Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0K5C3

Protein Details
Accession R0K5C3    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
70-105DIPDWEKKPHEPRDPRNWSKVYRKLKKDAEREKQADBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
85-85R
89-96KVYRKLKK
288-291KRKR
300-303KKRR
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 11, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MPALSLFELARQRLIKNIDMLRDVGDLPYSFLQPVLRFVQSPDQLLELENNCPQLQGETGEIWLRFIRRDIPDWEKKPHEPRDPRNWSKVYRKLKKDAEREKQADEEALKQHMQALQKDRAKNKTLIVDSRIGYGSGGSRMFTGRTTTPWGQPSGAPAKTGKAAFDKLKRGMFDHGRERPKASHIPAHILAQRKSTIRQAPARMIRMAESEAPRTMVLSKQASTSMANKPESSNAASASTSRPNITHRPAPQQRNPPPTRTSLPTGQQFNAPKPRPMTGQSGTAPAPKRKREEYSMFQPKKRRAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.33
3 0.37
4 0.4
5 0.38
6 0.38
7 0.38
8 0.33
9 0.31
10 0.27
11 0.2
12 0.18
13 0.14
14 0.15
15 0.16
16 0.15
17 0.14
18 0.15
19 0.17
20 0.15
21 0.2
22 0.21
23 0.2
24 0.2
25 0.23
26 0.31
27 0.3
28 0.31
29 0.28
30 0.25
31 0.24
32 0.24
33 0.26
34 0.19
35 0.19
36 0.19
37 0.2
38 0.18
39 0.18
40 0.18
41 0.14
42 0.14
43 0.13
44 0.13
45 0.11
46 0.13
47 0.15
48 0.15
49 0.15
50 0.16
51 0.15
52 0.14
53 0.15
54 0.21
55 0.21
56 0.25
57 0.3
58 0.37
59 0.46
60 0.5
61 0.55
62 0.54
63 0.58
64 0.63
65 0.66
66 0.68
67 0.67
68 0.72
69 0.76
70 0.81
71 0.8
72 0.79
73 0.75
74 0.71
75 0.71
76 0.72
77 0.72
78 0.72
79 0.73
80 0.73
81 0.78
82 0.8
83 0.81
84 0.82
85 0.81
86 0.81
87 0.77
88 0.7
89 0.62
90 0.53
91 0.45
92 0.36
93 0.3
94 0.22
95 0.21
96 0.19
97 0.17
98 0.18
99 0.19
100 0.21
101 0.21
102 0.25
103 0.31
104 0.36
105 0.41
106 0.45
107 0.47
108 0.48
109 0.46
110 0.43
111 0.42
112 0.4
113 0.38
114 0.36
115 0.34
116 0.3
117 0.29
118 0.26
119 0.19
120 0.16
121 0.14
122 0.11
123 0.09
124 0.09
125 0.07
126 0.08
127 0.08
128 0.09
129 0.09
130 0.1
131 0.09
132 0.11
133 0.17
134 0.18
135 0.21
136 0.22
137 0.23
138 0.21
139 0.21
140 0.23
141 0.22
142 0.21
143 0.18
144 0.17
145 0.17
146 0.19
147 0.19
148 0.16
149 0.13
150 0.17
151 0.21
152 0.26
153 0.29
154 0.3
155 0.33
156 0.32
157 0.31
158 0.34
159 0.34
160 0.35
161 0.38
162 0.42
163 0.45
164 0.45
165 0.46
166 0.41
167 0.41
168 0.41
169 0.36
170 0.34
171 0.31
172 0.35
173 0.33
174 0.35
175 0.33
176 0.32
177 0.3
178 0.27
179 0.29
180 0.25
181 0.26
182 0.29
183 0.32
184 0.33
185 0.38
186 0.4
187 0.45
188 0.5
189 0.51
190 0.45
191 0.4
192 0.34
193 0.3
194 0.28
195 0.24
196 0.2
197 0.19
198 0.19
199 0.19
200 0.18
201 0.17
202 0.17
203 0.14
204 0.17
205 0.17
206 0.17
207 0.18
208 0.19
209 0.19
210 0.2
211 0.23
212 0.24
213 0.27
214 0.28
215 0.28
216 0.28
217 0.3
218 0.31
219 0.29
220 0.24
221 0.19
222 0.19
223 0.18
224 0.18
225 0.19
226 0.21
227 0.2
228 0.2
229 0.2
230 0.24
231 0.31
232 0.36
233 0.4
234 0.4
235 0.5
236 0.58
237 0.66
238 0.69
239 0.73
240 0.76
241 0.79
242 0.78
243 0.73
244 0.67
245 0.65
246 0.62
247 0.56
248 0.53
249 0.49
250 0.52
251 0.54
252 0.55
253 0.49
254 0.51
255 0.49
256 0.51
257 0.55
258 0.51
259 0.49
260 0.48
261 0.51
262 0.48
263 0.49
264 0.49
265 0.41
266 0.45
267 0.41
268 0.41
269 0.39
270 0.41
271 0.43
272 0.44
273 0.5
274 0.51
275 0.57
276 0.6
277 0.66
278 0.69
279 0.72
280 0.72
281 0.74
282 0.77
283 0.78
284 0.76
285 0.78