Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2T858

Protein Details
Accession M2T858    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
323-369VIAVEKRRPGRPKGSKNKPRVKAIETVGPRPRGRPKGSKNKATLQAEHydrophilic
397-417GLVPRTLKRHCGRPKGSKTKRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
297-417AKVAKVAKVAKVAKVAKVSKATKVAKVIAVEKRRPGRPKGSKNKPRVKAIETVGPRPRGRPKGSKNKATLQAEKEAAYKPRGRPKGTTKHYAEKMPFPRGGLVPRTLKRHCGRPKGSKTKR
Subcellular Location(s) mito 21, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
IPR018828  RRG7  
IPR011856  tRNA_endonuc-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF10356  DUF2034  
Amino Acid Sequences MRPSLRPTWPTNSSQLAWLPRATPHRVPRRIATTSAHNAAPVDLPKMVVAPGSPHHNSLPTFLDYAKRINLSSDSTMFIGTHYEYTSALALMRLGFSLLRIGRTWDAGIDLIGHWVLAPLREPLPVIIQCKARKISVNPSHIRELEGSFRGIPPDWTKKDVLGLLVTTKKATRGVLEAVGHSHWPMGFVLISRQGLIQQFVWNRAACDRGLEGVGVTVRHTPRILLPDTEHETEQDESGTAKKRQAKFKNAGTRRDIQLTWMGSPIFPERKDLDRETLGLMQQIQADVKVDKVAKVAKVAKVAKVAKVAKVAKVSKATKVAKVIAVEKRRPGRPKGSKNKPRVKAIETVGPRPRGRPKGSKNKATLQAEKEAAYKPRGRPKGTTKHYAEKMPFPRGGLVPRTLKRHCGRPKGSKTKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.47
3 0.44
4 0.4
5 0.38
6 0.33
7 0.34
8 0.39
9 0.42
10 0.45
11 0.5
12 0.58
13 0.64
14 0.67
15 0.69
16 0.7
17 0.67
18 0.63
19 0.57
20 0.55
21 0.55
22 0.54
23 0.46
24 0.38
25 0.35
26 0.32
27 0.31
28 0.24
29 0.19
30 0.15
31 0.16
32 0.15
33 0.15
34 0.14
35 0.11
36 0.1
37 0.1
38 0.13
39 0.2
40 0.21
41 0.23
42 0.24
43 0.28
44 0.28
45 0.28
46 0.29
47 0.24
48 0.24
49 0.23
50 0.26
51 0.24
52 0.27
53 0.27
54 0.24
55 0.22
56 0.24
57 0.25
58 0.25
59 0.27
60 0.25
61 0.23
62 0.22
63 0.22
64 0.19
65 0.17
66 0.14
67 0.11
68 0.11
69 0.1
70 0.1
71 0.1
72 0.11
73 0.11
74 0.1
75 0.09
76 0.08
77 0.08
78 0.07
79 0.08
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.11
85 0.11
86 0.13
87 0.13
88 0.16
89 0.17
90 0.18
91 0.18
92 0.13
93 0.13
94 0.12
95 0.11
96 0.09
97 0.08
98 0.08
99 0.07
100 0.07
101 0.05
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.07
106 0.08
107 0.09
108 0.1
109 0.1
110 0.1
111 0.15
112 0.18
113 0.19
114 0.21
115 0.27
116 0.28
117 0.33
118 0.34
119 0.31
120 0.33
121 0.35
122 0.42
123 0.44
124 0.52
125 0.51
126 0.53
127 0.55
128 0.5
129 0.48
130 0.38
131 0.31
132 0.27
133 0.24
134 0.21
135 0.17
136 0.17
137 0.17
138 0.16
139 0.16
140 0.18
141 0.26
142 0.27
143 0.3
144 0.3
145 0.29
146 0.31
147 0.29
148 0.24
149 0.16
150 0.14
151 0.14
152 0.15
153 0.15
154 0.13
155 0.13
156 0.13
157 0.14
158 0.14
159 0.12
160 0.13
161 0.14
162 0.17
163 0.17
164 0.16
165 0.15
166 0.15
167 0.14
168 0.11
169 0.1
170 0.06
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.07
177 0.1
178 0.1
179 0.09
180 0.09
181 0.11
182 0.11
183 0.12
184 0.11
185 0.13
186 0.14
187 0.16
188 0.18
189 0.16
190 0.16
191 0.15
192 0.16
193 0.12
194 0.12
195 0.1
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.07
200 0.06
201 0.07
202 0.06
203 0.06
204 0.09
205 0.09
206 0.1
207 0.11
208 0.1
209 0.12
210 0.17
211 0.17
212 0.15
213 0.16
214 0.2
215 0.24
216 0.25
217 0.23
218 0.19
219 0.2
220 0.19
221 0.18
222 0.12
223 0.08
224 0.08
225 0.11
226 0.16
227 0.15
228 0.2
229 0.27
230 0.33
231 0.44
232 0.51
233 0.57
234 0.59
235 0.67
236 0.73
237 0.72
238 0.72
239 0.67
240 0.64
241 0.57
242 0.54
243 0.44
244 0.36
245 0.35
246 0.3
247 0.25
248 0.22
249 0.19
250 0.15
251 0.17
252 0.19
253 0.19
254 0.17
255 0.2
256 0.22
257 0.26
258 0.31
259 0.32
260 0.32
261 0.29
262 0.3
263 0.28
264 0.27
265 0.23
266 0.19
267 0.17
268 0.14
269 0.13
270 0.12
271 0.1
272 0.08
273 0.09
274 0.08
275 0.09
276 0.11
277 0.11
278 0.11
279 0.14
280 0.17
281 0.17
282 0.23
283 0.27
284 0.26
285 0.34
286 0.36
287 0.35
288 0.4
289 0.42
290 0.38
291 0.41
292 0.41
293 0.35
294 0.41
295 0.41
296 0.36
297 0.42
298 0.42
299 0.38
300 0.45
301 0.44
302 0.41
303 0.49
304 0.48
305 0.44
306 0.47
307 0.44
308 0.39
309 0.39
310 0.41
311 0.4
312 0.45
313 0.45
314 0.48
315 0.53
316 0.57
317 0.61
318 0.61
319 0.64
320 0.67
321 0.74
322 0.78
323 0.82
324 0.84
325 0.89
326 0.92
327 0.89
328 0.87
329 0.83
330 0.76
331 0.72
332 0.66
333 0.65
334 0.58
335 0.59
336 0.56
337 0.57
338 0.54
339 0.52
340 0.58
341 0.58
342 0.62
343 0.64
344 0.68
345 0.73
346 0.81
347 0.84
348 0.81
349 0.81
350 0.83
351 0.79
352 0.77
353 0.7
354 0.67
355 0.6
356 0.54
357 0.48
358 0.43
359 0.4
360 0.39
361 0.41
362 0.42
363 0.51
364 0.58
365 0.59
366 0.63
367 0.7
368 0.74
369 0.74
370 0.77
371 0.73
372 0.76
373 0.76
374 0.76
375 0.7
376 0.69
377 0.69
378 0.66
379 0.6
380 0.52
381 0.52
382 0.47
383 0.49
384 0.44
385 0.44
386 0.46
387 0.5
388 0.56
389 0.54
390 0.6
391 0.6
392 0.65
393 0.68
394 0.7
395 0.74
396 0.77
397 0.86