Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0JN72

Protein Details
Accession R0JN72    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-35KSESIKRPGKNWPRAFEKRHPELBasic
396-420KEQALAGKPKRGRKRKSDALEGSTVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-32KRPGKNWPRAFEKRH
390-411RAKRAAKEQALAGKPKRGRKRK
Subcellular Location(s) mito 12.5, mito_nucl 12, nucl 10.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004875  DDE_SF_endonuclease_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03184  DDE_1  
Amino Acid Sequences SLAFSIAHQRSTKSESIKRPGKNWPRAFEKRHPELQARRVRSIDWKRHGNNIYEKIVEWFDVIGQVLQDPCVLPENVYNMDETGVMLSMLGSAKVLVGKDNRQGSRGAGVKRTMVTAIECISADGRALLPLIIWPASTHRSNWTTHSTPGWHYAHSENGYNDSKISLEWLKRFCFTNNIILCRLPSHTSHKLQPCDVGPFAPLKSAYREQVERLNQGGVDIVGKEHFTYLYNPARDRTLTKRNIRAGWSATGLFPFNPERVLRDVPKPPAEVSNISNPGTETASADVSDDMPRTPTTPVTPVTTEALTSLHNLITKDTHVLEKTSKDRLQRRIQKLASAAKVSFAEQALLKDRNHFLLQINREAKTRRSTKSVVLGKAKVMSFQDLEEARAKRAAKEQALAGKPKRGRKRKSDALEGSTVLPSPK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.53
3 0.63
4 0.69
5 0.7
6 0.69
7 0.74
8 0.76
9 0.78
10 0.77
11 0.74
12 0.76
13 0.8
14 0.83
15 0.82
16 0.82
17 0.79
18 0.78
19 0.76
20 0.75
21 0.75
22 0.77
23 0.77
24 0.73
25 0.7
26 0.63
27 0.59
28 0.61
29 0.63
30 0.63
31 0.62
32 0.65
33 0.63
34 0.71
35 0.73
36 0.7
37 0.69
38 0.66
39 0.61
40 0.52
41 0.49
42 0.43
43 0.39
44 0.32
45 0.22
46 0.15
47 0.12
48 0.12
49 0.12
50 0.09
51 0.08
52 0.09
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.08
57 0.09
58 0.12
59 0.12
60 0.11
61 0.13
62 0.17
63 0.19
64 0.19
65 0.18
66 0.15
67 0.15
68 0.14
69 0.12
70 0.09
71 0.06
72 0.06
73 0.05
74 0.05
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.05
79 0.05
80 0.06
81 0.07
82 0.08
83 0.1
84 0.14
85 0.18
86 0.24
87 0.32
88 0.33
89 0.32
90 0.33
91 0.31
92 0.34
93 0.36
94 0.33
95 0.29
96 0.3
97 0.31
98 0.31
99 0.31
100 0.24
101 0.19
102 0.17
103 0.14
104 0.14
105 0.12
106 0.12
107 0.11
108 0.11
109 0.1
110 0.09
111 0.07
112 0.06
113 0.05
114 0.06
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.09
123 0.13
124 0.14
125 0.15
126 0.19
127 0.22
128 0.23
129 0.27
130 0.32
131 0.3
132 0.31
133 0.33
134 0.29
135 0.28
136 0.35
137 0.32
138 0.25
139 0.25
140 0.24
141 0.27
142 0.26
143 0.27
144 0.19
145 0.23
146 0.25
147 0.22
148 0.21
149 0.16
150 0.15
151 0.12
152 0.15
153 0.14
154 0.15
155 0.2
156 0.23
157 0.24
158 0.26
159 0.28
160 0.25
161 0.27
162 0.26
163 0.3
164 0.3
165 0.31
166 0.31
167 0.3
168 0.29
169 0.24
170 0.24
171 0.17
172 0.16
173 0.21
174 0.27
175 0.3
176 0.37
177 0.42
178 0.42
179 0.41
180 0.41
181 0.35
182 0.31
183 0.28
184 0.22
185 0.16
186 0.15
187 0.15
188 0.13
189 0.12
190 0.1
191 0.14
192 0.16
193 0.17
194 0.18
195 0.19
196 0.2
197 0.26
198 0.27
199 0.24
200 0.23
201 0.22
202 0.18
203 0.17
204 0.16
205 0.09
206 0.07
207 0.05
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.08
216 0.14
217 0.19
218 0.21
219 0.22
220 0.22
221 0.24
222 0.24
223 0.25
224 0.27
225 0.31
226 0.38
227 0.43
228 0.5
229 0.53
230 0.55
231 0.54
232 0.51
233 0.43
234 0.37
235 0.32
236 0.25
237 0.21
238 0.18
239 0.16
240 0.12
241 0.12
242 0.12
243 0.1
244 0.12
245 0.11
246 0.13
247 0.17
248 0.21
249 0.22
250 0.27
251 0.32
252 0.35
253 0.38
254 0.37
255 0.33
256 0.33
257 0.33
258 0.29
259 0.26
260 0.29
261 0.29
262 0.28
263 0.27
264 0.24
265 0.22
266 0.21
267 0.18
268 0.11
269 0.09
270 0.1
271 0.09
272 0.1
273 0.09
274 0.09
275 0.1
276 0.09
277 0.08
278 0.1
279 0.1
280 0.11
281 0.12
282 0.12
283 0.13
284 0.16
285 0.18
286 0.2
287 0.21
288 0.21
289 0.22
290 0.21
291 0.18
292 0.15
293 0.14
294 0.11
295 0.12
296 0.11
297 0.1
298 0.12
299 0.12
300 0.13
301 0.14
302 0.14
303 0.15
304 0.15
305 0.17
306 0.16
307 0.19
308 0.2
309 0.25
310 0.28
311 0.34
312 0.37
313 0.42
314 0.49
315 0.56
316 0.64
317 0.68
318 0.72
319 0.74
320 0.72
321 0.68
322 0.67
323 0.66
324 0.59
325 0.52
326 0.44
327 0.37
328 0.36
329 0.32
330 0.28
331 0.2
332 0.17
333 0.15
334 0.18
335 0.21
336 0.24
337 0.23
338 0.26
339 0.27
340 0.3
341 0.3
342 0.29
343 0.28
344 0.33
345 0.37
346 0.41
347 0.43
348 0.4
349 0.43
350 0.44
351 0.45
352 0.46
353 0.5
354 0.45
355 0.49
356 0.51
357 0.53
358 0.6
359 0.63
360 0.61
361 0.61
362 0.58
363 0.53
364 0.55
365 0.49
366 0.42
367 0.36
368 0.32
369 0.26
370 0.24
371 0.28
372 0.23
373 0.26
374 0.29
375 0.29
376 0.27
377 0.31
378 0.31
379 0.29
380 0.36
381 0.42
382 0.39
383 0.41
384 0.44
385 0.48
386 0.53
387 0.58
388 0.53
389 0.54
390 0.56
391 0.63
392 0.69
393 0.7
394 0.74
395 0.76
396 0.84
397 0.85
398 0.87
399 0.89
400 0.86
401 0.81
402 0.76
403 0.67
404 0.58
405 0.49