Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5H2X4

Protein Details
Accession U5H2X4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-43TAPPTMAASRPRRQRHKTSKALAGSDHydrophilic
218-243GITPPLKHVRKRRFRKRINKRTIEIVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
224-238KHVRKRRFRKRINKR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 15.5, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037817  TAF7  
IPR006751  TAFII55_prot_cons_reg  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF04658  TAFII55_N  
CDD cd08047  TAF7  
Amino Acid Sequences MDDGGAYYTSASTSLPPTAPPTMAASRPRRQRHKTSKALAGSDDEFEYTPRSSAPKIKLKMNQEGAGSALGSGTATTKETRPGAVNHDATGIGWDRELDSDPEVPLAVEEQFLLRLPKDLAPQLREMVEARTVNPKDVWFKFKDSRRAVFHLKGKSYSSKLFDLPTLLESQRLTGSGGGTVKIADVCQMLLVDEDEIQDEADVTKEAFNIEDFSYPHGITPPLKHVRKRRFRKRINKRTIEIVESAVEKLLEKDQAAEQVQYELLDHDVVSEDEYDNVNDDDRGGVGSSIGAPTPRREGSASSIAGDDDEGMDDGDRDDDDADEAGAGSGYDSDLANEINKGMEAIDRSSSEDDDSDSDDAGGLFGGGSSDDDDDEEQAIDPEVIEQKKRIKLLLEEIKDLESKITDSENKLSTAANPIFKKRFEDTIKKLTADRDGKRAAHSKAVAEMEKRRSDEEAAAVAATDVAANPEPLPTNPTLAEATSGEAIPLAEAATSGVVGEGEEPTATLAGGEDRMEIG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.17
4 0.21
5 0.24
6 0.24
7 0.23
8 0.27
9 0.28
10 0.33
11 0.41
12 0.45
13 0.5
14 0.6
15 0.69
16 0.73
17 0.77
18 0.83
19 0.85
20 0.87
21 0.89
22 0.87
23 0.86
24 0.82
25 0.76
26 0.66
27 0.6
28 0.51
29 0.42
30 0.35
31 0.27
32 0.2
33 0.18
34 0.19
35 0.15
36 0.14
37 0.13
38 0.16
39 0.19
40 0.27
41 0.36
42 0.42
43 0.46
44 0.54
45 0.59
46 0.63
47 0.69
48 0.67
49 0.62
50 0.53
51 0.49
52 0.42
53 0.35
54 0.28
55 0.18
56 0.11
57 0.07
58 0.06
59 0.06
60 0.06
61 0.06
62 0.08
63 0.1
64 0.11
65 0.16
66 0.18
67 0.2
68 0.23
69 0.24
70 0.3
71 0.36
72 0.36
73 0.31
74 0.31
75 0.29
76 0.25
77 0.25
78 0.2
79 0.12
80 0.11
81 0.11
82 0.1
83 0.12
84 0.13
85 0.12
86 0.13
87 0.14
88 0.14
89 0.14
90 0.14
91 0.12
92 0.1
93 0.1
94 0.08
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.07
99 0.08
100 0.09
101 0.08
102 0.1
103 0.12
104 0.15
105 0.18
106 0.24
107 0.28
108 0.29
109 0.31
110 0.31
111 0.29
112 0.27
113 0.25
114 0.21
115 0.22
116 0.19
117 0.19
118 0.26
119 0.26
120 0.27
121 0.27
122 0.28
123 0.3
124 0.33
125 0.37
126 0.31
127 0.38
128 0.44
129 0.5
130 0.58
131 0.56
132 0.6
133 0.59
134 0.62
135 0.62
136 0.61
137 0.61
138 0.58
139 0.54
140 0.5
141 0.48
142 0.47
143 0.45
144 0.42
145 0.39
146 0.34
147 0.33
148 0.32
149 0.29
150 0.25
151 0.22
152 0.18
153 0.18
154 0.15
155 0.16
156 0.14
157 0.15
158 0.13
159 0.13
160 0.12
161 0.1
162 0.1
163 0.11
164 0.11
165 0.1
166 0.1
167 0.09
168 0.09
169 0.08
170 0.08
171 0.06
172 0.06
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.05
177 0.05
178 0.06
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.04
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.08
197 0.08
198 0.1
199 0.1
200 0.12
201 0.14
202 0.14
203 0.13
204 0.12
205 0.13
206 0.13
207 0.15
208 0.21
209 0.28
210 0.32
211 0.38
212 0.47
213 0.57
214 0.66
215 0.75
216 0.77
217 0.79
218 0.86
219 0.91
220 0.93
221 0.94
222 0.94
223 0.91
224 0.81
225 0.79
226 0.7
227 0.62
228 0.51
229 0.41
230 0.31
231 0.24
232 0.22
233 0.13
234 0.11
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.12
243 0.13
244 0.12
245 0.11
246 0.11
247 0.11
248 0.09
249 0.09
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.04
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.07
262 0.06
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.06
267 0.06
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.05
279 0.06
280 0.07
281 0.11
282 0.12
283 0.13
284 0.14
285 0.15
286 0.19
287 0.25
288 0.24
289 0.2
290 0.2
291 0.18
292 0.17
293 0.16
294 0.1
295 0.05
296 0.05
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.03
315 0.03
316 0.03
317 0.03
318 0.04
319 0.03
320 0.04
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.06
325 0.06
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.06
331 0.07
332 0.08
333 0.1
334 0.1
335 0.13
336 0.14
337 0.14
338 0.13
339 0.12
340 0.12
341 0.11
342 0.13
343 0.11
344 0.1
345 0.1
346 0.09
347 0.09
348 0.07
349 0.06
350 0.04
351 0.03
352 0.03
353 0.03
354 0.03
355 0.03
356 0.04
357 0.05
358 0.05
359 0.06
360 0.06
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.07
366 0.07
367 0.06
368 0.06
369 0.07
370 0.12
371 0.13
372 0.14
373 0.17
374 0.24
375 0.29
376 0.3
377 0.3
378 0.29
379 0.31
380 0.4
381 0.46
382 0.42
383 0.4
384 0.39
385 0.39
386 0.36
387 0.32
388 0.23
389 0.14
390 0.12
391 0.11
392 0.14
393 0.16
394 0.19
395 0.23
396 0.24
397 0.25
398 0.25
399 0.24
400 0.21
401 0.26
402 0.27
403 0.29
404 0.3
405 0.36
406 0.4
407 0.41
408 0.45
409 0.4
410 0.45
411 0.47
412 0.54
413 0.55
414 0.6
415 0.62
416 0.58
417 0.57
418 0.51
419 0.52
420 0.51
421 0.47
422 0.45
423 0.47
424 0.47
425 0.51
426 0.55
427 0.48
428 0.47
429 0.46
430 0.4
431 0.4
432 0.43
433 0.4
434 0.37
435 0.43
436 0.43
437 0.46
438 0.46
439 0.42
440 0.4
441 0.4
442 0.38
443 0.34
444 0.28
445 0.23
446 0.21
447 0.19
448 0.16
449 0.13
450 0.1
451 0.06
452 0.04
453 0.06
454 0.07
455 0.08
456 0.08
457 0.1
458 0.12
459 0.12
460 0.17
461 0.16
462 0.19
463 0.18
464 0.21
465 0.2
466 0.19
467 0.21
468 0.16
469 0.17
470 0.15
471 0.15
472 0.12
473 0.11
474 0.11
475 0.08
476 0.08
477 0.06
478 0.04
479 0.05
480 0.05
481 0.05
482 0.05
483 0.05
484 0.05
485 0.04
486 0.05
487 0.06
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.06
492 0.07
493 0.07
494 0.07
495 0.06
496 0.06
497 0.07
498 0.08
499 0.09