Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A090CN91

Protein Details
Accession A0A090CN91    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
111-144LERIRKDEEKTRKNREKRNKKKQNKGKGGGNKGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
113-143RIRKDEEKTRKNREKRNKKKQNKGKGGGNKG
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 10, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009548  Prkrip1  
Gene Ontology GO:0003725  F:double-stranded RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06658  DUF1168  
Amino Acid Sequences MADAPPAKRLKTTTSAKTKHNLSPTSLQAATLSSLFANPDKPIPLPTGPQKKHLPPPPEIVTNVQGSSAGAGSGEFHVYKAARRREYERLRQMEEETAAEKAQREFEEERLERIRKDEEKTRKNREKRNKKKQNKGKGGGNKGGTPQPTTTAGGKEGDKKGDGGDKVAGNGTEKWDAKESTTPQPPAVPVAQGVGLVICDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.62
3 0.63
4 0.67
5 0.67
6 0.64
7 0.64
8 0.57
9 0.52
10 0.54
11 0.52
12 0.51
13 0.45
14 0.38
15 0.3
16 0.28
17 0.24
18 0.17
19 0.14
20 0.08
21 0.08
22 0.1
23 0.1
24 0.11
25 0.11
26 0.13
27 0.14
28 0.14
29 0.16
30 0.19
31 0.2
32 0.23
33 0.32
34 0.41
35 0.4
36 0.47
37 0.51
38 0.54
39 0.61
40 0.64
41 0.6
42 0.53
43 0.59
44 0.56
45 0.53
46 0.48
47 0.42
48 0.36
49 0.33
50 0.29
51 0.21
52 0.16
53 0.13
54 0.12
55 0.09
56 0.06
57 0.04
58 0.04
59 0.05
60 0.05
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.08
65 0.08
66 0.12
67 0.19
68 0.26
69 0.29
70 0.32
71 0.37
72 0.46
73 0.54
74 0.6
75 0.62
76 0.59
77 0.58
78 0.56
79 0.52
80 0.44
81 0.36
82 0.27
83 0.18
84 0.14
85 0.11
86 0.1
87 0.1
88 0.08
89 0.1
90 0.09
91 0.13
92 0.14
93 0.16
94 0.24
95 0.23
96 0.26
97 0.29
98 0.29
99 0.26
100 0.27
101 0.3
102 0.26
103 0.3
104 0.36
105 0.41
106 0.5
107 0.58
108 0.67
109 0.71
110 0.76
111 0.82
112 0.84
113 0.86
114 0.87
115 0.9
116 0.91
117 0.91
118 0.94
119 0.94
120 0.94
121 0.93
122 0.89
123 0.87
124 0.85
125 0.82
126 0.77
127 0.69
128 0.59
129 0.51
130 0.48
131 0.39
132 0.32
133 0.26
134 0.22
135 0.23
136 0.24
137 0.23
138 0.2
139 0.21
140 0.21
141 0.22
142 0.26
143 0.27
144 0.26
145 0.25
146 0.24
147 0.24
148 0.28
149 0.26
150 0.22
151 0.23
152 0.21
153 0.21
154 0.22
155 0.21
156 0.17
157 0.18
158 0.19
159 0.22
160 0.22
161 0.24
162 0.27
163 0.27
164 0.28
165 0.34
166 0.35
167 0.38
168 0.45
169 0.44
170 0.41
171 0.43
172 0.41
173 0.38
174 0.35
175 0.27
176 0.19
177 0.19
178 0.18
179 0.15
180 0.14
181 0.1
182 0.08