FuNGI

B2AZJ4

Protein Details

Accession

B2AZJ4

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
605-652	HTNLTREKQVKPPRRAPQRPAARRLRPRSRLLRSRRRSATRRWPDTRT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
19-54	PTFIRRKPNTDPLRARVKPRAKPLHALPPKGKEAKR
497-503	KKGKLKR
567-577	KKKFKMKAQRP
612-646	KQVKPPRRAPQRPAARRLRPRSRLLRSRRRSATRR

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	pan:PODANSg6285 -

Amino Acid Sequences

MSAPQQQPPGPPRPPGAAPTFIRRKPNTDPLRARVKPRAKPLHALPPKGKEAKRLVDSSGELDKEIEREYASKVEQLRQQRARNGGWSDQPAGSVQEFPLVLTKKAFREGIRHHVMRLHKQMGGAEVDIDLLNQDQFPRPVTLHRRDPRLPPAYRMAMKQDDVPMDPEQQAEMDRIQKMKADKEAQRALDQAQMAPVIKDNNPKPKTNNKKEKASAFYGKHSDAHKKQSGLRYEETLPWHLEDAEGKAGVWVGSYVAGLSDSNVVFVIDGARFRMIPLERWYKFDEKPRFDTLSLDDAEKLMYEVKEVKRWVMKDKEREERLREKLETRMFLNGPTRVKTESATSRAARGSERQDDYELDISGDEFQDDDETPGFEADDEDAKESKERVRKEQLASNLFGEGEEDKVEKEERERQLEKLKRKMIGKQTIKGLVKLEKAMDYDDMSESDSNNPFTDSSDSDDSDEEEKKEEEKKPEPVTSGSNTKGNTTPSKSAIANKKGKLKRAGSPEMSESSDIETARKKMKTGKGSSVPSRMGTPIPGRPKVMPGATSDGEATAGEGSDGGAMLKKKFKMKAQRPGGTPSGSRAGSPAPAGKLFPSAAVTPCHTNLTREKQVKPPRRAPQRPAARRLRPRSRLLRSRRRSATRRWPDTRTALRSCRSCRSSSTGLTSRGLLRGRSGSTWSRAFLTFIMRRSCSRRSRGGGLVRHCGLVFV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.52
2	0.5
3	0.48
4	0.47
5	0.46
6	0.51
7	0.57
8	0.56
9	0.63
10	0.6
11	0.61
12	0.62
13	0.69
14	0.69
15	0.7
16	0.73
17	0.71
18	0.78
19	0.76
20	0.75
21	0.75
22	0.75
23	0.72
24	0.75
25	0.79
26	0.73
27	0.76
28	0.76
29	0.77
30	0.74
31	0.74
32	0.7
33	0.67
34	0.71
35	0.72
36	0.66
37	0.64
38	0.65
39	0.66
40	0.66
41	0.6
42	0.54
43	0.5
44	0.5
45	0.45
46	0.42
47	0.33
48	0.27
49	0.26
50	0.24
51	0.21
52	0.21
53	0.18
54	0.13
55	0.14
56	0.17
57	0.2
58	0.2
59	0.23
60	0.24
61	0.3
62	0.35
63	0.42
64	0.5
65	0.54
66	0.6
67	0.62
68	0.66
69	0.63
70	0.64
71	0.6
72	0.54
73	0.52
74	0.49
75	0.46
76	0.4
77	0.37
78	0.31
79	0.28
80	0.24
81	0.2
82	0.15
83	0.16
84	0.15
85	0.15
86	0.21
87	0.2
88	0.2
89	0.22
90	0.26
91	0.25
92	0.3
93	0.34
94	0.29
95	0.36
96	0.42
97	0.48
98	0.53
99	0.51
100	0.47
101	0.5
102	0.54
103	0.54
104	0.55
105	0.49
106	0.42
107	0.42
108	0.42
109	0.39
110	0.35
111	0.26
112	0.18
113	0.14
114	0.13
115	0.12
116	0.1
117	0.08
118	0.06
119	0.06
120	0.06
121	0.08
122	0.1
123	0.11
124	0.14
125	0.16
126	0.16
127	0.25
128	0.34
129	0.4
130	0.48
131	0.54
132	0.59
133	0.61
134	0.67
135	0.68
136	0.68
137	0.62
138	0.56
139	0.57
140	0.57
141	0.55
142	0.51
143	0.47
144	0.42
145	0.41
146	0.39
147	0.36
148	0.3
149	0.29
150	0.3
151	0.25
152	0.24
153	0.23
154	0.2
155	0.17
156	0.15
157	0.15
158	0.13
159	0.13
160	0.15
161	0.17
162	0.18
163	0.18
164	0.21
165	0.23
166	0.26
167	0.31
168	0.35
169	0.38
170	0.46
171	0.51
172	0.5
173	0.49
174	0.46
175	0.39
176	0.35
177	0.3
178	0.22
179	0.17
180	0.16
181	0.15
182	0.13
183	0.14
184	0.12
185	0.14
186	0.22
187	0.27
188	0.36
189	0.39
190	0.42
191	0.47
192	0.55
193	0.64
194	0.68
195	0.73
196	0.7
197	0.76
198	0.79
199	0.8
200	0.74
201	0.7
202	0.68
203	0.59
204	0.57
205	0.51
206	0.47
207	0.44
208	0.41
209	0.44
210	0.4
211	0.46
212	0.45
213	0.44
214	0.48
215	0.51
216	0.55
217	0.51
218	0.48
219	0.43
220	0.41
221	0.42
222	0.39
223	0.34
224	0.28
225	0.24
226	0.22
227	0.18
228	0.16
229	0.13
230	0.12
231	0.11
232	0.1
233	0.09
234	0.09
235	0.09
236	0.08
237	0.07
238	0.05
239	0.04
240	0.04
241	0.04
242	0.04
243	0.04
244	0.04
245	0.04
246	0.05
247	0.07
248	0.06
249	0.07
250	0.07
251	0.07
252	0.06
253	0.06
254	0.07
255	0.06
256	0.06
257	0.07
258	0.07
259	0.07
260	0.07
261	0.12
262	0.12
263	0.15
264	0.21
265	0.3
266	0.3
267	0.34
268	0.38
269	0.37
270	0.4
271	0.46
272	0.49
273	0.45
274	0.49
275	0.51
276	0.5
277	0.45
278	0.44
279	0.37
280	0.33
281	0.28
282	0.23
283	0.18
284	0.15
285	0.15
286	0.13
287	0.1
288	0.07
289	0.06
290	0.07
291	0.13
292	0.14
293	0.19
294	0.19
295	0.22
296	0.24
297	0.26
298	0.32
299	0.36
300	0.41
301	0.45
302	0.52
303	0.58
304	0.6
305	0.63
306	0.62
307	0.6
308	0.59
309	0.55
310	0.51
311	0.43
312	0.45
313	0.44
314	0.4
315	0.32
316	0.31
317	0.26
318	0.27
319	0.28
320	0.25
321	0.23
322	0.23
323	0.23
324	0.2
325	0.2
326	0.18
327	0.2
328	0.21
329	0.23
330	0.26
331	0.24
332	0.25
333	0.26
334	0.26
335	0.22
336	0.21
337	0.22
338	0.24
339	0.25
340	0.24
341	0.25
342	0.24
343	0.25
344	0.23
345	0.18
346	0.12
347	0.1
348	0.09
349	0.09
350	0.08
351	0.06
352	0.04
353	0.04
354	0.05
355	0.05
356	0.06
357	0.05
358	0.06
359	0.06
360	0.06
361	0.06
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.06
366	0.07
367	0.08
368	0.08
369	0.09
370	0.1
371	0.1
372	0.15
373	0.19
374	0.21
375	0.26
376	0.35
377	0.4
378	0.42
379	0.47
380	0.48
381	0.46
382	0.45
383	0.38
384	0.3
385	0.24
386	0.21
387	0.17
388	0.1
389	0.07
390	0.06
391	0.06
392	0.06
393	0.07
394	0.08
395	0.08
396	0.11
397	0.19
398	0.22
399	0.3
400	0.31
401	0.33
402	0.42
403	0.49
404	0.53
405	0.54
406	0.54
407	0.52
408	0.53
409	0.58
410	0.58
411	0.61
412	0.59
413	0.54
414	0.54
415	0.57
416	0.55
417	0.49
418	0.42
419	0.36
420	0.32
421	0.29
422	0.26
423	0.19
424	0.19
425	0.18
426	0.16
427	0.13
428	0.12
429	0.11
430	0.11
431	0.11
432	0.1
433	0.1
434	0.13
435	0.14
436	0.13
437	0.13
438	0.13
439	0.12
440	0.13
441	0.15
442	0.13
443	0.16
444	0.17
445	0.17
446	0.18
447	0.18
448	0.18
449	0.18
450	0.19
451	0.15
452	0.14
453	0.14
454	0.16
455	0.22
456	0.26
457	0.3
458	0.33
459	0.4
460	0.43
461	0.45
462	0.45
463	0.41
464	0.4
465	0.37
466	0.37
467	0.31
468	0.3
469	0.28
470	0.28
471	0.28
472	0.28
473	0.3
474	0.3
475	0.31
476	0.3
477	0.33
478	0.32
479	0.37
480	0.43
481	0.47
482	0.49
483	0.5
484	0.58
485	0.59
486	0.64
487	0.65
488	0.61
489	0.58
490	0.59
491	0.63
492	0.56
493	0.55
494	0.51
495	0.45
496	0.42
497	0.35
498	0.27
499	0.21
500	0.2
501	0.18
502	0.16
503	0.17
504	0.19
505	0.26
506	0.26
507	0.26
508	0.32
509	0.4
510	0.48
511	0.51
512	0.57
513	0.58
514	0.64
515	0.67
516	0.64
517	0.57
518	0.49
519	0.44
520	0.37
521	0.29
522	0.27
523	0.26
524	0.27
525	0.33
526	0.35
527	0.35
528	0.35
529	0.38
530	0.38
531	0.36
532	0.3
533	0.26
534	0.3
535	0.27
536	0.27
537	0.24
538	0.19
539	0.17
540	0.15
541	0.13
542	0.06
543	0.06
544	0.05
545	0.05
546	0.04
547	0.04
548	0.04
549	0.04
550	0.07
551	0.08
552	0.11
553	0.17
554	0.21
555	0.27
556	0.33
557	0.41
558	0.49
559	0.58
560	0.66
561	0.72
562	0.75
563	0.72
564	0.73
565	0.69
566	0.61
567	0.51
568	0.44
569	0.4
570	0.33
571	0.3
572	0.25
573	0.22
574	0.21
575	0.22
576	0.22
577	0.18
578	0.19
579	0.2
580	0.19
581	0.2
582	0.19
583	0.18
584	0.17
585	0.16
586	0.17
587	0.19
588	0.21
589	0.21
590	0.23
591	0.27
592	0.25
593	0.27
594	0.34
595	0.4
596	0.47
597	0.5
598	0.53
599	0.58
600	0.68
601	0.75
602	0.75
603	0.76
604	0.77
605	0.82
606	0.87
607	0.85
608	0.85
609	0.86
610	0.85
611	0.85
612	0.86
613	0.85
614	0.86
615	0.89
616	0.89
617	0.86
618	0.87
619	0.87
620	0.87
621	0.87
622	0.87
623	0.88
624	0.85
625	0.88
626	0.88
627	0.88
628	0.84
629	0.85
630	0.85
631	0.85
632	0.87
633	0.83
634	0.79
635	0.76
636	0.79
637	0.78
638	0.75
639	0.72
640	0.69
641	0.69
642	0.71
643	0.7
644	0.7
645	0.65
646	0.6
647	0.56
648	0.57
649	0.57
650	0.54
651	0.57
652	0.54
653	0.53
654	0.52
655	0.49
656	0.44
657	0.43
658	0.4
659	0.32
660	0.29
661	0.31
662	0.32
663	0.31
664	0.34
665	0.34
666	0.38
667	0.4
668	0.37
669	0.35
670	0.33
671	0.33
672	0.29
673	0.33
674	0.31
675	0.35
676	0.4
677	0.39
678	0.43
679	0.48
680	0.56
681	0.56
682	0.59
683	0.63
684	0.63
685	0.68
686	0.72
687	0.74
688	0.73
689	0.7
690	0.71
691	0.62
692	0.57

B2AZJ4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer