FuNGI

U5HAS2

Protein Details

Accession

U5HAS2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
114-139	ASRSVTPKLKFKPKNTRKNRPAVSDD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
154-169	SRGRGRGRGRGAMAPR
280-294	AAERRKERQLRKAKA

Subcellular Location(s)

mito 13, nucl 9.5, cyto_nucl 8.5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MSERKGRGRGRRSVIDTSDSTPAATASPIASSSKQPKIEDNDEDAVMFEDPPEDVEMQAAEDAGDRVPSTGAEASTSSSKRISSTTTSSTTRANPRVRPVGGLLGGQSEYVQDASRSVTPKLKFKPKNTRKNRPAVSDDEDDEVKMEEFDNSRSRGRGRGRGRGAMAPRRELEMTASGPMAQGPGGAPKAFGSKRTFGAAGAGVMNASRDGTQLSGRRNDATDDDDEDDVVEDEDDGSHNDGGRQNGGMLPSSRELDSIGREDEMAPLTLPRDPRVEKLAAERRKERQLRKAKAEREAEMDVKAEPGDDSRASSIYLSSATVTPGLETDSKADSKTTLLEEEKEESKPINPEDTNLRPFFDIKTGEPDQLHIMQFPRVFPKFVRADGTSPPENKDDKSDIQPPEWGRAGTRKEKAARYSKEAGRIGEMRIHRNGKVTFKINNDLIYEVLPAAQPTFLQEIAMIDHPDLNDPPSPTDADQRPIPSVVILGQTYNKFIAAPEASYLLGRIAEQEREEKEAEMKLKAVKRESKAHQDARE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.72
2	0.67
3	0.61
4	0.54
5	0.5
6	0.41
7	0.34
8	0.26
9	0.23
10	0.17
11	0.15
12	0.12
13	0.08
14	0.09
15	0.1
16	0.13
17	0.15
18	0.21
19	0.29
20	0.36
21	0.41
22	0.41
23	0.48
24	0.53
25	0.59
26	0.57
27	0.56
28	0.51
29	0.46
30	0.44
31	0.37
32	0.29
33	0.23
34	0.17
35	0.1
36	0.08
37	0.07
38	0.09
39	0.1
40	0.09
41	0.09
42	0.1
43	0.1
44	0.1
45	0.1
46	0.08
47	0.06
48	0.07
49	0.08
50	0.07
51	0.08
52	0.07
53	0.08
54	0.08
55	0.08
56	0.1
57	0.11
58	0.11
59	0.12
60	0.12
61	0.14
62	0.2
63	0.21
64	0.2
65	0.19
66	0.2
67	0.2
68	0.22
69	0.24
70	0.23
71	0.28
72	0.32
73	0.36
74	0.38
75	0.38
76	0.4
77	0.42
78	0.45
79	0.48
80	0.5
81	0.5
82	0.55
83	0.62
84	0.58
85	0.54
86	0.47
87	0.44
88	0.38
89	0.33
90	0.26
91	0.19
92	0.18
93	0.16
94	0.13
95	0.08
96	0.08
97	0.08
98	0.08
99	0.06
100	0.07
101	0.1
102	0.14
103	0.16
104	0.18
105	0.24
106	0.26
107	0.35
108	0.43
109	0.51
110	0.56
111	0.63
112	0.73
113	0.76
114	0.85
115	0.87
116	0.9
117	0.88
118	0.9
119	0.87
120	0.83
121	0.77
122	0.73
123	0.68
124	0.6
125	0.53
126	0.45
127	0.38
128	0.31
129	0.26
130	0.2
131	0.14
132	0.1
133	0.09
134	0.08
135	0.09
136	0.13
137	0.17
138	0.19
139	0.21
140	0.23
141	0.24
142	0.3
143	0.35
144	0.41
145	0.44
146	0.51
147	0.54
148	0.57
149	0.58
150	0.56
151	0.56
152	0.55
153	0.51
154	0.45
155	0.41
156	0.38
157	0.36
158	0.3
159	0.26
160	0.21
161	0.2
162	0.17
163	0.16
164	0.13
165	0.13
166	0.12
167	0.1
168	0.06
169	0.05
170	0.04
171	0.07
172	0.08
173	0.08
174	0.08
175	0.09
176	0.16
177	0.16
178	0.2
179	0.22
180	0.24
181	0.26
182	0.28
183	0.28
184	0.21
185	0.22
186	0.18
187	0.14
188	0.11
189	0.1
190	0.07
191	0.07
192	0.07
193	0.05
194	0.05
195	0.04
196	0.04
197	0.05
198	0.06
199	0.1
200	0.14
201	0.17
202	0.21
203	0.22
204	0.23
205	0.23
206	0.24
207	0.21
208	0.2
209	0.18
210	0.16
211	0.17
212	0.16
213	0.15
214	0.14
215	0.12
216	0.09
217	0.08
218	0.05
219	0.03
220	0.04
221	0.04
222	0.04
223	0.04
224	0.05
225	0.06
226	0.06
227	0.08
228	0.1
229	0.11
230	0.11
231	0.1
232	0.1
233	0.1
234	0.11
235	0.1
236	0.09
237	0.1
238	0.1
239	0.11
240	0.11
241	0.1
242	0.11
243	0.1
244	0.11
245	0.11
246	0.11
247	0.1
248	0.1
249	0.1
250	0.1
251	0.09
252	0.08
253	0.06
254	0.06
255	0.07
256	0.08
257	0.09
258	0.09
259	0.13
260	0.14
261	0.16
262	0.2
263	0.2
264	0.19
265	0.27
266	0.35
267	0.37
268	0.4
269	0.43
270	0.43
271	0.52
272	0.59
273	0.56
274	0.57
275	0.62
276	0.65
277	0.7
278	0.74
279	0.69
280	0.7
281	0.68
282	0.59
283	0.53
284	0.48
285	0.39
286	0.31
287	0.27
288	0.18
289	0.15
290	0.13
291	0.09
292	0.06
293	0.06
294	0.08
295	0.07
296	0.08
297	0.08
298	0.09
299	0.09
300	0.09
301	0.08
302	0.07
303	0.07
304	0.06
305	0.07
306	0.07
307	0.07
308	0.07
309	0.07
310	0.06
311	0.06
312	0.08
313	0.08
314	0.08
315	0.09
316	0.11
317	0.12
318	0.12
319	0.12
320	0.11
321	0.11
322	0.12
323	0.12
324	0.13
325	0.13
326	0.14
327	0.16
328	0.19
329	0.2
330	0.18
331	0.18
332	0.15
333	0.17
334	0.19
335	0.19
336	0.22
337	0.2
338	0.21
339	0.28
340	0.32
341	0.35
342	0.32
343	0.32
344	0.26
345	0.27
346	0.26
347	0.24
348	0.21
349	0.16
350	0.23
351	0.24
352	0.26
353	0.25
354	0.25
355	0.23
356	0.25
357	0.24
358	0.18
359	0.18
360	0.19
361	0.2
362	0.2
363	0.24
364	0.22
365	0.23
366	0.22
367	0.29
368	0.28
369	0.29
370	0.33
371	0.28
372	0.29
373	0.33
374	0.38
375	0.35
376	0.33
377	0.34
378	0.34
379	0.34
380	0.32
381	0.33
382	0.32
383	0.31
384	0.35
385	0.4
386	0.38
387	0.37
388	0.42
389	0.38
390	0.37
391	0.35
392	0.3
393	0.24
394	0.29
395	0.35
396	0.38
397	0.41
398	0.43
399	0.48
400	0.53
401	0.6
402	0.62
403	0.61
404	0.6
405	0.64
406	0.61
407	0.63
408	0.6
409	0.53
410	0.48
411	0.45
412	0.39
413	0.36
414	0.36
415	0.32
416	0.36
417	0.38
418	0.34
419	0.39
420	0.41
421	0.41
422	0.45
423	0.45
424	0.43
425	0.45
426	0.5
427	0.45
428	0.44
429	0.38
430	0.33
431	0.28
432	0.23
433	0.19
434	0.13
435	0.12
436	0.09
437	0.08
438	0.08
439	0.08
440	0.07
441	0.09
442	0.12
443	0.11
444	0.11
445	0.11
446	0.11
447	0.13
448	0.16
449	0.14
450	0.11
451	0.13
452	0.13
453	0.15
454	0.15
455	0.15
456	0.17
457	0.18
458	0.19
459	0.2
460	0.22
461	0.21
462	0.29
463	0.3
464	0.31
465	0.34
466	0.35
467	0.35
468	0.33
469	0.32
470	0.24
471	0.21
472	0.19
473	0.18
474	0.16
475	0.15
476	0.19
477	0.19
478	0.21
479	0.21
480	0.19
481	0.15
482	0.15
483	0.2
484	0.17
485	0.17
486	0.17
487	0.18
488	0.18
489	0.18
490	0.18
491	0.12
492	0.11
493	0.09
494	0.13
495	0.15
496	0.17
497	0.2
498	0.25
499	0.26
500	0.3
501	0.31
502	0.28
503	0.28
504	0.31
505	0.32
506	0.28
507	0.29
508	0.33
509	0.37
510	0.42
511	0.47
512	0.5
513	0.53
514	0.61
515	0.66
516	0.7
517	0.74

U5HAS2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer