Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A090CD65

Protein Details
Accession A0A090CD65    Localization Confidence High Confidence Score 19.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-52DRSHYDNRDKDRDRDRRRDQDRRRDRDDDKSRHHHHDRSBasic
75-107RDSRRYRSGSRDRNDRRRSRSPRGDNRRDDRGKBasic
276-296VGAVKKEKKTEYRQYMNRVGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
24-121DRDRDRRRDQDRRRDRDDDKSRHHHHDRSSRDHYGRDRDRDRDRDRDRDRDRDSRRYRSGSRDRNDRRRSRSPRGDNRRDDRGKGYRQRDEPRGDREK
Subcellular Location(s) nucl 26, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MADRNHGSSRRGGDRSHYDNRDKDRDRDRRRDQDRRRDRDDDKSRHHHHDRSSRDHYGRDRDRDRDRDRDRDRDRDSRRYRSGSRDRNDRRRSRSPRGDNRRDDRGKGYRQRDEPRGDREKDRGNNTPGNAETLGSEKPPTKELQPPQRRPPPVGSPRRSESPDRGFDREFGGNKPTETLPTRSKPTSTNASTPVAAPVSFKVKPRDDHDGTYSRGRSEEHDEYHQSRGRFDADPMDEDEEDDVVVEDDGLDDMAAMMGFGGFGTTKGKKVTGNNVGAVKKEKKTEYRQYMNRVGGFNRPLSPPR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.57
3 0.61
4 0.61
5 0.6
6 0.64
7 0.71
8 0.73
9 0.69
10 0.7
11 0.71
12 0.74
13 0.77
14 0.81
15 0.83
16 0.83
17 0.89
18 0.91
19 0.91
20 0.91
21 0.92
22 0.9
23 0.88
24 0.85
25 0.8
26 0.8
27 0.8
28 0.78
29 0.77
30 0.78
31 0.77
32 0.78
33 0.81
34 0.76
35 0.75
36 0.75
37 0.74
38 0.73
39 0.74
40 0.72
41 0.67
42 0.68
43 0.65
44 0.66
45 0.66
46 0.66
47 0.65
48 0.64
49 0.7
50 0.74
51 0.73
52 0.73
53 0.71
54 0.73
55 0.73
56 0.76
57 0.74
58 0.74
59 0.75
60 0.74
61 0.75
62 0.75
63 0.76
64 0.75
65 0.75
66 0.73
67 0.7
68 0.71
69 0.74
70 0.73
71 0.72
72 0.73
73 0.76
74 0.8
75 0.85
76 0.84
77 0.82
78 0.83
79 0.85
80 0.85
81 0.85
82 0.85
83 0.86
84 0.88
85 0.9
86 0.88
87 0.84
88 0.84
89 0.77
90 0.69
91 0.66
92 0.63
93 0.63
94 0.62
95 0.64
96 0.61
97 0.66
98 0.7
99 0.69
100 0.68
101 0.64
102 0.63
103 0.64
104 0.6
105 0.55
106 0.54
107 0.55
108 0.54
109 0.54
110 0.52
111 0.49
112 0.49
113 0.46
114 0.44
115 0.35
116 0.32
117 0.27
118 0.2
119 0.15
120 0.13
121 0.13
122 0.1
123 0.11
124 0.11
125 0.12
126 0.13
127 0.14
128 0.15
129 0.22
130 0.29
131 0.39
132 0.47
133 0.53
134 0.6
135 0.67
136 0.65
137 0.61
138 0.59
139 0.58
140 0.57
141 0.61
142 0.56
143 0.53
144 0.55
145 0.56
146 0.54
147 0.47
148 0.44
149 0.42
150 0.45
151 0.44
152 0.44
153 0.4
154 0.38
155 0.38
156 0.35
157 0.29
158 0.22
159 0.22
160 0.2
161 0.19
162 0.2
163 0.17
164 0.17
165 0.18
166 0.21
167 0.24
168 0.28
169 0.32
170 0.31
171 0.33
172 0.32
173 0.34
174 0.38
175 0.35
176 0.34
177 0.33
178 0.34
179 0.33
180 0.31
181 0.28
182 0.2
183 0.16
184 0.13
185 0.11
186 0.15
187 0.17
188 0.2
189 0.25
190 0.29
191 0.33
192 0.38
193 0.46
194 0.43
195 0.44
196 0.47
197 0.44
198 0.43
199 0.45
200 0.41
201 0.32
202 0.3
203 0.27
204 0.25
205 0.29
206 0.32
207 0.29
208 0.33
209 0.37
210 0.38
211 0.44
212 0.44
213 0.36
214 0.31
215 0.3
216 0.28
217 0.25
218 0.24
219 0.25
220 0.23
221 0.25
222 0.27
223 0.28
224 0.24
225 0.23
226 0.22
227 0.14
228 0.12
229 0.1
230 0.08
231 0.05
232 0.05
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.03
240 0.03
241 0.04
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.04
251 0.09
252 0.11
253 0.14
254 0.16
255 0.19
256 0.23
257 0.29
258 0.39
259 0.43
260 0.46
261 0.48
262 0.53
263 0.52
264 0.5
265 0.51
266 0.48
267 0.43
268 0.46
269 0.49
270 0.51
271 0.6
272 0.68
273 0.71
274 0.75
275 0.78
276 0.8
277 0.81
278 0.79
279 0.73
280 0.66
281 0.57
282 0.55
283 0.51
284 0.46
285 0.41