Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5ADV1

Protein Details
Accession Q5ADV1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
154-176PEEAEPKPKKSKKSSSKGTSAKHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
159-170PKPKKSKKSSSK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 13.5, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013915  Pre-mRNA_splic_Prp19  
IPR038959  Prp19  
IPR011044  Quino_amine_DH_bsu  
IPR003613  Ubox_domain  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000974  C:Prp19 complex  
GO:0071006  C:U2-type catalytic step 1 spliceosome  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0004842  F:ubiquitin-protein transferase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0070534  P:protein K63-linked ubiquitination  
KEGG cal:CAALFM_C307480WA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08606  Prp19  
PF04564  U-box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51698  U_BOX  
CDD cd16656  RING-Ubox_PRP19  
Amino Acid Sequences MICSISGEIATDPVVSPKSGAIFQRKHIVNYIATSGTDPITDEPLTESELISLKVNEKSTAIAQPSPPDPSNSSIPSLLSTFQNEWDAIVLEVFTLKKQLQSAKQELSIALYRQDAAVNVAAKAIRERDEAREALEKLSSSINLSDVPDTNTPPEEAEPKPKKSKKSSSKGTSAKHSNDKDSETIDSEQIENIVRARDELFRLHKSQKIKLPFDVDTFLKQKGVDIQSIFEGEKISNYVYNKEIDTIVGVSQDKVIKHSLVDGASTKLDLKNVKLVEINNNGVVAVSSGTKIMFSNYKTIELNCEAEQIICHPSLDFFVVLAAKKWFVISTDSIVASRNGVLSLGALHYDGEILATKNDDKIKLYSIVSGDELGTFTATHENIAKLEFATNGYWLLALSTGDNTSSIQIFDLRKGIEVQNLQFNEVATKKIGNIMFYSLHSFFKYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.12
3 0.13
4 0.14
5 0.16
6 0.2
7 0.25
8 0.32
9 0.35
10 0.38
11 0.48
12 0.48
13 0.48
14 0.49
15 0.47
16 0.4
17 0.39
18 0.39
19 0.3
20 0.28
21 0.27
22 0.23
23 0.19
24 0.16
25 0.14
26 0.12
27 0.15
28 0.14
29 0.14
30 0.15
31 0.15
32 0.17
33 0.16
34 0.15
35 0.13
36 0.14
37 0.15
38 0.14
39 0.15
40 0.16
41 0.21
42 0.22
43 0.21
44 0.2
45 0.21
46 0.23
47 0.27
48 0.27
49 0.25
50 0.26
51 0.29
52 0.31
53 0.34
54 0.32
55 0.3
56 0.3
57 0.3
58 0.35
59 0.33
60 0.33
61 0.28
62 0.27
63 0.25
64 0.24
65 0.21
66 0.17
67 0.19
68 0.17
69 0.18
70 0.2
71 0.18
72 0.17
73 0.16
74 0.15
75 0.11
76 0.1
77 0.08
78 0.06
79 0.07
80 0.08
81 0.07
82 0.09
83 0.09
84 0.12
85 0.15
86 0.22
87 0.29
88 0.37
89 0.43
90 0.44
91 0.45
92 0.44
93 0.4
94 0.37
95 0.33
96 0.25
97 0.2
98 0.17
99 0.16
100 0.15
101 0.15
102 0.12
103 0.11
104 0.13
105 0.12
106 0.11
107 0.13
108 0.12
109 0.12
110 0.14
111 0.14
112 0.13
113 0.16
114 0.18
115 0.22
116 0.26
117 0.26
118 0.27
119 0.3
120 0.29
121 0.27
122 0.26
123 0.21
124 0.17
125 0.18
126 0.16
127 0.11
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.15
135 0.15
136 0.15
137 0.16
138 0.16
139 0.15
140 0.14
141 0.15
142 0.16
143 0.16
144 0.26
145 0.31
146 0.36
147 0.47
148 0.51
149 0.57
150 0.63
151 0.72
152 0.72
153 0.76
154 0.8
155 0.77
156 0.82
157 0.81
158 0.75
159 0.72
160 0.69
161 0.64
162 0.62
163 0.57
164 0.52
165 0.47
166 0.46
167 0.39
168 0.33
169 0.29
170 0.23
171 0.22
172 0.18
173 0.16
174 0.14
175 0.13
176 0.12
177 0.11
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.07
182 0.07
183 0.09
184 0.1
185 0.11
186 0.15
187 0.19
188 0.21
189 0.26
190 0.28
191 0.3
192 0.32
193 0.37
194 0.39
195 0.42
196 0.42
197 0.4
198 0.42
199 0.39
200 0.37
201 0.34
202 0.28
203 0.24
204 0.23
205 0.21
206 0.17
207 0.16
208 0.14
209 0.18
210 0.19
211 0.17
212 0.16
213 0.16
214 0.16
215 0.17
216 0.16
217 0.1
218 0.09
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.09
224 0.09
225 0.11
226 0.12
227 0.13
228 0.13
229 0.13
230 0.13
231 0.1
232 0.1
233 0.09
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.07
238 0.1
239 0.12
240 0.11
241 0.13
242 0.14
243 0.12
244 0.12
245 0.13
246 0.14
247 0.11
248 0.13
249 0.12
250 0.12
251 0.11
252 0.12
253 0.11
254 0.1
255 0.12
256 0.13
257 0.13
258 0.18
259 0.18
260 0.19
261 0.2
262 0.21
263 0.24
264 0.27
265 0.27
266 0.21
267 0.21
268 0.19
269 0.17
270 0.16
271 0.09
272 0.06
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.06
278 0.06
279 0.07
280 0.11
281 0.12
282 0.18
283 0.18
284 0.21
285 0.22
286 0.22
287 0.25
288 0.24
289 0.25
290 0.19
291 0.2
292 0.17
293 0.16
294 0.16
295 0.13
296 0.13
297 0.1
298 0.1
299 0.09
300 0.09
301 0.1
302 0.11
303 0.09
304 0.07
305 0.08
306 0.09
307 0.09
308 0.11
309 0.11
310 0.1
311 0.1
312 0.1
313 0.09
314 0.09
315 0.13
316 0.13
317 0.15
318 0.17
319 0.18
320 0.17
321 0.18
322 0.17
323 0.14
324 0.13
325 0.1
326 0.08
327 0.08
328 0.07
329 0.06
330 0.07
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.05
338 0.05
339 0.06
340 0.06
341 0.07
342 0.09
343 0.09
344 0.14
345 0.17
346 0.18
347 0.19
348 0.21
349 0.24
350 0.27
351 0.27
352 0.26
353 0.24
354 0.24
355 0.22
356 0.2
357 0.17
358 0.13
359 0.13
360 0.1
361 0.09
362 0.07
363 0.07
364 0.11
365 0.11
366 0.12
367 0.14
368 0.15
369 0.15
370 0.16
371 0.15
372 0.12
373 0.13
374 0.12
375 0.12
376 0.12
377 0.12
378 0.12
379 0.11
380 0.11
381 0.09
382 0.09
383 0.08
384 0.07
385 0.07
386 0.08
387 0.09
388 0.09
389 0.1
390 0.1
391 0.11
392 0.11
393 0.11
394 0.1
395 0.15
396 0.17
397 0.19
398 0.22
399 0.21
400 0.22
401 0.25
402 0.26
403 0.28
404 0.31
405 0.31
406 0.36
407 0.36
408 0.36
409 0.33
410 0.31
411 0.31
412 0.27
413 0.26
414 0.19
415 0.2
416 0.19
417 0.25
418 0.26
419 0.22
420 0.23
421 0.25
422 0.25
423 0.26
424 0.31
425 0.26
426 0.27