FuNGI

B2B188

Protein Details

Accession

B2B188

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
252-296	LKKVKHQGTINKKTKKRSKQYEKAIEKIKKQEKKKHAPHPLNFSA	Hydrophilic
697-718	EGKSTTNKEKARKKNFLMTIGK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
258-288	QGTINKKTKKRSKQYEKAIEKIKKQEKKKHA
566-572	KKKARKT
669-749	RVALARDGKPGREEHKSTQAIRKSKKEAEGKSTTNKEKARKKNFLMTIGKARAKNKRSLVETKKALTNHIAKSKQGGRRRN

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto 9.5, mito_nucl 9.333, cyto_mito 6.833

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027312 Sda1 IPR007949 SDA1_C IPR012977 SDA1_N
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0015031 P:protein transport GO:0042273 P:ribosomal large subunit biogenesis GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus
KEGG	pan:PODANSg6815 -
Pfam	View protein in Pfam PF08158 NUC130_3NT PF05285 SDA1

Amino Acid Sequences

MPKRKVAALEKVEADLVSLQYKIRRDPRSYAQEFYDQWLAYDAQRQIFVSSPATASSEDVKKFHDLVDLVAHVANLYPEITAPFPDHLKELLNQHHAVLDKELREKIVGSLVLLKRKDVIDSTSLLTTLFPILINTPSKTLRSLLYTKIISDLREANNKTTNHKLNRTIQTVLHNLVTSDRTSTKGMWACRITRELWRRQVWNDARPVDVMKEACLSDNEKVVVGGVRFFLGGDKEREEALEDDASDDDVDLKKVKHQGTINKKTKKRSKQYEKAIEKIKKQEKKKHAPHPLNFSALHLIHDPQGFAEKLFQKHLQNTKNKFSLENKLLVLQLVTRLVGLHKLTIISLYSWFVKYLSPKQANVTSFLASLAQATHNLVPPDVIEPLIVKIANEFVSEASAVEVCAAGINSIREVAMRQPLCMNETLLQDLVMYQKSKDKGVVMAAKGLQSLYREVYPELLQKKFRGKQATMGLRSGEIKLRRFGEEEEGGIEGLELLARYKEEQKKKKAAEEAEEDENGEKKAKKDDDEEDDGFNSDEWEIGSTDSESSGGWIDVSSDEEDDGPAKKKARKTKGGDDDDGDEAPDLVEKEDPAAEAERITKLATTTILTPADLAKLQELRREAKLDKMLGTTQSKRKKELIEKHIEDGVTAEDIELPAMLGKKSTKEERVALARDGKPGREEHKSTQAIRKSKKEAEGKSTTNKEKARKKNFLMTIGKARAKNKRSLVETKKALTNHIAKSKQGGRRRNGV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.23
3	0.19
4	0.14
5	0.13
6	0.14
7	0.19
8	0.22
9	0.29
10	0.37
11	0.43
12	0.48
13	0.54
14	0.63
15	0.69
16	0.7
17	0.65
18	0.6
19	0.59
20	0.54
21	0.52
22	0.47
23	0.36
24	0.33
25	0.31
26	0.28
27	0.23
28	0.29
29	0.27
30	0.23
31	0.25
32	0.25
33	0.24
34	0.25
35	0.26
36	0.21
37	0.2
38	0.18
39	0.17
40	0.19
41	0.18
42	0.17
43	0.21
44	0.25
45	0.26
46	0.27
47	0.28
48	0.3
49	0.31
50	0.3
51	0.29
52	0.23
53	0.22
54	0.26
55	0.24
56	0.21
57	0.2
58	0.19
59	0.13
60	0.13
61	0.11
62	0.07
63	0.07
64	0.06
65	0.06
66	0.08
67	0.09
68	0.1
69	0.12
70	0.14
71	0.15
72	0.16
73	0.17
74	0.17
75	0.19
76	0.21
77	0.25
78	0.3
79	0.34
80	0.34
81	0.32
82	0.34
83	0.33
84	0.3
85	0.29
86	0.26
87	0.24
88	0.29
89	0.29
90	0.27
91	0.27
92	0.26
93	0.23
94	0.23
95	0.2
96	0.16
97	0.24
98	0.26
99	0.33
100	0.32
101	0.31
102	0.29
103	0.3
104	0.31
105	0.24
106	0.24
107	0.2
108	0.22
109	0.24
110	0.21
111	0.21
112	0.18
113	0.16
114	0.13
115	0.11
116	0.09
117	0.07
118	0.07
119	0.09
120	0.13
121	0.16
122	0.16
123	0.19
124	0.2
125	0.21
126	0.22
127	0.23
128	0.21
129	0.24
130	0.27
131	0.27
132	0.32
133	0.31
134	0.3
135	0.34
136	0.33
137	0.27
138	0.27
139	0.29
140	0.27
141	0.35
142	0.36
143	0.35
144	0.41
145	0.42
146	0.43
147	0.46
148	0.51
149	0.5
150	0.55
151	0.59
152	0.61
153	0.68
154	0.67
155	0.6
156	0.54
157	0.52
158	0.49
159	0.43
160	0.35
161	0.27
162	0.23
163	0.22
164	0.21
165	0.16
166	0.16
167	0.15
168	0.16
169	0.18
170	0.18
171	0.23
172	0.27
173	0.28
174	0.32
175	0.35
176	0.34
177	0.36
178	0.38
179	0.33
180	0.38
181	0.44
182	0.46
183	0.51
184	0.54
185	0.54
186	0.53
187	0.62
188	0.59
189	0.57
190	0.56
191	0.48
192	0.44
193	0.41
194	0.4
195	0.31
196	0.28
197	0.22
198	0.15
199	0.16
200	0.15
201	0.15
202	0.15
203	0.17
204	0.14
205	0.17
206	0.16
207	0.14
208	0.13
209	0.13
210	0.14
211	0.11
212	0.11
213	0.08
214	0.08
215	0.08
216	0.08
217	0.09
218	0.09
219	0.11
220	0.13
221	0.14
222	0.15
223	0.15
224	0.15
225	0.16
226	0.15
227	0.14
228	0.13
229	0.11
230	0.11
231	0.11
232	0.11
233	0.09
234	0.08
235	0.07
236	0.07
237	0.08
238	0.09
239	0.09
240	0.13
241	0.2
242	0.21
243	0.25
244	0.3
245	0.39
246	0.48
247	0.59
248	0.65
249	0.67
250	0.71
251	0.75
252	0.81
253	0.82
254	0.81
255	0.82
256	0.83
257	0.84
258	0.9
259	0.91
260	0.86
261	0.82
262	0.81
263	0.75
264	0.69
265	0.69
266	0.68
267	0.65
268	0.68
269	0.72
270	0.73
271	0.78
272	0.83
273	0.83
274	0.85
275	0.86
276	0.83
277	0.82
278	0.74
279	0.67
280	0.57
281	0.48
282	0.41
283	0.31
284	0.27
285	0.19
286	0.16
287	0.15
288	0.16
289	0.14
290	0.1
291	0.13
292	0.11
293	0.11
294	0.15
295	0.17
296	0.18
297	0.22
298	0.26
299	0.26
300	0.32
301	0.4
302	0.43
303	0.48
304	0.52
305	0.55
306	0.56
307	0.53
308	0.5
309	0.46
310	0.47
311	0.4
312	0.38
313	0.32
314	0.29
315	0.28
316	0.25
317	0.2
318	0.12
319	0.1
320	0.07
321	0.07
322	0.05
323	0.06
324	0.06
325	0.08
326	0.08
327	0.07
328	0.07
329	0.07
330	0.07
331	0.08
332	0.08
333	0.06
334	0.06
335	0.07
336	0.08
337	0.08
338	0.08
339	0.08
340	0.09
341	0.13
342	0.18
343	0.26
344	0.28
345	0.28
346	0.31
347	0.36
348	0.35
349	0.35
350	0.3
351	0.21
352	0.19
353	0.18
354	0.16
355	0.1
356	0.1
357	0.07
358	0.06
359	0.05
360	0.06
361	0.07
362	0.09
363	0.09
364	0.09
365	0.08
366	0.08
367	0.09
368	0.08
369	0.07
370	0.05
371	0.05
372	0.06
373	0.07
374	0.06
375	0.05
376	0.05
377	0.06
378	0.07
379	0.07
380	0.06
381	0.05
382	0.06
383	0.06
384	0.06
385	0.05
386	0.04
387	0.04
388	0.04
389	0.04
390	0.03
391	0.03
392	0.03
393	0.03
394	0.04
395	0.04
396	0.04
397	0.04
398	0.04
399	0.04
400	0.05
401	0.07
402	0.13
403	0.14
404	0.14
405	0.15
406	0.16
407	0.18
408	0.18
409	0.17
410	0.13
411	0.13
412	0.14
413	0.12
414	0.12
415	0.1
416	0.1
417	0.1
418	0.09
419	0.09
420	0.08
421	0.13
422	0.14
423	0.15
424	0.16
425	0.15
426	0.15
427	0.2
428	0.24
429	0.2
430	0.22
431	0.22
432	0.21
433	0.2
434	0.18
435	0.14
436	0.1
437	0.11
438	0.1
439	0.1
440	0.1
441	0.11
442	0.13
443	0.13
444	0.18
445	0.2
446	0.22
447	0.23
448	0.26
449	0.35
450	0.37
451	0.41
452	0.43
453	0.4
454	0.44
455	0.52
456	0.57
457	0.51
458	0.47
459	0.42
460	0.36
461	0.36
462	0.29
463	0.25
464	0.21
465	0.21
466	0.24
467	0.26
468	0.26
469	0.26
470	0.27
471	0.27
472	0.24
473	0.22
474	0.19
475	0.17
476	0.15
477	0.14
478	0.12
479	0.06
480	0.04
481	0.04
482	0.03
483	0.03
484	0.04
485	0.04
486	0.06
487	0.15
488	0.23
489	0.33
490	0.43
491	0.51
492	0.6
493	0.64
494	0.69
495	0.68
496	0.64
497	0.6
498	0.57
499	0.53
500	0.46
501	0.43
502	0.36
503	0.3
504	0.27
505	0.21
506	0.18
507	0.16
508	0.14
509	0.23
510	0.26
511	0.28
512	0.32
513	0.37
514	0.41
515	0.46
516	0.46
517	0.39
518	0.36
519	0.33
520	0.28
521	0.22
522	0.15
523	0.08
524	0.07
525	0.06
526	0.07
527	0.07
528	0.07
529	0.08
530	0.07
531	0.08
532	0.07
533	0.08
534	0.06
535	0.06
536	0.07
537	0.06
538	0.06
539	0.05
540	0.06
541	0.06
542	0.09
543	0.08
544	0.08
545	0.08
546	0.08
547	0.09
548	0.09
549	0.11
550	0.12
551	0.15
552	0.21
553	0.26
554	0.33
555	0.44
556	0.53
557	0.6
558	0.65
559	0.73
560	0.78
561	0.79
562	0.75
563	0.66
564	0.6
565	0.51
566	0.43
567	0.32
568	0.22
569	0.15
570	0.12
571	0.11
572	0.08
573	0.07
574	0.08
575	0.07
576	0.09
577	0.09
578	0.09
579	0.1
580	0.11
581	0.11
582	0.11
583	0.13
584	0.13
585	0.13
586	0.13
587	0.12
588	0.11
589	0.12
590	0.12
591	0.11
592	0.12
593	0.16
594	0.16
595	0.15
596	0.15
597	0.14
598	0.15
599	0.15
600	0.14
601	0.13
602	0.18
603	0.19
604	0.23
605	0.26
606	0.28
607	0.31
608	0.35
609	0.33
610	0.35
611	0.4
612	0.38
613	0.37
614	0.36
615	0.35
616	0.35
617	0.41
618	0.41
619	0.44
620	0.51
621	0.52
622	0.54
623	0.58
624	0.62
625	0.66
626	0.69
627	0.7
628	0.71
629	0.71
630	0.7
631	0.67
632	0.57
633	0.46
634	0.37
635	0.28
636	0.17
637	0.14
638	0.11
639	0.08
640	0.08
641	0.08
642	0.07
643	0.05
644	0.07
645	0.08
646	0.08
647	0.1
648	0.12
649	0.16
650	0.23
651	0.3
652	0.34
653	0.38
654	0.42
655	0.47
656	0.53
657	0.52
658	0.51
659	0.52
660	0.49
661	0.51
662	0.5
663	0.45
664	0.4
665	0.42
666	0.42
667	0.42
668	0.46
669	0.44
670	0.52
671	0.56
672	0.58
673	0.62
674	0.66
675	0.66
676	0.69
677	0.71
678	0.69
679	0.71
680	0.75
681	0.75
682	0.73
683	0.73
684	0.73
685	0.7
686	0.71
687	0.73
688	0.7
689	0.69
690	0.69
691	0.7
692	0.72
693	0.77
694	0.79
695	0.8
696	0.8
697	0.81
698	0.81
699	0.81
700	0.77
701	0.73
702	0.72
703	0.71
704	0.7
705	0.65
706	0.66
707	0.66
708	0.65
709	0.67
710	0.66
711	0.66
712	0.68
713	0.73
714	0.75
715	0.75
716	0.76
717	0.71
718	0.69
719	0.61
720	0.58
721	0.56
722	0.55
723	0.53
724	0.56
725	0.54
726	0.49
727	0.57
728	0.62
729	0.62
730	0.63
731	0.65

B2B188

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer