FuNGI

M2U5L6

Protein Details

Accession

M2U5L6

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
78-99	RGGRGGSKGNSRNKKQNQEFDN	Hydrophilic
317-340	WELTEKEKYEKRKKQREANGNFSS	Hydrophilic
363-414	RGGSDRRDNRRDRSPRRRRDRSASNDSVDSDDWNKRRDRFKNGKDDRANSKE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
68-92	GRNSRDNRGGRGGRGGSKGNSRNKK
325-383	YEKRKKQREANGNFSSSRGNDRRGGGRGRGSNRGGRGGRGGSDRRDNRRDRSPRRRRDR

Subcellular Location(s)

nucl 22, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045180 La_dom_prot IPR006630 La_HTH IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
Pfam	View protein in Pfam PF05383 La PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50961 HTH_LA PS50102 RRM
CDD	cd12291 RRM1_La

Amino Acid Sequences

MADTEVAAAAASNPAEASQAEKALQVESDSKTETKPDTNAAEGEEKWELNGKSGEKSAHHNDREDRNGRNSRDNRGGRGGRGGSKGNSRNKKQNQEFDNLPESDDPAEIRAQIEFYFSAQNLATDEHMFKELEGPKNKPVSIHHICTFKRMRRFKPYSAVVEALRHSSDLVVVDDGEYSKPGSEAVKRKEPLAVPAKEGDDEKPPTTEELFYRLRSSSSNSMETSAYVKGFGDAEEAGQIALEQFFRPFGSVMVRKRRDDEGVWKGSVFVEFDSKDSQQQFLALDPKPKFNGNELTTMGKKEYIMMKCEEKGIKPDWELTEKEKYEKRKKQREANGNFSSSRGNDRRGGGRGRGSNRGGRGGRGGSDRRDNRRDRSPRRRRDRSASNDSVDSDDWNKRRDRFKNGKDDRANSKEEKKEIERDAHGVPVVKDSRTEAEIAAASNKRKAEDDQSGSPKKTKLEIKQDE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.07
2	0.08
3	0.08
4	0.12
5	0.12
6	0.15
7	0.15
8	0.17
9	0.17
10	0.17
11	0.18
12	0.16
13	0.18
14	0.19
15	0.21
16	0.22
17	0.22
18	0.22
19	0.27
20	0.28
21	0.28
22	0.28
23	0.32
24	0.32
25	0.34
26	0.33
27	0.32
28	0.32
29	0.28
30	0.29
31	0.25
32	0.22
33	0.2
34	0.25
35	0.22
36	0.22
37	0.27
38	0.25
39	0.26
40	0.29
41	0.32
42	0.27
43	0.35
44	0.4
45	0.45
46	0.47
47	0.49
48	0.54
49	0.59
50	0.66
51	0.63
52	0.59
53	0.58
54	0.64
55	0.62
56	0.66
57	0.62
58	0.6
59	0.66
60	0.65
61	0.6
62	0.61
63	0.61
64	0.52
65	0.55
66	0.51
67	0.46
68	0.46
69	0.44
70	0.38
71	0.43
72	0.5
73	0.52
74	0.58
75	0.6
76	0.67
77	0.73
78	0.8
79	0.8
80	0.81
81	0.76
82	0.73
83	0.69
84	0.64
85	0.61
86	0.5
87	0.42
88	0.33
89	0.3
90	0.24
91	0.21
92	0.16
93	0.11
94	0.11
95	0.1
96	0.1
97	0.09
98	0.09
99	0.09
100	0.11
101	0.09
102	0.1
103	0.12
104	0.12
105	0.13
106	0.12
107	0.12
108	0.12
109	0.12
110	0.12
111	0.11
112	0.12
113	0.11
114	0.13
115	0.12
116	0.11
117	0.18
118	0.23
119	0.29
120	0.33
121	0.35
122	0.39
123	0.44
124	0.44
125	0.39
126	0.36
127	0.38
128	0.39
129	0.41
130	0.4
131	0.43
132	0.43
133	0.49
134	0.54
135	0.51
136	0.54
137	0.58
138	0.6
139	0.64
140	0.71
141	0.69
142	0.7
143	0.69
144	0.65
145	0.59
146	0.54
147	0.44
148	0.4
149	0.35
150	0.27
151	0.21
152	0.16
153	0.13
154	0.1
155	0.1
156	0.09
157	0.08
158	0.07
159	0.07
160	0.07
161	0.07
162	0.07
163	0.07
164	0.06
165	0.05
166	0.05
167	0.05
168	0.06
169	0.08
170	0.14
171	0.23
172	0.28
173	0.36
174	0.37
175	0.37
176	0.41
177	0.39
178	0.4
179	0.41
180	0.37
181	0.3
182	0.32
183	0.32
184	0.28
185	0.28
186	0.22
187	0.19
188	0.2
189	0.19
190	0.18
191	0.17
192	0.18
193	0.18
194	0.18
195	0.13
196	0.17
197	0.18
198	0.18
199	0.19
200	0.19
201	0.18
202	0.17
203	0.21
204	0.22
205	0.23
206	0.25
207	0.23
208	0.25
209	0.24
210	0.24
211	0.21
212	0.15
213	0.12
214	0.09
215	0.09
216	0.08
217	0.08
218	0.07
219	0.06
220	0.05
221	0.05
222	0.05
223	0.05
224	0.05
225	0.04
226	0.04
227	0.03
228	0.04
229	0.04
230	0.04
231	0.04
232	0.05
233	0.05
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.11
238	0.17
239	0.23
240	0.33
241	0.37
242	0.37
243	0.4
244	0.42
245	0.4
246	0.37
247	0.39
248	0.37
249	0.37
250	0.36
251	0.33
252	0.31
253	0.28
254	0.26
255	0.17
256	0.1
257	0.09
258	0.1
259	0.11
260	0.13
261	0.13
262	0.17
263	0.17
264	0.17
265	0.14
266	0.15
267	0.14
268	0.14
269	0.19
270	0.16
271	0.23
272	0.23
273	0.26
274	0.26
275	0.28
276	0.27
277	0.26
278	0.33
279	0.28
280	0.31
281	0.3
282	0.32
283	0.31
284	0.3
285	0.27
286	0.19
287	0.17
288	0.16
289	0.22
290	0.2
291	0.22
292	0.24
293	0.27
294	0.26
295	0.31
296	0.3
297	0.24
298	0.26
299	0.27
300	0.28
301	0.26
302	0.3
303	0.28
304	0.3
305	0.31
306	0.3
307	0.35
308	0.33
309	0.37
310	0.38
311	0.45
312	0.52
313	0.6
314	0.67
315	0.69
316	0.77
317	0.82
318	0.87
319	0.88
320	0.85
321	0.85
322	0.8
323	0.72
324	0.63
325	0.54
326	0.46
327	0.37
328	0.37
329	0.31
330	0.3
331	0.31
332	0.34
333	0.38
334	0.41
335	0.44
336	0.4
337	0.43
338	0.47
339	0.46
340	0.5
341	0.48
342	0.48
343	0.46
344	0.5
345	0.44
346	0.38
347	0.38
348	0.32
349	0.32
350	0.34
351	0.36
352	0.32
353	0.41
354	0.47
355	0.52
356	0.6
357	0.62
358	0.62
359	0.69
360	0.75
361	0.76
362	0.8
363	0.82
364	0.84
365	0.89
366	0.93
367	0.91
368	0.9
369	0.9
370	0.88
371	0.88
372	0.84
373	0.76
374	0.67
375	0.6
376	0.53
377	0.42
378	0.35
379	0.3
380	0.31
381	0.3
382	0.33
383	0.37
384	0.41
385	0.5
386	0.55
387	0.61
388	0.65
389	0.71
390	0.78
391	0.81
392	0.85
393	0.83
394	0.83
395	0.81
396	0.76
397	0.73
398	0.68
399	0.69
400	0.65
401	0.61
402	0.62
403	0.58
404	0.6
405	0.6
406	0.61
407	0.54
408	0.51
409	0.48
410	0.44
411	0.4
412	0.34
413	0.29
414	0.3
415	0.3
416	0.26
417	0.26
418	0.26
419	0.28
420	0.26
421	0.27
422	0.19
423	0.2
424	0.2
425	0.2
426	0.24
427	0.25
428	0.25
429	0.29
430	0.3
431	0.29
432	0.31
433	0.34
434	0.36
435	0.41
436	0.46
437	0.51
438	0.59
439	0.64
440	0.64
441	0.65
442	0.6
443	0.53
444	0.55
445	0.55
446	0.55

M2U5L6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer