Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0JRI2

Protein Details
Accession R0JRI2    Localization Confidence High Confidence Score 20.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
100-122EPAPPAKSTKRGRPAKKAQEEETHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-77GRKARGSAAQSKSSAAATKAPAKGRPVARRTSGTSAVVMKKKAAGAKKASAKGGRK
106-117KSTKRGRPAKKA
128-162APPPAKRGRKPAAKEAVEKKETKAKPTAKSRGTKR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040349  Csm1/Pcs1  
IPR020981  Csm1/Pcs1_C  
IPR038608  Csm1/Pcs1_C_sf  
Gene Ontology GO:0033551  C:monopolin complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF12539  Csm1  
Amino Acid Sequences MTLDELNALPTPESNGDSKAQGRKARGSAAQSKSSAAATKAPAKGRPVARRTSGTSAVVMKKKAAGAKKASAKGGRKAQAESGDANGSETEEVDGFDDDEPAPPAKSTKRGRPAKKAQEEETQEEEAAPPPAKRGRKPAAKEAVEKKETKAKPTAKSRGTKRALEPEPEPEQMTIPETQPEPDADAMDISESIEMEEIPESMPPPVRPSARRAHAQPNSRARRTSAGVRRTGSVSDSERDPVMRRKVGDLTKKLDAMTAKYEALQEAASSGKETNFDLLKKRTDQTVKDQDAVIKSLRQQVSDLQSRTGDLSSLKKDVAAAAKESARLAAENKRLHDALTTAQNENKTLSSKLAAARASSAQPETKTVPGSAVKPRTTGVVLPGTAEAVKEATLARQKVDLYSDLTNLVVLSVKKSDDGDDVYDCLQTGRGRTLHFHLTVTADSASPEDTEFIYQPLLDEQRDRELLDILPDYLTEEICFPSAQAVKFYCKVLDSMNKKVVLEDDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.19
3 0.21
4 0.25
5 0.31
6 0.35
7 0.4
8 0.44
9 0.47
10 0.52
11 0.54
12 0.57
13 0.56
14 0.56
15 0.58
16 0.59
17 0.59
18 0.52
19 0.5
20 0.45
21 0.41
22 0.36
23 0.28
24 0.27
25 0.26
26 0.33
27 0.37
28 0.4
29 0.42
30 0.43
31 0.5
32 0.53
33 0.59
34 0.57
35 0.58
36 0.6
37 0.61
38 0.63
39 0.62
40 0.57
41 0.49
42 0.46
43 0.45
44 0.47
45 0.47
46 0.42
47 0.36
48 0.34
49 0.36
50 0.4
51 0.4
52 0.4
53 0.42
54 0.5
55 0.57
56 0.59
57 0.61
58 0.63
59 0.62
60 0.63
61 0.65
62 0.63
63 0.57
64 0.55
65 0.54
66 0.51
67 0.48
68 0.41
69 0.34
70 0.29
71 0.26
72 0.25
73 0.19
74 0.15
75 0.12
76 0.11
77 0.09
78 0.07
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.1
85 0.09
86 0.1
87 0.12
88 0.12
89 0.12
90 0.11
91 0.15
92 0.17
93 0.27
94 0.32
95 0.4
96 0.5
97 0.6
98 0.68
99 0.75
100 0.82
101 0.84
102 0.87
103 0.83
104 0.77
105 0.76
106 0.74
107 0.68
108 0.62
109 0.52
110 0.42
111 0.36
112 0.32
113 0.24
114 0.21
115 0.17
116 0.12
117 0.15
118 0.22
119 0.28
120 0.31
121 0.39
122 0.46
123 0.54
124 0.59
125 0.65
126 0.68
127 0.67
128 0.71
129 0.71
130 0.7
131 0.65
132 0.61
133 0.54
134 0.53
135 0.51
136 0.48
137 0.48
138 0.46
139 0.5
140 0.59
141 0.66
142 0.64
143 0.71
144 0.73
145 0.74
146 0.73
147 0.69
148 0.64
149 0.65
150 0.61
151 0.56
152 0.51
153 0.47
154 0.45
155 0.41
156 0.37
157 0.27
158 0.24
159 0.21
160 0.21
161 0.16
162 0.12
163 0.13
164 0.13
165 0.13
166 0.13
167 0.13
168 0.12
169 0.11
170 0.11
171 0.09
172 0.09
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.05
177 0.05
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.05
187 0.05
188 0.06
189 0.08
190 0.08
191 0.11
192 0.15
193 0.19
194 0.21
195 0.26
196 0.33
197 0.36
198 0.4
199 0.41
200 0.47
201 0.5
202 0.55
203 0.58
204 0.6
205 0.63
206 0.61
207 0.58
208 0.5
209 0.47
210 0.43
211 0.44
212 0.42
213 0.4
214 0.42
215 0.42
216 0.42
217 0.38
218 0.36
219 0.27
220 0.22
221 0.19
222 0.16
223 0.16
224 0.15
225 0.14
226 0.15
227 0.17
228 0.2
229 0.23
230 0.24
231 0.23
232 0.25
233 0.31
234 0.37
235 0.42
236 0.39
237 0.38
238 0.38
239 0.38
240 0.35
241 0.31
242 0.26
243 0.2
244 0.18
245 0.16
246 0.14
247 0.14
248 0.14
249 0.12
250 0.12
251 0.09
252 0.07
253 0.05
254 0.06
255 0.05
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.07
260 0.07
261 0.09
262 0.11
263 0.12
264 0.16
265 0.19
266 0.22
267 0.24
268 0.25
269 0.28
270 0.31
271 0.33
272 0.38
273 0.45
274 0.44
275 0.43
276 0.42
277 0.38
278 0.35
279 0.34
280 0.25
281 0.16
282 0.16
283 0.22
284 0.22
285 0.2
286 0.2
287 0.23
288 0.29
289 0.34
290 0.32
291 0.26
292 0.25
293 0.25
294 0.25
295 0.21
296 0.15
297 0.1
298 0.14
299 0.15
300 0.16
301 0.16
302 0.15
303 0.15
304 0.17
305 0.19
306 0.16
307 0.15
308 0.16
309 0.17
310 0.18
311 0.18
312 0.16
313 0.11
314 0.11
315 0.12
316 0.17
317 0.24
318 0.26
319 0.27
320 0.3
321 0.3
322 0.29
323 0.28
324 0.22
325 0.17
326 0.22
327 0.23
328 0.21
329 0.23
330 0.24
331 0.24
332 0.24
333 0.22
334 0.17
335 0.15
336 0.15
337 0.14
338 0.17
339 0.18
340 0.21
341 0.2
342 0.19
343 0.2
344 0.2
345 0.2
346 0.19
347 0.18
348 0.17
349 0.17
350 0.2
351 0.2
352 0.2
353 0.21
354 0.19
355 0.21
356 0.21
357 0.24
358 0.29
359 0.34
360 0.32
361 0.32
362 0.32
363 0.31
364 0.3
365 0.27
366 0.23
367 0.2
368 0.19
369 0.19
370 0.19
371 0.17
372 0.16
373 0.15
374 0.11
375 0.07
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.1
380 0.16
381 0.17
382 0.18
383 0.2
384 0.21
385 0.22
386 0.24
387 0.21
388 0.19
389 0.2
390 0.2
391 0.18
392 0.17
393 0.16
394 0.13
395 0.11
396 0.1
397 0.09
398 0.1
399 0.12
400 0.12
401 0.13
402 0.14
403 0.16
404 0.16
405 0.18
406 0.19
407 0.18
408 0.19
409 0.19
410 0.18
411 0.16
412 0.14
413 0.15
414 0.13
415 0.14
416 0.19
417 0.21
418 0.22
419 0.26
420 0.3
421 0.33
422 0.33
423 0.32
424 0.28
425 0.27
426 0.26
427 0.25
428 0.21
429 0.14
430 0.13
431 0.13
432 0.12
433 0.1
434 0.1
435 0.09
436 0.09
437 0.12
438 0.12
439 0.12
440 0.12
441 0.11
442 0.11
443 0.16
444 0.18
445 0.17
446 0.19
447 0.21
448 0.27
449 0.29
450 0.28
451 0.24
452 0.23
453 0.23
454 0.24
455 0.22
456 0.16
457 0.15
458 0.15
459 0.15
460 0.14
461 0.13
462 0.1
463 0.1
464 0.1
465 0.11
466 0.11
467 0.09
468 0.16
469 0.2
470 0.2
471 0.24
472 0.26
473 0.31
474 0.34
475 0.36
476 0.31
477 0.27
478 0.28
479 0.3
480 0.37
481 0.37
482 0.43
483 0.49
484 0.49
485 0.48
486 0.48
487 0.45