0.11
284 0.11
285 0.11
286 0.11
287 0.1
288 0.11
289 0.1
290 0.05
291 0.04
292 0.05
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.03
297 0.03
298 0.04
299 0.03
300 0.03
301 0.03
302 0.04
303 0.05
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.06
312 0.05
313 0.04
314 0.06
315 0.05
316 0.05
317 0.06
318 0.07
319 0.09
320 0.1
321 0.11
322 0.1
323 0.1
324 0.13
325 0.14
326 0.16
327 0.15
328 0.15
329 0.16
330 0.17
331 0.19
332 0.19
333 0.17
334 0.16
335 0.17
336 0.19
337 0.18
338 0.23
339 0.24
340 0.22
341 0.25
342 0.25
343 0.23
344 0.22
345 0.22
346 0.17
347 0.15
348 0.17
349 0.16
350 0.18
351 0.19
352 0.18
353 0.17
354 0.15
355 0.14
356 0.12
357 0.09
358 0.07
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.06
363 0.07
364 0.08
365 0.09
366 0.09
367 0.09
368 0.09
369 0.09
370 0.08
371 0.08
372 0.07
373 0.08
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.09
378 0.09
379 0.09
380 0.09
381 0.08
382 0.08
383 0.09
384 0.09
385 0.08
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.08
391 0.08
392 0.08
393 0.1
394 0.11
395 0.12
396 0.12
397 0.13
398 0.12
399 0.12
400 0.14
401 0.11
402 0.11
403 0.1
404 0.1
405 0.09
406 0.09
407 0.08
408 0.06
409 0.06
410 0.07
411 0.05
412 0.05
413 0.05
414 0.05
415 0.05
416 0.05
417 0.06
418 0.06
419 0.07
420 0.09
421 0.09
422 0.12
423 0.14
424 0.16
425 0.2
426 0.19
427 0.22
428 0.23
429 0.25
430 0.25
431 0.23
432 0.23
433 0.2
434 0.22
435 0.22
436 0.21
437 0.19
438 0.18
439 0.21
440 0.22
441 0.22
442 0.21
443 0.19
444 0.21
445 0.24
446 0.23
447 0.22
448 0.3
449 0.4
450 0.47
451 0.54
452 0.62
453 0.69
454 0.72
455 0.75
456 0.73
457 0.7
458 0.63
459 0.55
460 0.52
461 0.43
462 0.41
463 0.35
464 0.27
465 0.19
466 0.18
467 0.16
468 0.08
469 0.07
470 0.06
471 0.06
472 0.07
473 0.08
474 0.09
475 0.14
476 0.17
477 0.2
478 0.22
479 0.22
480 0.24
481 0.26
482 0.28
483 0.28
484 0.27
485 0.26
486 0.26
487 0.26
488 0.26
489 0.23
490 0.22
491 0.16
492 0.16
493 0.14
494 0.17
495 0.19
496 0.17
497 0.17
498 0.17
499 0.18
500 0.17
501 0.18
502 0.16
503 0.14
504 0.19
505 0.19
506 0.2
507 0.19
508 0.19
509 0.17
510 0.15
511 0.15
512 0.11
513 0.1
514 0.08
515 0.07
516 0.08
517 0.08
518 0.07
519 0.05
520 0.05
521 0.05
522 0.05
523 0.04
524 0.04
525 0.04
526 0.03
527 0.03
528 0.03
529 0.02
530 0.02
531 0.02
532 0.02
533 0.02
534 0.02
535 0.02
536 0.02
537 0.02
538 0.02
539 0.03
540 0.03
541 0.03
542 0.03
543 0.04
544 0.08
545 0.12
546 0.14
547 0.22
548 0.31
549 0.36
550 0.47
551 0.56
552 0.63
553 0.71
554 0.82
555 0.85
556 0.87
557 0.93
558 0.93
559 0.91
560 0.87
561 0.84
562 0.82
563 0.75
564 0.68
565 0.61
566 0.5
567 0.42
568 0.35
569 0.26
570 0.16
571 0.11
572 0.06
573 0.02
574 0.02
575 0.02
576 0.02
577 0.01
578 0.01
579 0.02
580 0.02
581 0.02
582 0.02
583 0.02
584 0.02
585 0.03
586 0.03
587 0.03
588 0.04
589 0.04
590 0.04
591 0.04
592 0.04
593 0.04
594 0.05
595 0.05
596 0.05
597 0.05
598 0.05
599 0.06
600 0.07
601 0.08
602 0.13
603 0.14
604 0.15
605 0.16
606 0.16
607 0.19
608 0.23
609 0.28
610 0.25
611 0.27
612 0.31
613 0.35
614 0.35
615 0.37
616 0.36
617 0.36
618 0.37
619 0.37
620 0.32
621 0.29
622 0.28
623 0.28
624 0.27
625 0.24
626 0.26