FuNGI

R0K3M9

Protein Details

Accession

R0K3M9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
145-168	EGGSSKSASKRRRKAAKARQASED	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
148-163	SSKSASKRRRKAAKAR
203-212	KRAAKPRAPK

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 13.833, cyto 13, nucl 10.5, mito_nucl 6.832

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039907 NOB1 IPR017117 Nob1_euk IPR036283 NOB1_Zf-like_sf IPR014881 NOB1_Zn-bd IPR033411 Ribonuclease_PIN
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0046872 F:metal ion binding GO:0004521 F:RNA endonuclease activity GO:0000469 P:cleavage involved in rRNA processing GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF08772 NOB1_Zn_bind PF17146 PIN_6
CDD	cd09876 PIN_Nob1-like

Amino Acid Sequences

MDDSTSAQQKPIHSLILDTGPLIKNAVSISTLINSAEELITTPAILSEIRDEATRSRVQTTLVPFLKIRNPSPASYDAVIVFSKKTGDYEVLSRQDLGILALAYEVHCERNGGNWGLREVPKGEVKRRPEEIEADKEKVAQAAAEGGSSKSASKRRRKAAKARQASEDVTEEAAEEANPEVSGSAEPGKADETDEGWEQPTGKRAAKPRAPKSIKFNFKPTEEAEEDQIQQQEQPTLTDAQEDGGVSVTQEQVHEQIQEQVAAQVQDQIHEQVENQIHEQLENKGQDNLESQVVEKAEQQIEQQVQEQVQEQLEEQLGEQGLIDKSAAVEAPSASIHIEQNAELSVAPEHSQATSEPNLEHDMADLSLSQQPSQQPTPPTTDDSAPDSDSDGEWITPHNLPEHQAKDSSLQPHIQTTANRQLDVATMTTDFAMQNVLLQLNLHLLSPHMQRIKNVTTKVLRCHACFHIVKQMARQFCPRCGQPTLQRVSCSTNAKGEFKIHLARNYTFNKRGDKYSIPKPIAGTANNKWSAGQGGGKAGWGKDLILAEDQKEYLRSVEADKRGKQRDLMDRDYLPAILTGDRGAKAG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.29
3	0.29
4	0.27
5	0.21
6	0.23
7	0.21
8	0.21
9	0.2
10	0.17
11	0.14
12	0.15
13	0.16
14	0.11
15	0.11
16	0.12
17	0.13
18	0.14
19	0.12
20	0.12
21	0.11
22	0.11
23	0.1
24	0.09
25	0.08
26	0.09
27	0.09
28	0.09
29	0.09
30	0.07
31	0.08
32	0.08
33	0.08
34	0.09
35	0.11
36	0.12
37	0.13
38	0.14
39	0.16
40	0.22
41	0.25
42	0.24
43	0.26
44	0.26
45	0.28
46	0.32
47	0.35
48	0.39
49	0.36
50	0.37
51	0.34
52	0.38
53	0.42
54	0.42
55	0.39
56	0.38
57	0.4
58	0.39
59	0.44
60	0.43
61	0.41
62	0.36
63	0.36
64	0.26
65	0.25
66	0.24
67	0.19
68	0.16
69	0.13
70	0.13
71	0.12
72	0.13
73	0.13
74	0.15
75	0.16
76	0.21
77	0.28
78	0.3
79	0.3
80	0.29
81	0.26
82	0.25
83	0.23
84	0.18
85	0.12
86	0.08
87	0.08
88	0.07
89	0.08
90	0.06
91	0.08
92	0.08
93	0.08
94	0.08
95	0.09
96	0.1
97	0.15
98	0.19
99	0.2
100	0.22
101	0.23
102	0.24
103	0.29
104	0.3
105	0.27
106	0.24
107	0.25
108	0.3
109	0.34
110	0.4
111	0.42
112	0.48
113	0.53
114	0.56
115	0.56
116	0.52
117	0.54
118	0.53
119	0.55
120	0.52
121	0.48
122	0.43
123	0.4
124	0.37
125	0.3
126	0.24
127	0.14
128	0.09
129	0.09
130	0.09
131	0.09
132	0.09
133	0.08
134	0.09
135	0.1
136	0.11
137	0.14
138	0.22
139	0.31
140	0.41
141	0.5
142	0.6
143	0.7
144	0.78
145	0.84
146	0.87
147	0.88
148	0.88
149	0.83
150	0.78
151	0.71
152	0.63
153	0.54
154	0.45
155	0.35
156	0.25
157	0.21
158	0.15
159	0.12
160	0.11
161	0.08
162	0.06
163	0.05
164	0.05
165	0.05
166	0.05
167	0.05
168	0.05
169	0.05
170	0.06
171	0.08
172	0.08
173	0.08
174	0.09
175	0.1
176	0.09
177	0.1
178	0.1
179	0.09
180	0.1
181	0.11
182	0.11
183	0.11
184	0.12
185	0.12
186	0.12
187	0.16
188	0.17
189	0.19
190	0.23
191	0.3
192	0.39
193	0.45
194	0.54
195	0.57
196	0.64
197	0.67
198	0.67
199	0.69
200	0.7
201	0.72
202	0.65
203	0.66
204	0.59
205	0.55
206	0.55
207	0.47
208	0.44
209	0.37
210	0.35
211	0.3
212	0.27
213	0.26
214	0.24
215	0.23
216	0.16
217	0.14
218	0.14
219	0.13
220	0.11
221	0.11
222	0.1
223	0.12
224	0.12
225	0.12
226	0.11
227	0.09
228	0.1
229	0.09
230	0.07
231	0.06
232	0.06
233	0.05
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.06
238	0.06
239	0.07
240	0.08
241	0.09
242	0.08
243	0.11
244	0.11
245	0.11
246	0.11
247	0.1
248	0.1
249	0.1
250	0.09
251	0.1
252	0.1
253	0.1
254	0.1
255	0.11
256	0.1
257	0.1
258	0.1
259	0.11
260	0.13
261	0.13
262	0.13
263	0.14
264	0.14
265	0.14
266	0.16
267	0.12
268	0.15
269	0.16
270	0.16
271	0.15
272	0.15
273	0.16
274	0.16
275	0.15
276	0.12
277	0.1
278	0.1
279	0.1
280	0.11
281	0.11
282	0.1
283	0.11
284	0.11
285	0.11
286	0.11
287	0.13
288	0.13
289	0.13
290	0.14
291	0.12
292	0.12
293	0.12
294	0.13
295	0.1
296	0.1
297	0.1
298	0.08
299	0.08
300	0.09
301	0.08
302	0.07
303	0.07
304	0.07
305	0.06
306	0.06
307	0.07
308	0.07
309	0.07
310	0.07
311	0.05
312	0.05
313	0.06
314	0.06
315	0.04
316	0.04
317	0.04
318	0.05
319	0.05
320	0.05
321	0.05
322	0.06
323	0.06
324	0.07
325	0.08
326	0.07
327	0.07
328	0.07
329	0.07
330	0.06
331	0.06
332	0.06
333	0.06
334	0.06
335	0.07
336	0.07
337	0.07
338	0.07
339	0.07
340	0.11
341	0.12
342	0.12
343	0.12
344	0.13
345	0.15
346	0.14
347	0.14
348	0.11
349	0.1
350	0.09
351	0.09
352	0.07
353	0.07
354	0.09
355	0.09
356	0.09
357	0.11
358	0.13
359	0.17
360	0.2
361	0.22
362	0.22
363	0.24
364	0.3
365	0.29
366	0.31
367	0.28
368	0.28
369	0.25
370	0.26
371	0.26
372	0.2
373	0.19
374	0.16
375	0.15
376	0.13
377	0.13
378	0.1
379	0.08
380	0.08
381	0.09
382	0.1
383	0.11
384	0.11
385	0.12
386	0.12
387	0.15
388	0.22
389	0.24
390	0.23
391	0.23
392	0.23
393	0.24
394	0.28
395	0.28
396	0.24
397	0.24
398	0.23
399	0.24
400	0.25
401	0.25
402	0.22
403	0.26
404	0.33
405	0.32
406	0.31
407	0.3
408	0.28
409	0.26
410	0.26
411	0.19
412	0.1
413	0.09
414	0.09
415	0.09
416	0.1
417	0.08
418	0.07
419	0.07
420	0.06
421	0.07
422	0.08
423	0.08
424	0.07
425	0.07
426	0.07
427	0.08
428	0.09
429	0.08
430	0.07
431	0.07
432	0.12
433	0.14
434	0.2
435	0.23
436	0.24
437	0.26
438	0.32
439	0.39
440	0.41
441	0.41
442	0.42
443	0.44
444	0.48
445	0.52
446	0.53
447	0.5
448	0.45
449	0.49
450	0.44
451	0.45
452	0.42
453	0.39
454	0.41
455	0.43
456	0.42
457	0.44
458	0.48
459	0.44
460	0.45
461	0.51
462	0.45
463	0.45
464	0.5
465	0.46
466	0.45
467	0.46
468	0.5
469	0.5
470	0.56
471	0.58
472	0.54
473	0.53
474	0.5
475	0.51
476	0.5
477	0.47
478	0.39
479	0.39
480	0.4
481	0.41
482	0.42
483	0.39
484	0.35
485	0.34
486	0.4
487	0.37
488	0.38
489	0.4
490	0.4
491	0.45
492	0.49
493	0.53
494	0.52
495	0.52
496	0.55
497	0.53
498	0.57
499	0.55
500	0.57
501	0.56
502	0.59
503	0.64
504	0.58
505	0.57
506	0.53
507	0.53
508	0.5
509	0.47
510	0.45
511	0.4
512	0.47
513	0.47
514	0.45
515	0.39
516	0.34
517	0.32
518	0.28
519	0.26
520	0.18
521	0.2
522	0.2
523	0.22
524	0.23
525	0.2
526	0.2
527	0.17
528	0.15
529	0.15
530	0.16
531	0.16
532	0.18
533	0.2
534	0.19
535	0.21
536	0.21
537	0.19
538	0.19
539	0.18
540	0.15
541	0.16
542	0.16
543	0.2
544	0.28
545	0.36
546	0.42
547	0.49
548	0.57
549	0.62
550	0.64
551	0.63
552	0.64
553	0.66
554	0.66
555	0.65
556	0.62
557	0.56
558	0.56
559	0.52
560	0.43
561	0.33
562	0.25
563	0.21
564	0.15
565	0.15
566	0.14
567	0.16

R0K3M9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer