Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A090C8C3

Protein Details
Accession A0A090C8C3    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
58-82SVGENERHPKGKRKRTAAKDKAILEBasic
110-134VQIWFQNRRQNDRRKSRPLSPQELAHydrophilic
555-582SSATRSEKDYRKHPRRTPTNNKTAPNDRHydrophilic
584-604NTAPVKGRGQRRDKRAAQDSVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
64-77RHPKGKRKRTAAKD
460-470PRPGAAKKAKL
589-595KGRGQRR
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR017970  Homeobox_CS  
IPR001356  Homeobox_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
Pfam View protein in Pfam  
PF00046  Homeodomain  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00027  HOMEOBOX_1  
PS50071  HOMEOBOX_2  
CDD cd00086  homeodomain  
Amino Acid Sequences MDHQAPLPRASSPSPAPRAQSPAVSGDEQQPSSPTTANALPAIPQQSSPEYRPEFLRSVGENERHPKGKRKRTAAKDKAILEAAYNANPKPDKAARLDIVKRVSLNEKEVQIWFQNRRQNDRRKSRPLSPQELAALRYGGMQILSSDPAPYNTAFSSDITNTSPLQSLSRPEQEPTSPTQPDRPVSQAGEEAEPVAEVPRETSKWEEPRDNAKELATPAPKPRPAHDQSSALSQSFSASVGYLSNRWNTGNSFTTPAPVTAGRDEPFSWVTPMMQPITVSPNPGYSLESFSSSCPPAFSAGSILPPPSTQPSRFRISMSLEGKAEVVASTISPPRPIAAPPTPDMLQSLRSIRRPNLQRSHSASPIVTLPPISVLTSSLTSHSPLPPRLTRGRSRDVHAWEFACDAENREDALTAQAKNESNGSAIAAISILRSTSSTGGSPLQQSSSAKRNATISKATPRPGAAKKAKLGRASSSVARMQSVLGLSEKANHDNQQVVSSTSEKIKVHARHSPSGHDSDKENWSPDEDGNPRTPYYSHAQSIMGSATTGRRPLPSSATRSEKDYRKHPRRTPTNNKTAPNDRANTAPVKGRGQRRDKRAAQDSVLEIFEDEEAENRSPASSRAALDDEVERFMRGNVSPSKKSDVDAVAGLLSLSQGNWR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.47
3 0.49
4 0.5
5 0.54
6 0.5
7 0.47
8 0.4
9 0.38
10 0.38
11 0.36
12 0.33
13 0.33
14 0.36
15 0.33
16 0.31
17 0.28
18 0.26
19 0.27
20 0.26
21 0.2
22 0.18
23 0.2
24 0.22
25 0.21
26 0.2
27 0.19
28 0.22
29 0.25
30 0.21
31 0.2
32 0.21
33 0.26
34 0.31
35 0.31
36 0.36
37 0.36
38 0.38
39 0.41
40 0.43
41 0.39
42 0.37
43 0.4
44 0.33
45 0.35
46 0.41
47 0.41
48 0.42
49 0.45
50 0.5
51 0.51
52 0.53
53 0.58
54 0.61
55 0.68
56 0.71
57 0.76
58 0.8
59 0.84
60 0.92
61 0.91
62 0.9
63 0.86
64 0.79
65 0.72
66 0.64
67 0.53
68 0.43
69 0.38
70 0.3
71 0.27
72 0.27
73 0.22
74 0.25
75 0.26
76 0.25
77 0.28
78 0.31
79 0.32
80 0.35
81 0.43
82 0.41
83 0.49
84 0.53
85 0.52
86 0.5
87 0.47
88 0.43
89 0.38
90 0.41
91 0.36
92 0.37
93 0.35
94 0.33
95 0.34
96 0.34
97 0.34
98 0.32
99 0.36
100 0.37
101 0.38
102 0.43
103 0.45
104 0.54
105 0.6
106 0.66
107 0.7
108 0.75
109 0.78
110 0.83
111 0.85
112 0.84
113 0.85
114 0.84
115 0.82
116 0.72
117 0.66
118 0.6
119 0.55
120 0.47
121 0.38
122 0.29
123 0.2
124 0.19
125 0.15
126 0.11
127 0.08
128 0.07
129 0.07
130 0.08
131 0.09
132 0.08
133 0.09
134 0.09
135 0.1
136 0.12
137 0.12
138 0.13
139 0.12
140 0.14
141 0.14
142 0.14
143 0.16
144 0.15
145 0.17
146 0.16
147 0.18
148 0.16
149 0.16
150 0.17
151 0.14
152 0.16
153 0.15
154 0.18
155 0.22
156 0.28
157 0.28
158 0.27
159 0.3
160 0.3
161 0.31
162 0.33
163 0.34
164 0.3
165 0.3
166 0.36
167 0.37
168 0.38
169 0.38
170 0.36
171 0.32
172 0.31
173 0.31
174 0.27
175 0.24
176 0.23
177 0.2
178 0.16
179 0.12
180 0.11
181 0.1
182 0.08
183 0.06
184 0.05
185 0.07
186 0.1
187 0.11
188 0.12
189 0.17
190 0.23
191 0.3
192 0.35
193 0.38
194 0.39
195 0.48
196 0.52
197 0.5
198 0.43
199 0.36
200 0.34
201 0.32
202 0.35
203 0.28
204 0.26
205 0.29
206 0.35
207 0.39
208 0.38
209 0.39
210 0.42
211 0.43
212 0.47
213 0.45
214 0.42
215 0.39
216 0.44
217 0.42
218 0.32
219 0.28
220 0.21
221 0.18
222 0.14
223 0.13
224 0.07
225 0.06
226 0.06
227 0.07
228 0.08
229 0.09
230 0.1
231 0.11
232 0.12
233 0.13
234 0.14
235 0.14
236 0.17
237 0.18
238 0.18
239 0.2
240 0.19
241 0.21
242 0.2
243 0.19
244 0.16
245 0.14
246 0.14
247 0.13
248 0.16
249 0.14
250 0.15
251 0.15
252 0.15
253 0.16
254 0.15
255 0.14
256 0.12
257 0.12
258 0.12
259 0.13
260 0.12
261 0.11
262 0.1
263 0.1
264 0.16
265 0.16
266 0.16
267 0.15
268 0.15
269 0.16
270 0.16
271 0.17
272 0.11
273 0.14
274 0.13
275 0.15
276 0.14
277 0.14
278 0.16
279 0.16
280 0.15
281 0.11
282 0.11
283 0.11
284 0.11
285 0.1
286 0.1
287 0.09
288 0.1
289 0.1
290 0.1
291 0.08
292 0.08
293 0.09
294 0.11
295 0.14
296 0.16
297 0.21
298 0.25
299 0.3
300 0.31
301 0.31
302 0.29
303 0.31
304 0.36
305 0.32
306 0.29
307 0.25
308 0.24
309 0.23
310 0.2
311 0.16
312 0.08
313 0.06
314 0.04
315 0.04
316 0.05
317 0.07
318 0.07
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.09
323 0.09
324 0.14
325 0.16
326 0.19
327 0.19
328 0.22
329 0.22
330 0.21
331 0.22
332 0.17
333 0.15
334 0.14
335 0.17
336 0.18
337 0.21
338 0.23
339 0.24
340 0.32
341 0.37
342 0.44
343 0.48
344 0.48
345 0.51
346 0.55
347 0.58
348 0.51
349 0.46
350 0.37
351 0.29
352 0.28
353 0.22
354 0.15
355 0.1
356 0.08
357 0.08
358 0.09
359 0.08
360 0.06
361 0.06
362 0.07
363 0.08
364 0.09
365 0.09
366 0.09
367 0.1
368 0.12
369 0.14
370 0.17
371 0.18
372 0.23
373 0.24
374 0.29
375 0.35
376 0.39
377 0.43
378 0.46
379 0.52
380 0.5
381 0.52
382 0.54
383 0.52
384 0.49
385 0.44
386 0.38
387 0.3
388 0.28
389 0.24
390 0.18
391 0.13
392 0.12
393 0.12
394 0.12
395 0.12
396 0.11
397 0.11
398 0.1
399 0.13
400 0.14
401 0.12
402 0.12
403 0.16
404 0.16
405 0.16
406 0.17
407 0.14
408 0.12
409 0.11
410 0.11
411 0.07
412 0.07
413 0.06
414 0.05
415 0.05
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.05
422 0.07
423 0.08
424 0.08
425 0.1
426 0.11
427 0.12
428 0.14
429 0.13
430 0.13
431 0.14
432 0.16
433 0.18
434 0.24
435 0.28
436 0.26
437 0.27
438 0.32
439 0.33
440 0.35
441 0.36
442 0.33
443 0.37
444 0.41
445 0.41
446 0.38
447 0.37
448 0.4
449 0.4
450 0.46
451 0.44
452 0.46
453 0.49
454 0.56
455 0.59
456 0.56
457 0.54
458 0.48
459 0.46
460 0.43
461 0.4
462 0.36
463 0.33
464 0.29
465 0.27
466 0.23
467 0.18
468 0.17
469 0.15
470 0.12
471 0.1
472 0.1
473 0.1
474 0.14
475 0.16
476 0.17
477 0.19
478 0.2
479 0.21
480 0.24
481 0.24
482 0.22
483 0.21
484 0.19
485 0.19
486 0.19
487 0.19
488 0.18
489 0.22
490 0.2
491 0.21
492 0.29
493 0.33
494 0.36
495 0.42
496 0.45
497 0.48
498 0.5
499 0.54
500 0.5
501 0.5
502 0.47
503 0.42
504 0.39
505 0.36
506 0.41
507 0.37
508 0.35
509 0.29
510 0.29
511 0.3
512 0.28
513 0.31
514 0.27
515 0.28
516 0.31
517 0.32
518 0.3
519 0.29
520 0.28
521 0.24
522 0.28
523 0.31
524 0.27
525 0.27
526 0.28
527 0.27
528 0.28
529 0.24
530 0.17
531 0.11
532 0.11
533 0.13
534 0.14
535 0.16
536 0.15
537 0.17
538 0.2
539 0.23
540 0.3
541 0.33
542 0.38
543 0.44
544 0.5
545 0.49
546 0.52
547 0.57
548 0.57
549 0.56
550 0.6
551 0.64
552 0.67
553 0.76
554 0.78
555 0.81
556 0.84
557 0.89
558 0.9
559 0.9
560 0.9
561 0.87
562 0.85
563 0.82
564 0.79
565 0.76
566 0.73
567 0.66
568 0.56
569 0.52
570 0.5
571 0.45
572 0.39
573 0.38
574 0.34
575 0.38
576 0.44
577 0.5
578 0.57
579 0.64
580 0.7
581 0.72
582 0.79
583 0.78
584 0.81
585 0.8
586 0.76
587 0.68
588 0.65
589 0.59
590 0.52
591 0.45
592 0.35
593 0.26
594 0.2
595 0.17
596 0.13
597 0.1
598 0.09
599 0.12
600 0.13
601 0.14
602 0.13
603 0.14
604 0.14
605 0.15
606 0.19
607 0.19
608 0.19
609 0.23
610 0.26
611 0.25
612 0.27
613 0.29
614 0.25
615 0.24
616 0.24
617 0.2
618 0.18
619 0.18
620 0.2
621 0.17
622 0.22
623 0.28
624 0.36
625 0.4
626 0.44
627 0.5
628 0.47
629 0.47
630 0.47
631 0.41
632 0.36
633 0.32
634 0.29
635 0.22
636 0.21
637 0.2
638 0.12
639 0.1
640 0.07