FuNGI

R0K3N8

Protein Details

Accession

R0K3N8

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
118-138	APEGTPKPKRRTSSTKRTIPA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 15, mito_nucl 11.833, cyto_nucl 10.333, mito 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039745 Vps54 IPR012501 Vps54_C
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0000938 C:GARP complex GO:0015031 P:protein transport GO:0042147 P:retrograde transport, endosome to Golgi
Pfam	View protein in Pfam PF07928 Vps54

Amino Acid Sequences

MGAVREQSNNAISTLLTPPIMRTGMVPHTTATASSSHRPPSIRDIPPVTLSQIPHIDPSAFNPYLSQVGNLYEAFQRAKAEAAEAAHPQRRQSRKEDGSEDLTPSPAGTPNLGGAPFAPEGTPKPKRRTSSTKRTIPAITPLSTIPNIYFDENFHIENPRTFDVVSERSEVVRPVRSMSTDDHGALDVPQPTARKALATNAILQEKLSWYMDTVEVHLISAISAASTSFFAALGSLRELQTEAADSVAKIQGLREDLKRLDEQMAIGGLKVVNMKRRRENLRRLTDSVDQLQAVIVGLSRCDEAVVDGDLETAMTRIEMVERLITGVLDTTDTKATAWLETRLPQRLIDLRPLRALDDVFESITELKFRIGRGFEARFVDTLLTDLREHVKRVPNHDTLERWVAASQKGRNSNQKLKTTLPAYMSTHEKLRAELRASLYGLSGAQFTNQASATFREAVLKEMKVLIRKHLPSSSEDDTGSMASVSTRGGRGQSQADKNSILARNLRAMDAGDAEDFFANIFTDIGEALRRLSTLVKVLLDVTSGVVTPPVSAGGLRSPRNSYPNNIDDYIGNGVPTPSSNDLQMEIMQALDMSSLLGQAVDAAQTQITKLLKVRSEATTNLPLDRFLRYFNMCRMFADECEAVSGRSGAALKGVVNTHITDFVTKFGDFEKQELAKSMDSDRWEPKDFDAGDTAVLARLLKAMESDPPSWAEAGDILQKIQEPTTNGTSTATNGTSEEKPKEKNKTAVPAIVDEEKYTISSSSTVVIRGIERFEILVSVMPSMTSEVAASLCEYIKLFNSRLCQLILGAGAMHSAGLKNINTKHLAIASQTLSFIIAILPYIRECFRRRVASTTKSPLGEFDNVKRLLHDQQNQIHEKLTDILSGRATVHMRSLKKVEWDSEAEIKKDVSPSMESLTKDTVTMHKVINKYLSEIQVRMIMGPVFESYREQVGKVIKEASVKTPGGKARLLREAKLFDAKLGPIDGAGNVGSHLIGLVVSKVVAEPKSESKPEPKQETESTNNNDNNKDEKGEKESNKSNGDAT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.19
2	0.17
3	0.15
4	0.15
5	0.15
6	0.2
7	0.2
8	0.17
9	0.16
10	0.2
11	0.27
12	0.29
13	0.28
14	0.24
15	0.26
16	0.26
17	0.25
18	0.21
19	0.17
20	0.2
21	0.26
22	0.31
23	0.33
24	0.37
25	0.38
26	0.41
27	0.47
28	0.52
29	0.5
30	0.52
31	0.52
32	0.52
33	0.53
34	0.51
35	0.44
36	0.39
37	0.35
38	0.33
39	0.32
40	0.3
41	0.28
42	0.29
43	0.27
44	0.23
45	0.27
46	0.3
47	0.26
48	0.25
49	0.24
50	0.24
51	0.26
52	0.26
53	0.22
54	0.15
55	0.16
56	0.19
57	0.18
58	0.18
59	0.16
60	0.18
61	0.18
62	0.19
63	0.19
64	0.17
65	0.19
66	0.17
67	0.17
68	0.17
69	0.17
70	0.19
71	0.22
72	0.28
73	0.31
74	0.32
75	0.35
76	0.42
77	0.48
78	0.51
79	0.54
80	0.59
81	0.61
82	0.68
83	0.67
84	0.64
85	0.62
86	0.59
87	0.55
88	0.45
89	0.38
90	0.29
91	0.25
92	0.21
93	0.18
94	0.16
95	0.14
96	0.14
97	0.15
98	0.17
99	0.17
100	0.15
101	0.12
102	0.15
103	0.14
104	0.14
105	0.12
106	0.12
107	0.16
108	0.25
109	0.35
110	0.39
111	0.47
112	0.54
113	0.6
114	0.68
115	0.75
116	0.76
117	0.78
118	0.8
119	0.81
120	0.77
121	0.76
122	0.7
123	0.62
124	0.6
125	0.54
126	0.45
127	0.37
128	0.35
129	0.34
130	0.3
131	0.28
132	0.2
133	0.18
134	0.18
135	0.19
136	0.18
137	0.15
138	0.21
139	0.23
140	0.23
141	0.21
142	0.24
143	0.24
144	0.27
145	0.3
146	0.26
147	0.25
148	0.24
149	0.24
150	0.25
151	0.28
152	0.27
153	0.25
154	0.24
155	0.24
156	0.26
157	0.27
158	0.24
159	0.26
160	0.24
161	0.24
162	0.26
163	0.26
164	0.28
165	0.28
166	0.3
167	0.26
168	0.26
169	0.23
170	0.21
171	0.2
172	0.18
173	0.18
174	0.15
175	0.13
176	0.15
177	0.16
178	0.16
179	0.19
180	0.18
181	0.17
182	0.16
183	0.21
184	0.26
185	0.26
186	0.29
187	0.31
188	0.32
189	0.3
190	0.29
191	0.25
192	0.19
193	0.2
194	0.17
195	0.13
196	0.12
197	0.14
198	0.16
199	0.15
200	0.15
201	0.15
202	0.14
203	0.14
204	0.13
205	0.11
206	0.09
207	0.08
208	0.06
209	0.04
210	0.04
211	0.04
212	0.04
213	0.05
214	0.05
215	0.05
216	0.05
217	0.05
218	0.06
219	0.06
220	0.07
221	0.09
222	0.1
223	0.1
224	0.1
225	0.11
226	0.11
227	0.11
228	0.11
229	0.09
230	0.08
231	0.08
232	0.08
233	0.1
234	0.11
235	0.11
236	0.09
237	0.1
238	0.12
239	0.15
240	0.19
241	0.18
242	0.22
243	0.23
244	0.26
245	0.27
246	0.26
247	0.25
248	0.23
249	0.21
250	0.17
251	0.17
252	0.13
253	0.12
254	0.11
255	0.09
256	0.09
257	0.12
258	0.13
259	0.2
260	0.26
261	0.33
262	0.4
263	0.48
264	0.57
265	0.63
266	0.72
267	0.75
268	0.79
269	0.79
270	0.73
271	0.7
272	0.65
273	0.59
274	0.51
275	0.42
276	0.31
277	0.25
278	0.23
279	0.18
280	0.12
281	0.08
282	0.07
283	0.05
284	0.05
285	0.06
286	0.06
287	0.05
288	0.05
289	0.05
290	0.05
291	0.06
292	0.07
293	0.07
294	0.06
295	0.07
296	0.06
297	0.06
298	0.06
299	0.04
300	0.03
301	0.03
302	0.03
303	0.03
304	0.04
305	0.05
306	0.06
307	0.06
308	0.06
309	0.07
310	0.07
311	0.07
312	0.06
313	0.06
314	0.05
315	0.06
316	0.06
317	0.07
318	0.08
319	0.08
320	0.08
321	0.1
322	0.1
323	0.11
324	0.12
325	0.13
326	0.14
327	0.19
328	0.23
329	0.26
330	0.26
331	0.24
332	0.26
333	0.3
334	0.3
335	0.35
336	0.35
337	0.32
338	0.34
339	0.34
340	0.31
341	0.26
342	0.24
343	0.16
344	0.15
345	0.15
346	0.12
347	0.11
348	0.11
349	0.1
350	0.11
351	0.1
352	0.07
353	0.08
354	0.09
355	0.1
356	0.13
357	0.14
358	0.16
359	0.21
360	0.23
361	0.25
362	0.26
363	0.26
364	0.22
365	0.22
366	0.19
367	0.13
368	0.12
369	0.1
370	0.09
371	0.08
372	0.09
373	0.14
374	0.15
375	0.16
376	0.21
377	0.28
378	0.29
379	0.36
380	0.42
381	0.41
382	0.43
383	0.44
384	0.4
385	0.36
386	0.37
387	0.31
388	0.24
389	0.21
390	0.2
391	0.2
392	0.23
393	0.24
394	0.26
395	0.32
396	0.35
397	0.43
398	0.49
399	0.55
400	0.58
401	0.6
402	0.57
403	0.53
404	0.55
405	0.47
406	0.43
407	0.36
408	0.32
409	0.28
410	0.28
411	0.29
412	0.24
413	0.25
414	0.24
415	0.21
416	0.19
417	0.21
418	0.22
419	0.2
420	0.23
421	0.23
422	0.22
423	0.23
424	0.21
425	0.18
426	0.15
427	0.13
428	0.1
429	0.08
430	0.05
431	0.05
432	0.06
433	0.06
434	0.07
435	0.08
436	0.08
437	0.08
438	0.1
439	0.12
440	0.12
441	0.12
442	0.13
443	0.13
444	0.16
445	0.17
446	0.16
447	0.14
448	0.16
449	0.17
450	0.2
451	0.2
452	0.22
453	0.26
454	0.28
455	0.3
456	0.3
457	0.3
458	0.27
459	0.32
460	0.31
461	0.25
462	0.24
463	0.22
464	0.19
465	0.18
466	0.15
467	0.09
468	0.06
469	0.04
470	0.04
471	0.04
472	0.05
473	0.05
474	0.06
475	0.07
476	0.08
477	0.1
478	0.14
479	0.2
480	0.24
481	0.25
482	0.26
483	0.26
484	0.25
485	0.28
486	0.26
487	0.21
488	0.19
489	0.18
490	0.2
491	0.2
492	0.2
493	0.15
494	0.13
495	0.12
496	0.11
497	0.1
498	0.06
499	0.06
500	0.06
501	0.06
502	0.05
503	0.05
504	0.04
505	0.03
506	0.03
507	0.03
508	0.03
509	0.03
510	0.03
511	0.04
512	0.04
513	0.04
514	0.04
515	0.04
516	0.04
517	0.05
518	0.06
519	0.06
520	0.08
521	0.09
522	0.09
523	0.09
524	0.09
525	0.09
526	0.08
527	0.07
528	0.05
529	0.05
530	0.04
531	0.04
532	0.04
533	0.04
534	0.04
535	0.04
536	0.04
537	0.04
538	0.03
539	0.04
540	0.08
541	0.13
542	0.14
543	0.16
544	0.19
545	0.21
546	0.26
547	0.27
548	0.26
549	0.28
550	0.3
551	0.32
552	0.3
553	0.28
554	0.23
555	0.23
556	0.22
557	0.15
558	0.12
559	0.09
560	0.08
561	0.07
562	0.08
563	0.08
564	0.09
565	0.09
566	0.1
567	0.1
568	0.11
569	0.12
570	0.12
571	0.1
572	0.07
573	0.07
574	0.06
575	0.05
576	0.04
577	0.04
578	0.03
579	0.03
580	0.02
581	0.03
582	0.03
583	0.03
584	0.02
585	0.03
586	0.03
587	0.03
588	0.03
589	0.03
590	0.04
591	0.04
592	0.04
593	0.08
594	0.08
595	0.09
596	0.11
597	0.15
598	0.16
599	0.18
600	0.21
601	0.2
602	0.23
603	0.24
604	0.25
605	0.28
606	0.27
607	0.26
608	0.24
609	0.22
610	0.2
611	0.21
612	0.18
613	0.13
614	0.16
615	0.17
616	0.2
617	0.24
618	0.28
619	0.26
620	0.26
621	0.28
622	0.25
623	0.23
624	0.25
625	0.19
626	0.14
627	0.15
628	0.15
629	0.11
630	0.1
631	0.1
632	0.06
633	0.07
634	0.07
635	0.05
636	0.06
637	0.07
638	0.06
639	0.08
640	0.09
641	0.08
642	0.09
643	0.1
644	0.1
645	0.11
646	0.11
647	0.1
648	0.1
649	0.11
650	0.12
651	0.12
652	0.11
653	0.11
654	0.17
655	0.15
656	0.16
657	0.2
658	0.19
659	0.2
660	0.21
661	0.23
662	0.18
663	0.19
664	0.2
665	0.17
666	0.19
667	0.22
668	0.25
669	0.27
670	0.29
671	0.29
672	0.28
673	0.32
674	0.3
675	0.28
676	0.25
677	0.2
678	0.17
679	0.17
680	0.16
681	0.08
682	0.08
683	0.07
684	0.05
685	0.06
686	0.05
687	0.05
688	0.06
689	0.06
690	0.11
691	0.15
692	0.16
693	0.16
694	0.17
695	0.18
696	0.17
697	0.16
698	0.12
699	0.08
700	0.09
701	0.12
702	0.11
703	0.1
704	0.11
705	0.12
706	0.12
707	0.12
708	0.13
709	0.11
710	0.15
711	0.2
712	0.2
713	0.19
714	0.2
715	0.2
716	0.19
717	0.19
718	0.16
719	0.11
720	0.12
721	0.15
722	0.17
723	0.21
724	0.24
725	0.25
726	0.31
727	0.38
728	0.46
729	0.49
730	0.52
731	0.54
732	0.59
733	0.58
734	0.55
735	0.5
736	0.42
737	0.39
738	0.36
739	0.3
740	0.21
741	0.19
742	0.15
743	0.15
744	0.13
745	0.11
746	0.08
747	0.09
748	0.09
749	0.11
750	0.11
751	0.11
752	0.11
753	0.12
754	0.12
755	0.13
756	0.13
757	0.11
758	0.1
759	0.1
760	0.1
761	0.09
762	0.08
763	0.09
764	0.08
765	0.08
766	0.07
767	0.07
768	0.07
769	0.08
770	0.08
771	0.06
772	0.05
773	0.06
774	0.06
775	0.06
776	0.06
777	0.06
778	0.06
779	0.07
780	0.07
781	0.08
782	0.11
783	0.15
784	0.15
785	0.18
786	0.21
787	0.23
788	0.24
789	0.24
790	0.21
791	0.17
792	0.17
793	0.14
794	0.11
795	0.09
796	0.07
797	0.06
798	0.06
799	0.05
800	0.04
801	0.04
802	0.04
803	0.07
804	0.08
805	0.13
806	0.16
807	0.2
808	0.22
809	0.23
810	0.24
811	0.23
812	0.23
813	0.19
814	0.21
815	0.19
816	0.17
817	0.16
818	0.15
819	0.13
820	0.12
821	0.11
822	0.07
823	0.05
824	0.05
825	0.06
826	0.06
827	0.06
828	0.09
829	0.11
830	0.16
831	0.19
832	0.26
833	0.33
834	0.4
835	0.42
836	0.49
837	0.56
838	0.59
839	0.64
840	0.64
841	0.61
842	0.55
843	0.52
844	0.46
845	0.42
846	0.4
847	0.35
848	0.33
849	0.36
850	0.36
851	0.36
852	0.35
853	0.33
854	0.35
855	0.4
856	0.43
857	0.42
858	0.47
859	0.56
860	0.58
861	0.56
862	0.51
863	0.42
864	0.36
865	0.31
866	0.25
867	0.2
868	0.18
869	0.19
870	0.17
871	0.18
872	0.18
873	0.19
874	0.19
875	0.16
876	0.22
877	0.27
878	0.28
879	0.32
880	0.35
881	0.34
882	0.41
883	0.43
884	0.39
885	0.38
886	0.4
887	0.4
888	0.44
889	0.44
890	0.37
891	0.35
892	0.33
893	0.3
894	0.29
895	0.25
896	0.19
897	0.19
898	0.2
899	0.23
900	0.26
901	0.25
902	0.26
903	0.28
904	0.25
905	0.23
906	0.23
907	0.24
908	0.22
909	0.25
910	0.25
911	0.27
912	0.29
913	0.32
914	0.36
915	0.32
916	0.34
917	0.36
918	0.38
919	0.36
920	0.35
921	0.33
922	0.31
923	0.3
924	0.26
925	0.23
926	0.17
927	0.14
928	0.14
929	0.14
930	0.11
931	0.12
932	0.14
933	0.14
934	0.2
935	0.2
936	0.2
937	0.23
938	0.29
939	0.3
940	0.3
941	0.31
942	0.27
943	0.31
944	0.33
945	0.33
946	0.34
947	0.32
948	0.32
949	0.36
950	0.38
951	0.37
952	0.39
953	0.39
954	0.38
955	0.47
956	0.48
957	0.45
958	0.47
959	0.46
960	0.46
961	0.5
962	0.44
963	0.36
964	0.36
965	0.33
966	0.29
967	0.27
968	0.22
969	0.15
970	0.15
971	0.13
972	0.11
973	0.1
974	0.08
975	0.07
976	0.08
977	0.07
978	0.06
979	0.06
980	0.04
981	0.04
982	0.05
983	0.05
984	0.05
985	0.05
986	0.05
987	0.07
988	0.11
989	0.11
990	0.13
991	0.17
992	0.24
993	0.32
994	0.35
995	0.39
996	0.44
997	0.53
998	0.61
999	0.65
1000	0.63
1001	0.63
1002	0.66
1003	0.7
1004	0.67
1005	0.66
1006	0.63
1007	0.63
1008	0.63
1009	0.61
1010	0.57
1011	0.53
1012	0.51
1013	0.45
1014	0.43
1015	0.38
1016	0.37
1017	0.42
1018	0.48
1019	0.5
1020	0.54
1021	0.59
1022	0.62
1023	0.63

R0K3N8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer