Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0IRN3

Protein Details
Accession R0IRN3    Localization Confidence High Confidence Score 17.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-34IPTSADPRSKRPVKKRALTPRTEQASHydrophilic
119-152EKKDREKTEKNRLKREKARQRKEKAKKGGRGGEGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-23KRPVKK
110-151EFAKRKEELEKKDREKTEKNRLKREKARQRKEKAKKGGRGGE
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009548  Prkrip1  
Gene Ontology GO:0003725  F:double-stranded RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF06658  DUF1168  
Amino Acid Sequences MSEPIPEAIPTSADPRSKRPVKKRALTPRTEQASQVEALFAKPDREIHIPGSGPVAKTSSLPPEIVANVQGSSAGAGSGEFHVYKASRRREYERLRAMDEEVKKEEEEREFAKRKEELEKKDREKTEKNRLKREKARQRKEKAKKGGRGGEGGAGEGGNAEDSKAGHDSEQSKKKLVPNANVPNSGTGEDADTRNSEAEVKNAEEIGLVIEDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.33
3 0.42
4 0.5
5 0.59
6 0.65
7 0.71
8 0.76
9 0.82
10 0.87
11 0.88
12 0.88
13 0.84
14 0.81
15 0.8
16 0.76
17 0.68
18 0.59
19 0.5
20 0.43
21 0.38
22 0.31
23 0.22
24 0.16
25 0.15
26 0.16
27 0.13
28 0.12
29 0.12
30 0.13
31 0.16
32 0.2
33 0.22
34 0.22
35 0.25
36 0.24
37 0.24
38 0.27
39 0.24
40 0.21
41 0.2
42 0.19
43 0.15
44 0.16
45 0.17
46 0.17
47 0.17
48 0.16
49 0.16
50 0.17
51 0.17
52 0.16
53 0.15
54 0.11
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.07
59 0.06
60 0.06
61 0.04
62 0.03
63 0.03
64 0.04
65 0.05
66 0.06
67 0.05
68 0.06
69 0.07
70 0.08
71 0.13
72 0.2
73 0.27
74 0.32
75 0.36
76 0.43
77 0.51
78 0.58
79 0.63
80 0.63
81 0.58
82 0.54
83 0.51
84 0.47
85 0.43
86 0.37
87 0.31
88 0.24
89 0.22
90 0.2
91 0.2
92 0.21
93 0.16
94 0.16
95 0.15
96 0.21
97 0.24
98 0.25
99 0.28
100 0.27
101 0.28
102 0.35
103 0.4
104 0.41
105 0.45
106 0.54
107 0.55
108 0.61
109 0.63
110 0.6
111 0.62
112 0.63
113 0.67
114 0.66
115 0.68
116 0.72
117 0.76
118 0.8
119 0.8
120 0.83
121 0.83
122 0.85
123 0.88
124 0.88
125 0.89
126 0.9
127 0.91
128 0.9
129 0.9
130 0.88
131 0.85
132 0.83
133 0.81
134 0.73
135 0.64
136 0.55
137 0.48
138 0.38
139 0.31
140 0.22
141 0.14
142 0.11
143 0.08
144 0.07
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.05
150 0.07
151 0.08
152 0.09
153 0.08
154 0.13
155 0.18
156 0.27
157 0.35
158 0.36
159 0.37
160 0.41
161 0.46
162 0.51
163 0.53
164 0.52
165 0.54
166 0.62
167 0.65
168 0.63
169 0.59
170 0.53
171 0.47
172 0.4
173 0.3
174 0.19
175 0.17
176 0.17
177 0.17
178 0.16
179 0.16
180 0.16
181 0.16
182 0.16
183 0.17
184 0.15
185 0.18
186 0.2
187 0.21
188 0.21
189 0.21
190 0.2
191 0.16
192 0.15
193 0.13
194 0.1