Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A090CTT1

Protein Details
Accession A0A090CTT1    Localization Confidence Low Confidence Score 9.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1162-1182QGNNSRRGRVGRSPQPDRRRQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10.333, mito 6.5, cyto_mito 5.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR033133  PUM-HD  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00806  PUF  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50302  PUM  
PS50303  PUM_HD  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSTSRPAEHLTIGYPPQTVSAQNRSNSPTSTSPNDPQSAGSTLRSPYGLSPGLTPTSKMPGASRSGAGSPNHEMAASGRLFSKRAREIQAQEGIPGIPVNPWGGPPTSGNSTPLRENIPESPTDGFPDFAQLPTPQELPSTRRARAGTVPSRFSPGGAGNGLLAIPSLASKTSRPSPSQTPFKSPSPGIESSGNDISNASALLSRLRAGSMPQRSPFAHVPGTSSPFGPSIFSSWNPTGTGRDRGNTLASIASVPSNGPSSPAQSHFSREGNAESDVHMRTLDYLGLAETPQPARAQIATPTYVPNYADFSKAANRFRSYSVNNKDRYADEDEDDYDDPVMMMENQYLQIQDQLAATNAAIQQHNLAVQAFANQAARPRARTAGVLDTPASRVLRNYYPTPSRLDESITASDIRVSGDKEYDDLPQAVAGLSLGRSNSRNNGLLSAEEQGLEGPTSALWLGSIPTSTTTSTLTEMFKSYGPILSARVLTHKNCGFVNFERVDSAISAKNTMNGKEIFPGAGPIRINFAKPPSASNTPGHDGAMPSPSPDPFSKGQDNSQGMGTGAPGDSSPAALVGTATPTVPPLAEMTGDILSIVVQFGATEEDKYNISASLQRAIQYGEFVDEIPPIKEPAHTRIHDAPKLRDIRKRIDNQALSQAEIESIAVDMLPEIAELSSDYLGNTVVQKLFEHCSDDVRDQMLAEIAPHMAEIGVHKNGTWAAQKIIEVCKTPHQMNLIVQHLRPYTIPLFLDQYGNYVLQGCLKFGSPHNDFIFETMLSRMWEAAQGRYGARAMRACLESHHATKDQQRLLAAAIALHSVKLATNANGALLLTWFLDTCTFPQRRTVLSPQLVPYLVNLCTHKVAYLTVLKVINQKAEGDARDTVLKALFFTPNDQVLEAILSDHACGATLIFKVLTTPFFDETIRSQVVETVKNVLIRIKAQPGQGYKRLMDEVGLSTRSGGGGGNSASRDHSNDNRQRPGSRQTPGNAQHHQQPQQAQQAQQQQQQGGQYNGNAAPQYYNHLNAPAGVPGYDMAYGVPRGEGVDAGLTQQFPTFQQGAMYNAPNTPMAPASIQQMQYQQAMMRGGPPMSNYYSAAVPAGFNGYPDQYRNIGSPIQPPSAQLSNVPGQAPFPPAPGFGMNMSYGYGGQGQMPPNMGYMPQQEQGNNSRRGRVGRSPQPDRRRQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.2
3 0.2
4 0.2
5 0.23
6 0.25
7 0.33
8 0.38
9 0.39
10 0.44
11 0.47
12 0.49
13 0.46
14 0.45
15 0.42
16 0.41
17 0.45
18 0.47
19 0.48
20 0.51
21 0.52
22 0.47
23 0.42
24 0.4
25 0.38
26 0.33
27 0.29
28 0.26
29 0.24
30 0.26
31 0.24
32 0.22
33 0.19
34 0.24
35 0.24
36 0.22
37 0.23
38 0.24
39 0.28
40 0.28
41 0.27
42 0.23
43 0.27
44 0.28
45 0.27
46 0.25
47 0.26
48 0.31
49 0.33
50 0.32
51 0.28
52 0.29
53 0.33
54 0.32
55 0.32
56 0.31
57 0.3
58 0.28
59 0.25
60 0.23
61 0.19
62 0.25
63 0.2
64 0.17
65 0.18
66 0.2
67 0.22
68 0.24
69 0.32
70 0.33
71 0.39
72 0.45
73 0.49
74 0.53
75 0.59
76 0.64
77 0.55
78 0.48
79 0.43
80 0.36
81 0.28
82 0.24
83 0.16
84 0.09
85 0.09
86 0.11
87 0.1
88 0.11
89 0.13
90 0.14
91 0.15
92 0.16
93 0.2
94 0.24
95 0.25
96 0.27
97 0.29
98 0.31
99 0.32
100 0.33
101 0.32
102 0.29
103 0.32
104 0.33
105 0.32
106 0.3
107 0.29
108 0.29
109 0.26
110 0.28
111 0.25
112 0.21
113 0.18
114 0.22
115 0.21
116 0.18
117 0.2
118 0.17
119 0.19
120 0.21
121 0.22
122 0.17
123 0.2
124 0.23
125 0.25
126 0.34
127 0.36
128 0.35
129 0.4
130 0.41
131 0.42
132 0.46
133 0.52
134 0.51
135 0.52
136 0.54
137 0.5
138 0.55
139 0.5
140 0.43
141 0.36
142 0.29
143 0.26
144 0.22
145 0.21
146 0.15
147 0.15
148 0.15
149 0.11
150 0.09
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.05
155 0.06
156 0.07
157 0.09
158 0.15
159 0.23
160 0.29
161 0.32
162 0.37
163 0.46
164 0.53
165 0.63
166 0.61
167 0.61
168 0.61
169 0.62
170 0.62
171 0.53
172 0.5
173 0.46
174 0.44
175 0.39
176 0.38
177 0.35
178 0.35
179 0.37
180 0.31
181 0.24
182 0.22
183 0.19
184 0.15
185 0.14
186 0.09
187 0.07
188 0.07
189 0.09
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.11
194 0.11
195 0.13
196 0.21
197 0.28
198 0.32
199 0.33
200 0.37
201 0.38
202 0.43
203 0.43
204 0.4
205 0.35
206 0.3
207 0.33
208 0.33
209 0.37
210 0.32
211 0.29
212 0.25
213 0.23
214 0.23
215 0.19
216 0.15
217 0.14
218 0.16
219 0.17
220 0.22
221 0.22
222 0.23
223 0.23
224 0.23
225 0.26
226 0.26
227 0.33
228 0.28
229 0.29
230 0.29
231 0.3
232 0.31
233 0.25
234 0.22
235 0.15
236 0.14
237 0.13
238 0.11
239 0.1
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.09
244 0.09
245 0.11
246 0.11
247 0.15
248 0.19
249 0.22
250 0.25
251 0.24
252 0.29
253 0.3
254 0.31
255 0.28
256 0.26
257 0.26
258 0.24
259 0.24
260 0.2
261 0.17
262 0.2
263 0.18
264 0.17
265 0.15
266 0.12
267 0.12
268 0.12
269 0.11
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.08
275 0.07
276 0.09
277 0.1
278 0.11
279 0.11
280 0.11
281 0.12
282 0.13
283 0.14
284 0.15
285 0.18
286 0.18
287 0.18
288 0.2
289 0.2
290 0.2
291 0.19
292 0.16
293 0.18
294 0.17
295 0.18
296 0.16
297 0.17
298 0.23
299 0.28
300 0.32
301 0.33
302 0.34
303 0.35
304 0.38
305 0.43
306 0.39
307 0.44
308 0.49
309 0.52
310 0.52
311 0.51
312 0.5
313 0.44
314 0.45
315 0.41
316 0.34
317 0.27
318 0.27
319 0.26
320 0.26
321 0.25
322 0.21
323 0.14
324 0.12
325 0.1
326 0.08
327 0.08
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.06
332 0.06
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.08
337 0.08
338 0.09
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.09
343 0.08
344 0.09
345 0.1
346 0.11
347 0.11
348 0.11
349 0.11
350 0.11
351 0.12
352 0.1
353 0.09
354 0.07
355 0.07
356 0.09
357 0.08
358 0.09
359 0.09
360 0.09
361 0.12
362 0.18
363 0.19
364 0.19
365 0.21
366 0.23
367 0.23
368 0.24
369 0.23
370 0.25
371 0.25
372 0.24
373 0.22
374 0.2
375 0.2
376 0.21
377 0.19
378 0.12
379 0.12
380 0.15
381 0.19
382 0.22
383 0.24
384 0.27
385 0.3
386 0.32
387 0.35
388 0.33
389 0.31
390 0.27
391 0.27
392 0.23
393 0.24
394 0.24
395 0.2
396 0.18
397 0.16
398 0.16
399 0.14
400 0.13
401 0.1
402 0.09
403 0.09
404 0.1
405 0.1
406 0.11
407 0.12
408 0.12
409 0.13
410 0.12
411 0.11
412 0.09
413 0.09
414 0.08
415 0.07
416 0.06
417 0.04
418 0.04
419 0.05
420 0.05
421 0.07
422 0.08
423 0.1
424 0.13
425 0.17
426 0.19
427 0.19
428 0.2
429 0.19
430 0.18
431 0.18
432 0.16
433 0.13
434 0.1
435 0.1
436 0.08
437 0.08
438 0.07
439 0.06
440 0.04
441 0.04
442 0.04
443 0.04
444 0.04
445 0.03
446 0.03
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.04
451 0.06
452 0.07
453 0.08
454 0.08
455 0.09
456 0.1
457 0.11
458 0.13
459 0.13
460 0.12
461 0.13
462 0.13
463 0.12
464 0.13
465 0.12
466 0.11
467 0.11
468 0.11
469 0.11
470 0.12
471 0.12
472 0.11
473 0.15
474 0.17
475 0.17
476 0.22
477 0.22
478 0.22
479 0.22
480 0.23
481 0.23
482 0.22
483 0.28
484 0.22
485 0.21
486 0.2
487 0.2
488 0.18
489 0.14
490 0.15
491 0.11
492 0.1
493 0.12
494 0.12
495 0.17
496 0.18
497 0.18
498 0.19
499 0.17
500 0.18
501 0.17
502 0.17
503 0.13
504 0.11
505 0.13
506 0.1
507 0.12
508 0.11
509 0.1
510 0.14
511 0.14
512 0.15
513 0.13
514 0.15
515 0.16
516 0.16
517 0.18
518 0.2
519 0.23
520 0.26
521 0.27
522 0.28
523 0.27
524 0.27
525 0.25
526 0.2
527 0.17
528 0.15
529 0.15
530 0.11
531 0.1
532 0.1
533 0.1
534 0.12
535 0.12
536 0.15
537 0.15
538 0.2
539 0.23
540 0.24
541 0.26
542 0.3
543 0.32
544 0.28
545 0.27
546 0.22
547 0.17
548 0.16
549 0.13
550 0.07
551 0.05
552 0.05
553 0.04
554 0.04
555 0.04
556 0.04
557 0.04
558 0.04
559 0.04
560 0.03
561 0.04
562 0.03
563 0.04
564 0.04
565 0.04
566 0.04
567 0.04
568 0.05
569 0.04
570 0.05
571 0.04
572 0.05
573 0.05
574 0.05
575 0.06
576 0.06
577 0.06
578 0.05
579 0.05
580 0.04
581 0.04
582 0.04
583 0.02
584 0.02
585 0.02
586 0.03
587 0.04
588 0.05
589 0.06
590 0.06
591 0.07
592 0.08
593 0.08
594 0.08
595 0.07
596 0.07
597 0.1
598 0.1
599 0.12
600 0.13
601 0.13
602 0.13
603 0.14
604 0.13
605 0.1
606 0.09
607 0.07
608 0.07
609 0.07
610 0.07
611 0.07
612 0.07
613 0.07
614 0.08
615 0.08
616 0.08
617 0.1
618 0.12
619 0.17
620 0.24
621 0.24
622 0.28
623 0.35
624 0.4
625 0.41
626 0.42
627 0.38
628 0.38
629 0.45
630 0.44
631 0.41
632 0.4
633 0.44
634 0.49
635 0.53
636 0.51
637 0.53
638 0.51
639 0.48
640 0.53
641 0.46
642 0.38
643 0.32
644 0.26
645 0.17
646 0.15
647 0.13
648 0.05
649 0.04
650 0.03
651 0.03
652 0.03
653 0.03
654 0.03
655 0.03
656 0.02
657 0.03
658 0.02
659 0.03
660 0.03
661 0.04
662 0.04
663 0.04
664 0.05
665 0.05
666 0.05
667 0.05
668 0.06
669 0.07
670 0.07
671 0.07
672 0.08
673 0.1
674 0.11
675 0.12
676 0.14
677 0.13
678 0.15
679 0.17
680 0.18
681 0.17
682 0.16
683 0.15
684 0.12
685 0.12
686 0.09
687 0.07
688 0.06
689 0.06
690 0.05
691 0.05
692 0.04
693 0.04
694 0.03
695 0.04
696 0.05
697 0.08
698 0.09
699 0.09
700 0.09
701 0.09
702 0.1
703 0.12
704 0.13
705 0.11
706 0.11
707 0.13
708 0.13
709 0.15
710 0.18
711 0.18
712 0.17
713 0.17
714 0.23
715 0.25
716 0.25
717 0.25
718 0.24
719 0.25
720 0.26
721 0.3
722 0.28
723 0.26
724 0.25
725 0.27
726 0.25
727 0.23
728 0.2
729 0.19
730 0.15
731 0.16
732 0.16
733 0.14
734 0.17
735 0.17
736 0.18
737 0.14
738 0.14
739 0.13
740 0.13
741 0.12
742 0.1
743 0.09
744 0.12
745 0.12
746 0.11
747 0.1
748 0.11
749 0.13
750 0.14
751 0.22
752 0.2
753 0.25
754 0.26
755 0.27
756 0.27
757 0.26
758 0.25
759 0.18
760 0.16
761 0.11
762 0.12
763 0.1
764 0.1
765 0.09
766 0.07
767 0.11
768 0.11
769 0.11
770 0.12
771 0.13
772 0.13
773 0.14
774 0.15
775 0.13
776 0.14
777 0.15
778 0.14
779 0.16
780 0.17
781 0.17
782 0.17
783 0.22
784 0.23
785 0.23
786 0.25
787 0.23
788 0.25
789 0.31
790 0.37
791 0.34
792 0.32
793 0.3
794 0.28
795 0.27
796 0.26
797 0.19
798 0.12
799 0.1
800 0.09
801 0.09
802 0.08
803 0.07
804 0.05
805 0.05
806 0.07
807 0.08
808 0.08
809 0.09
810 0.09
811 0.1
812 0.1
813 0.09
814 0.07
815 0.06
816 0.06
817 0.05
818 0.05
819 0.05
820 0.05
821 0.06
822 0.06
823 0.09
824 0.17
825 0.18
826 0.19
827 0.25
828 0.27
829 0.29
830 0.35
831 0.4
832 0.4
833 0.41
834 0.44
835 0.4
836 0.4
837 0.37
838 0.31
839 0.25
840 0.19
841 0.17
842 0.16
843 0.16
844 0.15
845 0.16
846 0.16
847 0.16
848 0.13
849 0.13
850 0.14
851 0.17
852 0.16
853 0.18
854 0.19
855 0.2
856 0.25
857 0.26
858 0.24
859 0.21
860 0.21
861 0.19
862 0.22
863 0.21
864 0.19
865 0.19
866 0.18
867 0.19
868 0.18
869 0.17
870 0.15
871 0.14
872 0.12
873 0.13
874 0.15
875 0.14
876 0.17
877 0.18
878 0.2
879 0.21
880 0.19
881 0.17
882 0.14
883 0.14
884 0.11
885 0.09
886 0.06
887 0.06
888 0.06
889 0.06
890 0.05
891 0.05
892 0.05
893 0.05
894 0.07
895 0.07
896 0.08
897 0.07
898 0.07
899 0.08
900 0.1
901 0.11
902 0.11
903 0.14
904 0.15
905 0.16
906 0.17
907 0.17
908 0.19
909 0.23
910 0.21
911 0.18
912 0.17
913 0.2
914 0.23
915 0.24
916 0.22
917 0.22
918 0.23
919 0.24
920 0.24
921 0.23
922 0.22
923 0.22
924 0.25
925 0.26
926 0.28
927 0.29
928 0.34
929 0.38
930 0.43
931 0.46
932 0.46
933 0.4
934 0.4
935 0.39
936 0.33
937 0.27
938 0.22
939 0.2
940 0.19
941 0.19
942 0.16
943 0.15
944 0.15
945 0.14
946 0.12
947 0.09
948 0.06
949 0.08
950 0.09
951 0.11
952 0.11
953 0.12
954 0.14
955 0.15
956 0.17
957 0.2
958 0.27
959 0.35
960 0.44
961 0.51
962 0.57
963 0.59
964 0.6
965 0.6
966 0.61
967 0.58
968 0.54
969 0.53
970 0.48
971 0.54
972 0.58
973 0.6
974 0.56
975 0.51
976 0.54
977 0.57
978 0.59
979 0.54
980 0.52
981 0.51
982 0.57
983 0.59
984 0.53
985 0.51
986 0.56
987 0.57
988 0.57
989 0.54
990 0.45
991 0.44
992 0.45
993 0.43
994 0.35
995 0.31
996 0.26
997 0.26
998 0.26
999 0.25
1000 0.2
1001 0.17
1002 0.16
1003 0.15
1004 0.21
1005 0.19
1006 0.21
1007 0.2
1008 0.22
1009 0.21
1010 0.2
1011 0.21
1012 0.16
1013 0.15
1014 0.12
1015 0.12
1016 0.1
1017 0.11
1018 0.1
1019 0.09
1020 0.07
1021 0.09
1022 0.09
1023 0.09
1024 0.09
1025 0.08
1026 0.08
1027 0.09
1028 0.09
1029 0.07
1030 0.08
1031 0.08
1032 0.1
1033 0.11
1034 0.11
1035 0.1
1036 0.11
1037 0.11
1038 0.1
1039 0.16
1040 0.16
1041 0.15
1042 0.17
1043 0.19
1044 0.22
1045 0.26
1046 0.27
1047 0.22
1048 0.22
1049 0.23
1050 0.21
1051 0.2
1052 0.17
1053 0.14
1054 0.13
1055 0.13
1056 0.13
1057 0.16
1058 0.21
1059 0.22
1060 0.23
1061 0.25
1062 0.26
1063 0.26
1064 0.26
1065 0.23
1066 0.21
1067 0.21
1068 0.19
1069 0.18
1070 0.18
1071 0.18
1072 0.18
1073 0.18
1074 0.19
1075 0.21
1076 0.23
1077 0.22
1078 0.21
1079 0.21
1080 0.2
1081 0.19
1082 0.15
1083 0.12
1084 0.11
1085 0.14
1086 0.11
1087 0.12
1088 0.13
1089 0.16
1090 0.17
1091 0.19
1092 0.22
1093 0.2
1094 0.22
1095 0.23
1096 0.24
1097 0.25
1098 0.26
1099 0.31
1100 0.33
1101 0.35
1102 0.34
1103 0.34
1104 0.36
1105 0.36
1106 0.34
1107 0.28
1108 0.29
1109 0.29
1110 0.32
1111 0.31
1112 0.25
1113 0.22
1114 0.24
1115 0.28
1116 0.23
1117 0.21
1118 0.2
1119 0.2
1120 0.23
1121 0.22
1122 0.22
1123 0.17
1124 0.19
1125 0.17
1126 0.16
1127 0.16
1128 0.14
1129 0.12
1130 0.12
1131 0.12
1132 0.1
1133 0.12
1134 0.16
1135 0.17
1136 0.19
1137 0.21
1138 0.2
1139 0.2
1140 0.2
1141 0.18
1142 0.18
1143 0.21
1144 0.24
1145 0.26
1146 0.28
1147 0.28
1148 0.33
1149 0.42
1150 0.47
1151 0.51
1152 0.48
1153 0.5
1154 0.52
1155 0.56
1156 0.58
1157 0.59
1158 0.61
1159 0.62
1160 0.7
1161 0.74
1162 0.8