FuNGI

M2SV19

Protein Details

Accession

M2SV19

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
24-55	QQPQAPQQQMPVRRRRPRPQADVLRKPRRPLQ	Hydrophilic
534-560	EASGNESSRKKHKKKHHDKLADGSRKS	Basic
574-598	SEMTDAGKKRKKEKKEKNRIMLGGS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
36-52	RRRRPRPQADVLRKPRR
181-182	RK
195-204	GMKKPPAFHK
517-557	KPGESKSKKRPGSPNLSEASGNESSRKKHKKKHHDKLADGS
580-593	GKKRKKEKKEKNRI

Subcellular Location(s)

nucl 21, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MNESQPPAAAPVAPVASNGQQPSQQPQAPQQQMPVRRRRPRPQADVLRKPRRPLQNITKPMVSLSQMNEARKPPPGPAADGTHSKDALRQEYVDQGATVFPLIVSRKDLKELRHHVMRLQSKSHVDITDEKQFTPPIKLHRRDPRAPPSGIGSHYEEEDTKEDLEEIKERERIEQQKEERRKVREENQAKIAPTGMKKPPAFHKKTEQKYRPDDTPEAKKRQLLRYEETLPWHLEDYENKQTWVGTYESELSETHVMLSATRPGDPNTAIQMAPMERWYRFNVKGKIKPTSDDVDKILAKVESGGPKFFAELERRQAQRMKAEDEARMFSGVRTRVGGGADDEGRIKRERFDDDTIGFVKREADADDIDFNLEEDFADDEEGLNGLFEGEEQDVKEAAEKLKRDQLQAALWDRPDEQLIAQKEEEERRAAEETRAMEKITRKTLAKREKQYDYLDSDPENPYLTESESDTDSEAERQQAKEEAEKKAAEQNGKAPEAGNVPSGASTKGSNTPSGNHKPGESKSKKRPGSPNLSEASGNESSRKKHKKKHHDKLADGSRKSTLGNLKGAGSGSDSEMTDAGKKRKKEKKEKNRIMLGGSPAGTPGASRAGSPAANGSRAGSPSVGPSKPSLPSAKEIYESLPPQGMNIQNLILKFKGRVDKSNTQVFIKLVKAVSRFDKAKSWLTPLEKLPSDEHINAFMNAANAPKPT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.16
3	0.18
4	0.22
5	0.23
6	0.22
7	0.24
8	0.26
9	0.32
10	0.37
11	0.36
12	0.35
13	0.42
14	0.51
15	0.53
16	0.53
17	0.54
18	0.54
19	0.61
20	0.68
21	0.7
22	0.7
23	0.74
24	0.83
25	0.85
26	0.88
27	0.89
28	0.89
29	0.89
30	0.9
31	0.91
32	0.92
33	0.92
34	0.92
35	0.85
36	0.82
37	0.8
38	0.79
39	0.75
40	0.74
41	0.74
42	0.74
43	0.78
44	0.77
45	0.71
46	0.61
47	0.55
48	0.48
49	0.39
50	0.32
51	0.26
52	0.31
53	0.33
54	0.35
55	0.38
56	0.38
57	0.38
58	0.41
59	0.39
60	0.33
61	0.36
62	0.37
63	0.37
64	0.39
65	0.42
66	0.4
67	0.45
68	0.45
69	0.41
70	0.39
71	0.34
72	0.34
73	0.32
74	0.33
75	0.29
76	0.27
77	0.25
78	0.3
79	0.31
80	0.28
81	0.23
82	0.19
83	0.16
84	0.15
85	0.13
86	0.08
87	0.06
88	0.09
89	0.11
90	0.12
91	0.17
92	0.21
93	0.22
94	0.3
95	0.34
96	0.35
97	0.44
98	0.5
99	0.53
100	0.56
101	0.55
102	0.52
103	0.58
104	0.61
105	0.55
106	0.51
107	0.49
108	0.44
109	0.47
110	0.47
111	0.38
112	0.33
113	0.36
114	0.37
115	0.41
116	0.39
117	0.36
118	0.34
119	0.36
120	0.34
121	0.33
122	0.32
123	0.32
124	0.42
125	0.46
126	0.54
127	0.62
128	0.69
129	0.71
130	0.77
131	0.77
132	0.74
133	0.7
134	0.61
135	0.56
136	0.52
137	0.46
138	0.4
139	0.34
140	0.27
141	0.27
142	0.26
143	0.21
144	0.2
145	0.2
146	0.18
147	0.14
148	0.14
149	0.13
150	0.14
151	0.15
152	0.17
153	0.17
154	0.2
155	0.23
156	0.23
157	0.26
158	0.33
159	0.39
160	0.41
161	0.48
162	0.52
163	0.59
164	0.68
165	0.73
166	0.73
167	0.71
168	0.71
169	0.7
170	0.71
171	0.72
172	0.69
173	0.66
174	0.67
175	0.65
176	0.59
177	0.51
178	0.44
179	0.37
180	0.33
181	0.34
182	0.3
183	0.34
184	0.34
185	0.38
186	0.46
187	0.53
188	0.56
189	0.54
190	0.6
191	0.62
192	0.72
193	0.79
194	0.76
195	0.74
196	0.78
197	0.78
198	0.72
199	0.68
200	0.64
201	0.6
202	0.63
203	0.62
204	0.61
205	0.58
206	0.58
207	0.58
208	0.6
209	0.61
210	0.56
211	0.53
212	0.52
213	0.54
214	0.52
215	0.48
216	0.43
217	0.35
218	0.3
219	0.26
220	0.2
221	0.17
222	0.18
223	0.22
224	0.28
225	0.27
226	0.27
227	0.26
228	0.26
229	0.25
230	0.24
231	0.18
232	0.09
233	0.1
234	0.12
235	0.12
236	0.13
237	0.13
238	0.12
239	0.12
240	0.12
241	0.1
242	0.1
243	0.1
244	0.09
245	0.1
246	0.12
247	0.12
248	0.13
249	0.14
250	0.13
251	0.16
252	0.16
253	0.17
254	0.15
255	0.16
256	0.15
257	0.14
258	0.14
259	0.13
260	0.12
261	0.13
262	0.12
263	0.11
264	0.14
265	0.17
266	0.21
267	0.27
268	0.35
269	0.41
270	0.47
271	0.53
272	0.55
273	0.59
274	0.54
275	0.5
276	0.46
277	0.43
278	0.37
279	0.32
280	0.29
281	0.27
282	0.26
283	0.24
284	0.21
285	0.16
286	0.13
287	0.12
288	0.14
289	0.15
290	0.16
291	0.16
292	0.15
293	0.16
294	0.16
295	0.15
296	0.16
297	0.15
298	0.17
299	0.23
300	0.28
301	0.29
302	0.31
303	0.35
304	0.34
305	0.36
306	0.36
307	0.33
308	0.32
309	0.33
310	0.33
311	0.31
312	0.29
313	0.23
314	0.21
315	0.18
316	0.13
317	0.16
318	0.14
319	0.13
320	0.12
321	0.12
322	0.13
323	0.13
324	0.13
325	0.09
326	0.1
327	0.1
328	0.09
329	0.1
330	0.09
331	0.11
332	0.12
333	0.11
334	0.12
335	0.15
336	0.19
337	0.22
338	0.26
339	0.27
340	0.26
341	0.27
342	0.26
343	0.24
344	0.2
345	0.15
346	0.12
347	0.09
348	0.1
349	0.08
350	0.09
351	0.08
352	0.09
353	0.09
354	0.09
355	0.08
356	0.07
357	0.07
358	0.05
359	0.05
360	0.04
361	0.04
362	0.04
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.04
369	0.04
370	0.03
371	0.03
372	0.03
373	0.02
374	0.02
375	0.04
376	0.04
377	0.05
378	0.05
379	0.06
380	0.06
381	0.06
382	0.08
383	0.08
384	0.1
385	0.14
386	0.14
387	0.16
388	0.23
389	0.25
390	0.25
391	0.25
392	0.26
393	0.24
394	0.28
395	0.28
396	0.23
397	0.22
398	0.22
399	0.2
400	0.18
401	0.16
402	0.12
403	0.09
404	0.14
405	0.15
406	0.17
407	0.16
408	0.17
409	0.19
410	0.21
411	0.22
412	0.18
413	0.16
414	0.16
415	0.19
416	0.18
417	0.16
418	0.17
419	0.18
420	0.2
421	0.2
422	0.18
423	0.19
424	0.23
425	0.27
426	0.29
427	0.3
428	0.29
429	0.35
430	0.45
431	0.52
432	0.56
433	0.6
434	0.62
435	0.63
436	0.66
437	0.63
438	0.58
439	0.53
440	0.46
441	0.39
442	0.33
443	0.31
444	0.27
445	0.24
446	0.21
447	0.15
448	0.14
449	0.13
450	0.13
451	0.11
452	0.1
453	0.11
454	0.11
455	0.11
456	0.1
457	0.1
458	0.1
459	0.11
460	0.11
461	0.14
462	0.15
463	0.15
464	0.16
465	0.2
466	0.21
467	0.26
468	0.3
469	0.3
470	0.31
471	0.31
472	0.31
473	0.33
474	0.35
475	0.3
476	0.27
477	0.3
478	0.31
479	0.32
480	0.31
481	0.25
482	0.23
483	0.23
484	0.23
485	0.18
486	0.12
487	0.11
488	0.12
489	0.13
490	0.11
491	0.1
492	0.09
493	0.11
494	0.17
495	0.18
496	0.2
497	0.21
498	0.24
499	0.32
500	0.38
501	0.4
502	0.35
503	0.35
504	0.38
505	0.41
506	0.48
507	0.48
508	0.5
509	0.57
510	0.66
511	0.69
512	0.72
513	0.77
514	0.76
515	0.78
516	0.74
517	0.7
518	0.62
519	0.6
520	0.51
521	0.42
522	0.39
523	0.31
524	0.26
525	0.24
526	0.25
527	0.28
528	0.38
529	0.49
530	0.51
531	0.57
532	0.68
533	0.74
534	0.83
535	0.9
536	0.91
537	0.9
538	0.87
539	0.88
540	0.88
541	0.85
542	0.75
543	0.66
544	0.56
545	0.47
546	0.42
547	0.37
548	0.33
549	0.28
550	0.31
551	0.3
552	0.28
553	0.29
554	0.29
555	0.23
556	0.18
557	0.14
558	0.13
559	0.13
560	0.12
561	0.11
562	0.12
563	0.12
564	0.16
565	0.21
566	0.28
567	0.32
568	0.38
569	0.48
570	0.57
571	0.67
572	0.73
573	0.79
574	0.82
575	0.87
576	0.93
577	0.92
578	0.92
579	0.84
580	0.77
581	0.7
582	0.63
583	0.55
584	0.45
585	0.35
586	0.26
587	0.23
588	0.19
589	0.13
590	0.11
591	0.11
592	0.11
593	0.11
594	0.12
595	0.15
596	0.16
597	0.16
598	0.21
599	0.19
600	0.2
601	0.2
602	0.2
603	0.21
604	0.21
605	0.22
606	0.17
607	0.15
608	0.2
609	0.27
610	0.25
611	0.24
612	0.26
613	0.28
614	0.3
615	0.34
616	0.33
617	0.3
618	0.35
619	0.38
620	0.38
621	0.36
622	0.35
623	0.32
624	0.34
625	0.32
626	0.29
627	0.27
628	0.24
629	0.23
630	0.28
631	0.29
632	0.23
633	0.23
634	0.23
635	0.22
636	0.23
637	0.25
638	0.2
639	0.19
640	0.19
641	0.24
642	0.31
643	0.33
644	0.41
645	0.47
646	0.55
647	0.59
648	0.67
649	0.63
650	0.56
651	0.55
652	0.49
653	0.44
654	0.36
655	0.35
656	0.28
657	0.3
658	0.3
659	0.32
660	0.36
661	0.4
662	0.4
663	0.39
664	0.44
665	0.44
666	0.5
667	0.49
668	0.5
669	0.49
670	0.52
671	0.55
672	0.52
673	0.56
674	0.5
675	0.49
676	0.45
677	0.44
678	0.45
679	0.42
680	0.39
681	0.36
682	0.35
683	0.33
684	0.31
685	0.26
686	0.2
687	0.18
688	0.19

M2SV19

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer