FuNGI

U5H294

Protein Details

Accession

U5H294

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-21	MDGSKQTNRAHRPSKAPKAGP	Hydrophilic
186-208	VKTPAALKAQKKRLKNRFWTEVY	Hydrophilic
1078-1097	LPYASKPKLQTPQKNKTYMQ	Hydrophilic
1117-1180	IQAISRDKLAKRKEKKAETKEKRQKKLAKIDAGRAEKEKEKKQEHFKMQENKKQAQERKRQRTA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
10-32	AHRPSKAPKAGPAKGQNPKAFVP
35-38	FRRA
1124-1179	KLAKRKEKKAETKEKRQKKLAKIDAGRAEKEKEKKQEHFKMQENKKQAQERKRQRT

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 12, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012948 AARP2CN IPR039761 Bms1/Tsr1 IPR037875 Bms1_N IPR007034 BMS1_TSR1_C IPR030387 G_Bms1/Tsr1_dom IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0030686 C:90S preribosome GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005730 C:nucleolus GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0005525 F:GTP binding GO:0003924 F:GTPase activity GO:0034511 F:U3 snoRNA binding GO:0000480 P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000472 P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:2000232 P:regulation of rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF08142 AARP2CN PF04950 RIBIOP_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS51714 G_BMS1
CDD	cd01882 BMS1

Amino Acid Sequences

MDGSKQTNRAHRPSKAPKAGPAKGQNPKAFVPSSFRRAEKQGRRNVEKDQTRLHVPAVDRTFGGTSGQGGKDVEGEVPPVIVAVIGPQGVGKSTLVRSMVRRYTKNTLADIKGPVTVVTGKNRRLTIIECPNDLGSMIDVAKVADLVLLMIDGSFGFEMETFEALSALSSHGMPKIIAVLTHLDLVKTPAALKAQKKRLKNRFWTEVYDGAKMFYLSGVMNGRYPDREILNLSRFISVAKFRPLVFRNQHSYFLADRFDDLTSRETIRQNPKTDRTLALFGYLRGVPLRPPGPTHSLRVHIPGAGVDAFQVSRLLELVDPCPLPTKDSEKRRKMGDKNKVAYAPMSGGSATGVMWDGDKVWINTSGTFSKRREGDEEYDPEDDTDQVGGDGIKMMMELQDVPETLGDGVAASQIRLFGSSKQPLQVPPPRINPHDPSSSSSSSSLKRTRRAAFDDAVGEHDGADYEDDEEEEVEVDEDDFDTDSEEEEEEEEEEDEGMKFEKVGSSEVRTGRRVAGGPTSVGERGEKIAYADSDSDLGFGEEEERQLNLEEDEDSDEEEEEGPEWKKNLASLAAANLGQRRKPNLMKLIYNSTFSAEEIASGRTDKPNNDDEEEEENIQDDDDDLFKISRKAHLAENGEEEDESAPEDRFRRPVSNAELEVWQDEDFLDSIRHLFITGGAADSSVATGANAYEEEGGDFEDLENEEGSSKPAADSVQEDSKTKADRLAAKKADLKRKFDAEYDHDSDDEDKMDFYTEQKDEMERKLRATRAEFAEDDAETRALVEGHRPGTYVRLEITGVPYQMVENFNPRIPIIVGCLLAHEESFGYVQVRIKKHRWFPKILKTNDPLIFSLGWRRFQTVPIYSLDDGTRNRMLKYTPEHMHCLATFYGPISAPNTGFCAFNRLGNDTPSFRVSANGVVLDINGATSIVKKLKLTGTPYKVFKNTAFVKDMFTSSLEVAKFEGAHIRTVSGIRGQVKKALSKPEGCYRAAFEDKVLMSDIVFLRAWYQIKPRQFYNPVASLWLRDKASWQGMRLTGEVRRDQGVKTPSDINSLYKPIVRETRRFNTLKVPRKLQAALPYASKPKLQTPQKNKTYMQKRAVVMEPDEKQALSLLQQIQAISRDKLAKRKEKKAETKEKRQKKLAKIDAGRAEKEKEKKQEHFKMQENKKQAQERKRQRTA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.82
2	0.83
3	0.78
4	0.78
5	0.79
6	0.77
7	0.76
8	0.74
9	0.73
10	0.72
11	0.77
12	0.72
13	0.67
14	0.64
15	0.6
16	0.53
17	0.46
18	0.45
19	0.43
20	0.46
21	0.48
22	0.48
23	0.47
24	0.53
25	0.62
26	0.64
27	0.67
28	0.69
29	0.73
30	0.79
31	0.78
32	0.78
33	0.78
34	0.75
35	0.71
36	0.69
37	0.63
38	0.6
39	0.59
40	0.51
41	0.46
42	0.4
43	0.43
44	0.39
45	0.36
46	0.31
47	0.31
48	0.3
49	0.25
50	0.25
51	0.16
52	0.15
53	0.2
54	0.2
55	0.19
56	0.19
57	0.19
58	0.19
59	0.19
60	0.17
61	0.12
62	0.13
63	0.11
64	0.11
65	0.1
66	0.08
67	0.07
68	0.06
69	0.05
70	0.05
71	0.06
72	0.06
73	0.06
74	0.06
75	0.07
76	0.08
77	0.09
78	0.09
79	0.11
80	0.13
81	0.17
82	0.19
83	0.22
84	0.26
85	0.34
86	0.42
87	0.46
88	0.49
89	0.52
90	0.58
91	0.62
92	0.63
93	0.59
94	0.58
95	0.54
96	0.54
97	0.51
98	0.44
99	0.38
100	0.33
101	0.27
102	0.22
103	0.23
104	0.23
105	0.29
106	0.35
107	0.39
108	0.44
109	0.45
110	0.44
111	0.42
112	0.41
113	0.41
114	0.45
115	0.43
116	0.39
117	0.4
118	0.39
119	0.36
120	0.33
121	0.23
122	0.13
123	0.12
124	0.11
125	0.09
126	0.09
127	0.09
128	0.09
129	0.08
130	0.07
131	0.05
132	0.05
133	0.04
134	0.04
135	0.04
136	0.04
137	0.03
138	0.04
139	0.03
140	0.04
141	0.04
142	0.04
143	0.04
144	0.05
145	0.06
146	0.07
147	0.08
148	0.07
149	0.07
150	0.07
151	0.07
152	0.07
153	0.06
154	0.06
155	0.07
156	0.07
157	0.08
158	0.09
159	0.1
160	0.1
161	0.1
162	0.12
163	0.12
164	0.11
165	0.12
166	0.14
167	0.14
168	0.17
169	0.17
170	0.14
171	0.14
172	0.16
173	0.16
174	0.13
175	0.13
176	0.12
177	0.17
178	0.24
179	0.32
180	0.39
181	0.49
182	0.55
183	0.64
184	0.72
185	0.77
186	0.81
187	0.84
188	0.83
189	0.82
190	0.8
191	0.77
192	0.71
193	0.68
194	0.6
195	0.52
196	0.43
197	0.34
198	0.3
199	0.24
200	0.19
201	0.12
202	0.1
203	0.07
204	0.11
205	0.13
206	0.13
207	0.14
208	0.16
209	0.17
210	0.17
211	0.19
212	0.19
213	0.18
214	0.19
215	0.22
216	0.27
217	0.3
218	0.32
219	0.31
220	0.28
221	0.27
222	0.25
223	0.25
224	0.22
225	0.22
226	0.25
227	0.26
228	0.26
229	0.34
230	0.35
231	0.42
232	0.44
233	0.47
234	0.5
235	0.5
236	0.53
237	0.46
238	0.47
239	0.4
240	0.35
241	0.3
242	0.23
243	0.21
244	0.19
245	0.18
246	0.16
247	0.15
248	0.15
249	0.15
250	0.18
251	0.21
252	0.23
253	0.3
254	0.4
255	0.46
256	0.5
257	0.56
258	0.6
259	0.6
260	0.61
261	0.56
262	0.5
263	0.46
264	0.39
265	0.35
266	0.3
267	0.25
268	0.25
269	0.22
270	0.18
271	0.15
272	0.15
273	0.12
274	0.17
275	0.19
276	0.17
277	0.2
278	0.24
279	0.3
280	0.32
281	0.36
282	0.34
283	0.35
284	0.36
285	0.37
286	0.33
287	0.26
288	0.24
289	0.19
290	0.17
291	0.14
292	0.12
293	0.08
294	0.08
295	0.07
296	0.07
297	0.08
298	0.05
299	0.05
300	0.06
301	0.06
302	0.07
303	0.08
304	0.09
305	0.11
306	0.11
307	0.12
308	0.17
309	0.16
310	0.17
311	0.19
312	0.27
313	0.32
314	0.43
315	0.54
316	0.56
317	0.61
318	0.67
319	0.74
320	0.75
321	0.77
322	0.77
323	0.77
324	0.73
325	0.73
326	0.66
327	0.57
328	0.48
329	0.39
330	0.29
331	0.2
332	0.16
333	0.11
334	0.09
335	0.09
336	0.08
337	0.06
338	0.05
339	0.05
340	0.04
341	0.05
342	0.05
343	0.05
344	0.07
345	0.09
346	0.09
347	0.1
348	0.13
349	0.13
350	0.14
351	0.17
352	0.19
353	0.21
354	0.26
355	0.26
356	0.29
357	0.31
358	0.33
359	0.34
360	0.35
361	0.37
362	0.38
363	0.4
364	0.37
365	0.36
366	0.33
367	0.29
368	0.24
369	0.19
370	0.13
371	0.09
372	0.06
373	0.05
374	0.05
375	0.05
376	0.05
377	0.05
378	0.04
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.04
383	0.04
384	0.05
385	0.05
386	0.06
387	0.06
388	0.07
389	0.07
390	0.07
391	0.06
392	0.06
393	0.05
394	0.04
395	0.04
396	0.05
397	0.05
398	0.05
399	0.05
400	0.06
401	0.06
402	0.07
403	0.08
404	0.09
405	0.16
406	0.2
407	0.21
408	0.23
409	0.25
410	0.25
411	0.32
412	0.36
413	0.35
414	0.37
415	0.44
416	0.47
417	0.49
418	0.53
419	0.5
420	0.47
421	0.47
422	0.43
423	0.38
424	0.4
425	0.38
426	0.34
427	0.31
428	0.3
429	0.26
430	0.32
431	0.36
432	0.35
433	0.39
434	0.45
435	0.48
436	0.5
437	0.53
438	0.51
439	0.45
440	0.41
441	0.37
442	0.31
443	0.28
444	0.23
445	0.17
446	0.12
447	0.1
448	0.08
449	0.06
450	0.06
451	0.04
452	0.05
453	0.05
454	0.05
455	0.05
456	0.05
457	0.05
458	0.05
459	0.04
460	0.04
461	0.04
462	0.04
463	0.04
464	0.04
465	0.04
466	0.04
467	0.04
468	0.05
469	0.05
470	0.05
471	0.05
472	0.05
473	0.05
474	0.06
475	0.06
476	0.05
477	0.06
478	0.06
479	0.05
480	0.05
481	0.06
482	0.05
483	0.05
484	0.05
485	0.05
486	0.05
487	0.05
488	0.06
489	0.06
490	0.09
491	0.1
492	0.12
493	0.18
494	0.22
495	0.24
496	0.24
497	0.25
498	0.24
499	0.24
500	0.22
501	0.18
502	0.17
503	0.15
504	0.14
505	0.13
506	0.14
507	0.12
508	0.12
509	0.11
510	0.08
511	0.09
512	0.09
513	0.08
514	0.07
515	0.08
516	0.08
517	0.09
518	0.09
519	0.08
520	0.08
521	0.08
522	0.08
523	0.06
524	0.06
525	0.05
526	0.04
527	0.05
528	0.05
529	0.06
530	0.06
531	0.06
532	0.06
533	0.06
534	0.07
535	0.06
536	0.06
537	0.06
538	0.06
539	0.07
540	0.07
541	0.07
542	0.07
543	0.07
544	0.06
545	0.06
546	0.06
547	0.05
548	0.07
549	0.07
550	0.08
551	0.08
552	0.09
553	0.09
554	0.09
555	0.1
556	0.08
557	0.09
558	0.08
559	0.09
560	0.09
561	0.1
562	0.1
563	0.12
564	0.12
565	0.13
566	0.15
567	0.17
568	0.21
569	0.24
570	0.28
571	0.33
572	0.35
573	0.36
574	0.37
575	0.42
576	0.37
577	0.36
578	0.31
579	0.24
580	0.21
581	0.18
582	0.17
583	0.09
584	0.09
585	0.08
586	0.09
587	0.07
588	0.08
589	0.09
590	0.11
591	0.13
592	0.13
593	0.16
594	0.2
595	0.22
596	0.23
597	0.23
598	0.22
599	0.24
600	0.25
601	0.21
602	0.16
603	0.14
604	0.12
605	0.12
606	0.09
607	0.05
608	0.05
609	0.05
610	0.05
611	0.05
612	0.05
613	0.06
614	0.09
615	0.09
616	0.12
617	0.14
618	0.16
619	0.18
620	0.24
621	0.26
622	0.25
623	0.27
624	0.24
625	0.22
626	0.2
627	0.18
628	0.12
629	0.09
630	0.08
631	0.06
632	0.06
633	0.07
634	0.09
635	0.1
636	0.13
637	0.15
638	0.18
639	0.19
640	0.25
641	0.29
642	0.32
643	0.31
644	0.29
645	0.28
646	0.25
647	0.23
648	0.19
649	0.13
650	0.08
651	0.07
652	0.06
653	0.05
654	0.06
655	0.06
656	0.05
657	0.05
658	0.05
659	0.05
660	0.05
661	0.05
662	0.05
663	0.06
664	0.06
665	0.06
666	0.06
667	0.06
668	0.06
669	0.05
670	0.05
671	0.04
672	0.03
673	0.03
674	0.03
675	0.03
676	0.03
677	0.03
678	0.04
679	0.04
680	0.04
681	0.04
682	0.04
683	0.05
684	0.04
685	0.04
686	0.04
687	0.05
688	0.05
689	0.06
690	0.05
691	0.05
692	0.06
693	0.06
694	0.07
695	0.06
696	0.06
697	0.06
698	0.07
699	0.07
700	0.07
701	0.09
702	0.11
703	0.16
704	0.17
705	0.18
706	0.19
707	0.22
708	0.23
709	0.21
710	0.2
711	0.19
712	0.27
713	0.31
714	0.39
715	0.38
716	0.4
717	0.46
718	0.5
719	0.57
720	0.53
721	0.54
722	0.49
723	0.51
724	0.5
725	0.45
726	0.44
727	0.39
728	0.41
729	0.39
730	0.36
731	0.31
732	0.3
733	0.28
734	0.23
735	0.18
736	0.11
737	0.08
738	0.07
739	0.08
740	0.08
741	0.08
742	0.13
743	0.13
744	0.14
745	0.14
746	0.17
747	0.19
748	0.24
749	0.3
750	0.26
751	0.3
752	0.34
753	0.36
754	0.37
755	0.38
756	0.39
757	0.35
758	0.38
759	0.34
760	0.3
761	0.29
762	0.25
763	0.22
764	0.17
765	0.13
766	0.09
767	0.09
768	0.08
769	0.06
770	0.06
771	0.08
772	0.11
773	0.12
774	0.13
775	0.13
776	0.13
777	0.16
778	0.17
779	0.15
780	0.13
781	0.12
782	0.13
783	0.13
784	0.17
785	0.15
786	0.15
787	0.14
788	0.13
789	0.12
790	0.14
791	0.15
792	0.12
793	0.14
794	0.16
795	0.17
796	0.18
797	0.17
798	0.16
799	0.15
800	0.15
801	0.13
802	0.14
803	0.13
804	0.12
805	0.13
806	0.12
807	0.11
808	0.11
809	0.08
810	0.05
811	0.06
812	0.06
813	0.06
814	0.06
815	0.08
816	0.12
817	0.19
818	0.23
819	0.29
820	0.34
821	0.42
822	0.5
823	0.59
824	0.61
825	0.64
826	0.68
827	0.73
828	0.77
829	0.73
830	0.72
831	0.65
832	0.67
833	0.61
834	0.55
835	0.44
836	0.37
837	0.33
838	0.26
839	0.31
840	0.26
841	0.27
842	0.26
843	0.29
844	0.27
845	0.3
846	0.35
847	0.3
848	0.29
849	0.27
850	0.3
851	0.27
852	0.28
853	0.25
854	0.23
855	0.21
856	0.23
857	0.26
858	0.23
859	0.23
860	0.24
861	0.24
862	0.27
863	0.32
864	0.36
865	0.36
866	0.39
867	0.43
868	0.42
869	0.43
870	0.37
871	0.34
872	0.26
873	0.2
874	0.17
875	0.13
876	0.14
877	0.12
878	0.12
879	0.11
880	0.12
881	0.12
882	0.12
883	0.15
884	0.14
885	0.15
886	0.14
887	0.19
888	0.17
889	0.2
890	0.22
891	0.23
892	0.23
893	0.25
894	0.28
895	0.24
896	0.26
897	0.24
898	0.23
899	0.19
900	0.19
901	0.18
902	0.18
903	0.16
904	0.14
905	0.13
906	0.12
907	0.11
908	0.1
909	0.09
910	0.06
911	0.04
912	0.04
913	0.04
914	0.05
915	0.09
916	0.11
917	0.13
918	0.13
919	0.17
920	0.22
921	0.27
922	0.33
923	0.39
924	0.44
925	0.49
926	0.53
927	0.54
928	0.52
929	0.51
930	0.45
931	0.44
932	0.43
933	0.41
934	0.42
935	0.37
936	0.38
937	0.37
938	0.36
939	0.29
940	0.23
941	0.2
942	0.16
943	0.2
944	0.16
945	0.15
946	0.14
947	0.14
948	0.13
949	0.12
950	0.18
951	0.15
952	0.18
953	0.18
954	0.17
955	0.18
956	0.18
957	0.19
958	0.16
959	0.19
960	0.22
961	0.27
962	0.27
963	0.31
964	0.34
965	0.39
966	0.41
967	0.45
968	0.45
969	0.46
970	0.51
971	0.55
972	0.56
973	0.51
974	0.48
975	0.42
976	0.44
977	0.41
978	0.36
979	0.27
980	0.28
981	0.27
982	0.27
983	0.25
984	0.18
985	0.14
986	0.19
987	0.18
988	0.15
989	0.15
990	0.14
991	0.14
992	0.18
993	0.2
994	0.17
995	0.25
996	0.29
997	0.37
998	0.41
999	0.42
1000	0.48
1001	0.52
1002	0.55
1003	0.54
1004	0.52
1005	0.45
1006	0.46
1007	0.43
1008	0.37
1009	0.36
1010	0.35
1011	0.29
1012	0.24
1013	0.27
1014	0.29
1015	0.37
1016	0.37
1017	0.35
1018	0.35
1019	0.37
1020	0.39
1021	0.37
1022	0.34
1023	0.29
1024	0.32
1025	0.33
1026	0.29
1027	0.3
1028	0.29
1029	0.29
1030	0.34
1031	0.35
1032	0.31
1033	0.32
1034	0.35
1035	0.33
1036	0.37
1037	0.37
1038	0.33
1039	0.32
1040	0.34
1041	0.32
1042	0.29
1043	0.29
1044	0.3
1045	0.39
1046	0.4
1047	0.43
1048	0.49
1049	0.55
1050	0.61
1051	0.62
1052	0.58
1053	0.59
1054	0.63
1055	0.67
1056	0.66
1057	0.65
1058	0.6
1059	0.64
1060	0.64
1061	0.59
1062	0.58
1063	0.53
1064	0.48
1065	0.44
1066	0.46
1067	0.45
1068	0.45
1069	0.42
1070	0.35
1071	0.38
1072	0.46
1073	0.52
1074	0.58
1075	0.63
1076	0.72
1077	0.78
1078	0.83
1079	0.79
1080	0.79
1081	0.79
1082	0.79
1083	0.76
1084	0.73
1085	0.66
1086	0.65
1087	0.66
1088	0.6
1089	0.54
1090	0.52
1091	0.46
1092	0.42
1093	0.41
1094	0.35
1095	0.29
1096	0.26
1097	0.22
1098	0.16
1099	0.2
1100	0.19
1101	0.2
1102	0.22
1103	0.22
1104	0.23
1105	0.27
1106	0.29
1107	0.23
1108	0.26
1109	0.32
1110	0.35
1111	0.44
1112	0.52
1113	0.57
1114	0.63
1115	0.73
1116	0.78
1117	0.81
1118	0.88
1119	0.9
1120	0.92
1121	0.91
1122	0.93
1123	0.94
1124	0.94
1125	0.92
1126	0.92
1127	0.9
1128	0.89
1129	0.9
1130	0.88
1131	0.88
1132	0.83
1133	0.83
1134	0.82
1135	0.79
1136	0.72
1137	0.65
1138	0.6
1139	0.57
1140	0.6
1141	0.6
1142	0.6
1143	0.64
1144	0.69
1145	0.76
1146	0.81
1147	0.84
1148	0.84
1149	0.85
1150	0.85
1151	0.87
1152	0.86
1153	0.83
1154	0.79
1155	0.78
1156	0.79
1157	0.79
1158	0.79
1159	0.8
1160	0.82

U5H294

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer