Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0IA80

Protein Details
Accession R0IA80    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
51-77RNASLPRGTPRPRERRRLSSPPPPPVFHydrophilic
250-272VRPTSKRDKAKSKRTNDPDRQGYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
60-67PRPRERRR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR006016  UspA  
Pfam View protein in Pfam  
PF00582  Usp  
CDD cd00293  USP_Like  
Amino Acid Sequences MDASPAPPASPAPPKSPAANATSPLLPLPNDARPALEETRRPSTIQFLAHRNASLPRGTPRPRERRRLSSPPPPPVFQNRVSFDTFDKPADFIEESSFTLIAKHKDYEYTKRSRTFLCGFDENEYSVYALQWLINELVDDGDEIVCLRVVEKEDAIAGDRSVESGRYRVEAENAMSDIQSRNHDNKAINLILEFSIGKVNKVIDDMINLYEPAILVVGTRGKSLGGFQGLLPGSVSKYCLQHSPVPVIVVRPTSKRDKAKSKRTNDPDRQGYRELLAKSERLPDYDSPRNRFFANEDEAAAVARAIAAPKPAVETIHPLAQVERAQDSSGDELETGDSSTMVGDDPRSPGPMMKSPHLQNLDSPELSSQSSSDDEDEQAGVSSSTESRGADAAAQEAAQADAAKDVSKDATQDATQDAARDAAAAAASKGAQQT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.43
3 0.47
4 0.45
5 0.43
6 0.43
7 0.39
8 0.37
9 0.36
10 0.33
11 0.28
12 0.26
13 0.19
14 0.19
15 0.21
16 0.23
17 0.25
18 0.25
19 0.25
20 0.25
21 0.31
22 0.33
23 0.34
24 0.35
25 0.37
26 0.45
27 0.45
28 0.44
29 0.39
30 0.41
31 0.4
32 0.42
33 0.41
34 0.4
35 0.43
36 0.44
37 0.43
38 0.38
39 0.37
40 0.33
41 0.3
42 0.27
43 0.28
44 0.36
45 0.41
46 0.49
47 0.56
48 0.64
49 0.71
50 0.78
51 0.81
52 0.82
53 0.86
54 0.86
55 0.84
56 0.83
57 0.83
58 0.83
59 0.79
60 0.7
61 0.66
62 0.65
63 0.63
64 0.58
65 0.57
66 0.51
67 0.51
68 0.51
69 0.47
70 0.41
71 0.41
72 0.36
73 0.3
74 0.26
75 0.23
76 0.21
77 0.23
78 0.2
79 0.15
80 0.16
81 0.16
82 0.16
83 0.16
84 0.16
85 0.12
86 0.14
87 0.17
88 0.17
89 0.18
90 0.19
91 0.19
92 0.26
93 0.31
94 0.38
95 0.42
96 0.48
97 0.52
98 0.55
99 0.57
100 0.52
101 0.54
102 0.5
103 0.46
104 0.43
105 0.4
106 0.37
107 0.37
108 0.36
109 0.3
110 0.26
111 0.21
112 0.16
113 0.12
114 0.11
115 0.08
116 0.07
117 0.07
118 0.06
119 0.07
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.05
127 0.05
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.05
133 0.04
134 0.05
135 0.06
136 0.08
137 0.1
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.1
142 0.11
143 0.1
144 0.08
145 0.08
146 0.07
147 0.08
148 0.08
149 0.09
150 0.08
151 0.09
152 0.1
153 0.11
154 0.13
155 0.12
156 0.14
157 0.15
158 0.15
159 0.14
160 0.14
161 0.13
162 0.11
163 0.11
164 0.11
165 0.11
166 0.13
167 0.15
168 0.17
169 0.18
170 0.22
171 0.22
172 0.23
173 0.26
174 0.24
175 0.2
176 0.17
177 0.17
178 0.13
179 0.13
180 0.1
181 0.06
182 0.1
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.1
189 0.11
190 0.07
191 0.08
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.07
197 0.07
198 0.06
199 0.05
200 0.04
201 0.03
202 0.03
203 0.04
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.07
210 0.07
211 0.09
212 0.07
213 0.08
214 0.07
215 0.13
216 0.13
217 0.12
218 0.12
219 0.1
220 0.1
221 0.1
222 0.12
223 0.08
224 0.1
225 0.11
226 0.13
227 0.16
228 0.2
229 0.22
230 0.23
231 0.22
232 0.22
233 0.21
234 0.19
235 0.17
236 0.16
237 0.16
238 0.15
239 0.19
240 0.25
241 0.32
242 0.38
243 0.44
244 0.52
245 0.61
246 0.7
247 0.76
248 0.76
249 0.79
250 0.81
251 0.85
252 0.82
253 0.81
254 0.8
255 0.74
256 0.71
257 0.63
258 0.55
259 0.45
260 0.42
261 0.34
262 0.27
263 0.25
264 0.21
265 0.2
266 0.27
267 0.25
268 0.21
269 0.25
270 0.25
271 0.31
272 0.39
273 0.43
274 0.42
275 0.44
276 0.45
277 0.41
278 0.39
279 0.34
280 0.31
281 0.3
282 0.25
283 0.23
284 0.22
285 0.21
286 0.2
287 0.17
288 0.11
289 0.05
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.05
294 0.06
295 0.06
296 0.07
297 0.09
298 0.1
299 0.1
300 0.11
301 0.16
302 0.17
303 0.21
304 0.2
305 0.19
306 0.19
307 0.21
308 0.22
309 0.17
310 0.17
311 0.14
312 0.14
313 0.15
314 0.16
315 0.14
316 0.13
317 0.11
318 0.1
319 0.09
320 0.1
321 0.1
322 0.08
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.07
331 0.08
332 0.11
333 0.12
334 0.15
335 0.15
336 0.18
337 0.22
338 0.27
339 0.3
340 0.31
341 0.38
342 0.38
343 0.46
344 0.47
345 0.43
346 0.39
347 0.42
348 0.44
349 0.36
350 0.34
351 0.27
352 0.25
353 0.25
354 0.22
355 0.15
356 0.12
357 0.13
358 0.14
359 0.15
360 0.15
361 0.15
362 0.16
363 0.16
364 0.13
365 0.12
366 0.11
367 0.09
368 0.08
369 0.09
370 0.08
371 0.09
372 0.11
373 0.1
374 0.11
375 0.12
376 0.12
377 0.12
378 0.13
379 0.12
380 0.11
381 0.11
382 0.1
383 0.09
384 0.09
385 0.08
386 0.08
387 0.06
388 0.08
389 0.08
390 0.09
391 0.09
392 0.1
393 0.12
394 0.13
395 0.14
396 0.14
397 0.18
398 0.18
399 0.19
400 0.2
401 0.2
402 0.2
403 0.2
404 0.18
405 0.15
406 0.14
407 0.13
408 0.11
409 0.09
410 0.1
411 0.09
412 0.08
413 0.09
414 0.09