Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5HH92

Protein Details
Accession U5HH92    Localization Confidence High Confidence Score 15.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-27YNVTRFTRQVLKRYRKEPPSLVHydrophilic
417-453VLEARQRAQANKKRQENKLRKEKRKLEKEKQLAAANDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
214-221PPKRKRSR
422-446QRAQANKKRQENKLRKEKRKLEKEK
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 10, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MAGATYNVTRFTRQVLKRYRKEPPSLVLHLYNTHFRFEQQHGNFNYDSPMKCFLEAIREQKLPTDLLDVLDEAGVRYYEGCLIVEVHDHRDQSYSSAAPAQPSIRPGLALSFQLGRQAQPVVQARAEVYRIVLGPNPATLWTELGIMDRRIRETAEEDAAEGGVEPETLGWTEEEAVEIEAIILARTTAPLCLSPSLQTSRIANSMLRATTLRPPKRKRSRAASEGETGEDGEDVLRREREEHEKMMKLGDEGVSRGRGHAFARLAFIQSYRERQNNPQASVQAGPSAAASAGNVGGNAATSSAAGGTQSPTNVIRITAPVHQIAPSGASTPRTAGSPPASISDRKKKLPIGNIAASTADDASEAGTPGPATLPATSAAAMAHAASTKKAKKIAAQAANSNVVDPTLPSDPAEREKVLEARQRAQANKKRQENKLRKEKRKLEKEKQLAAANDVKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.54
3 0.63
4 0.7
5 0.77
6 0.81
7 0.79
8 0.82
9 0.78
10 0.75
11 0.73
12 0.68
13 0.65
14 0.59
15 0.52
16 0.48
17 0.45
18 0.46
19 0.38
20 0.37
21 0.32
22 0.3
23 0.34
24 0.34
25 0.42
26 0.37
27 0.45
28 0.43
29 0.48
30 0.46
31 0.41
32 0.41
33 0.36
34 0.33
35 0.28
36 0.33
37 0.29
38 0.29
39 0.3
40 0.25
41 0.29
42 0.33
43 0.35
44 0.36
45 0.36
46 0.36
47 0.38
48 0.39
49 0.31
50 0.27
51 0.25
52 0.19
53 0.19
54 0.19
55 0.16
56 0.14
57 0.13
58 0.12
59 0.08
60 0.08
61 0.07
62 0.06
63 0.06
64 0.07
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.09
70 0.1
71 0.14
72 0.15
73 0.18
74 0.21
75 0.21
76 0.21
77 0.22
78 0.22
79 0.19
80 0.21
81 0.17
82 0.15
83 0.19
84 0.19
85 0.19
86 0.2
87 0.2
88 0.19
89 0.2
90 0.21
91 0.17
92 0.16
93 0.15
94 0.16
95 0.15
96 0.14
97 0.14
98 0.14
99 0.13
100 0.18
101 0.18
102 0.16
103 0.16
104 0.16
105 0.15
106 0.21
107 0.25
108 0.23
109 0.23
110 0.23
111 0.22
112 0.23
113 0.24
114 0.16
115 0.12
116 0.11
117 0.11
118 0.12
119 0.12
120 0.12
121 0.11
122 0.11
123 0.11
124 0.1
125 0.11
126 0.11
127 0.1
128 0.09
129 0.09
130 0.09
131 0.1
132 0.12
133 0.12
134 0.15
135 0.15
136 0.16
137 0.16
138 0.16
139 0.16
140 0.16
141 0.18
142 0.18
143 0.17
144 0.15
145 0.15
146 0.14
147 0.12
148 0.1
149 0.07
150 0.04
151 0.04
152 0.03
153 0.03
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.05
160 0.05
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.05
165 0.05
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.05
177 0.06
178 0.07
179 0.08
180 0.09
181 0.1
182 0.13
183 0.15
184 0.16
185 0.16
186 0.16
187 0.17
188 0.17
189 0.17
190 0.14
191 0.13
192 0.14
193 0.13
194 0.12
195 0.11
196 0.12
197 0.17
198 0.27
199 0.33
200 0.4
201 0.47
202 0.57
203 0.67
204 0.74
205 0.75
206 0.76
207 0.77
208 0.75
209 0.74
210 0.67
211 0.59
212 0.51
213 0.44
214 0.34
215 0.25
216 0.17
217 0.12
218 0.08
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.07
223 0.07
224 0.08
225 0.1
226 0.13
227 0.21
228 0.23
229 0.27
230 0.31
231 0.32
232 0.32
233 0.31
234 0.28
235 0.21
236 0.18
237 0.15
238 0.11
239 0.1
240 0.11
241 0.12
242 0.12
243 0.12
244 0.11
245 0.11
246 0.11
247 0.15
248 0.15
249 0.14
250 0.16
251 0.16
252 0.16
253 0.15
254 0.15
255 0.15
256 0.16
257 0.2
258 0.21
259 0.25
260 0.27
261 0.32
262 0.42
263 0.44
264 0.45
265 0.43
266 0.4
267 0.38
268 0.36
269 0.3
270 0.21
271 0.15
272 0.12
273 0.09
274 0.08
275 0.07
276 0.05
277 0.05
278 0.04
279 0.05
280 0.05
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.04
287 0.03
288 0.03
289 0.03
290 0.03
291 0.03
292 0.04
293 0.04
294 0.05
295 0.06
296 0.06
297 0.08
298 0.09
299 0.1
300 0.11
301 0.11
302 0.1
303 0.11
304 0.13
305 0.15
306 0.17
307 0.17
308 0.17
309 0.17
310 0.16
311 0.15
312 0.14
313 0.11
314 0.11
315 0.11
316 0.12
317 0.12
318 0.13
319 0.13
320 0.13
321 0.13
322 0.15
323 0.17
324 0.17
325 0.18
326 0.2
327 0.22
328 0.26
329 0.34
330 0.4
331 0.43
332 0.44
333 0.48
334 0.52
335 0.56
336 0.6
337 0.61
338 0.58
339 0.57
340 0.55
341 0.5
342 0.43
343 0.36
344 0.29
345 0.19
346 0.12
347 0.07
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.07
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.07
357 0.07
358 0.07
359 0.07
360 0.08
361 0.09
362 0.1
363 0.1
364 0.1
365 0.09
366 0.08
367 0.08
368 0.07
369 0.06
370 0.08
371 0.08
372 0.1
373 0.18
374 0.23
375 0.27
376 0.32
377 0.34
378 0.38
379 0.48
380 0.56
381 0.57
382 0.56
383 0.57
384 0.56
385 0.59
386 0.52
387 0.43
388 0.32
389 0.24
390 0.2
391 0.15
392 0.15
393 0.12
394 0.13
395 0.13
396 0.16
397 0.2
398 0.25
399 0.29
400 0.26
401 0.26
402 0.3
403 0.34
404 0.38
405 0.42
406 0.42
407 0.42
408 0.49
409 0.53
410 0.56
411 0.62
412 0.64
413 0.67
414 0.72
415 0.77
416 0.79
417 0.83
418 0.88
419 0.88
420 0.89
421 0.9
422 0.91
423 0.91
424 0.93
425 0.94
426 0.93
427 0.94
428 0.94
429 0.93
430 0.93
431 0.92
432 0.9
433 0.87
434 0.82
435 0.73
436 0.67