Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0K6D2

Protein Details
Accession R0K6D2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
280-309QVQRKAVKDAKPKSKRGAKKKTESEDDDGMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
283-300RKAVKDAKPKSKRGAKKK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001719  AP_endonuc_2  
IPR018246  AP_endonuc_F2_Zn_BS  
IPR036237  Xyl_isomerase-like_sf  
IPR013022  Xyl_isomerase-like_TIM-brl  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF01261  AP_endonuc_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00730  AP_NUCLEASE_F2_2  
PS51432  AP_NUCLEASE_F2_4  
CDD cd00019  AP2Ec  
Amino Acid Sequences MDPEHAQFFIQWCKDHSIDAAECCLPHGSYLVNLAHPDPARKKQAYDSFLNDLSRCHRLGIRYYNFHPGNSNATSHEEGIQIIAENLNRAHADPQTGKVVTVLETMATVGNTIGGTFSDIADIIKLVKDKSRVGVCLDTCHVFAAGYDLRTPEAYAETMKKFDEVIGLDYLKAFHVNDSKAPLSSHRDLHARIGTGYLGLQSFHNLMNDERFHGLPMVLETPIDVVDENGKKIEDKGVWAREIKMLESLVGMDVDSEEFKTLSARLQEEGSAERERVGDQVQRKAVKDAKPKSKRGAKKKTESEDDDGMEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.33
3 0.32
4 0.3
5 0.3
6 0.29
7 0.3
8 0.25
9 0.24
10 0.24
11 0.24
12 0.17
13 0.14
14 0.14
15 0.11
16 0.11
17 0.16
18 0.16
19 0.16
20 0.17
21 0.17
22 0.22
23 0.22
24 0.28
25 0.3
26 0.36
27 0.43
28 0.44
29 0.47
30 0.5
31 0.58
32 0.56
33 0.55
34 0.53
35 0.49
36 0.51
37 0.5
38 0.41
39 0.34
40 0.33
41 0.31
42 0.26
43 0.23
44 0.23
45 0.24
46 0.32
47 0.4
48 0.43
49 0.45
50 0.47
51 0.55
52 0.53
53 0.5
54 0.45
55 0.37
56 0.36
57 0.31
58 0.3
59 0.22
60 0.26
61 0.27
62 0.25
63 0.24
64 0.19
65 0.17
66 0.16
67 0.14
68 0.09
69 0.08
70 0.08
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.09
75 0.09
76 0.09
77 0.11
78 0.11
79 0.15
80 0.16
81 0.18
82 0.22
83 0.21
84 0.21
85 0.19
86 0.19
87 0.15
88 0.14
89 0.12
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.06
95 0.05
96 0.04
97 0.05
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.05
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.04
111 0.06
112 0.06
113 0.07
114 0.1
115 0.13
116 0.13
117 0.18
118 0.2
119 0.2
120 0.22
121 0.26
122 0.23
123 0.23
124 0.24
125 0.2
126 0.18
127 0.17
128 0.14
129 0.09
130 0.08
131 0.1
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.07
143 0.1
144 0.11
145 0.12
146 0.12
147 0.12
148 0.11
149 0.1
150 0.11
151 0.09
152 0.1
153 0.11
154 0.11
155 0.1
156 0.1
157 0.1
158 0.08
159 0.08
160 0.06
161 0.07
162 0.1
163 0.11
164 0.12
165 0.16
166 0.17
167 0.17
168 0.17
169 0.18
170 0.21
171 0.24
172 0.25
173 0.24
174 0.26
175 0.26
176 0.31
177 0.3
178 0.24
179 0.21
180 0.19
181 0.16
182 0.13
183 0.13
184 0.09
185 0.07
186 0.06
187 0.06
188 0.07
189 0.08
190 0.08
191 0.09
192 0.09
193 0.1
194 0.14
195 0.15
196 0.15
197 0.16
198 0.15
199 0.15
200 0.15
201 0.14
202 0.1
203 0.11
204 0.11
205 0.09
206 0.08
207 0.08
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.05
212 0.05
213 0.11
214 0.13
215 0.13
216 0.14
217 0.14
218 0.14
219 0.15
220 0.2
221 0.15
222 0.19
223 0.26
224 0.29
225 0.32
226 0.33
227 0.34
228 0.32
229 0.32
230 0.28
231 0.22
232 0.19
233 0.16
234 0.15
235 0.13
236 0.1
237 0.09
238 0.08
239 0.05
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.08
248 0.08
249 0.12
250 0.15
251 0.16
252 0.17
253 0.18
254 0.19
255 0.2
256 0.22
257 0.22
258 0.2
259 0.18
260 0.18
261 0.18
262 0.18
263 0.18
264 0.19
265 0.21
266 0.24
267 0.33
268 0.38
269 0.42
270 0.43
271 0.49
272 0.52
273 0.55
274 0.6
275 0.62
276 0.66
277 0.71
278 0.77
279 0.8
280 0.83
281 0.85
282 0.86
283 0.87
284 0.86
285 0.88
286 0.91
287 0.9
288 0.89
289 0.85
290 0.81
291 0.75