Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0IPS6

Protein Details
Accession R0IPS6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-40QDQDTPSKCNKVRCRHCGFVRAKNHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016084  Haem_Oase-like_multi-hlx  
IPR004305  Thiaminase-2/PQQC  
Gene Ontology GO:0006772  P:thiamine metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF03070  TENA_THI-4  
CDD cd19357  TenA_E_At3g16990-like  
Amino Acid Sequences MGRHANPDIRRAFAEFQDQDTPSKCNKVRCRHCGFVRAKNTTRQIEHLQDCQAYLASSDAQAHVLAQQQDGTPVDGSTAAGPSPILSGQQPNPNLQVQRRGPNASKRARDGQPIAPVLAPAAPVTPSLTSHLLNTCAAPFRQATQRPFLSHAGCGSLAAEPLSQWLVQDGHYARGYIRFVGQLLAKIRLPQTPNSQFHPMYRTMDLLISALNNMRREMQFFEITATKYGLALGTEPPNPITRALMDLFVNATSSSASLLEGMVALWGTEHCYRSAWQYAATFTSALPTSASDSHIIALHQVLIPNWTSPASSKFLDATRALVDELANITTTRDGKEEMARCEEVFRQICWLAERFWPAIDDNGDEGPRPRIEGPMAAIGPTMDTTSMQGGMPNGLPMAMNRNNMHANMAGPSMHNTAINMHGNPVNTNTTNTNMAAPTQTPNMHPHNKYGMPHRKSMDSAGQAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.36
3 0.38
4 0.42
5 0.41
6 0.4
7 0.38
8 0.4
9 0.34
10 0.42
11 0.41
12 0.45
13 0.54
14 0.62
15 0.7
16 0.76
17 0.81
18 0.81
19 0.83
20 0.83
21 0.81
22 0.8
23 0.79
24 0.78
25 0.73
26 0.72
27 0.74
28 0.71
29 0.67
30 0.63
31 0.6
32 0.6
33 0.59
34 0.55
35 0.51
36 0.44
37 0.41
38 0.36
39 0.29
40 0.2
41 0.16
42 0.13
43 0.1
44 0.1
45 0.11
46 0.11
47 0.11
48 0.11
49 0.11
50 0.11
51 0.16
52 0.15
53 0.15
54 0.16
55 0.15
56 0.18
57 0.18
58 0.18
59 0.13
60 0.12
61 0.12
62 0.11
63 0.11
64 0.1
65 0.09
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.07
70 0.08
71 0.07
72 0.08
73 0.09
74 0.14
75 0.18
76 0.26
77 0.27
78 0.28
79 0.31
80 0.35
81 0.38
82 0.36
83 0.41
84 0.4
85 0.46
86 0.48
87 0.51
88 0.52
89 0.57
90 0.64
91 0.63
92 0.63
93 0.6
94 0.64
95 0.62
96 0.63
97 0.58
98 0.54
99 0.53
100 0.49
101 0.44
102 0.36
103 0.32
104 0.25
105 0.21
106 0.15
107 0.08
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.08
112 0.08
113 0.09
114 0.12
115 0.14
116 0.14
117 0.15
118 0.16
119 0.17
120 0.17
121 0.16
122 0.15
123 0.15
124 0.15
125 0.15
126 0.14
127 0.16
128 0.24
129 0.3
130 0.31
131 0.36
132 0.39
133 0.39
134 0.42
135 0.43
136 0.36
137 0.3
138 0.27
139 0.22
140 0.19
141 0.17
142 0.14
143 0.1
144 0.09
145 0.08
146 0.07
147 0.05
148 0.06
149 0.07
150 0.06
151 0.06
152 0.07
153 0.07
154 0.08
155 0.13
156 0.13
157 0.15
158 0.16
159 0.16
160 0.15
161 0.18
162 0.18
163 0.14
164 0.14
165 0.11
166 0.11
167 0.13
168 0.13
169 0.13
170 0.14
171 0.16
172 0.15
173 0.17
174 0.18
175 0.2
176 0.22
177 0.22
178 0.29
179 0.36
180 0.39
181 0.41
182 0.44
183 0.41
184 0.41
185 0.41
186 0.34
187 0.28
188 0.26
189 0.23
190 0.18
191 0.18
192 0.16
193 0.12
194 0.1
195 0.07
196 0.06
197 0.07
198 0.09
199 0.1
200 0.1
201 0.12
202 0.12
203 0.14
204 0.16
205 0.18
206 0.16
207 0.15
208 0.17
209 0.16
210 0.17
211 0.16
212 0.14
213 0.1
214 0.1
215 0.09
216 0.08
217 0.06
218 0.06
219 0.07
220 0.09
221 0.1
222 0.1
223 0.11
224 0.12
225 0.12
226 0.12
227 0.11
228 0.09
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.1
233 0.1
234 0.1
235 0.09
236 0.09
237 0.06
238 0.06
239 0.04
240 0.04
241 0.05
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.03
253 0.03
254 0.06
255 0.08
256 0.09
257 0.09
258 0.1
259 0.11
260 0.14
261 0.18
262 0.16
263 0.16
264 0.16
265 0.17
266 0.17
267 0.17
268 0.14
269 0.1
270 0.12
271 0.1
272 0.09
273 0.09
274 0.08
275 0.1
276 0.1
277 0.12
278 0.1
279 0.11
280 0.11
281 0.12
282 0.11
283 0.09
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.09
291 0.08
292 0.09
293 0.08
294 0.08
295 0.09
296 0.12
297 0.15
298 0.15
299 0.15
300 0.17
301 0.18
302 0.21
303 0.2
304 0.18
305 0.16
306 0.16
307 0.15
308 0.13
309 0.12
310 0.09
311 0.1
312 0.08
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.09
317 0.1
318 0.11
319 0.11
320 0.12
321 0.14
322 0.22
323 0.26
324 0.27
325 0.31
326 0.31
327 0.3
328 0.31
329 0.3
330 0.3
331 0.27
332 0.24
333 0.23
334 0.23
335 0.24
336 0.25
337 0.25
338 0.19
339 0.21
340 0.24
341 0.21
342 0.2
343 0.2
344 0.18
345 0.2
346 0.19
347 0.17
348 0.15
349 0.17
350 0.16
351 0.16
352 0.17
353 0.17
354 0.16
355 0.18
356 0.17
357 0.17
358 0.19
359 0.2
360 0.21
361 0.23
362 0.23
363 0.2
364 0.2
365 0.16
366 0.16
367 0.14
368 0.11
369 0.06
370 0.06
371 0.07
372 0.08
373 0.1
374 0.09
375 0.1
376 0.1
377 0.12
378 0.12
379 0.11
380 0.09
381 0.09
382 0.09
383 0.08
384 0.16
385 0.18
386 0.23
387 0.24
388 0.28
389 0.3
390 0.31
391 0.32
392 0.25
393 0.21
394 0.18
395 0.18
396 0.14
397 0.13
398 0.16
399 0.16
400 0.16
401 0.15
402 0.14
403 0.15
404 0.21
405 0.24
406 0.21
407 0.22
408 0.23
409 0.24
410 0.25
411 0.26
412 0.26
413 0.23
414 0.26
415 0.25
416 0.26
417 0.28
418 0.27
419 0.27
420 0.22
421 0.22
422 0.22
423 0.21
424 0.21
425 0.23
426 0.24
427 0.24
428 0.3
429 0.38
430 0.44
431 0.45
432 0.48
433 0.51
434 0.54
435 0.56
436 0.61
437 0.62
438 0.58
439 0.63
440 0.61
441 0.57
442 0.55
443 0.56
444 0.54