FuNGI

U5H5S2

Protein Details

Accession

U5H5S2

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
290-311	LMSLKKEKEMREKERKRRETTE	Basic
535-560	DGEIKPAQARRVRKRNRPRDSATATG	Hydrophilic
566-586	ATKQLLTKKRFSKKINYAAVD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
295-307	KEKEMREKERKRR
340-340	R
543-553	ARRVRKRNRPR

Subcellular Location(s)

cyto 18.5, cyto_nucl 12.5, nucl 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011665 BRF1_TBP-bd_dom IPR013763 Cyclin-like_dom IPR036915 Cyclin-like_sf IPR000812 TFIIB IPR013150 TFIIB_cyclin
Gene Ontology	GO:0000126 C:transcription factor TFIIIB complex GO:0000995 F:RNA polymerase III general transcription initiation factor activity GO:0001006 F:RNA polymerase III type 3 promoter sequence-specific DNA binding GO:0017025 F:TBP-class protein binding GO:0006384 P:transcription initiation at RNA polymerase III promoter GO:0070897 P:transcription preinitiation complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF07741 BRF1 PF00382 TFIIB
CDD	cd20553 CYCLIN_TFIIIB90_rpt1 cd20554 CYCLIN_TFIIIB90_rpt2

Amino Acid Sequences

MSCYSCGKDTLLEVDGARTVCTRCGTVLEENAIVSEITFGETGGGAAIVQGSYVGADQTRARAPAGYRNAGGRQESREQTMINGRRRIQGLAIALHIPERLADAGQRYFNLAVNLNFVQGRRTQYVVAACLYCACRMDKTSHMLIDFSDMLEINVFVLGSTYLKLIKELQLQLPTVDPSLYITRFAALLEFGEETQKVAQDAVRLVARMGRDWMHIGRRPAGVCGACLLLAARMNNFRRSVAEVVQVVKIADTTLKKRLDEFRDTPSGALTVADFRTLWLDETADPPAFLMSLKKEKEMREKERKRRETTELGEEEDGQEAFEELAKRIDEGGERDRERRKRGGGDEEYDEEEEDEEGDEPGGGKSRSPSKESTASHAAELMPPPAVPSSKALGKRRRLFNPEESDDDDQSDKDADEEEEEAQKDAEPNPLLEDNADLDEAIMAELSTTLGSRAGVALTDELDKVEAKRLEAASAMTNLSHGGNHGGSDRLDDLDEDELDAFILTEEEVQAKSRLWMQMNKDYLQALADRQTGPDGEIKPAQARRVRKRNRPRDSATATGANAAEATKQLLTKKRFSKKINYAAVDALFERDDDDAASSVGGDDRRDDDDDDGILFGQRHGPAKTQRGITPTAYRKGTPILTPAPTFSSRRGTPASNRAGSVPVTLRAIEPEPEEEAVEEDADADGWRKQLGATMGEDDGFADEWA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.21
3	0.2
4	0.18
5	0.17
6	0.16
7	0.18
8	0.2
9	0.2
10	0.17
11	0.21
12	0.24
13	0.27
14	0.3
15	0.29
16	0.28
17	0.26
18	0.26
19	0.23
20	0.18
21	0.13
22	0.1
23	0.07
24	0.08
25	0.08
26	0.07
27	0.07
28	0.08
29	0.07
30	0.06
31	0.06
32	0.04
33	0.04
34	0.05
35	0.04
36	0.04
37	0.04
38	0.04
39	0.04
40	0.05
41	0.05
42	0.05
43	0.08
44	0.09
45	0.13
46	0.16
47	0.17
48	0.18
49	0.21
50	0.23
51	0.31
52	0.37
53	0.37
54	0.35
55	0.38
56	0.42
57	0.42
58	0.44
59	0.38
60	0.36
61	0.41
62	0.42
63	0.42
64	0.4
65	0.36
66	0.36
67	0.43
68	0.46
69	0.46
70	0.5
71	0.48
72	0.52
73	0.53
74	0.51
75	0.42
76	0.39
77	0.34
78	0.29
79	0.28
80	0.23
81	0.21
82	0.2
83	0.18
84	0.13
85	0.1
86	0.1
87	0.08
88	0.08
89	0.1
90	0.14
91	0.17
92	0.19
93	0.19
94	0.2
95	0.2
96	0.22
97	0.22
98	0.21
99	0.18
100	0.21
101	0.21
102	0.2
103	0.2
104	0.18
105	0.18
106	0.19
107	0.24
108	0.22
109	0.24
110	0.23
111	0.25
112	0.28
113	0.28
114	0.26
115	0.21
116	0.19
117	0.2
118	0.21
119	0.18
120	0.17
121	0.16
122	0.16
123	0.18
124	0.22
125	0.24
126	0.28
127	0.31
128	0.32
129	0.31
130	0.29
131	0.26
132	0.26
133	0.22
134	0.16
135	0.13
136	0.1
137	0.1
138	0.1
139	0.1
140	0.06
141	0.06
142	0.05
143	0.04
144	0.04
145	0.05
146	0.05
147	0.06
148	0.06
149	0.08
150	0.08
151	0.1
152	0.12
153	0.16
154	0.22
155	0.24
156	0.28
157	0.29
158	0.3
159	0.29
160	0.28
161	0.25
162	0.19
163	0.15
164	0.11
165	0.11
166	0.15
167	0.15
168	0.14
169	0.14
170	0.13
171	0.14
172	0.14
173	0.11
174	0.07
175	0.07
176	0.07
177	0.07
178	0.07
179	0.08
180	0.08
181	0.09
182	0.09
183	0.1
184	0.08
185	0.09
186	0.1
187	0.1
188	0.11
189	0.13
190	0.13
191	0.12
192	0.12
193	0.14
194	0.13
195	0.12
196	0.13
197	0.12
198	0.12
199	0.15
200	0.19
201	0.23
202	0.26
203	0.28
204	0.3
205	0.31
206	0.31
207	0.29
208	0.3
209	0.23
210	0.2
211	0.18
212	0.15
213	0.12
214	0.11
215	0.1
216	0.07
217	0.08
218	0.09
219	0.09
220	0.16
221	0.19
222	0.22
223	0.23
224	0.22
225	0.22
226	0.26
227	0.27
228	0.23
229	0.24
230	0.22
231	0.23
232	0.23
233	0.21
234	0.17
235	0.14
236	0.12
237	0.08
238	0.1
239	0.11
240	0.14
241	0.21
242	0.23
243	0.24
244	0.28
245	0.36
246	0.38
247	0.44
248	0.43
249	0.42
250	0.44
251	0.44
252	0.4
253	0.33
254	0.26
255	0.18
256	0.16
257	0.1
258	0.08
259	0.08
260	0.08
261	0.07
262	0.07
263	0.09
264	0.09
265	0.1
266	0.07
267	0.08
268	0.08
269	0.1
270	0.12
271	0.1
272	0.1
273	0.09
274	0.09
275	0.08
276	0.07
277	0.07
278	0.09
279	0.16
280	0.17
281	0.21
282	0.25
283	0.29
284	0.39
285	0.47
286	0.53
287	0.57
288	0.67
289	0.74
290	0.81
291	0.86
292	0.82
293	0.78
294	0.75
295	0.72
296	0.66
297	0.64
298	0.54
299	0.48
300	0.41
301	0.35
302	0.29
303	0.21
304	0.17
305	0.08
306	0.07
307	0.05
308	0.05
309	0.06
310	0.07
311	0.06
312	0.08
313	0.08
314	0.08
315	0.08
316	0.09
317	0.08
318	0.11
319	0.15
320	0.2
321	0.21
322	0.26
323	0.33
324	0.38
325	0.42
326	0.43
327	0.43
328	0.43
329	0.46
330	0.51
331	0.47
332	0.45
333	0.42
334	0.39
335	0.36
336	0.29
337	0.25
338	0.15
339	0.12
340	0.09
341	0.07
342	0.05
343	0.04
344	0.04
345	0.04
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.06
350	0.06
351	0.06
352	0.08
353	0.16
354	0.19
355	0.22
356	0.24
357	0.26
358	0.34
359	0.34
360	0.38
361	0.35
362	0.34
363	0.3
364	0.29
365	0.25
366	0.19
367	0.18
368	0.13
369	0.08
370	0.07
371	0.08
372	0.07
373	0.08
374	0.07
375	0.09
376	0.11
377	0.15
378	0.22
379	0.3
380	0.38
381	0.47
382	0.54
383	0.59
384	0.63
385	0.64
386	0.63
387	0.64
388	0.63
389	0.57
390	0.52
391	0.49
392	0.45
393	0.39
394	0.35
395	0.27
396	0.18
397	0.16
398	0.13
399	0.09
400	0.07
401	0.08
402	0.06
403	0.07
404	0.08
405	0.08
406	0.1
407	0.1
408	0.1
409	0.1
410	0.1
411	0.1
412	0.1
413	0.13
414	0.12
415	0.11
416	0.14
417	0.14
418	0.14
419	0.12
420	0.12
421	0.09
422	0.09
423	0.09
424	0.06
425	0.05
426	0.05
427	0.05
428	0.04
429	0.03
430	0.03
431	0.03
432	0.03
433	0.03
434	0.03
435	0.03
436	0.03
437	0.04
438	0.04
439	0.04
440	0.05
441	0.04
442	0.04
443	0.05
444	0.05
445	0.06
446	0.06
447	0.06
448	0.06
449	0.07
450	0.07
451	0.07
452	0.14
453	0.14
454	0.13
455	0.17
456	0.18
457	0.18
458	0.18
459	0.18
460	0.13
461	0.14
462	0.13
463	0.09
464	0.09
465	0.09
466	0.09
467	0.08
468	0.06
469	0.07
470	0.07
471	0.08
472	0.09
473	0.09
474	0.09
475	0.11
476	0.11
477	0.1
478	0.1
479	0.09
480	0.1
481	0.1
482	0.1
483	0.09
484	0.08
485	0.07
486	0.07
487	0.07
488	0.05
489	0.04
490	0.04
491	0.03
492	0.04
493	0.04
494	0.05
495	0.06
496	0.07
497	0.08
498	0.08
499	0.1
500	0.13
501	0.18
502	0.2
503	0.26
504	0.3
505	0.38
506	0.41
507	0.41
508	0.38
509	0.34
510	0.3
511	0.26
512	0.21
513	0.14
514	0.14
515	0.16
516	0.15
517	0.15
518	0.16
519	0.15
520	0.16
521	0.2
522	0.17
523	0.18
524	0.2
525	0.2
526	0.25
527	0.28
528	0.33
529	0.34
530	0.42
531	0.5
532	0.59
533	0.68
534	0.73
535	0.81
536	0.86
537	0.9
538	0.89
539	0.85
540	0.84
541	0.82
542	0.76
543	0.69
544	0.61
545	0.51
546	0.44
547	0.37
548	0.27
549	0.2
550	0.15
551	0.12
552	0.08
553	0.1
554	0.08
555	0.11
556	0.16
557	0.24
558	0.29
559	0.37
560	0.47
561	0.55
562	0.63
563	0.67
564	0.73
565	0.75
566	0.8
567	0.81
568	0.73
569	0.66
570	0.6
571	0.54
572	0.45
573	0.34
574	0.26
575	0.17
576	0.14
577	0.12
578	0.1
579	0.09
580	0.08
581	0.09
582	0.08
583	0.08
584	0.08
585	0.07
586	0.07
587	0.09
588	0.1
589	0.09
590	0.1
591	0.13
592	0.16
593	0.18
594	0.19
595	0.18
596	0.19
597	0.19
598	0.17
599	0.15
600	0.12
601	0.12
602	0.11
603	0.1
604	0.13
605	0.15
606	0.19
607	0.2
608	0.27
609	0.33
610	0.4
611	0.46
612	0.45
613	0.46
614	0.46
615	0.49
616	0.47
617	0.49
618	0.49
619	0.5
620	0.48
621	0.45
622	0.44
623	0.45
624	0.44
625	0.36
626	0.35
627	0.34
628	0.35
629	0.35
630	0.35
631	0.35
632	0.36
633	0.36
634	0.34
635	0.36
636	0.33
637	0.38
638	0.4
639	0.41
640	0.45
641	0.52
642	0.57
643	0.51
644	0.51
645	0.47
646	0.45
647	0.4
648	0.37
649	0.3
650	0.24
651	0.23
652	0.22
653	0.21
654	0.22
655	0.24
656	0.21
657	0.2
658	0.2
659	0.21
660	0.21
661	0.21
662	0.18
663	0.18
664	0.16
665	0.14
666	0.11
667	0.09
668	0.08
669	0.08
670	0.08
671	0.08
672	0.09
673	0.1
674	0.1
675	0.1
676	0.1
677	0.14
678	0.17
679	0.19
680	0.2
681	0.22
682	0.23
683	0.22
684	0.22
685	0.18
686	0.16

U5H5S2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer