Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2VCH1

Protein Details
Accession M2VCH1    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-27APDDTKGKKRKSAPETIPKAKKAKKABasic
32-51ASEPKPTRKSARKQASDFMEHydrophilic
63-83ATEPVKPKKGKQSKAAAPAKVHydrophilic
118-139TETPKETTKKTKKTKVAADVPAHydrophilic
143-166ETTVVTKSKKTKGSKKQEAPEPEPHydrophilic
479-504VESAADKKTKKDKKRKSDVALETNTTHydrophilic
507-552EAVVKAPAKNKRAKKEKESKPETIVEEAEEKKAAAKPKKASKKAKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-43KGKKRKSAPETIPKAKKAKKADDVAASEPKPTRKSAR
68-77KPKKGKQSKA
101-106KKQAKK
423-432KAKKGKKGAK
485-494KKTKKDKKRK
512-552APAKNKRAKKEKESKPETIVEEAEEKKAAAKPKKASKKAKA
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAPDDTKGKKRKSAPETIPKAKKAKKADDVAASEPKPTRKSARKQASDFMELDEEKEVAPVVATEPVKPKKGKQSKAAAPAKVPEPTAEVPEVAEVQEKPKKQAKKTKAAAVEETTVTETPKETTKKTKKTKVAADVPAVVEETTVVTKSKKTKGSKKQEAPEPEPEVDAAELAAPSDDEDVAEDDQTAALLAGFSDDDSDDADEDVDFNEDEKIPRLSAKQRKAIKQAEDAPKSNQPGVIYVGRVPRGFYEPQMKKYFSQFGKVNQLRLSRNKKTGASKHYAFVEFQSQEVADIVARTMNNYLLFGHVLKVHLIPTDQVHPDLFKGAKQRFKVDPRNKKAGLEMERGAERSQWEKRVANENKRRDTKAKELKDIFDYEFEAPTLKTVDSVPAHTTIKKLKPSESKKLITDAPAEQTTVAEPKAKKGKKGAKAEAETPATEVVEPVKVASPAQAKKGKNATNAAVSEKPNDVAEEPAVVESAADKKTKKDKKRKSDVALETNTTVEEAVVKAPAKNKRAKKEKESKPETIVEEAEEKKAAAKPKKASKKAKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.81
3 0.85
4 0.87
5 0.86
6 0.83
7 0.85
8 0.81
9 0.79
10 0.78
11 0.79
12 0.77
13 0.77
14 0.76
15 0.75
16 0.72
17 0.69
18 0.67
19 0.58
20 0.53
21 0.5
22 0.49
23 0.43
24 0.44
25 0.48
26 0.5
27 0.61
28 0.67
29 0.73
30 0.76
31 0.79
32 0.82
33 0.78
34 0.73
35 0.63
36 0.55
37 0.5
38 0.4
39 0.36
40 0.29
41 0.22
42 0.17
43 0.16
44 0.14
45 0.08
46 0.08
47 0.07
48 0.07
49 0.13
50 0.13
51 0.16
52 0.25
53 0.3
54 0.37
55 0.39
56 0.45
57 0.5
58 0.6
59 0.65
60 0.65
61 0.71
62 0.73
63 0.81
64 0.82
65 0.73
66 0.66
67 0.62
68 0.57
69 0.49
70 0.41
71 0.31
72 0.29
73 0.27
74 0.28
75 0.24
76 0.2
77 0.18
78 0.18
79 0.18
80 0.12
81 0.14
82 0.11
83 0.17
84 0.22
85 0.24
86 0.29
87 0.36
88 0.44
89 0.5
90 0.61
91 0.64
92 0.69
93 0.75
94 0.77
95 0.78
96 0.74
97 0.69
98 0.61
99 0.55
100 0.44
101 0.38
102 0.32
103 0.24
104 0.2
105 0.16
106 0.13
107 0.12
108 0.19
109 0.21
110 0.23
111 0.34
112 0.44
113 0.54
114 0.64
115 0.72
116 0.74
117 0.79
118 0.84
119 0.83
120 0.82
121 0.76
122 0.69
123 0.62
124 0.54
125 0.45
126 0.36
127 0.26
128 0.17
129 0.12
130 0.09
131 0.07
132 0.07
133 0.08
134 0.08
135 0.13
136 0.2
137 0.28
138 0.35
139 0.44
140 0.54
141 0.64
142 0.74
143 0.81
144 0.83
145 0.84
146 0.84
147 0.83
148 0.78
149 0.75
150 0.68
151 0.58
152 0.49
153 0.41
154 0.33
155 0.25
156 0.19
157 0.11
158 0.06
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.04
163 0.04
164 0.05
165 0.05
166 0.04
167 0.05
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.05
176 0.04
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.06
198 0.07
199 0.08
200 0.09
201 0.1
202 0.1
203 0.11
204 0.15
205 0.24
206 0.32
207 0.38
208 0.45
209 0.51
210 0.57
211 0.64
212 0.66
213 0.61
214 0.58
215 0.61
216 0.62
217 0.59
218 0.55
219 0.49
220 0.47
221 0.45
222 0.39
223 0.31
224 0.22
225 0.19
226 0.2
227 0.18
228 0.15
229 0.16
230 0.18
231 0.18
232 0.18
233 0.17
234 0.15
235 0.18
236 0.18
237 0.18
238 0.25
239 0.27
240 0.33
241 0.37
242 0.37
243 0.35
244 0.38
245 0.43
246 0.33
247 0.37
248 0.32
249 0.32
250 0.42
251 0.42
252 0.4
253 0.36
254 0.4
255 0.38
256 0.44
257 0.49
258 0.43
259 0.47
260 0.49
261 0.49
262 0.52
263 0.56
264 0.53
265 0.51
266 0.47
267 0.44
268 0.43
269 0.39
270 0.32
271 0.26
272 0.25
273 0.18
274 0.17
275 0.15
276 0.12
277 0.12
278 0.11
279 0.1
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.05
284 0.05
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.07
289 0.08
290 0.08
291 0.07
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.09
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.09
304 0.13
305 0.12
306 0.13
307 0.12
308 0.12
309 0.12
310 0.15
311 0.13
312 0.11
313 0.19
314 0.23
315 0.28
316 0.3
317 0.35
318 0.39
319 0.48
320 0.57
321 0.6
322 0.66
323 0.68
324 0.75
325 0.71
326 0.64
327 0.59
328 0.57
329 0.52
330 0.45
331 0.39
332 0.32
333 0.32
334 0.33
335 0.29
336 0.22
337 0.18
338 0.19
339 0.22
340 0.24
341 0.27
342 0.29
343 0.32
344 0.42
345 0.48
346 0.54
347 0.59
348 0.63
349 0.68
350 0.71
351 0.73
352 0.68
353 0.66
354 0.66
355 0.67
356 0.64
357 0.64
358 0.62
359 0.59
360 0.57
361 0.53
362 0.43
363 0.34
364 0.31
365 0.23
366 0.2
367 0.17
368 0.15
369 0.11
370 0.11
371 0.12
372 0.09
373 0.09
374 0.09
375 0.14
376 0.14
377 0.17
378 0.17
379 0.2
380 0.21
381 0.21
382 0.24
383 0.27
384 0.32
385 0.37
386 0.37
387 0.42
388 0.51
389 0.58
390 0.65
391 0.66
392 0.64
393 0.59
394 0.61
395 0.55
396 0.47
397 0.43
398 0.35
399 0.31
400 0.28
401 0.26
402 0.22
403 0.2
404 0.18
405 0.16
406 0.15
407 0.16
408 0.16
409 0.23
410 0.33
411 0.36
412 0.39
413 0.48
414 0.56
415 0.6
416 0.7
417 0.71
418 0.7
419 0.72
420 0.7
421 0.67
422 0.59
423 0.5
424 0.41
425 0.33
426 0.24
427 0.19
428 0.16
429 0.11
430 0.1
431 0.1
432 0.1
433 0.11
434 0.11
435 0.11
436 0.16
437 0.23
438 0.24
439 0.32
440 0.39
441 0.37
442 0.45
443 0.54
444 0.55
445 0.53
446 0.55
447 0.51
448 0.5
449 0.51
450 0.48
451 0.44
452 0.39
453 0.36
454 0.32
455 0.3
456 0.24
457 0.24
458 0.2
459 0.17
460 0.16
461 0.14
462 0.13
463 0.12
464 0.12
465 0.1
466 0.09
467 0.08
468 0.12
469 0.14
470 0.16
471 0.17
472 0.24
473 0.35
474 0.46
475 0.55
476 0.62
477 0.7
478 0.79
479 0.89
480 0.92
481 0.9
482 0.91
483 0.89
484 0.88
485 0.82
486 0.74
487 0.63
488 0.53
489 0.45
490 0.34
491 0.24
492 0.15
493 0.11
494 0.08
495 0.08
496 0.12
497 0.12
498 0.15
499 0.22
500 0.3
501 0.37
502 0.46
503 0.54
504 0.61
505 0.71
506 0.78
507 0.82
508 0.85
509 0.88
510 0.9
511 0.89
512 0.85
513 0.8
514 0.77
515 0.7
516 0.63
517 0.53
518 0.44
519 0.43
520 0.38
521 0.33
522 0.27
523 0.24
524 0.24
525 0.27
526 0.34
527 0.37
528 0.43
529 0.51
530 0.61
531 0.72
532 0.79