FuNGI

R0K025

Protein Details

Accession

R0K025

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
23-45	AQTARGPKPPQPRLKLICRRLPP	Hydrophilic
132-152	YAPYPKMPGGRRRNDNRQGTI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
194-234	REKKANRDKPNAKANRQARGEAKEDGADRAEKKIMTKPAKE
370-370	R
546-584	KEKVARNPRFNAPPAGPARGGARGNFAARGGRGSRGAAR

Subcellular Location(s)

nucl 16, mito 6, extr 3, cyto_mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3 cd00590 RRM_SF

Amino Acid Sequences

MAPQPGSNGGVLPVALLQKNAPAQTARGPKPPQPRLKLICRRLPPGLTRAEFVEALGDEWRLGAGKLDWLNYRKGKISTDAAKPSKPARVYLHVTKQDHVKALGDHVRALSFHDAAKSWQDPVLVGPPTLEYAPYPKMPGGRRRNDNRQGTIDQDQEFKDFLESLTNPITKPAASDNDAPKDKVKTTPLIEALREKKANRDKPNAKANRQARGEAKEDGADRAEKKIMTKPAKENTPSTGDKNRRSNKADKAQATKDAVKILNKEASSSKSSAVANTPDKASATPPPERKRGNVALAKSMLQRDLGVAPAPNRRRGTKREVSTAAPDTATQSKETKASDEKTKDAPAAAPPATSTPDKPAQTNRKERPTRAERRAFKANQGDKANEKLATADAKPQTPQKTPAPQILKKPQTPAPPKGPAASRAPPTEPAAVRNSPAPAQPQATPAKTENPPTPTAANPPKAASASAAPAPMSKQAFLKHANPSQGITEPLIEEAMRAFGSIDKVEIDKRKGFAYVDFAEPEGLLKAMAASPIKIAQGAVQVLERKEKVARNPRFNAPPAGPARGGARGNFAARGGRGSRGAARGGGQAGANASAGASDSAPAVASPAPAPVAT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.13
2	0.13
3	0.14
4	0.13
5	0.17
6	0.21
7	0.21
8	0.22
9	0.2
10	0.22
11	0.3
12	0.39
13	0.39
14	0.44
15	0.49
16	0.54
17	0.63
18	0.71
19	0.72
20	0.7
21	0.76
22	0.75
23	0.81
24	0.84
25	0.83
26	0.82
27	0.78
28	0.77
29	0.73
30	0.71
31	0.65
32	0.61
33	0.61
34	0.53
35	0.48
36	0.44
37	0.41
38	0.35
39	0.29
40	0.26
41	0.17
42	0.16
43	0.16
44	0.13
45	0.1
46	0.1
47	0.1
48	0.08
49	0.07
50	0.08
51	0.08
52	0.14
53	0.16
54	0.19
55	0.25
56	0.27
57	0.35
58	0.37
59	0.4
60	0.39
61	0.4
62	0.4
63	0.39
64	0.45
65	0.44
66	0.48
67	0.55
68	0.53
69	0.53
70	0.53
71	0.52
72	0.51
73	0.46
74	0.44
75	0.4
76	0.44
77	0.5
78	0.55
79	0.61
80	0.62
81	0.62
82	0.59
83	0.6
84	0.56
85	0.51
86	0.44
87	0.36
88	0.28
89	0.33
90	0.37
91	0.31
92	0.28
93	0.26
94	0.25
95	0.23
96	0.25
97	0.21
98	0.16
99	0.16
100	0.16
101	0.16
102	0.17
103	0.22
104	0.2
105	0.18
106	0.19
107	0.18
108	0.17
109	0.19
110	0.23
111	0.19
112	0.18
113	0.16
114	0.15
115	0.16
116	0.16
117	0.14
118	0.08
119	0.12
120	0.15
121	0.16
122	0.17
123	0.18
124	0.24
125	0.3
126	0.4
127	0.46
128	0.52
129	0.61
130	0.68
131	0.78
132	0.81
133	0.83
134	0.78
135	0.74
136	0.66
137	0.62
138	0.58
139	0.51
140	0.43
141	0.37
142	0.33
143	0.28
144	0.26
145	0.21
146	0.17
147	0.13
148	0.11
149	0.14
150	0.14
151	0.15
152	0.2
153	0.21
154	0.2
155	0.21
156	0.21
157	0.15
158	0.17
159	0.18
160	0.17
161	0.2
162	0.26
163	0.3
164	0.37
165	0.39
166	0.39
167	0.37
168	0.36
169	0.35
170	0.34
171	0.32
172	0.3
173	0.31
174	0.36
175	0.38
176	0.37
177	0.37
178	0.39
179	0.39
180	0.4
181	0.41
182	0.36
183	0.4
184	0.48
185	0.56
186	0.56
187	0.63
188	0.63
189	0.68
190	0.79
191	0.78
192	0.72
193	0.72
194	0.69
195	0.67
196	0.62
197	0.59
198	0.53
199	0.49
200	0.47
201	0.4
202	0.35
203	0.29
204	0.27
205	0.24
206	0.21
207	0.19
208	0.17
209	0.17
210	0.18
211	0.16
212	0.17
213	0.23
214	0.3
215	0.34
216	0.39
217	0.44
218	0.48
219	0.54
220	0.55
221	0.5
222	0.45
223	0.45
224	0.42
225	0.39
226	0.41
227	0.42
228	0.47
229	0.55
230	0.58
231	0.59
232	0.63
233	0.65
234	0.66
235	0.68
236	0.68
237	0.63
238	0.63
239	0.58
240	0.58
241	0.54
242	0.47
243	0.39
244	0.36
245	0.32
246	0.28
247	0.28
248	0.25
249	0.25
250	0.23
251	0.23
252	0.21
253	0.22
254	0.23
255	0.22
256	0.2
257	0.19
258	0.19
259	0.18
260	0.19
261	0.2
262	0.19
263	0.2
264	0.19
265	0.16
266	0.16
267	0.16
268	0.15
269	0.16
270	0.18
271	0.23
272	0.31
273	0.35
274	0.41
275	0.42
276	0.42
277	0.45
278	0.45
279	0.46
280	0.42
281	0.39
282	0.36
283	0.36
284	0.35
285	0.29
286	0.25
287	0.18
288	0.14
289	0.13
290	0.1
291	0.09
292	0.08
293	0.07
294	0.07
295	0.09
296	0.16
297	0.18
298	0.23
299	0.25
300	0.28
301	0.33
302	0.38
303	0.45
304	0.47
305	0.48
306	0.49
307	0.5
308	0.48
309	0.47
310	0.43
311	0.35
312	0.26
313	0.23
314	0.19
315	0.19
316	0.18
317	0.15
318	0.14
319	0.14
320	0.17
321	0.17
322	0.18
323	0.19
324	0.22
325	0.28
326	0.3
327	0.31
328	0.32
329	0.33
330	0.3
331	0.26
332	0.23
333	0.17
334	0.19
335	0.17
336	0.14
337	0.13
338	0.14
339	0.16
340	0.15
341	0.14
342	0.14
343	0.21
344	0.21
345	0.23
346	0.32
347	0.39
348	0.47
349	0.57
350	0.59
351	0.63
352	0.67
353	0.68
354	0.68
355	0.69
356	0.7
357	0.7
358	0.73
359	0.68
360	0.69
361	0.76
362	0.67
363	0.63
364	0.63
365	0.58
366	0.56
367	0.53
368	0.49
369	0.42
370	0.44
371	0.39
372	0.3
373	0.25
374	0.18
375	0.17
376	0.17
377	0.16
378	0.19
379	0.19
380	0.19
381	0.21
382	0.26
383	0.29
384	0.3
385	0.34
386	0.35
387	0.41
388	0.43
389	0.5
390	0.53
391	0.52
392	0.58
393	0.63
394	0.63
395	0.57
396	0.59
397	0.56
398	0.58
399	0.61
400	0.59
401	0.57
402	0.56
403	0.54
404	0.54
405	0.51
406	0.45
407	0.44
408	0.42
409	0.38
410	0.35
411	0.36
412	0.34
413	0.35
414	0.37
415	0.31
416	0.29
417	0.3
418	0.28
419	0.27
420	0.26
421	0.25
422	0.21
423	0.22
424	0.22
425	0.19
426	0.21
427	0.21
428	0.25
429	0.29
430	0.28
431	0.3
432	0.28
433	0.32
434	0.32
435	0.36
436	0.35
437	0.34
438	0.35
439	0.34
440	0.35
441	0.29
442	0.36
443	0.39
444	0.38
445	0.35
446	0.34
447	0.33
448	0.32
449	0.31
450	0.24
451	0.18
452	0.16
453	0.16
454	0.16
455	0.14
456	0.14
457	0.15
458	0.18
459	0.18
460	0.16
461	0.17
462	0.19
463	0.24
464	0.28
465	0.32
466	0.35
467	0.38
468	0.41
469	0.39
470	0.38
471	0.36
472	0.33
473	0.3
474	0.23
475	0.19
476	0.15
477	0.14
478	0.14
479	0.11
480	0.09
481	0.08
482	0.08
483	0.07
484	0.07
485	0.07
486	0.08
487	0.11
488	0.11
489	0.11
490	0.11
491	0.12
492	0.18
493	0.24
494	0.27
495	0.29
496	0.3
497	0.3
498	0.32
499	0.31
500	0.28
501	0.3
502	0.27
503	0.26
504	0.25
505	0.24
506	0.22
507	0.21
508	0.19
509	0.13
510	0.1
511	0.07
512	0.06
513	0.06
514	0.07
515	0.1
516	0.1
517	0.1
518	0.11
519	0.13
520	0.13
521	0.13
522	0.12
523	0.11
524	0.15
525	0.15
526	0.15
527	0.16
528	0.2
529	0.21
530	0.27
531	0.25
532	0.23
533	0.29
534	0.33
535	0.41
536	0.48
537	0.56
538	0.6
539	0.66
540	0.72
541	0.73
542	0.71
543	0.68
544	0.59
545	0.59
546	0.53
547	0.52
548	0.43
549	0.37
550	0.37
551	0.36
552	0.35
553	0.27
554	0.29
555	0.27
556	0.29
557	0.29
558	0.27
559	0.24
560	0.23
561	0.28
562	0.24
563	0.24
564	0.24
565	0.26
566	0.3
567	0.3
568	0.31
569	0.27
570	0.27
571	0.27
572	0.26
573	0.24
574	0.19
575	0.17
576	0.16
577	0.15
578	0.13
579	0.1
580	0.08
581	0.07
582	0.08
583	0.07
584	0.06
585	0.06
586	0.06
587	0.07
588	0.07
589	0.07
590	0.08
591	0.08
592	0.09
593	0.09
594	0.1

R0K025

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer