Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A090CK94

Protein Details
Accession A0A090CK94    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
387-411GEYDVRGKNRVKKGKWKNGVAEFDEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
393-405GKNRVKKGKWKNG
413-441RKALGPPIIPAKYRTGGRGEEKKAEEKKP
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, cyto 4.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MGKGKWIDKKTATHFTLVYRPQNDPLIHDDTAPSMVLAPSAPSKNSKSKGLSDLASELGSDAASIRDNEGEAANYGVYYDDTEYDYMQHLRDLGTGAGEAVFVEAPSLQKSKGKQKMNLSEALAKMDLEHKSEGLLDEEILPSKNLQRLTYQAQQDVPDSIAGFQPDMDPRLREVLEALEDEAYVDEEGGEDVLKGLVEGDAEELDELRDVWEEDEDEDEGWESDCTVKAGPAQKKQQRSQEEDQVPELVDTSREGDQEGPSDDWMGEFKKFKDDQKSGAAAPKKKAVGWGATPSEIQSSIWTTTTNGGRQKKRKGALTNPSTYSMTSSSIYRTEQLNILDRRFEKLEEEYNYDEDDLASVSAVSTMSTVQGTTRQDFDSMLDEFLGEYDVRGKNRVKKGKWKNGVAEFDEIRKALGPPIIPAKYRTGGRGEEKKAEEKKP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.51
3 0.54
4 0.52
5 0.53
6 0.46
7 0.47
8 0.47
9 0.52
10 0.48
11 0.42
12 0.41
13 0.39
14 0.36
15 0.34
16 0.3
17 0.24
18 0.25
19 0.22
20 0.15
21 0.1
22 0.1
23 0.1
24 0.09
25 0.1
26 0.14
27 0.16
28 0.18
29 0.22
30 0.28
31 0.37
32 0.41
33 0.46
34 0.46
35 0.5
36 0.54
37 0.54
38 0.49
39 0.43
40 0.41
41 0.34
42 0.29
43 0.23
44 0.17
45 0.12
46 0.11
47 0.08
48 0.06
49 0.06
50 0.07
51 0.08
52 0.09
53 0.09
54 0.1
55 0.11
56 0.11
57 0.11
58 0.1
59 0.11
60 0.09
61 0.08
62 0.08
63 0.07
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.08
68 0.09
69 0.1
70 0.1
71 0.11
72 0.14
73 0.14
74 0.13
75 0.13
76 0.12
77 0.12
78 0.13
79 0.13
80 0.1
81 0.09
82 0.09
83 0.08
84 0.08
85 0.07
86 0.06
87 0.05
88 0.05
89 0.04
90 0.05
91 0.05
92 0.06
93 0.09
94 0.1
95 0.1
96 0.14
97 0.2
98 0.3
99 0.38
100 0.45
101 0.49
102 0.58
103 0.67
104 0.67
105 0.67
106 0.59
107 0.56
108 0.49
109 0.44
110 0.34
111 0.24
112 0.21
113 0.21
114 0.19
115 0.16
116 0.16
117 0.14
118 0.14
119 0.15
120 0.15
121 0.12
122 0.11
123 0.09
124 0.09
125 0.09
126 0.1
127 0.1
128 0.09
129 0.09
130 0.11
131 0.15
132 0.15
133 0.16
134 0.17
135 0.21
136 0.27
137 0.33
138 0.32
139 0.31
140 0.31
141 0.31
142 0.3
143 0.26
144 0.21
145 0.14
146 0.12
147 0.11
148 0.1
149 0.09
150 0.08
151 0.07
152 0.09
153 0.09
154 0.11
155 0.12
156 0.11
157 0.12
158 0.16
159 0.15
160 0.13
161 0.13
162 0.12
163 0.12
164 0.12
165 0.11
166 0.08
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.05
172 0.04
173 0.03
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.04
188 0.03
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.04
211 0.04
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.09
217 0.17
218 0.22
219 0.28
220 0.37
221 0.42
222 0.5
223 0.55
224 0.6
225 0.59
226 0.62
227 0.6
228 0.61
229 0.59
230 0.52
231 0.48
232 0.4
233 0.34
234 0.25
235 0.21
236 0.11
237 0.08
238 0.07
239 0.08
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.1
244 0.1
245 0.12
246 0.13
247 0.11
248 0.1
249 0.11
250 0.1
251 0.09
252 0.1
253 0.09
254 0.1
255 0.12
256 0.12
257 0.2
258 0.23
259 0.27
260 0.36
261 0.37
262 0.39
263 0.42
264 0.44
265 0.38
266 0.41
267 0.43
268 0.38
269 0.38
270 0.39
271 0.34
272 0.32
273 0.34
274 0.31
275 0.28
276 0.27
277 0.31
278 0.27
279 0.27
280 0.27
281 0.23
282 0.22
283 0.18
284 0.15
285 0.1
286 0.11
287 0.11
288 0.12
289 0.12
290 0.11
291 0.16
292 0.19
293 0.23
294 0.28
295 0.36
296 0.44
297 0.52
298 0.61
299 0.64
300 0.67
301 0.7
302 0.7
303 0.72
304 0.73
305 0.73
306 0.7
307 0.63
308 0.61
309 0.53
310 0.45
311 0.38
312 0.29
313 0.23
314 0.18
315 0.17
316 0.15
317 0.17
318 0.18
319 0.18
320 0.18
321 0.18
322 0.2
323 0.22
324 0.28
325 0.29
326 0.3
327 0.33
328 0.32
329 0.34
330 0.33
331 0.31
332 0.25
333 0.26
334 0.32
335 0.3
336 0.34
337 0.32
338 0.32
339 0.32
340 0.29
341 0.25
342 0.17
343 0.14
344 0.09
345 0.07
346 0.06
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.07
358 0.12
359 0.16
360 0.18
361 0.2
362 0.2
363 0.21
364 0.21
365 0.22
366 0.21
367 0.18
368 0.16
369 0.14
370 0.13
371 0.12
372 0.11
373 0.11
374 0.07
375 0.06
376 0.13
377 0.17
378 0.18
379 0.24
380 0.3
381 0.38
382 0.49
383 0.59
384 0.6
385 0.67
386 0.77
387 0.83
388 0.87
389 0.86
390 0.85
391 0.84
392 0.83
393 0.75
394 0.7
395 0.61
396 0.54
397 0.49
398 0.39
399 0.31
400 0.25
401 0.23
402 0.2
403 0.21
404 0.19
405 0.2
406 0.29
407 0.32
408 0.32
409 0.34
410 0.37
411 0.4
412 0.42
413 0.41
414 0.38
415 0.41
416 0.49
417 0.56
418 0.55
419 0.58
420 0.6
421 0.66