FuNGI

M2VA16

Protein Details

Accession

M2VA16

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
722-744	SSRLEKCFRTLQRREPNRNNLDS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 10.5, nucl 9.5, cyto 8.5, extr 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR014801 Mediator_Med5_fun
Gene Ontology	GO:0016592 C:mediator complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF08689 Med5

Amino Acid Sequences

MDSMVKEWSVLLDRCLERRVQSDVFAAAVAQLHAKSPLPGRKLAALLLRPRVADNSNIDPRIVIYLEQLLSLKKLDTSDVLIVALLYSKVRQPIKTEEKPSKDAQWSNPPELEELIFHRLHKVFAAEERPVNNVEGVHTLAVVARWMQAMVTSHTSDTMIQAMAGIQQPQQQSINVREGLAMLVVGVIENSKILRILNHPKAKEVRKELTKSLTSFIPFLSNNSAGSQTSLSLANRLEMSQKQHDLYEKLPNVNGEGNESAGLEVAALQLDAVMELPQANTRAGLYVFLNSLLVARPLTDDFVIISHLHTRYKLEPQNMATDLITAAFDILANAMYRNEPTQTLFYLKSFLINKIPTLLTQISGSIFPMTVEMCITQALSHVDPSAFPSFSQGFDDIMGSNNSLSDVRQDYLNACVLHGLLPAGTVERLLGEAPMQGPPAKRYERKELLNQCKSNFDKVSVYIDELENLDGNAGAIVAAVADFISHLCDTQTTMYLKQLCCLIFKKPQAMDVMLQFTSPASILRPLCQFLEDWHYDSDQGEYQPVYDEFGSILVLVMAFVYRYDLVYHDIGIAHDTFIAKLLQHGHHSIPPDELTEEQGRNLGSWLKGLYDSDKEGLSNEVFASCRPQDFYLIVPTLFHQTVVACSLGVLSFETVKGGLEYLGETFLMPSLIGGLTWMTSYALLQTHNDLDAITRIFNAILLSAPSSGDAQAMHSTIIAMVSSRLEKCFRTLQRREPNRNNLDSFLEAIKVHAHYERTVFATMKELDQWTNAPNSTLNTSLRHTVQQLSQWASTASMQPNPPSYTHRQLYASLKMLGAARTLRAIVDEVKTQTDGGNGAAALDVGVSIICAPTVEDSPISVDWVGSTVPAPTPQRTRMNLREMLKQDFDNAASLVATDPLTAETIVRLHRRVEAHFTSLAENGLQAPPINIPSVNMADMQSQSISEHLNRAMDDAAAASMVEDISNMDNKALQRSMDELASTEGLDLSGIGMGNGDAGSGDMSTDLGNLPDLDLGDMGGMGIDMDMSMDMGGGGGGDDDWGLDFDNM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.34
3	0.34
4	0.3
5	0.33
6	0.38
7	0.32
8	0.32
9	0.32
10	0.3
11	0.28
12	0.24
13	0.2
14	0.14
15	0.13
16	0.11
17	0.1
18	0.1
19	0.1
20	0.12
21	0.13
22	0.16
23	0.23
24	0.3
25	0.32
26	0.36
27	0.38
28	0.41
29	0.42
30	0.42
31	0.41
32	0.4
33	0.43
34	0.46
35	0.45
36	0.41
37	0.41
38	0.41
39	0.36
40	0.35
41	0.34
42	0.36
43	0.41
44	0.41
45	0.4
46	0.36
47	0.35
48	0.33
49	0.28
50	0.19
51	0.13
52	0.18
53	0.18
54	0.19
55	0.19
56	0.16
57	0.16
58	0.17
59	0.16
60	0.13
61	0.13
62	0.14
63	0.15
64	0.19
65	0.2
66	0.19
67	0.18
68	0.16
69	0.15
70	0.13
71	0.12
72	0.09
73	0.07
74	0.08
75	0.11
76	0.18
77	0.22
78	0.24
79	0.29
80	0.39
81	0.49
82	0.56
83	0.63
84	0.65
85	0.68
86	0.71
87	0.7
88	0.67
89	0.65
90	0.62
91	0.61
92	0.62
93	0.62
94	0.62
95	0.6
96	0.53
97	0.46
98	0.42
99	0.35
100	0.26
101	0.23
102	0.23
103	0.22
104	0.21
105	0.26
106	0.25
107	0.25
108	0.24
109	0.23
110	0.2
111	0.25
112	0.3
113	0.27
114	0.3
115	0.31
116	0.31
117	0.31
118	0.29
119	0.25
120	0.2
121	0.18
122	0.16
123	0.16
124	0.13
125	0.12
126	0.11
127	0.1
128	0.1
129	0.09
130	0.07
131	0.07
132	0.07
133	0.07
134	0.07
135	0.09
136	0.11
137	0.14
138	0.17
139	0.18
140	0.18
141	0.18
142	0.19
143	0.17
144	0.16
145	0.14
146	0.1
147	0.09
148	0.09
149	0.08
150	0.1
151	0.11
152	0.11
153	0.11
154	0.15
155	0.16
156	0.19
157	0.2
158	0.19
159	0.22
160	0.26
161	0.3
162	0.27
163	0.27
164	0.24
165	0.23
166	0.21
167	0.17
168	0.12
169	0.06
170	0.05
171	0.04
172	0.04
173	0.03
174	0.03
175	0.03
176	0.04
177	0.04
178	0.04
179	0.05
180	0.06
181	0.09
182	0.16
183	0.26
184	0.36
185	0.44
186	0.44
187	0.5
188	0.58
189	0.63
190	0.64
191	0.62
192	0.61
193	0.63
194	0.67
195	0.65
196	0.64
197	0.61
198	0.54
199	0.48
200	0.43
201	0.35
202	0.31
203	0.27
204	0.24
205	0.2
206	0.21
207	0.23
208	0.21
209	0.2
210	0.21
211	0.22
212	0.17
213	0.18
214	0.16
215	0.11
216	0.12
217	0.14
218	0.13
219	0.14
220	0.14
221	0.14
222	0.14
223	0.14
224	0.17
225	0.17
226	0.23
227	0.27
228	0.3
229	0.29
230	0.31
231	0.34
232	0.33
233	0.33
234	0.36
235	0.34
236	0.32
237	0.33
238	0.31
239	0.3
240	0.3
241	0.27
242	0.21
243	0.18
244	0.16
245	0.15
246	0.15
247	0.12
248	0.09
249	0.09
250	0.05
251	0.04
252	0.04
253	0.04
254	0.03
255	0.03
256	0.03
257	0.03
258	0.03
259	0.03
260	0.03
261	0.04
262	0.04
263	0.05
264	0.06
265	0.08
266	0.08
267	0.08
268	0.08
269	0.09
270	0.09
271	0.1
272	0.09
273	0.09
274	0.1
275	0.1
276	0.09
277	0.08
278	0.08
279	0.07
280	0.07
281	0.06
282	0.06
283	0.08
284	0.08
285	0.09
286	0.09
287	0.08
288	0.08
289	0.08
290	0.1
291	0.08
292	0.08
293	0.12
294	0.13
295	0.14
296	0.15
297	0.18
298	0.19
299	0.28
300	0.33
301	0.32
302	0.36
303	0.37
304	0.41
305	0.39
306	0.37
307	0.28
308	0.23
309	0.19
310	0.15
311	0.13
312	0.07
313	0.06
314	0.04
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.05
321	0.05
322	0.06
323	0.07
324	0.08
325	0.09
326	0.09
327	0.11
328	0.12
329	0.13
330	0.16
331	0.16
332	0.16
333	0.17
334	0.16
335	0.19
336	0.19
337	0.2
338	0.22
339	0.22
340	0.21
341	0.22
342	0.23
343	0.17
344	0.21
345	0.19
346	0.14
347	0.14
348	0.14
349	0.12
350	0.12
351	0.12
352	0.08
353	0.07
354	0.06
355	0.07
356	0.06
357	0.05
358	0.06
359	0.05
360	0.05
361	0.05
362	0.05
363	0.05
364	0.06
365	0.08
366	0.08
367	0.08
368	0.09
369	0.09
370	0.09
371	0.13
372	0.14
373	0.12
374	0.11
375	0.15
376	0.15
377	0.16
378	0.17
379	0.14
380	0.12
381	0.12
382	0.13
383	0.09
384	0.1
385	0.1
386	0.08
387	0.07
388	0.07
389	0.07
390	0.07
391	0.06
392	0.08
393	0.1
394	0.1
395	0.1
396	0.11
397	0.11
398	0.13
399	0.17
400	0.14
401	0.12
402	0.12
403	0.11
404	0.11
405	0.11
406	0.09
407	0.04
408	0.04
409	0.04
410	0.05
411	0.04
412	0.04
413	0.04
414	0.04
415	0.04
416	0.04
417	0.04
418	0.04
419	0.05
420	0.05
421	0.06
422	0.07
423	0.08
424	0.09
425	0.11
426	0.17
427	0.22
428	0.26
429	0.3
430	0.4
431	0.44
432	0.47
433	0.55
434	0.59
435	0.64
436	0.68
437	0.65
438	0.57
439	0.57
440	0.55
441	0.51
442	0.42
443	0.34
444	0.26
445	0.25
446	0.28
447	0.21
448	0.21
449	0.16
450	0.16
451	0.14
452	0.13
453	0.12
454	0.07
455	0.07
456	0.06
457	0.04
458	0.04
459	0.03
460	0.03
461	0.02
462	0.02
463	0.02
464	0.02
465	0.02
466	0.02
467	0.02
468	0.02
469	0.02
470	0.02
471	0.03
472	0.04
473	0.04
474	0.04
475	0.04
476	0.05
477	0.06
478	0.1
479	0.1
480	0.11
481	0.14
482	0.18
483	0.18
484	0.18
485	0.2
486	0.17
487	0.19
488	0.2
489	0.21
490	0.23
491	0.25
492	0.3
493	0.27
494	0.29
495	0.28
496	0.28
497	0.25
498	0.2
499	0.21
500	0.15
501	0.15
502	0.12
503	0.1
504	0.09
505	0.07
506	0.06
507	0.04
508	0.08
509	0.09
510	0.11
511	0.13
512	0.13
513	0.13
514	0.14
515	0.13
516	0.1
517	0.16
518	0.15
519	0.16
520	0.15
521	0.15
522	0.15
523	0.15
524	0.15
525	0.1
526	0.09
527	0.08
528	0.08
529	0.08
530	0.09
531	0.08
532	0.08
533	0.07
534	0.07
535	0.06
536	0.06
537	0.06
538	0.05
539	0.05
540	0.03
541	0.03
542	0.03
543	0.03
544	0.02
545	0.02
546	0.02
547	0.03
548	0.03
549	0.04
550	0.04
551	0.05
552	0.08
553	0.08
554	0.09
555	0.08
556	0.09
557	0.08
558	0.09
559	0.08
560	0.06
561	0.06
562	0.06
563	0.05
564	0.06
565	0.06
566	0.05
567	0.07
568	0.1
569	0.11
570	0.13
571	0.15
572	0.15
573	0.17
574	0.19
575	0.19
576	0.16
577	0.15
578	0.14
579	0.13
580	0.12
581	0.13
582	0.15
583	0.14
584	0.13
585	0.14
586	0.13
587	0.13
588	0.13
589	0.12
590	0.09
591	0.09
592	0.1
593	0.09
594	0.09
595	0.1
596	0.11
597	0.1
598	0.11
599	0.12
600	0.11
601	0.11
602	0.11
603	0.12
604	0.1
605	0.09
606	0.08
607	0.08
608	0.08
609	0.08
610	0.12
611	0.11
612	0.11
613	0.12
614	0.13
615	0.14
616	0.14
617	0.16
618	0.15
619	0.16
620	0.15
621	0.14
622	0.14
623	0.16
624	0.15
625	0.13
626	0.09
627	0.09
628	0.09
629	0.1
630	0.1
631	0.06
632	0.06
633	0.06
634	0.06
635	0.06
636	0.05
637	0.04
638	0.05
639	0.05
640	0.05
641	0.05
642	0.05
643	0.05
644	0.05
645	0.04
646	0.04
647	0.05
648	0.05
649	0.05
650	0.05
651	0.05
652	0.05
653	0.05
654	0.05
655	0.04
656	0.03
657	0.04
658	0.04
659	0.04
660	0.04
661	0.04
662	0.04
663	0.04
664	0.04
665	0.04
666	0.04
667	0.04
668	0.05
669	0.06
670	0.07
671	0.08
672	0.09
673	0.1
674	0.1
675	0.1
676	0.08
677	0.08
678	0.09
679	0.1
680	0.08
681	0.07
682	0.07
683	0.07
684	0.08
685	0.07
686	0.05
687	0.05
688	0.05
689	0.06
690	0.06
691	0.06
692	0.06
693	0.07
694	0.07
695	0.07
696	0.06
697	0.08
698	0.08
699	0.09
700	0.08
701	0.08
702	0.08
703	0.07
704	0.07
705	0.05
706	0.04
707	0.04
708	0.06
709	0.08
710	0.09
711	0.11
712	0.13
713	0.13
714	0.17
715	0.26
716	0.32
717	0.4
718	0.46
719	0.55
720	0.64
721	0.74
722	0.8
723	0.81
724	0.84
725	0.81
726	0.8
727	0.71
728	0.62
729	0.55
730	0.46
731	0.38
732	0.28
733	0.22
734	0.16
735	0.15
736	0.15
737	0.12
738	0.13
739	0.14
740	0.15
741	0.14
742	0.16
743	0.17
744	0.18
745	0.19
746	0.18
747	0.16
748	0.2
749	0.19
750	0.18
751	0.19
752	0.18
753	0.16
754	0.17
755	0.18
756	0.15
757	0.17
758	0.16
759	0.15
760	0.14
761	0.16
762	0.17
763	0.19
764	0.19
765	0.18
766	0.2
767	0.23
768	0.23
769	0.24
770	0.23
771	0.23
772	0.24
773	0.26
774	0.29
775	0.29
776	0.28
777	0.26
778	0.24
779	0.22
780	0.21
781	0.21
782	0.19
783	0.19
784	0.21
785	0.22
786	0.26
787	0.27
788	0.27
789	0.29
790	0.34
791	0.38
792	0.38
793	0.4
794	0.38
795	0.41
796	0.45
797	0.44
798	0.4
799	0.33
800	0.31
801	0.29
802	0.29
803	0.24
804	0.21
805	0.16
806	0.13
807	0.13
808	0.13
809	0.11
810	0.1
811	0.12
812	0.12
813	0.13
814	0.16
815	0.17
816	0.18
817	0.18
818	0.18
819	0.17
820	0.15
821	0.13
822	0.1
823	0.1
824	0.08
825	0.08
826	0.08
827	0.07
828	0.05
829	0.05
830	0.04
831	0.03
832	0.03
833	0.03
834	0.03
835	0.03
836	0.03
837	0.03
838	0.04
839	0.05
840	0.07
841	0.08
842	0.08
843	0.09
844	0.12
845	0.12
846	0.13
847	0.11
848	0.1
849	0.09
850	0.1
851	0.09
852	0.07
853	0.07
854	0.07
855	0.08
856	0.13
857	0.16
858	0.2
859	0.26
860	0.33
861	0.41
862	0.45
863	0.53
864	0.55
865	0.6
866	0.63
867	0.6
868	0.62
869	0.58
870	0.58
871	0.52
872	0.45
873	0.4
874	0.34
875	0.32
876	0.25
877	0.21
878	0.16
879	0.13
880	0.12
881	0.1
882	0.09
883	0.08
884	0.06
885	0.07
886	0.07
887	0.08
888	0.08
889	0.08
890	0.08
891	0.1
892	0.16
893	0.19
894	0.2
895	0.21
896	0.27
897	0.3
898	0.32
899	0.38
900	0.36
901	0.36
902	0.37
903	0.36
904	0.32
905	0.3
906	0.27
907	0.19
908	0.15
909	0.14
910	0.12
911	0.12
912	0.1
913	0.1
914	0.11
915	0.12
916	0.14
917	0.11
918	0.12
919	0.15
920	0.17
921	0.16
922	0.16
923	0.15
924	0.16
925	0.17
926	0.18
927	0.14
928	0.12
929	0.12
930	0.12
931	0.14
932	0.13
933	0.16
934	0.17
935	0.18
936	0.18
937	0.19
938	0.19
939	0.16
940	0.14
941	0.11
942	0.09
943	0.07
944	0.07
945	0.05
946	0.05
947	0.05
948	0.05
949	0.04
950	0.05
951	0.08
952	0.11
953	0.11
954	0.11
955	0.14
956	0.15
957	0.21
958	0.22
959	0.2
960	0.19
961	0.22
962	0.24
963	0.22
964	0.21
965	0.16
966	0.17
967	0.17
968	0.16
969	0.13
970	0.11
971	0.09
972	0.09
973	0.08
974	0.05
975	0.06
976	0.06
977	0.05
978	0.05
979	0.05
980	0.06
981	0.06
982	0.05
983	0.04
984	0.04
985	0.05
986	0.04
987	0.05
988	0.04
989	0.05
990	0.05
991	0.06
992	0.06
993	0.06
994	0.07
995	0.07
996	0.08
997	0.09
998	0.09
999	0.09
1000	0.08
1001	0.08
1002	0.07
1003	0.07
1004	0.06
1005	0.04
1006	0.04
1007	0.03
1008	0.03
1009	0.03
1010	0.03
1011	0.03
1012	0.03
1013	0.04
1014	0.04
1015	0.04
1016	0.03
1017	0.04
1018	0.04
1019	0.03
1020	0.03
1021	0.03
1022	0.03
1023	0.03
1024	0.03
1025	0.04
1026	0.04
1027	0.05

M2VA16

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer