Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PHW1

Protein Details
Accession A0A1D8PHW1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
135-155GARVTRRKRARSTIGNSHKTNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
141-143RKR
Subcellular Location(s) mito 10, cyto 9.5, cyto_nucl 9, nucl 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002132  Ribosomal_L5  
IPR031309  Ribosomal_L5_C  
IPR020929  Ribosomal_L5_CS  
IPR022803  Ribosomal_L5_dom_sf  
IPR031310  Ribosomal_L5_N  
Gene Ontology GO:0022625  C:cytosolic large ribosomal subunit  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
KEGG cal:CAALFM_C206810CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00281  Ribosomal_L5  
PF00673  Ribosomal_L5_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00358  RIBOSOMAL_L5  
Amino Acid Sequences MSDKSQNVMRELRIEKLVLNICVGESGDRLTRAAKVLEQLSGQTPVQSKARYTVRTFGIRRNEKIAVHVTVRGPKAEEILERGLKVKEYQLRSKNFSATGNFGFGIDEHIDLGIKYDPSIGIYGMDFYVVMGRAGARVTRRKRARSTIGNSHKTNKEDTIQWFKTRYDAEVLDK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.29
3 0.32
4 0.34
5 0.26
6 0.25
7 0.21
8 0.18
9 0.19
10 0.18
11 0.12
12 0.08
13 0.1
14 0.11
15 0.12
16 0.12
17 0.13
18 0.14
19 0.15
20 0.16
21 0.15
22 0.17
23 0.17
24 0.18
25 0.18
26 0.17
27 0.17
28 0.19
29 0.17
30 0.16
31 0.16
32 0.18
33 0.21
34 0.21
35 0.2
36 0.24
37 0.31
38 0.32
39 0.34
40 0.37
41 0.38
42 0.45
43 0.46
44 0.46
45 0.5
46 0.51
47 0.5
48 0.5
49 0.48
50 0.39
51 0.41
52 0.38
53 0.3
54 0.25
55 0.26
56 0.23
57 0.25
58 0.25
59 0.22
60 0.19
61 0.17
62 0.17
63 0.16
64 0.14
65 0.12
66 0.15
67 0.16
68 0.15
69 0.16
70 0.15
71 0.14
72 0.14
73 0.16
74 0.18
75 0.21
76 0.29
77 0.35
78 0.38
79 0.43
80 0.44
81 0.41
82 0.37
83 0.35
84 0.29
85 0.26
86 0.23
87 0.19
88 0.17
89 0.15
90 0.13
91 0.11
92 0.12
93 0.09
94 0.08
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.08
100 0.07
101 0.06
102 0.06
103 0.07
104 0.07
105 0.08
106 0.09
107 0.07
108 0.06
109 0.06
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.05
114 0.05
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.05
119 0.05
120 0.06
121 0.07
122 0.09
123 0.13
124 0.23
125 0.29
126 0.39
127 0.47
128 0.55
129 0.62
130 0.7
131 0.74
132 0.75
133 0.77
134 0.78
135 0.8
136 0.8
137 0.76
138 0.74
139 0.71
140 0.63
141 0.59
142 0.52
143 0.45
144 0.43
145 0.48
146 0.5
147 0.48
148 0.5
149 0.49
150 0.46
151 0.48
152 0.43
153 0.38
154 0.34