Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0J2Q1

Protein Details
Accession R0J2Q1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
597-616QTAPHHHHHHHHHHHHHQKPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
560-565KKPKRP
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036609  LCCL_sf  
IPR013951  Rxt3  
Gene Ontology GO:0016575  P:histone deacetylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF08642  Rxt3  
Amino Acid Sequences MTTSTNPPAPAPYAFDAARRRSLNGASPPDPYGAPSPRPTLLPPAPWRANEKTGPSHEYPPPPSFARPQMPPPSSPTQQQQQQQQQQQHAHASQPPRSQYPPNFAANRDLPGLGQPMRPGTSMAISSLIGGGGGGGGDTGAPVATTQSPSSPSTNAPSSSAHAMQPPSPRRALPSDPRSDFAAFRRQQTPERGTYAASTARQDGHAFSSASPSQSYSNQASPDPARQSLPPNPQSYKPMTFPGQRLYAQDPNRQSSANVPQRPNSQPNGPPENNDQEGRAMYDTFGGRRNAFGPPEERRRTLGESHHARPNAAELLAGASQTRSERDRAATVHPVSQSAFSPPQEHRNMSGSSEPPRSLWRHSAPTGPGRELAHEGRQEEPPPMHRTYGPYPPAMLGGGRYAAQSSEEMLRRSVDHLGHRVVEQYHAPPTSDPNSVERHRTEPLARSLSSGGRSLYDQPQKMGEAMQHSKSHIGFGLEASRRTGRASPLPQAVQGAQAQPLSIGKDPGIKSEFGRMFSGLGSGLGSSTPSRGSPMPQNGPGSFESDSGEMMRRIGSQQGKKPKRPKDEEGIFDMDSADGRGTPFGSRGAKRNKHHHQTAPHHHHHHHHHHHHHQKPDDEGLSAPAPTTSLNGRQTSLPQPGPGQSIHHHHHIQANPHHHHHHHHHHAPRPNQPVPHVAAKVPIKVYEIQHILEEAAKRPRKHLGSQLYQARTELPKPNSSLDDQFGYASKPQRLPCFDVNPINCTFTIRVPRYYLKPRQRQHIVLERHLWGARVYRDDSDPLAAAIHSGWIRGEWDDTVDVAMLDPRITAPNDPSDAEDVLTKLPAAPVTPPADMDLQIEILILPQLQEYTGSVEYGISSRKSKAHEGLSFMINKIRWVEEGVGSRGQDRTAAALKRRLDASAALLTLKSGILEYHRVNGMTKLHA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.34
3 0.38
4 0.4
5 0.47
6 0.43
7 0.42
8 0.42
9 0.46
10 0.48
11 0.5
12 0.53
13 0.47
14 0.48
15 0.47
16 0.44
17 0.4
18 0.34
19 0.33
20 0.3
21 0.33
22 0.35
23 0.37
24 0.37
25 0.4
26 0.39
27 0.41
28 0.4
29 0.44
30 0.46
31 0.52
32 0.54
33 0.55
34 0.6
35 0.56
36 0.58
37 0.54
38 0.55
39 0.54
40 0.54
41 0.58
42 0.55
43 0.56
44 0.56
45 0.59
46 0.58
47 0.53
48 0.52
49 0.48
50 0.49
51 0.48
52 0.5
53 0.49
54 0.47
55 0.53
56 0.58
57 0.59
58 0.57
59 0.57
60 0.57
61 0.53
62 0.54
63 0.52
64 0.51
65 0.55
66 0.59
67 0.62
68 0.65
69 0.72
70 0.74
71 0.74
72 0.73
73 0.72
74 0.7
75 0.67
76 0.58
77 0.52
78 0.5
79 0.5
80 0.49
81 0.5
82 0.49
83 0.47
84 0.5
85 0.55
86 0.54
87 0.56
88 0.54
89 0.56
90 0.54
91 0.51
92 0.54
93 0.48
94 0.45
95 0.38
96 0.32
97 0.25
98 0.24
99 0.28
100 0.22
101 0.21
102 0.2
103 0.22
104 0.23
105 0.23
106 0.22
107 0.19
108 0.19
109 0.18
110 0.17
111 0.15
112 0.13
113 0.13
114 0.12
115 0.1
116 0.07
117 0.06
118 0.05
119 0.03
120 0.03
121 0.03
122 0.02
123 0.02
124 0.02
125 0.02
126 0.03
127 0.02
128 0.03
129 0.03
130 0.05
131 0.07
132 0.09
133 0.1
134 0.12
135 0.16
136 0.18
137 0.21
138 0.21
139 0.21
140 0.25
141 0.28
142 0.27
143 0.26
144 0.25
145 0.26
146 0.29
147 0.28
148 0.24
149 0.24
150 0.25
151 0.27
152 0.35
153 0.38
154 0.38
155 0.38
156 0.38
157 0.39
158 0.43
159 0.47
160 0.48
161 0.52
162 0.57
163 0.56
164 0.58
165 0.57
166 0.52
167 0.46
168 0.4
169 0.42
170 0.34
171 0.37
172 0.41
173 0.41
174 0.45
175 0.51
176 0.53
177 0.47
178 0.49
179 0.45
180 0.4
181 0.37
182 0.35
183 0.3
184 0.26
185 0.23
186 0.2
187 0.21
188 0.21
189 0.21
190 0.19
191 0.18
192 0.2
193 0.19
194 0.17
195 0.22
196 0.22
197 0.22
198 0.21
199 0.19
200 0.18
201 0.19
202 0.24
203 0.21
204 0.24
205 0.24
206 0.24
207 0.27
208 0.27
209 0.32
210 0.31
211 0.29
212 0.27
213 0.28
214 0.34
215 0.37
216 0.45
217 0.44
218 0.46
219 0.48
220 0.49
221 0.52
222 0.52
223 0.48
224 0.41
225 0.4
226 0.39
227 0.42
228 0.41
229 0.41
230 0.4
231 0.37
232 0.38
233 0.39
234 0.41
235 0.41
236 0.44
237 0.44
238 0.43
239 0.43
240 0.4
241 0.34
242 0.32
243 0.38
244 0.41
245 0.44
246 0.42
247 0.45
248 0.51
249 0.57
250 0.55
251 0.49
252 0.46
253 0.44
254 0.5
255 0.55
256 0.49
257 0.47
258 0.47
259 0.49
260 0.45
261 0.41
262 0.34
263 0.26
264 0.26
265 0.24
266 0.19
267 0.13
268 0.1
269 0.13
270 0.13
271 0.13
272 0.17
273 0.18
274 0.17
275 0.18
276 0.2
277 0.19
278 0.2
279 0.21
280 0.22
281 0.27
282 0.37
283 0.4
284 0.4
285 0.39
286 0.42
287 0.43
288 0.43
289 0.42
290 0.41
291 0.44
292 0.46
293 0.5
294 0.46
295 0.42
296 0.37
297 0.34
298 0.26
299 0.19
300 0.15
301 0.09
302 0.11
303 0.11
304 0.11
305 0.08
306 0.06
307 0.07
308 0.08
309 0.1
310 0.1
311 0.11
312 0.14
313 0.16
314 0.19
315 0.2
316 0.24
317 0.29
318 0.28
319 0.3
320 0.28
321 0.27
322 0.24
323 0.23
324 0.2
325 0.17
326 0.18
327 0.15
328 0.19
329 0.2
330 0.27
331 0.3
332 0.31
333 0.29
334 0.3
335 0.3
336 0.28
337 0.31
338 0.25
339 0.26
340 0.28
341 0.26
342 0.22
343 0.26
344 0.27
345 0.26
346 0.31
347 0.31
348 0.34
349 0.35
350 0.38
351 0.37
352 0.41
353 0.4
354 0.34
355 0.32
356 0.26
357 0.27
358 0.26
359 0.25
360 0.23
361 0.22
362 0.22
363 0.21
364 0.23
365 0.22
366 0.21
367 0.2
368 0.21
369 0.24
370 0.24
371 0.23
372 0.22
373 0.27
374 0.29
375 0.35
376 0.32
377 0.28
378 0.27
379 0.26
380 0.25
381 0.2
382 0.16
383 0.08
384 0.07
385 0.07
386 0.06
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.07
393 0.11
394 0.13
395 0.13
396 0.14
397 0.15
398 0.14
399 0.16
400 0.18
401 0.16
402 0.17
403 0.19
404 0.2
405 0.2
406 0.19
407 0.2
408 0.16
409 0.15
410 0.14
411 0.12
412 0.14
413 0.13
414 0.14
415 0.12
416 0.15
417 0.17
418 0.18
419 0.17
420 0.17
421 0.23
422 0.24
423 0.27
424 0.25
425 0.25
426 0.24
427 0.26
428 0.25
429 0.24
430 0.28
431 0.28
432 0.26
433 0.25
434 0.25
435 0.25
436 0.24
437 0.2
438 0.15
439 0.12
440 0.13
441 0.14
442 0.2
443 0.24
444 0.23
445 0.22
446 0.23
447 0.23
448 0.22
449 0.2
450 0.14
451 0.14
452 0.17
453 0.19
454 0.19
455 0.19
456 0.21
457 0.2
458 0.19
459 0.14
460 0.12
461 0.09
462 0.09
463 0.16
464 0.15
465 0.15
466 0.16
467 0.16
468 0.16
469 0.17
470 0.19
471 0.14
472 0.2
473 0.23
474 0.25
475 0.28
476 0.28
477 0.27
478 0.26
479 0.23
480 0.19
481 0.17
482 0.13
483 0.11
484 0.1
485 0.1
486 0.09
487 0.09
488 0.09
489 0.09
490 0.08
491 0.08
492 0.13
493 0.14
494 0.17
495 0.18
496 0.16
497 0.17
498 0.24
499 0.25
500 0.22
501 0.22
502 0.19
503 0.18
504 0.17
505 0.17
506 0.09
507 0.07
508 0.06
509 0.05
510 0.04
511 0.04
512 0.04
513 0.04
514 0.05
515 0.05
516 0.05
517 0.08
518 0.08
519 0.11
520 0.17
521 0.24
522 0.27
523 0.3
524 0.32
525 0.3
526 0.33
527 0.31
528 0.27
529 0.21
530 0.18
531 0.15
532 0.13
533 0.13
534 0.11
535 0.12
536 0.09
537 0.09
538 0.09
539 0.08
540 0.09
541 0.14
542 0.2
543 0.24
544 0.31
545 0.42
546 0.5
547 0.58
548 0.66
549 0.7
550 0.74
551 0.76
552 0.75
553 0.74
554 0.74
555 0.68
556 0.64
557 0.58
558 0.47
559 0.4
560 0.34
561 0.23
562 0.16
563 0.13
564 0.08
565 0.05
566 0.05
567 0.05
568 0.06
569 0.06
570 0.07
571 0.11
572 0.16
573 0.17
574 0.26
575 0.36
576 0.44
577 0.5
578 0.59
579 0.65
580 0.69
581 0.74
582 0.73
583 0.73
584 0.74
585 0.79
586 0.78
587 0.76
588 0.72
589 0.68
590 0.68
591 0.67
592 0.68
593 0.67
594 0.67
595 0.69
596 0.74
597 0.81
598 0.8
599 0.79
600 0.73
601 0.66
602 0.59
603 0.55
604 0.45
605 0.36
606 0.3
607 0.25
608 0.2
609 0.17
610 0.14
611 0.09
612 0.09
613 0.08
614 0.09
615 0.09
616 0.14
617 0.19
618 0.2
619 0.21
620 0.22
621 0.25
622 0.29
623 0.33
624 0.27
625 0.24
626 0.25
627 0.26
628 0.27
629 0.24
630 0.22
631 0.19
632 0.25
633 0.27
634 0.31
635 0.3
636 0.3
637 0.36
638 0.37
639 0.41
640 0.41
641 0.47
642 0.46
643 0.49
644 0.51
645 0.47
646 0.5
647 0.51
648 0.55
649 0.55
650 0.59
651 0.62
652 0.66
653 0.72
654 0.71
655 0.71
656 0.69
657 0.63
658 0.58
659 0.53
660 0.5
661 0.46
662 0.46
663 0.39
664 0.31
665 0.34
666 0.33
667 0.34
668 0.3
669 0.27
670 0.23
671 0.25
672 0.26
673 0.26
674 0.26
675 0.23
676 0.22
677 0.22
678 0.2
679 0.19
680 0.19
681 0.16
682 0.24
683 0.29
684 0.3
685 0.32
686 0.4
687 0.42
688 0.46
689 0.52
690 0.52
691 0.53
692 0.61
693 0.66
694 0.6
695 0.56
696 0.51
697 0.45
698 0.39
699 0.37
700 0.37
701 0.33
702 0.35
703 0.37
704 0.4
705 0.39
706 0.39
707 0.37
708 0.31
709 0.29
710 0.25
711 0.24
712 0.21
713 0.2
714 0.21
715 0.23
716 0.25
717 0.29
718 0.32
719 0.39
720 0.43
721 0.47
722 0.5
723 0.51
724 0.51
725 0.54
726 0.52
727 0.48
728 0.45
729 0.4
730 0.33
731 0.3
732 0.27
733 0.24
734 0.32
735 0.31
736 0.33
737 0.36
738 0.41
739 0.46
740 0.55
741 0.6
742 0.6
743 0.67
744 0.7
745 0.75
746 0.78
747 0.75
748 0.74
749 0.73
750 0.69
751 0.65
752 0.64
753 0.56
754 0.52
755 0.47
756 0.39
757 0.31
758 0.3
759 0.27
760 0.27
761 0.28
762 0.26
763 0.28
764 0.29
765 0.29
766 0.25
767 0.22
768 0.17
769 0.16
770 0.13
771 0.11
772 0.09
773 0.11
774 0.09
775 0.09
776 0.09
777 0.09
778 0.1
779 0.11
780 0.12
781 0.09
782 0.11
783 0.12
784 0.12
785 0.11
786 0.1
787 0.09
788 0.08
789 0.09
790 0.08
791 0.07
792 0.07
793 0.08
794 0.11
795 0.12
796 0.14
797 0.15
798 0.21
799 0.23
800 0.23
801 0.24
802 0.25
803 0.24
804 0.22
805 0.2
806 0.16
807 0.15
808 0.14
809 0.12
810 0.1
811 0.1
812 0.11
813 0.1
814 0.11
815 0.16
816 0.2
817 0.2
818 0.2
819 0.21
820 0.22
821 0.21
822 0.21
823 0.16
824 0.13
825 0.12
826 0.12
827 0.09
828 0.08
829 0.08
830 0.06
831 0.06
832 0.06
833 0.06
834 0.06
835 0.07
836 0.07
837 0.12
838 0.12
839 0.12
840 0.12
841 0.11
842 0.12
843 0.14
844 0.16
845 0.15
846 0.17
847 0.2
848 0.25
849 0.29
850 0.35
851 0.41
852 0.46
853 0.47
854 0.51
855 0.51
856 0.52
857 0.5
858 0.43
859 0.41
860 0.32
861 0.3
862 0.27
863 0.25
864 0.2
865 0.22
866 0.24
867 0.25
868 0.3
869 0.32
870 0.32
871 0.31
872 0.32
873 0.29
874 0.27
875 0.23
876 0.18
877 0.2
878 0.24
879 0.3
880 0.34
881 0.4
882 0.42
883 0.45
884 0.46
885 0.41
886 0.36
887 0.32
888 0.31
889 0.28
890 0.26
891 0.22
892 0.21
893 0.2
894 0.18
895 0.16
896 0.11
897 0.07
898 0.08
899 0.11
900 0.18
901 0.19
902 0.24
903 0.26
904 0.27
905 0.28
906 0.32